result

Gene information

Detail information of AfisC1G09167

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC1G09167	chr1	1685919052	1685932656	-

Sequences

CDS

>AfisC1G09167
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Protein

Gene

>AfisC1G09167
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ALI87040.1	5.8e-35	phytochrome interacting factor 1
Swissprot	Q8GZM7.1	2.8e-26	bHLH transcription factor bHLH015
trEMBL	A0A0P0C6U2	4.2e-35	Phytochrome interacting factor 1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G20180.1	41.52	3e-32	136	PIF1;PIL5	phytochrome interacting factor 3-like 5

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g46766.t1
Allium fistulosum	AfisC1G09167
Allium sativum	Asa7G07295.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00010.23	HLH	Domain	199	244	49.4	3e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0001046	F	core promoter sequence-specific DNA binding
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GO:0006366	P	transcription from RNA polymerase II promoter
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network