result

Gene information

Detail information of AfisC2G00008

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G00008	chr2	1166711	1172055	-

Sequences

CDS

>AfisC2G00008
ATGATGCAGCAACAATTTGTTTTCTTAACCATCATATTTTACTCTCTGATCATCGGCAGCTTTTCTAACTCAAACACCATAAGCCTTACTCAACCTCTCCCTTATGGCAAAACCTTAGTTTCTTCAGACAAGACGTTTGCTTTGGGTTTCTTCACTCCTTCTACTGATTCTGATAAGCATTACCTTGGTATTTGGTACAACAAAATACCTACTCAAACCGTCGTATGGGTCGCGAACCGTGAAAACCCAGTTCATGGTAGGACAGGCTTACTATCAATCAGCGATAATGGCACTCTCTTGATTACCAGTGGAAACTCAAACGTAATTTGGTCATCTTCTTCATCGTACTTGAATGTTATTACTGATCCTGTAGCTATGTTACTGGATTCTGGCAACTTTGTTGTCACCAATGGTTATGATGAAAACAACTTTTTTGCCTGGCAGAGCTTTGATTACCCAACTGATACGATTTTACCAGGAATGAAACTTGGCTGGAACCTAACAAGTGGGTTCAATCGCAACCTGACCTCATGGTCCAGCTCGTCAGATCCATCTAGAGGTAACCTCACTGTGGCTGTGGACCTTAGAGGCGACCCACAGTTGATATTCTGGGCTGGGTCGACCCGTAGGCTTAGATCCGGTCCATGGACCGGGCAGTACTTTAGTGGGCTGGCACCCTATAAACCCGATCTCGATAATGTCTTGATGTTCGACTTTGTGGACACGAAGCAAGAAGTTTACTTCACCATCGAAGCAATCAACACTTCTTCGATATCTAGGCTTGTATTGAATTCTTTAGGGGTGTTGCAACAGTTTGTGCTATTGGATTCGGGTCAGTGGGGTTTGTATTGGTACACACCAAGGACTCAGTGTGACTCGTACCTTGTTTGTGGGCCATATGGAGCTGGCTGCTATGTGGATGGATCACCAATGTGTAGTTGTTTACCGGGTTATACTCCAAAAAATACGGGTAATTGGGCTTTGAGGGACTGGTCCGGAGGGTGTGTTAGAAAAACAAAGTTAGACTGTAGGAATGGGACAGATGGCTTTGTGAAGGTGCAAAGGACGCTTTTGCCAGACACTGTGAGTGCAAGTGTTAATTCAGGTTTGAGTTTGAGCGACTGTAGAGATGTATGTTTGAAAAATTGTTCGTGTACTGCATATGCTAGCGCCGATATACGCAATGGTGGAAATGGGTGTATATTATGGTCAACTGAGCTTTCTGATATTCTGGTGTATACTAACGGAGGACAGGATCTCTTTATGAGATTGGCAGCAGCAGATTTAGGTTTACCAAGTTCAAACCAAGCTCATAAGAAAAGTAATGCAACCATAGCCATAGTGCTTTGTTTAACCTTGGGGATGTTGATAATAGTAAGTATTGTTCTCTTTGCCTGGAGGATGAGGAGGAGAACTGGAGGCAATACCTTCATTGGTGAAAATGTTGCGGAGAATACCGGTGAGGATGAAATGGAGCTACCGCTTTTTGATTTGGAAACTATAATTGAAGCAACAAATGACTTTTCTGACAAAAATAAACTTGGAGAAGGTGGATTTGGTCCTGTTTACAAGGGAAAAGCGAGGGAGGGACAAGAGATAGCCGTGAAGAGACTGTCTAAAACTTCATCACAAGGTTTCGATGAACTAAAGACAGAAGTGATATTAGTAGCAAAGCTTCAACATCGTAATCTTGTAAGGCTTCTTGGATGTTGCATCCAAGGAGATGAAAGAATGTTAATTTATGAATACATGCCGAACAGAAGCCTAGATGCGTTTCTCTTTGATGAAGAAAAGGCCTTATTGCTAGATTGGGCATCACGCTATCACATCATTGTAGGAATAGCTAGAGGCCTTCTTTACCTCCATCAAGATTCTAGATTCCGGATAATTCACAGGGACCTTAAAGCTAGCAACATTCTTCTTGATAAAGATATGAATCCAAAAATATCAGACTTTGGATTGGCCAGAATATTTGGAGAAGACGAGACGAAAACCAAAACTGCAAGAGTAGTTGGCACATACGGGTATATGGCACCAGAGTATGCACTTAACGGGATAATTTCAGTAAAAAGCGATGTATTTAGCTTTGGTGTTTTAATTCTGGAAATTATAAGTGGAAAGCGAAATAAAGGAGTATATTTGTCTGAGGCTGAAGAATATCTTCTCGGCAGAGCATGGACTTTGTGGAGAGAAGGAAAAGGGGTGCAGCTAGTAAGCTCGTCTATTCAACATTCTATCTGCATAGATGAAGTTGTAAGATGTATTAAAGTGGGACTCTTGTGCATCCAAGAGAGACCTGAGGACAGGCCAACAATGTCATCCGTATGTTTAATGTTAAGTAGTGAAAATACAAATTTGCCCCAGCCTCAGCAACCTGCCTTTCTTCTAAGAAGAACCAGTCCCGGAGAAACCACGTCTTCCGATTCGAATAGCATAAATGATTTGACAATAACAACGGCTATAGCTAGATAG

Protein

Gene

>AfisC2G00008
CCCGCTTTCACGTTGTTATACAATTAGTCTAAATAGCTAGAGTCAAATCAACGGAGATGATGCATGTTTTTCTTCCTACTTATATCGAACCCGCCTTCAAACCCATGATCAGTGATGATGCAGCAACAATTTGTTTTCTTAACCATCATATTTTACTCTCTGATCATCGGCAGCTTTTCTAACTCAAACACCATAAGCCTTACTCAACCTCTCCCTTATGGCAAAACCTTAGTTTCTTCAGACAAGACGTTTGCTTTGGGTTTCTTCACTCCTTCTACTGATTCTGATAAGCATTACCTTGGTATTTGGTACAACAAAATACCTACTCAAACCGTCGTATGGGTCGCGAACCGTGAAAACCCAGTTCATGGTAGGACAGGCTTACTATCAATCAGCGATAATGGCACTCTCTTGATTACCAGTGGAAACTCAAACGTAATTTGGTCATCTTCTTCATCGTACTTGAATGTTATTACTGATCCTGTAGCTATGTTACTGGATTCTGGCAACTTTGTTGTCACCAATGGTTATGATGAAAACAACTTTTTTGCCTGGCAGAGCTTTGATTACCCAACTGATACGATTTTACCAGGAATGAAACTTGGCTGGAACCTAACAAGTGGGTTCAATCGCAACCTGACCTCATGGTCCAGCTCGTCAGATCCATCTAGAGGTAACCTCACTGTGGCTGTGGACCTTAGAGGCGACCCACAGTTGATATTCTGGGCTGGGTCGACCCGTAGGCTTAGATCCGGTCCATGGACCGGGCAGTACTTTAGTGGGCTGGCACCCTATAAACCCGATCTCGATAATGTCTTGATGTTCGACTTTGTGGACACGAAGCAAGAAGTTTACTTCACCATCGAAGCAATCAACACTTCTTCGATATCTAGGCTTGTATTGAATTCTTTAGGGGTGTTGCAACAGTTTGTGCTATTGGATTCGGGTCAGTGGGGTTTGTATTGGTACACACCAAGGACTCAGTGTGACTCGTACCTTGTTTGTGGGCCATATGGAGCTGGCTGCTATGTGGATGGATCACCAATGTGTAGTTGTTTACCGGGTTATACTCCAAAAAATACGGGTAATTGGGCTTTGAGGGACTGGTCCGGAGGGTGTGTTAGAAAAACAAAGTTAGACTGTAGGAATGGGACAGATGGCTTTGTGAAGGTGCAAAGGACGCTTTTGCCAGACACTGTGAGTGCAAGTGTTAATTCAGGTTTGAGTTTGAGCGACTGTAGAGATGTATGTTTGAAAAATTGTTCGTGTACTGCATATGCTAGCGCCGATATACGCAATGGTGGAAATGGGTGTATATTATGGTCAACTGAGCTTTCTGATATTCTGGTGTATACTAACGGAGGACAGGATCTCTTTATGAGATTGGCAGCAGCAGATTTAGGTATCTACTTTTTGTTTGATATGTACATATGCTTGTGTTTACTTATGATAGAATGTTATCAGTCTGCCTGCCCATTCCATTAATATGGATAATTCGCTATTAATCATGTAGTCATGTGATATTACCTAGATTATAAGGTATATTATGCAATTAGGGTGCTCATGAAGATACATTTTCTGATTTGATTTTGGTGCTTGCGACCAACTTCTAGCAGACAGTTAATGGAAGTGAGTTTACATCCAGTGTCCAACATAAGTTTACATTGGACACAAGGCGATGATAAAATTGTATGCGCAATGAAGCTTTAGTCCTCACTTTTGTTTATGCTGGAACATCAAATCTATTCACTATAAAGATCTGTAGCTTTCCTGAACTGAATGTATACTCATTTCAGTTATTGCTGCACATTTTAAAATCTCTAATATTAACTCGTGTCATGTTTAGGGTTGTAAACTCATGGAGCTAAATTGAAATGCCAGATACATTAAGATAGATTTCTGCTGAAAATTTGATATGCGTAGCAATTGTGAAAATAAAGTCTGTTTTACCATTTCAAATTTCTTGTTGGTTTGACCATACATTATTCTTGTGCTCTGTAGTGTTTTGTATTTCCAGACAGAAATAAGATAACTATTATCATGGTGCAAGTTGTGCAGAATATTATAATATATAGTATTTAATCAGTTAAATGACATAACGATTCACATGGCCTATTTGCTTTTAAATATGAAATAACCTAATAAGCACAACCTGTCTATTTAAATGTATGTGGTCCACTTTTCTGTTAAGTACCCTCTTATCTTCAGAATTTTTTGTCTTCTGTACCATAAATCTAGTTTCGGAAGGCTTGCAGCCACATCTGTATATTTCCTTTTATAACTTTTATTTATATGTGTGTATGTGTACATATTGATAGAATATATAAGAACTGAAAACAGAGTACAAAACGTTTGCCCGACTATGTTCCTGATATAATTGCTGCGCCTTACCCCTTTTTAGGCTAGATTATAGGCTGCCTGTGGACTTTTCATCTCCAGAATCACTATATAATATCATTGGTCAATAAGTAAAGAAAATAACATTACCAGCTACCACCTTTTCATTTCAGCTGTACCACGAGATATAGAAATCTATGATTAGTTTTAAGTTTTCTTAAAAGGATAATTTAATATCAGCACTCTTTTCCCTGATGTGTGCGTTAGCATTCCATTTTTGACTTATAGTCTCTTTCACAACAACAAGCACTTTGACCGCTTGCCAATATTTCAGTGGTCAAAGATATATCTCAGACTTCTCAGTGTTGCCTTTAATTAGGAAAATATATACCCGTTCACCATTGTTGTTGAATATTGTTTATTTGATTAATTATTTATAAAACTTATACTATACAGTGGATGTAATCAACAGGTTTACCAAGTTCAAACCAAGCTCATAAGAAAAGTAATGCAACCATAGCCATAGTGCTTTGTTTAACCTTGGGGATGTTGATAATAGTAAGTATTGTTCTCTTTGCCTGGAGGATGAGGAGGAGAACTGGAGGTACTATGCCGATTATTGATTTGCTTCGAACCAATTAACTTGAACATGCTCCTACTTAAATATTTATCACTCTACTTGTGTATAGGCAATACCTTCATTGGTGAAAATGTTGCGGAGAATACCGGTGAGGATGAAATGGAGCTACCGCTTTTTGATTTGGAAACTATAATTGAAGCAACAAATGACTTTTCTGACAAAAATAAACTTGGAGAAGGTGGATTTGGTCCTGTTTACAAGGTTAAACTTCAACATTGACCAATTTAGTTATTTAACTTTTCAACCTTTTTGTTTTGGATAAATGTGTGAATTCTTCTATAATATCGTTGTCGACTTTCTTGTAGACTTGTACATCTAAGATGGAAGAACGTAAATTATCTTAAATGATCTGTGATATTGCAACATATAATTTCCTTTGTTGAAGTTAAAGTTAGAAATTGCTTTTATATTTTCCAGTAACTTCTTAAATGTCCAATGAGTATGCTTGCTTGCCGTATTTAGGTTTTTTTAATGCTCTATAATTCCTTTCATATATTAGTTTGCATGTGCTTTATCCTGTTACGACGTCCTTTCTTAAAGTAAACACTGATATCTTGATGGTGGAATTTTAGGGAAAAGCGAGGGAGGGACAAGAGATAGCCGTGAAGAGACTGTCTAAAACTTCATCACAAGGTTTCGATGAACTAAAGACAGAAGTGATATTAGTAGCAAAGCTTCAACATCGTAATCTTGTAAGGCTTCTTGGATGTTGCATCCAAGGAGATGAAAGAATGTTAATTTATGAATACATGCCGAACAGAAGCCTAGATGCGTTTCTCTTTGGTATGCTAAAACCTTTGCACTTCCCACGCTCTTTCTTTCTCTTTATTTTATCATTCATATTACATATTCTATATGGATGCATTCTTTCCTCCTTTTTTTCCTGTAGTTGTTCAATGGAAAATCGGCTGTATCTTTTTTCTTTGGGACAGTGGCCCATAAGCCAGTTAGTTACCAGGACGCGATCTAAAAGAAAAATGAAACAATAAGTCAATTGGAGAAAAGTGATTTAGATTGAGATAATAGTTTTGAAGATCAGTATAAGGTTAAATATGCATCCTCCTGCAACTGTAGTAACCTTTCTGGCAATTCTATATCAAATTAGCTTGCACAGAAAATAAGAATAAATAAAAATAGAGTATTGATATAAGGTTAAAACTTTGTAATCAATGGATTAATCCATAACCTCGATGGATTTAATTTTTCATGAATAAAAATTCACAGTTTAGCAGAATCAAACTTTATTTCATCTCATGGTAATCTTTTGTTGCTTCTAGTGTTTTTCATTCCATCATCTGTTGCGTTCTAAATATGCATATATAATTTTTTCCAGATGAAGAAAAGGCCTTATTGCTAGATTGGGCATCACGCTATCACATCATTGTAGGAATAGCTAGAGGCCTTCTTTACCTCCATCAAGATTCTAGATTCCGGATAATTCACAGGGACCTTAAAGCTAGCAACATTCTTCTTGATAAAGATATGAATCCAAAAATATCAGACTTTGGATTGGCCAGAATATTTGGAGAAGACGAGACGAAAACCAAAACTGCAAGAGTAGTTGGCACATAGTAAGGCACTGGCCATCTTAACATACTAACATTTTATCTTAATTTGCTCGGTCGATAATGGCGTGTAATTAACGTGCAGCGGGTATATGGCACCAGAGTATGCACTTAACGGGATAATTTCAGTAAAAAGCGATGTATTTAGCTTTGGTGTTTTAATTCTGGAAATTATAAGTGGAAAGCGAAATAAAGGAGTATATTTGTCTGAGGCTGAAGAATATCTTCTCGGCAGAGTATGTATATTCCAAACCTAATGATTTAATTCAATATTCTCTCATTCTCCATTACATAGAGAAATATGGTCTGAGTTTCTTGATTTGGTAGGCATGGACTTTGTGGAGAGAAGGAAAAGGGGTGCAGCTAGTAAGCTCGTCTATTCAACATTCTATCTGCATAGATGAAGTTGTAAGATGTATTAAAGTGGGACTCTTGTGCATCCAAGAGAGACCTGAGGACAGGCCAACAATGTCATCCGTATGTTTAATGTTAAGTAGTGAAAATACAAATTTGCCCCAGCCTCAGCAACCTGCCTTTCTTCTAAGAAGAACCAGTCCCGGAGAAACCACGTCTTCCGATTCGAATAGCATAAATGATTTGACAATAACAACGGCTATAGCTAGATAGTGAATCAGCTCTTGTTATTGTAAATTTGTAGTATCTTTTTTGCTCTGATATATTTGCCTCCTATAGATACTAATTAATGTTTTGTCTCTTTTTTTATTAATTTCTTTAGTGCATAGAGTTCCTCTTGTATAAAATGACTCGGTTTTCTTTGAAGATTGCACTATACAGGTGATAAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020272816.1	3.0e-288	receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-8 isoform X3
Swissprot	O81905.1	3.2e-218	S-domain-1 (SD1) receptor kinase 8
trEMBL	A0A0A7LYW8	4.9e-288	Receptor-like serine/threonine-protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G21380.1	47.15	0.0	766	ARK3;RK3	receptor kinase 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC2G00008	AT4G21380.1	842	397	14	14	823	25	850	47.15	766
AfisC2G00008	AT1G65800.1	845	397	17	14	823	23	847	46.51	733
AfisC2G00008	AT1G65790.1	833	385	15	25	823	28	843	47.66	732

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01453.21	B_lectin	Domain	72	181	104.0	3.7e-30
PF00954.17	S_locus_glycop	Domain	212	322	83.9	9.6e-24
PF08276.8	PAN_2	Domain	343	410	75.8	1.8e-21
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	511	776	169.3	8.8e-50
PF11883.5	DUF3403	Family	781	823	33.2	3.8e-08

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0006952	P	defense response
GO:0005773	C	vacuole
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009875	P	pollen-pistil interaction
GO:0019199	F	transmembrane receptor protein kinase activity
GO:0031625	F	ubiquitin protein ligase binding
GO:0044699	P	single-organism process
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0071215	P	cellular response to abscisic acid stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network