result

Gene information

Detail information of AfisC1G07885

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G07885	chr1	1432950922	1432960358	-

Sequences

CDS

>AfisC1G07885
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Protein

Gene

>AfisC1G07885
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020246311.1	9.5e-149	probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
Swissprot	Q3EDL4.2	1.9e-141	Probable serine/threonine-protein kinase At1g01540
trEMBL	A0A5P1FQD5	6.8e-149	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G01540.2	76.82	3e-144	508		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G07885	AT1G01540.2	302	70	0	44	345	131	432	76.82	3e-144	508
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AfisC1G07885	AT4G01330.1	304	73	0	42	345	137	440	75.99	5e-142	501

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	69	336	156.2	9.1e-46

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0016021	C	integral component of membrane
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
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GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
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GO:0010068	P	protoderm histogenesis
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GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048364	P	root development
GO:0048367	P	shoot system development
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network