result

Gene information

Detail information of AfisC1G06174

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G06174	chr1	1122330404	1122335143	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G06174
AAAAAAAATTCTTCTCCTCCTCCGAATCCTCGGTGCCAAAAAATTTATTTTTTACTTCTTTTCTTCTTCAACAAATTAAACGAGATGCTAAAATGGGTTTTTTGCTGCTAATTAACGTCTGCTTCAAGCTAAATTCTGCTACAACCTTGCTAATTAACTGGCCTAAATAAATACTGAGCTCTCTTTAATTAGCGCATTTAGGTTTCCAACTCTTAGTATAAATATTCTTATCCTTTTCTCCAACCGCCGCCTCCTCCTCCAAGCAAATCAATACAAAAAAGCTGGGCGGTTTTTGTATTTTACACCTTATTCCTTGCAATCATGGCTACTAGAGCACTTTCACAGAAAGAAAAGGACATCCAAATGATGCTGGCCGCCGACATTCATTTGGGTACAAAGAACTGCGATTTTCAAATGGAGTGATATGTCTTCAAGCGCAGATCTGATGGTATCGTTTCTATACTATTGTCTTATTTGATTTTGAGAAAGTACTACATGCACACGTAAATCTTAGTTTGCAGTATCGGTTGAAAATATCCAAAACTTGGGCTATTTTCGTTAATGTTTAATGGGTTGAATTGTTGTAAGTGGTGAAATATACGCTATTCACTTTTTCTTGTCAGCTGAATTATATTATATACAGAAAGGTTTATTGAAATACCCATTACTCGCAAAACGCTTTTAATTTAATTATATCAAAGGTAAAAAAAAATTATAACTATGACATTATTGAAAATTTCACAATGTTTTGCACTTTGGAGAGTACATGTTAATATGCGTTGGCTGATTTATGATAACTGCGATGTAATAATGGTAGAAGTTTACCTGAATATGATGTTTAAGTAGAGTGAACACATTGCCACAATTTTTGACAGTTTTATCCCTGGAAGCATAAAAATTTTTGACATGAATTTTTGATAGTTTTATCCATGGAAGAATAAAATTATTTGACATAGTACAATGTCAAAGTTAAACTGTAAGAATCAGTAAAGTCAACTTGAGAAAAAATATATCTGTATTCCTTACAAGTTAAGATGTTTTAATACTTTAACGTTGCTTGTGGTCTAATGGTGCCAACGGATTTGCGATTAAAATACATTTTCAGTTGGCACCCATAAGGTTATTGTTGTGTGTATATATTTGGCCCTATAATAGTTTTCAATTTAATAATTAAGGTATTTTCATCATCAACCTTGGCAAGACATGGGAAAAGCTTTACCTTGCTGCAAGGGTTATCGTTGCTATTGAGAATCCTCAAGATATTATTGTTCAGTCTGCAAGGCCATATGGTCAGAGAGCTGTTTTGAAGTTTGCCCAGTACACTGGTGCTCATCCTATTGCTAGGAGACACACTCCTGGTACTTTCACCAATCAACTCCATACTTCCTTTTGTAAGCCTCGCCTACTTATTCTCACTGACCCTAGAACCGATCATCAGGTCATTTTCCCTATTACTCAATACTTATGTTAAAATGGCATCCTTGTATCCTTCTTGCTTGTTAATGACATAATTTGTTAACACTGGAAAGGCCTCGTTGGATTTCAAGAAAATTACTTTAGACCTGCACATAATGAAATAACTTCAATTTATACATACATACATACATATATATATATATATAATAATGATTATTATTTTAACAAAAGGGAATACAAATTGTTGCAGCCAATCAAAGAAGCAGCTCTTGGAAATATTCCAACCATTGCTTTCTATGATATTGATTCACCAATGAGGCATGTTGATATTGGCATTCCAGCGAACAACAAAGGCAAGCGCAGTATTAGATGCCTTTTCTGGTTGTTGGCTAGAATGGTTCTTCAGACGCGAGGAACTATTGCTCCTGGACACAAATGGTATTAATATAAATTTAATATTAAGAAAATATCTACTTAGTTATATTATGTGCTCTTGTTAAAAAAAATATGAACCAATATCAAGGTACACAAAAGAGCTACCAGTAATGGTGCAATAATTCCTTATTCTAATAGCTCAGGATATCTCATAATTATTGCTAATTAATATAATTTGCGAGCTACCAGTATGGTGGCACTAATTCCTTATTCTATTAGCTCAGGATATCTCATAATTTTTGCTAATTAATATAATTTGCACGTGACAATGACTACTATTATACAATGAATAGTCCTAGTTAATATTACTATGTTGCCATTAATATGCTTGACTGTAGATTAGATGGAGAAGTATCATATGCCGCATCTTTGTACATTAATGTGATCCCAATAGTCTAAGGACAACTTGTACTAAAATCATTTACTTAATGAATGTATAATAGTAGATACTACTATACTCTGATATTTAGAGGAGACATTGCATTTATGATCACAGAAACCAACAGTTTCTAGATCTTCACGATTAGCCTTTGATTTTTGCAACTCTGTTTTAGTCAATATATAAAATAATGGGCGCATTTTTGCCAATTTTAATTGTTTATTAGAGGAACTTATCTCGTCAAAACTTGTTGGTTCCATAATGTATTGATACTCTCATTTCTGTGGAGGAGTACCATGCTCTTTCACTGAAGGGGAGTGTGAGTCCCAGTTATTGATGAAATAAATATTAATTGAAATAGTGTATTTTCCACCAATATAAGAGAAATTACGTTATCACACTCCTCATATGAGTGGTAAATTTACAAAGTTTGAGTGAAAATAAAATGCATGGCAACAATAATTGCTATTCATAGATTTTGGTTTTGATTTTTTCATTCGATTCAACCTAGAAATTAGTGTAAGATTCCTTATAGTGTGCGGGAAACATTGCTCAACCGCCTTGCGCTTGAACTATGCTGATGACAACGTGAAAACAGGCCAAGTCGGATTATTTTCCTTTATCAATGCAGATATTCCAGGCAGCCGAGTTGTTATCCGTAGATCTACCAGCACTCGTGGTTGCGACCGTAAATATAAACGCATGATGAACAACAGACAGTCCGCTGCTAGATCCAGAGCTAGAAAACAGGTCTGCTTCATTATATAGCAACACTGTATTTTTTTGATTACTCTCCTCGCTTACTACAAATTAAAAGCAGTAAATATATAATGGTTATTCGTTGAACTGTCCATAAGTGATTTATGTTGAACTTAAACTATGTATTTGTAAAAACAGGCTTATACAAATCAGTTAGAAATGGAAGTTGCAAGACTAGTCGCGGAGAATGATAAACTCAGGATACAATGTGATGAGGTAACTAACGTAGAATAGTATAACGTCCTCTTTTCTAAATGCTCATGCTACTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATATGATCATGTTGGATTTCGTTGTTGGTGCAGCTACGTCCAAAAGTGGATGCCCATGTCTCCAAAGAAAAGAAGCTTCAAAGAACCTTAACAGCTCCATTTTGATCTATCAAAATTTACGATTACTGATGTTGCAACGCTTGGTGCGTATTTTGAGAAGCAAGGTGGACCCTCTCGGTATGTGTAGCATGCTACAATGTTGTTTTAAACAATATGCTTATTGTTTGCTGTGTTGTTATAGAATGATTGTAGGAAGCAACGTTATTGCTATGGTTCCTGTAGGAATTTGATGTGTATCTATCGTGGTATGATTTAAAGTTGAAGAAAGCAGTAATTCTGATGAGTTTGTGACTAAAAAATGTGCAGCTCCAGTGGCAGCTGAGTGGGATGCAGTAGTACCTCCAGCAGAAGGCGTTGCTCCTGCAGCCACTGGATGGGAATGAAGCTTCGATTACTGATATGCTGCATGTATTCAAATATTTAATGGAGTTTTTGTTTGTCGTTTAATGCAGTTTAGAAGCAGGTGACGAATGTGGATGTATTGGCAATGGGAGTTGTATAGGGAGTGGTGCTAAGGAGTGCAGTTTTGTATAGGAAGCAGTTTTGACAGTGAGGATGGGTTGCCATGGTTCTGGTTGCGTGTTGAAATGGTGAGATGGTGGTTGCTTTGTGTAGTGGAATAAAGTGATGCAGAGCGATGGGTTGTTGTATTAGTCGTTTTGGTTGAGTGTGCAGTGGGGATTGGGAGGGAGCGATATGTTGTTTTGGTGACTACTGTAGTGATGGTATTGCTGCGTTTGGATGGTGGAAGTGCTGTAGGGAATTAAGTTGAAGGGGAATGAACAGTGGTTTGTGCTGTGACCAGGGAAGGAATTAGGTGGAGATTATGGGTTCAGAATGGAGATTATGGGTTCAGAATGGAAATTATGGATGATTTATGAGGATTGCTTTAAGCAGGTGGGTTGCTTTGTGAATGGCAAAATGTGACAGTGAGGAAGGATTTTTGAGTATGCGGAGGAGCAGTTGATGAATGAAGTGCAGATGTTTTTGACAATAGTGTTTGGCAGAGAAGTGGTTTAGTGGTTGTAGGCGTATAGCAGCAGTAAATGGATATGAAGAAGTATGGGACTGTTGATGTTCGTTGTGGTCAGTTGAAGAAGTTGTGGTCGTTGTAGAAGTAATGGGCAGTGGATGGTAGGCACGTAAATGATGTTTCTGGGTAGGTAGGGGTAGTGAGATGGTTTGCATTGCACAGTTTTGTTGGTGGTGGATGGTAGTTGAAAGAGAACCGTCATTTCATAATTTCAAACATGTGAAAATCTTCCATTCATATTTTGTACAAAAGATCTGAATTATGCTGCAAAAATGAATGTATGAACCATTATTTTGTATAGATTATTAACACTTTAATTGATATATGTTTATTTTGGTATAATGTTATTCAGTTTGTATTTGCC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020262433.1	1.1e-14	protein FD
Swissprot	Q7PCC6.1	5.1e-14	Protein FD PARALOG
trEMBL	A0A5B6UI23	1.9e-13	Protein FD-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G17770.2	57.69	1e-17	85.1	ATBZIP27;BZIP27;FDP	basic region/leucine zipper motif 27

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G06174	AT2G17770.2	78	32	1	51	128	119	195	57.69	1e-17	85.1
AfisC1G06174	AT4G35900.1	135	61	3	15	128	151	285	39.26	4e-17	83.2
AfisC1G06174	AT3G56850.1	95	50	2	36	128	204	297	44.21	7e-14	72.4

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	59	111	51.6	6.9e-14

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000976	F	transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0010255	P	glucose mediated signaling pathway
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0043621	F	protein self-association
GO:2000028	P	regulation of photoperiodism, flowering

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network