result

Gene information

Detail information of AfisC1G06390

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G06390	chr1	1157700451	1157716035	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G06390
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_026664948.1	1.5e-78	receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK1 isoform X2
Swissprot	Q8H1D6.1	3.3e-70	Protein ROP BINDING PROTEIN KINASES 1
trEMBL	A0A8T3B963	6.5e-79	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G65530.1	65.53	8e-76	281		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G06390	AT5G65530.1	206	68	2	3	206	147	351	65.53	8e-76	281
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AfisC1G06390	AT5G35960.1	208	82	1	2	209	136	342	60.10	4e-71	265

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	3	203	134.3	4.2e-39

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
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GO:0005983	P	starch catabolic process
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GO:0048229	P	gametophyte development
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GO:0071369	P	cellular response to ethylene stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network