result

Gene information

Detail information of AfisC1G07469

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G07469	chr1	1351102800	1351115672	+

Sequences

CDS

>AfisC1G07469
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Protein

Gene

>AfisC1G07469
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020250486.1	1.1e-263	CDPK-related kinase 1-like
Swissprot	O80673.1	1.6e-243	Calmodulin-binding protein kinase 3
trEMBL	A0A1R3L617	7.9e-264	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G41140.1	74.33	0.0	896	ATCBK3;ATCRK1;CRK1	CDPK-related kinase 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC1G07469	AT2G41140.1	596	131	5	1	595	1	575	74.33	896
AfisC1G07469	AT3G56760.1	597	132	5	1	595	1	576	74.04	893
AfisC1G07469	AT3G50530.1	552	140	3	50	593	48	598	73.01	842

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	143	405	235.9	4.5e-70

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0051015	F	actin filament binding
GO:0006952	P	defense response
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GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004702	F	receptor signaling protein serine/threonine kinase activity
GO:0004723	F	calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
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GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0005885	C	Arp2/3 protein complex
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009825	P	multidimensional cell growth
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010090	P	trichome morphogenesis
GO:0010150	P	leaf senescence
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GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019903	F	protein phosphatase binding
GO:0034314	P	Arp2/3 complex-mediated actin nucleation
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13412	CPK; calcium-dependent protein kinase	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network