result

Gene information

Detail information of AfisC1G07209

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G07209	chr1	1309592436	1309619674	+

Sequences

CDS

>AfisC1G07209
ATGCATACGCCTGATAGGAGAAAGATCGGAACCTCGCAAAGATCAGGTTTTGAGGGTTCTCCAACCTATTGTTTCATCAATGATTTGTCTCTGATCCAACAAGTAGAGCCTAAAGACGACGAGTGTATGTTTCAATCTCCGAGTTTTGCATCTGTAGAATCAGATTTCTCTTCACAAGAGGCACCTGTAATCTCCAGAGGACATTCAATTTCACTGCACCACGATGTTTGTCCTGAAGATTTTCATGGAAGTAGCCATATTGCTCAAGAGAGAAACAAAGAAATATGTTCTTTCGACAAATCTATTATGGAGTGTCTTGACTCACCTGCTGAATTAGCTGAACCCGTGCAATTCAAACATAATAAAGAAATTATTTCTAGCCTGGAAGATGACCATAACATAGTCAGTGATGCCATCCAGACTCTGGTTGAAGTTCAGAATGAACATTATCAGGCCACACCAAATAAGGAAGAAGAGAGTCCAGATTTGAGGAACAGAGTAAAACATTTGGATAAGGAAGAAGACAGAGGTAGGTTTTGGGAATGTGATGTGATGATGCCGCTGCAGACTCCTAGTCCTTTTGTATATAATATTATACTCGAAAAACATGCCATAAACCACACTTCACAAACGGAACATCATTATAATGAAGCAGGAAAACCCAATATTGGCATATCCGCAGACTGCAAGGCTTCCAAAGATACTCAAGTTGATACCCAGCATCATAGCAAAAGAAGGCGGTGCTCGACTGTTCAGAATAAAGCTAATAGAAGTATCATCAATACCAGATCTATTAATCAGCAGCAAGGAAACATCTTACCACCACACATGGCATCTTGTATTGGGATGCTTTCAAATACTCCAGCAATTATCCAAGATTTAATGTTAACTGATCCATTTTGTTCAATAATAGCTGGAAATGCTTCTTTTAGTAAGCTGTTCATCGCTACACAAGATAAACTTCCCATTGGCGCTGAAGCTCAAAATACTAATACTAGTATTTTTAAAGAACCTGAATGTGGCTCTAACAAAAAATTGAGACAGTTGATGAAAGCAAATAGTGATAAAAGTGGAGGTTGCAAGATATGTAAATGTATAAGGTCTTCATGTTTAAAACTTTATTGTGAGTGCTTTGCTGCTAGAATCTATTGCACAGGGAATTGCTCATGTCAAAATTGTTTTAACATTCCCATACATCAAGAAAGAGTTGTGGCTGCTCGCAAACAGATAACCTCTCGAAATCCTCTTGCATTTGCCCCAAAAATCGTTTCAGATTCAGAACTTACATGCAATATGATGATGGAAGAGGACCAAAACACTCCTGCTTCAAGCAGACATAAAAATGGATGCAACTGCAAGAAGTCAACTTGTCAAAAAAACTATTGTGAATGTTATCAGGGTGGTGTTGCATGCTCTCAACTCTGTAGATGCAATGGGTGTAAGAACAAATTTGGAACAAAAAATGGAGAGAAAATTGCTGCTAAATCTTTGAGTGATGACAATGTACTAAAGGACAAACGAAATGTCATTATCAAAGAGTTTGAAGATGGATCCTTAAGGAACTCTATACCGTTGACACCATCTCTTGAAAGAAGCAGAGGCATCATCAGCCCGGAATATGTTACAAGCAGGGCACAACCATGTTCTTCAACTCATCCGCTTACACTAAACAAGCATAAATTACCAATGATGTCAAATATTGGTGAGCAATTTTATGTCAACAAGGAGAACATTTGTATGCCATTGGGGGAGAATATTTCAAGCACGACGCTACCTATACAATCAACTACTGCAGAGCGATTTGACTCCTGCAAGGATAACAATATTATAACCTCGAAGGAGAATATTTATGCTGTAGAGGTTATGGATTATGATATCTTCTCCAAAACGGAACCAAATTCTCATGAAAAGGAAAATGTTGATGATGTTTATTATGGCGAGTCTTCTTCTATGCATGTGGTGAATATTACATCTCCAAATGGAAAGTGGGTATCACATTCATCTAGTTCTATTCACTTGTCCCAGAGTGTAGTGAGTAGTAGGCCTACATTGGAAGTAGTAGATACTCTTCCAGTTCAACCATCCCTCAACTATGACTTGACAAATGATGACACAATGCACCTTTCAAGCCGTTCTTTCAGGTTAATGTGTTTTGTGACTTTTGTCAAGCAAACTTTTGTTCGTCATCAGGAAAGATATGAAGCGGAGCAAGCTCGAGTAGCGCAGTATACTGGTCGTGAGTTGACCTTGAATCGTATATGGGATGCTCTGATTGATCCTTCTCCGCGAAATAGGCGTTACACTTACGGAAATCATGAGACGGCTTATAGGAGATCCCAGGCAGAGGAGGAGATAGCTCAGCTGAAACAGCAGATGACAGAGTTCAATGATTGA

Protein

Gene

>AfisC1G07209
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
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Swissprot	F4JIF5.1	2.4e-45	Protein TSO1-like 2
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Best hit in Arabidopsis

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>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

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Gene Ontology

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GO:0010008	C	endosome membrane
GO:0010082	P	regulation of root meristem growth
GO:0030317	P	sperm motility
GO:0030849	C	autosome
GO:0031523	C	Myb complex
GO:0048477	P	oogenesis
GO:0070176	C	DRM complex

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K21776	LIN54; protein lin-54	EC:-	Cellular senescence	ko04218

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network