result

Gene information

Detail information of AfisC1G06285

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G06285	chr1	1139947264	1139972364	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G06285
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020240778.1	2.6e-79	transcription factor MYB39-like
Swissprot	Q9S9Z2.1	2.5e-50	Myb-related protein 93
trEMBL	A0A8B8J2V0	5.5e-63	transcription factor MYB92-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G16770.1	66.45	2e-55	213	AtMYB9;MYB9	myb domain protein 9

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa
Allium fistulosum	AfisC1G06285
Allium sativum	Asa7G03225.1; Asa7G04688.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	2	36	30.3	3.1e-07
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	42	86	55.3	4.9e-15

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09422	MYBP; transcription factor MYB, plant	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network