result

Gene information

Detail information of AfisC1G08965

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G08965	chr1	1652343774	1652352301	-

Sequences

CDS

>AfisC1G08965
ATGGAGTGGCATCAAAGTGCTGAAATTCAAAATTCAAATAGCGATGTTATACCTTTAGATGTTAAACCACTGAAAACGTTAGCGCCAATGTTTCCATCAGCCACTGGCGTTACTGCATTTTCCATTACCGATGATGATCCATTTGTTTATGTTAGCACTACAAGAACTTCACTGCCTTCTAGTGACTCACCACCACCCAAGCCTGCATTTTCATCATTTACAACTCCATCTAAATCACCTAAAATTTTGTATGAAGACAGTGATAAGAAGGATGAGGTAGTTTTGCTCAGTAATCATACGTCATCTTCTGGTAGAAAAATTAAATCAGTGGCTGAGCCTGGGTCTGAGTCTAGGTCAGTCACCGATGTCAAAATTATCCGTCAACCAAAGCCAATAAGAAAGAAAGTTAAGGTAGAAAATCATAACAGCATGGCTCTAATACCTTCACTTAGTGACCCTAAAGAAGCGGTAGATGTCGTTCTTATGACTTATGATGCAGTGCGGCGAAAGCTAGTACAATTAGAAGATGGGCAGGATGTGAAAAAGTCACAACCGAATTTAAAAGCGGGTAACATTTTGATGAGCAATAACATAAAGGCCAACGTGGAAAAAAGAATAGGTGCGGTTACCGGTGTTGAAATCGGAGATATATTTTACTTTAGAGTGGAACTTTGTTTGGTTGGAGTGCACGCTCCAATCATGGGTGGGATAGATTACATGACTAGTAGTTTTGAAGACGGTGACGATACAGTTGCGATTAGTGTTGTTTTATCTGGCGGTTATGAGAATGAAGACAACGGTGTAAATTCATTGATTTACACTGGGCATGGAGACCAGCATTTGGATCAGAAACTTGAAAAGGGTAATCTTGCAATGGAAAGAAGCTTGTGTAGAGGCATATTGGTTAGAGTCATACGTAGCGCGCAAGGTAATAGTGTTTCCAGTGGAAAAATCTACTACTATGATGGTCTATATAAAATTGAAAAGTCATGGGTTGAAAAGGGAAGGATGGGATACAATGTTTTCAAGTTCAAACTTGTGAGGCAACCGAATCAACCCCATGGACTTGCAATATGGAAAATGACACAACAATGGAAGGATAACCCTAAAACTAGAGGTAAGGTTATTTCAAGTGACTTATCATCGGGTGTTGAGAATGTACCCGTTTGCTTAGTTAATGAAATCGATGATGAGAAGGGGCCCAAACAGTTCAAATACAGCAACAAAGTTGAGTATTTGTTCTCTCTTGATTCGATGAAGACTTTGGAGATTTGTCAATGCCTAAGTGTTTGTCTCCCTGGCGATGTTGATTGCATATGTGCGGAGAAAAACGGTGGGCACTTGCCTTATAGTTCTTCCGGCACTCTTGTGAGTAGAAAACCAGTCATCTATGAATGCAATGCTTCATGTTGCTGTTCTACAAGTTGTAGGAATCGAGCTACTCAAAAAGGTATTAAACTGCAATTTGAGGTTTTTAAAACACAAGATAGGGGATGGGGACTTCGATCTTGGGACCCAATTAGAGTGGGTACTTTTTTATGTGAGTACACTGGTGAAGTCATTCAAAATGTAAATTTAGACAACGAAACTGGTGAAGACAACGAGTATATATTCAAAGCAGTAGGCATGGGTGAAAAAGCATTTAAATGGAATTATGGGCCTGAATTAATTGGAGAACCAAGCACCGACCATTCAAATGAGACCCTTGGGTCGTTACCTATCATTATTAGTGCTAAGAATATGGGTAATATATCTCGTTTTATGAATCATAGCTGCTCACCTAATGTGTTTTGGCAGCCTGTGTTGTATGATCATGGAGATGAAAGGTATCCACATATTATGTTCTTCGCCATGAAGCATATTCCTCCTATGACTGAGCTGACCTATGATTATGGAATGAGTGGTGGGGATGGGTCTCACAAGATGAAGAAGTGTTTATGTGCATCGTCGAAATGTCGGGGATTTTTTGGTTAA

Protein

Gene

>AfisC1G08965
GAAAAATCCCATAGCGTATCACCAGTGTATCTATCTGTCTCTTGCACAGAGTAAATTAAAATTAAAATCAAAATTAATGAGTAAGATGTCAATCTGATTTCCGGCTAATCCCAGTTTTAAGAGAGTAAACCATAGCTATTTTTGCCTCTAATTTTATTATTATTCCAGTAACTTCTGTTTTCCATGATCCTTTTTTCCACTATAAATCCATGGTGGATTATCCTTGAATTTGAGCTGAAACCATTCAAATCCTACTGAGAAAGATTAGATTTTTGGAAGAACCATCTGCTCAGAATCTCAACTCAGGTAATTTTCACTGTTTTTGCCGTTCCTTCATCTTTTTAAGCTAGTTTACTTTTAACAATGTAAGGTTTGACTTATTCAGCTCCCGGAAGCTTTGATTTTTATGTCTGGTAATGTGGCAAAACATTTTTTTATTTCAGACCTATTTGCAGTATATTGCAATGGAGTGGCATCAAAGTGCTGAAATTCAAAATTCAAATAGCGATGTTATACCTTTAGATGTTAAACCACTGAAAACGTTAGCGCCAATGTTTCCATCAGCCACTGGCGTTACTGCATTTTCCATTACCGATGATGATCCATTTGTTTATGTTAGCACTACAAGAACTTCACTGCCTTCTAGTGACTCACCACCACCCAAGCCTGCATTTTCATCATTTACAACTCCATCTAAATCACCTAAAATTTTGTATGAAGACAGTGATAAGAAGGATGAGGTAGTTTTGCTCAGTAATCATACGTCATCTTCTGGTAGAAAAATTAAATCAGTGGCTGAGCCTGGGTCTGAGTCTAGGTCAGTCACCGATGTCAAAATTATCCGTCAACCAAAGCCAATAAGAAAGAAAGTTAAGGTAGAAAATCATAACAGCATGGCTCTAATACCTTCACTTAGTGACCCTAAAGAAGCGGTAGATGTCGTTCTTATGACTTATGATGCAGTGCGGCGAAAGCTAGTACAATTAGAAGATGGGCAGGATGTGAAAAAGTCACAACCGAATTTAAAAGCGGGTAACATTTTGATGAGCAATAACATAAAGGCCAACGTGGAAAAAAGAATAGGTGCGGTTACCGGTGTTGAAATCGGAGATATATTTTACTTTAGAGTGGAACTTTGTTTGGTTGGAGTGCACGCTCCAATCATGGGTGGGATAGATTACATGACTAGTAGTTTTGAAGACGGTGACGATACAGTTGCGATTAGTGTTGTTTTATCTGGCGGTTATGAGAATGAAGACAACGGTGTAAATTCATTGATTTACACTGGGCATGGAGACCAGCATTTGGATCAGAAACTTGAAAAGGGTAATCTTGCAATGGAAAGAAGCTTGTGTAGAGGCATATTGGTTAGAGTCATACGTAGCGCGCAAGGTAATAGTGTTTCCAGTGGAAAAATCTACTACTATGATGGTCTATATAAAATTGAAAAGTCATGGGTTGAAAAGGGAAGGATGGGATACAATGTTTTCAAGTTCAAACTTGTGAGGCAACCGAATCAACCCCATGGACTTGCAATATGGAAAATGACACAACAATGGAAGGATAACCCTAAAACTAGAGGTAAGGTTATTTCAAGTGACTTATCATCGGGTGTTGAGAATGTACCCGTTTGCTTAGTTAATGAAATCGATGATGAGAAGGGGCCCAAACAGTTCAAATACAGCAACAAAGTTGAGTATTTGTTCTCTCTTGATTCGATGAAGACTTTGGAGATTTGTCAATGCCTAAGTGTTTGTCTCCCTGGCGATGTTGATTGCATATGTGCGGAGAAAAACGGTGGGCACTTGCCTTATAGTTCTTCCGGCACTCTTGTGAGTAGAAAACCAGTCATCTATGAATGCAATGCTTCATGTTGCTGTTCTACAAGTTGTAGGAATCGAGCTACTCAAAAAGGTATTAAACTGCAATTTGAGGTTTTTAAAACACAAGATAGGGGATGGGGACTTCGATCTTGGGACCCAATTAGAGTGGGTACTTTTTTATGTGAGTACACTGGTGAAGTCATTCAAAATGTAAATTTAGACAACGAAACTGGTGAAGACAACGAGTATATATTCAAAGCAGTAGGCATGGGTGAAAAAGCATTTAAATGGAATTATGGGCCTGAATTAATTGGAGAACCAAGCACCGACCATTCAAATGAGACCCTTGGGTCGTTACCTATCATTATTAGTGCTAAGAATATGGGTAATATATCTCGTTTTATGAATCATAGCTGCTCACCTAATGTGTTTTGGCAGCCTGTGTTGTATGATCATGGAGATGAAAGGTATCCACATATTATGTTCTTCGCCATGAAGCATATTCCTCCTATGACTGAGCTGACCTATGATTATGGAATGAGTGGTGGGGATGGGTCTCACAAGATGAAGAAGTGTTTATGTGCATCGTCGAAATGTCGGGGATTTTTTGGTTAATCTTTCAGCATGTGAAAGGTCAGTGTATTTTCATCCTACCAGTTAAATTTTCATGTATCACTTAATATGTTATAATTTATAAACAGTCATACCTCAAAGGCATAGTCCTCCTTTTGTTCTCAGCTTTATTACCCAGCAGATGACTGCATTATTACCCATTGTTTACTTTCTACTTGAGCCATTGCATGTCTAATTCCTTATTGTTTACTGCTTGAAATACCAATGTATATCTTTTACAACAAAGAATAGAGGCATTTATTTTCAATAACATCAATAAATTATTTCACTGTGGATGATTACTGAGTAGAACTTGTTTCAATTTTAATTCACATCTATAAATTCCTAATCATCAACTCTTTTAGGCTAGTATTGTCTTATAGTACATTAAAACTTTAAATCTGGGATTTCAGTCATGTTTGTTTTGAGATTTTTACATATGAAATTTGTAATGGATGAAATCTTTTACAAGGTGAGTAGATGAGTGTATTTTGTGTGTACCTCTCGGATAATCTTGAGACTAACTTGGGATAACTTATGAGGACATTGTTTTATAATACTGCAAATGATAGCCAAATTCATCACTGTAACATAGTAATAATTCTTTAAAACAAGTCATGAAGCTCGTACTCTTTATTGTAGCCAATAAGTCCGTTTATATAGGTTATATCTTACAGGTCAGAAACTTGTAGGATAATTTAATAAGAACATTTTCGAAGATAGTTTAATATTACTATACATTTGTTAAATTAAATAAAGATAGAAAAATATATCTTTTATTTTTCATTATCAAATTTCAGGAATAGATATAAATTAAAATCCACACATTATCCACTTTAACCTTTTCATTTATTAAATTACATAATAATTTTAAAAAAAATTCGAACTTCTAATTTTTTTTTTTACTTCCTTTCATATTTTGGGGAATTGTTCGTAGTCTTTTTTTTTATGCATTTGATCTATATTTCAAGAACATATTATTCTTTATATTTTTAATATTGAACTAAAATTGAGAATATTTAAACAACAATCTCCTGGTCATCTTATTGTTATTGAACTAAAAATTCATAAGACAACCACCATTATCATAAGTTTCTTACTTCTTAGTATCAAATTAAAATTAAAAAATGGGAATAGTTTAACTAAGACTTTTCACGTAATTTGTATTTTAAATAAACAATAACATCCAGGAACAATGGTGTGACATTTAAAAATAAATAATGAGGATGTGGCATTCTAACTTTTATATATTTCTAATTCCTTATGCTCTCTTTAATTATTATTTTACACATACTGCTCCACTTTAACTTTTATTCTCATCTTTCCTTTTATTATATTTTATAATACAACATTTCACATAGGAATTTTAACTTTTGTTTATTTTTATATGTTTTGGAACAAATGATCTTTTAATAAATTTATCTTTTTTAAAAATTCAATTTATATTTGAAGAGTAGTTCTTTTAATTGATTTTTAATATCCGATTGAAGTTAAATTTATTGAACACCTAATTTTCAGCCATCCTGCTGTTATAATATAAAGTGGGCATGGTACAACCATTTTTTGTCGTAACTTTCTATTATCAATTTAAAACAAAACGTTATTTAAATAACAATTTCTTGTAACCTTGATTTGATATGCATAATTCGATATGAATAAACTCATTTATAAATAATTTTTGGGGTTATTTTCTTGAGGCATACTTATATCATTTATTTTTTCCCCAATCACTATTATACAAAATCAATAAATGGATTTGTAAATACAATTTGATGTAGTTTATCTTATTGTCATACATTCAAGTTATGTGAACATCAAAACACCAAATGTCTTCAAAATATTCAATTTCTTACTATATTAATATATAAGTCGTGTGTAAAGATGGATCGTGGAGTAGTTCGTACGTAATATCAATATTATTTTCATTTTATGAATTGGAATAAATTTGCTTTTTTATTTAAATGGTTAGTTATTGTAAATACATAATACTATGTATTGGATATTAGGTTATCCTTCGAATTTTTACGAAATTAGGTTAGGATTTTACTATTCATAATCTTTTTGAAAAATGGTTCAATTACGGACCAAGATTTTTAAGTTAAAAATTAATACAGATGGAGATCAATTTGATCAAAATTTGGTCCATTGACTAGTATAGTTCTATGGTTAGGTAGTATGGTTGAAGTTCAATTGTAGATTTGTCACATGATTGTGGTTTTAGTTCAATTTGCATAATTTAAACATAATATTCCCTCTCTTCATAGTTATTAATGGCGCGCATTGGAAAAAAGCACAAAGGCTCTCTAAAGCCTTGGTGCACGACGTAGCAAATGGCGCACATCTTTTATTTACTATGCATATTTAGAATTTTTTTTCCCAAAATTTCATACATATAACGATTAATTTCAAAAGTTCAATTTAATTTGTATTTTTTTACTAGCACGTATATAACAAAGATTTGTTTGGACATTTTGCAAAACACATCATCAATTATAATATCATAAGCATATAATTTCAAGCATTATAGTCTTCAAAAGCCAAAATCCAAGATAATAATACATATTA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020240987.1	1.2e-239	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH3-like
Swissprot	Q9FF80.1	5.8e-146	Suppressor of variegation 3-9 homolog protein 1
trEMBL	A0A5P1FN48	1.7e-235	Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G73100.1	43.68	1e-149	527	SDG19;SUVH3	SU(VAR)3-9 homolog 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G08965	AT1G73100.1	673	324	14	17	657	20	669	43.68	1e-149	527
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02182.14	SAD_SRA	Domain	206	352	141.1	1.9e-41
PF05033.13	Pre-SET	Family	381	479	58.3	8.4e-16
PF00856.25	SET	Family	498	632	73.1	3e-20

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0005720	C	nuclear heterochromatin
GO:0006342	P	chromatin silencing
GO:0008361	P	regulation of cell size
GO:0009294	P	DNA mediated transformation
GO:0010033	P	response to organic substance
GO:0018024	F	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0033554	P	cellular response to stress
GO:0034968	P	histone lysine methylation
GO:0048366	P	leaf development
GO:0080188	P	RNA-directed DNA methylation
GO:1901698	P	response to nitrogen compound

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Lysine degradation	ko00310
K11420	EHMT; [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT	EC:2.1.1.355	Longevity regulating pathway	ko04211

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network