result

Gene information

Detail information of AfisC1G09108

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G09108	chr1	1677058308	1677066185	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC1G09108
ATGGTTGCTTCGCTAAGCTTTGGTGCTTGCATTGGAGTGTTGGCATCCACTGAGTCAATCGCTGGTACTCTAGCTATAACGAACAACTTGGACTCTAATCCTTTTTAAAAATTTGAATCTTGAATCCATGACCTAAATTTTTGGGATGCTTAGACTTTTCTCAGGTTAGAGTTCCTTTCCTAATAAATTTTAATTAGGAATTTTCAGCTTTTGCAGACCATGCTGTTTTTGCTTCTAGTAGTTTTGATCAGCTAACCTAAACTATACGTTTTGTTATTGTTTTAATGACCGAGTTGTGGATGTAAGTGAATGGAGCACAAAACCAACAAAATCTAGTAAGATAAACATGAATATAAACAACAAACATTTGCTCATTATTGTTATGTATAGGAGCACATGGATATTGGATTATTGTCTCCTCTAAATAAACGTAAGTGAATAGGTTCCATACTATATATATTTTTTGGTTCAAATTTTTAGCTTCTTTCAACTTATCAAAACAAATGCATGAGAAGATTTCCTTTCAATATGCTGTAACGACCCAATATTTTGGACCATTCGCATCCATTATAAGTGTATAGGTAGACAAAAGAAAAACATGAAATATAGACATGCGTACCCACTAACCTATTTATAAATAGATTAAACAACACCCTTTATGACAAAACTGGCATACCATACTTCTTTCAAAACCAAGTATACATAGCTAGCTGACATTACTACTCTATAAAATCTAACATATATAACTTTGAATATAACAAAACAAATGTATATAAAAAAATGCTATCTGTACTATCCTATTACAACAAAAAAAATCAGATCGTAGATGAAATCTACATTTAAAAACGAATATACATAAATCATCTAGTACAGCTTATATAATATAACATACCATATTATTTTCTGCAAAATACAATACTTATAAAGATATATATATATAAGTAATATAAACATATAATATCTTTACTTCGGTCATACAAACAAAGAAAATGAAACATTTTAGTACATACAACTTGAAAAACTCGTACATCAATCTGTATATATAAAATAACAGGGAAAATATATAACTGACTTACTATAAATTAAATATATGCGGATATGTATATTTTTCTTAGCAAAGAGACAAAGGAAAGGACAATATATATCACCTCGATATATAAGCGGCTGAGCTCGACTTTGGTGGCTCGGGTGGATGGTCGCACACGGCTGTGCTCGGCGAGAGTTTCTGGGGAGCGGAGGAGGAGAGGAGGAAGACGAGTAGTGGTTCACGGTGGTTGGGGTTTTTGGGTCTGTCTGATGACGTGGAGGGTATGGGATTGGCGTTGGTTTCGGTGGGCAATGGTGTGGGTGAGGCACGGTGGTTGGTAATCGCGTGGAGGGATGGGAGGTGTCAGCTATTGTGGAGGATGATGGAAGGCATAGGCACTGGGTGGTCGGGTTTGGTGAGTGGAGATGCTGGAAAAATATGAGGCGAGGGGTTGAGGCGGAGGAACAAAGTGGGAGAGTGGAGATGGTGGGTTGGAGACTGCAGACGTGTGGGTGGGGAAGATAGCAGGGGAAATTAAATCAAAGGGAGTTTCAAAACAAAAGGGAAAGGACTCGAACGAAGATGAGATAATTAAAATTCAAAAAGAGAAGATGGATATACTCAAATAAGAATATAATTAGGGAGAGGCCAGAACGAAAGTGATTCCGCAAATCAGTTTACCATATATGCTAAGTTTTGCCTAGAACCTCGCTCTGATACCAACTGTAACAATCTGATATTTTGAACTATTCAAGTCAGACATGTGTGGATTATTGTCGATTTGAATGGTCCAAAATAGCGGGTCGTTACATATGCAGAGTATTATATCAGCTTACGGAAAACTTTTAGTTTCCAAAGATGATTTCATGTGGACTTTACCTAAATAAAAGATGATCTAGACGAAATATTAATAGAAGAAAAAAGTTAAGATACGTTGGAGGAACAGAGGTTAGTTTTTCAAAAGAAAATGCTTCTCTTGCTTGTGGTGCTCTAGTAGCACTCAGTGCCTGTAGTGTAGAATTTTTTTATGAAGGTTATAATGTTGTTCATTTGGATGTATTCCTTGTATTCCCTTTCTTTCTTTCTTTTAGAGATCTCCGTTTTTTTATTACTTATTTATATCATGTCCTATTTTGTTTGTTCGGCTTAACTCATGTCCTTGAATCAACAATGTGATAAATTTTGCATTTGTTCCCCTATGATAGGTTTTAACTTAAAAATCATAATTCCTATGTTAATTTACTTTACCAACTTGAAATATACATGTAAAAGAATCAACATGATTAGCTATATACTGTTATGATTTTAGAACAATATACACACCCTTTTGGAACAAATATACACATGATTTTGGAACAAATATATACATGCTTATGAATAAACTTTTGTACGTTAAGATAACGACGATGTCTGTTAAATAACCCTATGTTAGGTTTTAAAGACAATGTGAAGAGAGAACTGATCTCGTGGACTATAATGATTGCTTCCTATGGAATGAATGGGCAAAGAAAAGAAGCAATGGAAGCTTTTAAAGAGATGAAATCTTCTTTCATTTCACTACTGTACCCTTGTAGCCAGTCTTGTTTAGTTGATGAAGGATGGAGATACTTTAATATAATGCAGCGTGAATATAAAATTGAGCCTACTTTAGAGCACTACACTTGAATGATTGTTTTACTTTCATGAGCTGGTTAGTTAAAGATTTGATTATAAGCTGATAACATCGATGCCAGTAAAACAGGATTCCAGCATATGAGGTGTATTTCTTAGTGGTAAATTCATAGGGATGTGAAGCTTGCTGAGAAAGTTGTAGATCATTTATTTAAATTAGAGCCTGAGAATACTAGCAACTTTGTACTGCTTACATGCCTGTATGAAGAATTGGAGAAATAAGAGCCTAACAGGAAAAGGAGAAAATTTCCAACTATGCATAGATAGAGATCATATTTCAGTCAATTTTTTTTAAGTGAAGCTTGAAAAGTAGGATTACAAACACGGTCCCAAACTCAAATTTTCTTAAGGTGACCCATTTGTGTTGCTGCTCTAATGCATGGATGTCACTAAATGCTTTACAGTAATTTTTTTGCAGTGAGTATGATTTTAGTATAAATATAAATATGTTTGGATATAATTGGGTAGAGTAATAATGTATAATGTTATCAGTGTGTTGTGTACAATATGTGTACACTAAACTAGGATGATAACTTTTTTAATGTACTACTTACACTTTGGCCTGAGTTAAGCTCCAAATATGACATCAGGAACATAAAGTCTGAAGAGATGATTGAATTTTGTGTCTATACATTAAGATCGTAAATAAAAATATTTAGTCAAGTAAACAATGGGTATCCTAGAAATATTAGTCATCTTATGCCATAGTAAGTTGCTTGGAAAAAAATAGCAAAGGATGAATGGCTGTTAAAAAGTAACCAACTACCTAAAATACATTGTTTTTTAGTTTTCTATTGTATCTGAATCATTGAATCTTCATTGTATATAGTCCATACCGGCACTATTCAGTGTTAATGATTCCCATGTATGCTATTTATAAACATTAAACATTAATGATTCCATTGCATATATTCATGGAACAAAATATAGGATATATTGTAATGCTTTGGCCATCAGTAGTTACCTTGCACTACATGTAGGGATGTAATTCACATGATCAACATATGCATGATATGGTGAATACATTAGTGTATTATGCATTAGGTATATGATTTATTGACATATATATGAGATACTATGTGTTAAAATGTGCTTTCCATTGTCTAAGACGCCATGATGATCTTTTTGTTGTTATGTGTTTTCCATTGTTTAAGAAGAATCTATTTTTTATAAAGATACCATATGATTATTATAGTGAAATATATGTCAGATTTTTTTTACAAGGTCTTAAGTAACAACAAATCTTATAAACACTATTTTCCATTAATATATTTTGATTAATTGAAACATGTTTGTTATGATTCTAGGACATTAGTCTTAAATATGGTCTATCTATTGGCATAAAAGCTAACTTAGTCATGGAGAGTGCTTACCAAAGCTCATGAAAAATGCAGCGGAATAGAAGTCCTTTCTTTCTTCTAATATTATGCAGCAAGCTGGATTTTCATATTTCCAACGGTGCAAATCCTACTGGTGTTGCTTACTTTCAATGCTTATGTATTATAAGCAATATCCCACTATTTGACATAGGTAACTACTATAAGTAATTAAGTGTTCAGTAGTTTGTCTTTAATTGACATGAATTGGATTTTTAATACTAAAAAATAATTCTTTTTCTTTCTTTCTTTTTTCAGTGTTTACATTAATACATAATCTTGTTGTGCTACATGGATACTGTGTATATCACTGTTAGGATAACTATGCAATGTTAACTTTGAATAATTCTGCATACATCATGGGGCAGTCTAGAAAAAGATAAGTCTTATTGCTACCTATAAGAAATTAACATGGAGTGGATATTTCAGACAATATTTGTTATTCTTTTGTTTTAAGTAAGTAAAGTCTTCTATATAAGAGATAAAATCCTAATCAATCCATCATTCGATGCCCACTTAAGCACATGACATACATGATAGATAGCATAGATTTTTAGGAGATACCAACAAACCTTCAATTCATCCTAAAAGAGGAACTTAGCCGAATACCTTTTTTGAAAAGGCCTGAACTCAAATAAGTGAAACTGAAAATGTACTTTGCGACACAATTGTGCATTGTCAAGTAATATCGTTATTCCTTTTTTTCATAGGTTAGCTTTTAGCATTGTCTCGATCAATTAATATCATATCCACTACTTCAGGTTAGCTATTTCTTCTCACCAACATTTATAGGATGTAGTTAAATCATTTACATGTAGGATATTTGGTATATTAGCACTTCTATATTTATTCAATTTTGAAACAAACATCAGTGTTAAATTAACTCACTACAAGAAAAATGAACCCAACTCCTAGCCTGGTCGCCA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010912431.1	1.2e-11	tubby-like F-box protein 14
Swissprot	Q9FRH7.1	6.3e-13	SKP1-interacting partner 26
trEMBL	A0A8K0MXD8	6.8e-12	Tubby-like F-box protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G76900.1	74.47	2e-15	78.6	AtTLP1;TLP1	tubby like protein 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC1G09108	AT1G76900.2	47	12	129	175	148	194	74.47	2e-15	78.6
AfisC1G09108	AT1G76900.1	47	12	129	175	148	194	74.47	2e-15	78.6
AfisC1G09108	AT1G43640.1	70	34	106	175	123	192	51.43	3e-14	74.7

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01167.15	Tub	Domain	134	175	44.3	1.4e-11

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0016021	C	integral component of membrane
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005576	C	extracellular region
GO:0005829	C	cytosol
GO:0016567	P	protein ubiquitination
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0005929	C	cilium
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008081	F	phosphoric diester hydrolase activity
GO:0009536	C	plastid
GO:0009620	P	response to fungus
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009682	P	induced systemic resistance
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0035091	F	phosphatidylinositol binding
GO:0042542	P	response to hydrogen peroxide
GO:0061512	P	protein localization to cilium
GO:0071470	P	cellular response to osmotic stress

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network