result

Gene information

Detail information of AfisC1G09033

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G09033	chr1	1665308006	1665319850	+

Sequences

CDS

Protein

>AfisC1G09033
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Gene

>AfisC1G09033
ATGTCTCCACCACCAAGGGCTAAGCAAGCAATTGCGGCCATGAGTGTTATTGGATTTCCCAGCAAAGTGTGCACACCTGTACTTAAGAGGCTTCTCAAGTTATATGATTGCAACTATGAATTTATCGAAGATAACGGTTATCGAGTGTTAATTGATAGCATACTCGAGGAGCAGAAGAAGGTAGTGCACAATAATATTTTATTATTACCGATTGCATTGCCATATATCTTAATTTGTAATGTTTATTCTCATCTCGATCTTTTGTTTGATCCTAAGCTACCGTGTGAACCATTTACTTGGAGCATATGTATAAATTGAAATGTTGTATTTTTAATAGATGTATTATTTTAATTTACATTATAAATAAATTGTGCCATTTCTGTTTGTTGTTTTTAGTATTTTTTTTAAGGAAAATAAGTTCTTAGTTATTTTTTATAGTACTTATATACTGCTTTACATGTGGATTATTACCTTCTTGAATTGTTTTTGACATGCAACATGGAAATTGCTAATGGATAATGATATGTATTTTAACAGTGAAAATGAATTTTCATTCCAGCTTTACTTTGAAAAGATTTGCATTTTCAAAATTCAGTTTCTTAGCTATAAACCATTGCCACTTTACATCATATTTCCTAGTTCTTGTTGTTTACCTATTTTTGGATTTAAATGATTAAGCAAAATGAAAAGACAAACTCTCATCAATAAGTTATCAGTTGACCATTCATTTTGTTTTAAAAAATATGGTTTTGGTTTTTGGCAAAATTGGCTTCAAAATTGTAATGGAGGGAATAATTTTCTTAGAGTGCTCAAATTTCCTCACCGCCTTAAACTTCTGCAAAATTGTATCCATTTGACTGTAGAGTATTTCACTGTCAAACGCGTTGATACAAAAACCTTGTATAAGTGGGCTGAAAATATATGCCCATGTTTTCGGCAATAAATATGATGCCATTTTACTTCTACTTCACTCTCAGTTGCCTACTATATTATATTTAAGAACATGTCTCTTAACTGTCACTTTGGAAGTTAATTATCCAAAAAAATTGTGTCAGGCTGCGAATGGTAAAAACGAAAATCCTGTGGCTGACGATAACTGCAAACAAAGTAGAAAAAGAGCAGTTAGTTCGCATGAAGTGAGCATTTCACTATCCAAACACAATTGTAAAAAATTTGGTGAGTTTACAACAAAGAAACAAAAGATGGAGTCGGATGTAGATGTTCAGACAAATTATATTGCTGAGTATCCATCTAAGGGAACAAGTGTTGAAGCTGGCAATGAGATACCAATTTCTTTATCAGCCATTCCCCCATGCCAGCAGAATCAGGATGCAAACGATGGTAAATTCTGTGATAAATTGTCAGATGACCATTAAAATGCTACTTGTGACTTTTTTTTTTGCTTGGCTGTTTGCATCTTTCATATTATGTTGATAACAAGACAGTCTGTTTATATATACCTACAACGTAAATATATGGCATCACATCGTCATATTATACTTATACGGTTCAATATTTTTATAACAACCATCTCAGTTGCATTTCTCTCTCTCTTTATTTTCAATTTTTTTAAATAATTTTATTAGGATAACTTGTCAACTCCAAGTTTTAAGTCTCCATTTAGTTATTTGTCTATTATATATATGAGTATACTTTTACCTTTACCATGTCCTAAATCATGTTCTTGTGCTTAATACAGTTTATAACCATCATTTTTGTTAAATTTGTAATATATCCTTAATATAGGCCTTCAACATAATTTAATTCAAGTCAGTTCTTCGTCAAGGAGCAAAACAGTGTTGGAAGCAAATGATAATGCACCACTAGCTACCCAGAGTACAACCCCTCGTTTTGATGTGGTTAGTGAAAAACAGGTTGCTGCAGATACCTCACTTAGGAAAGGAAGGGCATCTGAGTTTGATACTTCCAGGAAAACATCTACTCTTGCTTTTTCAGATGGGGAGGATATTAAACTTCTTCTCAACGTGAATCCTAATGCTCTCATGCCAAGACATGACACAGTTATTAAAGCAACAGAGGAAAAGTACCTTAAATGCTACATGCTTTCAGATCCTGAATTTTCTCTCAAGAAAATTTTGAAAGATATGTGCCAATGTGCATCAGAACTGAGTCCTAAAACTATTAATTCTGAGCAAGAAAATGCAGTTAAGCTTTCATGCGATGAGGGAAGCAAAGATACTCAGGAGAAAGATAAGAACAATGCAGAAGGAAAAGAAATCAAAGAACAAAAGAAGATAAATTGCAGTTCTCAAAGTTTGCAAGTACTTAGAGAGTATATAAAACCTTGGCATTATCAAGATGATATTAGTAAAGGTAAAGAGAGGGTTAAGATATCCTTTGTAAATGAGTATAGCAATGAGGAAACTCCTCCTCCATTTTATTACACACCTAAAAGCATTGTGTATCAGAATGCATTTGTTAATTTCTCATTAGCTAGAGTTGGTGATGAGGATTGTTGCTCTGATTGTTTTGGCGATTGTGTAAGTACACCCATACCTTGTCCGTGTGCACGGGAAACTGGAGGGGAGTTTGCATACAGAACTGATGGCTTGCTAAAACCCTCTTTTCTAGATGGATGCATGTCTATTAATAGCAAGCCACAAAAGCATCGCCATGTGTATTGCCAAGACTGCCCTTTAAAACATTCTACGAAAAGTAATGTTTCAAATAAGTGTAAGGGGCATATTGCTAGAAAATTTATCAAAGAATGTTGGATCAAGTGTGGTTGCAGTAAACAGTGTACAAACCGAGTTGTTCAGCATGGCATAAGTCGAAGACTACAGGTCAGATGATAATATATGACTTCTGAGTGGAGGTCTCTCCTCAAAATACTACTTTATTTAACTTAACTTAACTTAATATAATAAATATATTGATTTAACATGATCTTAGTGCACTTTCTTTAAACCAATTTTCCCAGTGTTATCCAAAAATAGCATGTACTGTGGAATGAGATAGTTTTAAACTAACTAAACCTGGGCAAGAAGTTAGGGAAAGTGTGCAATCTGAATAAACTGTGGTATATGGTACTGAGTGTGAAATATCATTAAATTTGGCTGTTGATACACACATAAATAGTACGTTCTAACCGTTTTCTACCTATATTAGGTTTTCTTTACTCCTGAAGGAAAGGGGTGGGGTCTACGAACATTAGAAGAATTGCCTAGAGGTGCTTTTGTGTGTGAATATGTTGGAGAAATCTTAACAACCATGGAACTACATGGTCGCACTATCCAAAGCATGGTCAATGCTGAACATACATACCCGGTGCTTCTGGATGCTGATTGGGGATCTGAAAGGCAGCTAAAAGATAATGAAGCTTTATGTCTGGATGCCGCAATTTATGGGAATGTTGCTAGGTTTGTGAATCATAGGTAAGTTTCTTATAAATTAAGATTAAAGAAACATGCAACCGTATGTTTGGGTCATCGTCCATTCCCTCTGAAAATCAGTTGATACTTATATTCTGTTTTTACAAGATATATAATATTTGGTTCACACACACACCCCAACTGGACTTACCGAGAAACATTTATACCATATGTTGCACAAGTTGAAATATAACTTAAGAAATTAATTAATTACTTGATTCAAATAAGAAAATCACAAGTACAAACCTTCTATCCTATGTTGTGGACTTAACCTTGCTTATTATTTCCATGCTTCATGTACAATATCTAGTTTGAAATTTTGCACCAGAATTTCTGTAGCTTGCCAGCACTTTTGTTTGATAAGTTATCTTTAATTGTATACTGTCACAATATTTTTGTTTATCTGCAGCCCCAAAATGTCTAGCATTCAAATGAGATCACAAATCCGAATTAAACTATTGCTAGAACTTAATGTACTTTTTCTTTTTGCTAAAATTTTGATATGTAGATGATGTCTTGAGTTTGAATCACAGTTCCAACAAGAAGTTTTTATCTTTTTTATTTGTATACTGTCAATACATTTATCTTTGTTATATTCTTTATATCAATACATACTTTTTAAAACCGTTCATTCTTACGTTTTACATTCACAAAATTCAGTATTCTATATATTTTGCCTTTTGTTTTCAGGTTCGATAATTTTTATTTTTATTTAGCTCAATAATTATTTTATTAACAACTATATGAACATTTGAACTTGAATGTTCATCATAAAAAAATTTCAGTGATATTTTCTTACACGTGCATCACACATGCTGAAGTACTTATATATAACTGTATAGATATTCTATTTTTTGTCTGTAAGACACATCTTTTGTTTGTCTCAAACCAAATCATACGTGAAGAGAGCTGAATTAGATCAACAGATTCCCACACATCTTTATAAAACAATCTTATTTCTTAGAGGTTCAGTAACCGAAATAATAATGTGGAGGATCACTATGTTGTTGGTTGTTTTTGCATTAATACTGAGAACAAATAAGTTACGTAAACTACAGTGATAAAACAAGCGATCAGCATCTTCATTATTGTCGAGGCAAAATAAACAATATTGATTCAAATCCATATTTCCCCTATTTTATATATAGTTGTCAGTTGACATTAATAGAGAGAACTGATAATTGAGTTGAGCAATTTGTCAAATAAGGCACACAGTTTTGAATAATTTTCATATAGGGCACCATTTTCTGAAAGTAGTAACTTGCATGAAGCATGTTATTCTACATCATACTTTCAAGTGCCTACTGTATTGTTCTTGGATGTCTTAGATAATGTTTTTGAAAAGATTATGTTTTAAAACAAAGGCTCTACATACAAATTATATAAGAAACAGTATACCATGCCTAGGCCCTGAAAGCTAAAATTGAAATCCATAATCTAACAAGAAATAAACTTGTTTGAAATAAAGTCCTCCAATCTTGATACAGTTGGCAGGCAGACCTCATTATAATAACTCTTAAGGCAGATGTCATGACCTCATTATTTTGACTTTATGAGCTCTTAGTAGTATTTTGATATTTCACAGGGCAGTGAATGGATTTTTCAAGG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ATTGTTGAGGAAGAAGCTACTCCACTAACCAGAATACATGATGATATTACGGGGTCTTCATCACGTGCAGTACATGATGAAATTCAGGGTACAACTTCAGATCATTTACCATTTTTCGTTGAGTCTAAAACTACTGAACTAAACAAAAGGTGTTCTGAAGTTCCAAAATCAACATCAGATCTGATAATAGCTTCCATTGAAGTGGAACCTAATGAGCAAAACAAAACATGTAACACAAATTCGGGGTTGGCATCTGATATATTACCATCTATTGAAGCTGAAGCCGCAGGACTTGATAAAATGGTTGATGAAGTATCAGATGATTTGCCATCATCTGTTGTTGAAAAAGAACCTGGTGAACAGAAGAGTAAAAGCAGCGATATTTGTGATTCAATGTCAGTTTTAGCATTTAATACACTGACTACAACTACAGCTCCATCTTCCATGCCCGCTGAAGAAACTTCTGAAATATATTCAAATACTGATCCAAGTTTAGCATGTACTGCAAATCTGGGATTAAGAACCGATTATGTACCATTATCTATGGTTGAAGAGGAGCTTAATGAGTCAAATGGAACTAGTATATTGTCATTTGATAGCCCTGTTAGATCACTTATAGAAGCTCGAGAAATCATAGTGTCAAATGAAGCAAATGAAACACATGTGGAAACTCCAGCAGTTACGTTACCTGCAACTGAAAATGAAACAGTTGCAGAAAGTGTAACTATCGGCATGGCTACAGTAGAATCTATCAAACCACATGGATGTTCTACTGAAAATTTAGAACCTGAATCAATACTCTTCAGCAAGGAGAATGAAATCATAGTTTCTGAATCAGTTGTTGATGTAGTACAAGAACGTGTTGGCCCAAGTTCATGTCCTGTGGAAACTGGTGGTGCAAATCCTCTATCTAATAATATTGCATCAGTCTATGAAACTGAAAATACAATAGTTTCGAACACGGCGAAAGCCAGTGCTGAGAATTGCGAAGAATTAGCCGGACAGTCTCCTTTGCCTTCACCCCCATCATCATCAAAAGAGGTCATCGGTTCATCGAACTTACACAGTGGGAATCCGCACACTGAACAACCAGTTATTGTGAATGAAAACTTGAACCTAGGCCATTCTAACGATTCATCTCATCCGTCTATTTTGCATCCATCGCCTCCACTGGAAACTGAAGAAAATAATACAGGTAGCAGTAGTGCTTCGCTTGGTTTTCAAATATTGCCGATAACTTCGATAATTCATCCTCTAACTCTTCATCCCAACCCACTTCAAAATGAACTCACAAGAATACATAAACATATTGAGATGATAACGAAGGCACATGAAGAAAAGAAGTTGAAAATTAAACTAGAATGCGAGCAAGAGTTGGAAAAAGTGTGGAAGAAGTATGATGCAGTTCTCAAGGAAGATGAACGTGGATTCAATAAAGATAGGAAGATCCTCGAGACGATTTATAGAAAATTGGTCATGAACCAAAAATTAGCTGAGCAGTTTGGATGTTGGTTTATGGGTAAGGAAAGGCCGGAGAGTTCAGGTGGTCAGCATGTAGGGCCTACCATGCAGTTTAATGATCATCAAGTGCAGATGACACAGGCAAGTCCCACTGCTCTAGGACCTACCCCACAGTTTCATCATCAAGTGCACATGACAACGACAAGTCCCGCTGCTCCAGGACCTACCCTACAGTTCCGTCATCAAATGCGAATGCCACAGGTGCGTCCTACTGCTGCAGGGCCTGCCCTACGTGCTCAGCCCCCTCATCTACTGCATCGCTCCAGACCTTCATCGACTCTGCCCTCGAGTACTTCATCAACTGTGGTCAGACATGATCCGTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020271978.1	2.2e-163	probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR1 isoform X1
Swissprot	Q8W595.2	1.2e-121	Suppressor of variegation 3-9-related protein 4
trEMBL	A0A5P1EDL7	1.6e-163	SET domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G04380.1	61.01	5e-124	442	SDG31;SUVR4	SET-domain containing protein lysine methyltransferase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G09033	AT3G04380.1	318	122	2	348	665	146	461	61.01	5e-124	442
AfisC1G09033	AT3G04380.2	318	122	2	348	665	119	434	61.01	1e-123	441
AfisC1G09033	AT1G04050.1	476	238	7	208	676	274	733	45.17	2e-117	421

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF10440.6	WIYLD	Domain	6	59	59.5	1.9e-16
PF05033.13	Pre-SET	Family	349	497	48.9	7.4e-13
PF00856.25	SET	Family	517	639	55.7	6.9e-15

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0006260	P	DNA replication
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000790	C	nuclear chromatin
GO:0003682	F	chromatin binding
GO:0003690	F	double-stranded DNA binding
GO:0004519	F	endonuclease activity
GO:0006303	P	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0007154	P	cell communication
GO:0007275	P	multicellular organism development
GO:0008283	P	cell proliferation
GO:0010452	P	histone H3-K36 methylation
GO:0016458	P	gene silencing
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0018024	F	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0018027	P	peptidyl-lysine dimethylation
GO:0022402	P	cell cycle process
GO:0031667	P	response to nutrient levels
GO:0042221	P	response to chemical
GO:0045786	P	negative regulation of cell cycle
GO:0045814	P	negative regulation of gene expression, epigenetic
GO:0048583	P	regulation of response to stimulus
GO:0051054	P	positive regulation of DNA metabolic process
GO:0051128	P	regulation of cellular component organization
GO:0090305	P	nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network