result

Gene information

Detail information of AfisC1G08036

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G08036	chr1	1464523395	1464534692	-

Sequences

CDS

>AfisC1G08036
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Protein

Gene

>AfisC1G08036
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020261404.1	0.0e+00	ethylene receptor 2-like
Swissprot	Q7XX84.1	1.9e-236	OsPK1
trEMBL	A0A6I9S474	5.5e-294	Ethylene receptor

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G04580.1	52.39	0.0	712	EIN4	Signal transduction histidine kinase, hybrid-type, ethylene sensor

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC1G08036	AT3G04580.2	752	333	13	23	759	21	762	52.39	712
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01590.23	GAF	Domain	183	333	42.2	1e-10
PF00512.22	HisKA	Domain	370	431	30.2	3.2e-07
PF00072.21	Response_reg	Domain	638	753	49.2	4.4e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0001944	P	vasculature development
GO:0002237	P	response to molecule of bacterial origin
GO:0042742	P	defense response to bacterium
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0004673	F	protein histidine kinase activity
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GO:0005789	C	endoplasmic reticulum membrane
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GO:0009739	P	response to gibberellin
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GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0038199	F	ethylene receptor activity
GO:0043167	F	ion binding
GO:0050665	P	hydrogen peroxide biosynthetic process
GO:0051301	P	cell division
GO:0051740	F	ethylene binding
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GO:0071281	P	cellular response to iron ion
GO:1900140	P	regulation of seedling development
GO:2000904	P	regulation of starch metabolic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14509	ETR, ERS; ethylene receptor	EC:2.7.13.-	MAPK signaling pathway - plant	ko04016
K14509	ETR, ERS; ethylene receptor	EC:2.7.13.-	Plant hormone signal transduction	ko04075

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network