result

Gene information

Detail information of AfisC2G00093

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G00093	chr2	10835593	10843334	-

Sequences

CDS

>AfisC2G00093
ATGGAGGGTGAAATCCCAACTTCGTATGATAATAATCAGAGTATTCCACATAGAAAGCTGCATAATATTTCAGTTCAAACTGGTGAAGAGTTTTCTATGGAATTTCTCCAAGATCGTGTAACACCTAAAGCATTTCAACCTAGATCGAACATTGACCCTAGTTACAATAATTTTAATCCTAAGTTATATGTTAAAGATAAAAATCCTCCAAATGGCATCAAGTTCAATGAGAATTCATTCGAAGCAAAGTATGATCATTCTACTTCAGTAAAGCTTAAGTTCATTTGTAGCTTTGGAGGAAAAATACTACCAAGACCAGGTGATGGAAAGTTAAGGTATGTAGGTGGTGAGAAAAGGATTATATCTATCAAGAAGAGAAATTCGTTAAGTGAATTAATGCAGAAAACATTAACTATATGTAAGCAACCTCACACTATAAAGTATCAACTTCCTGGAGAGGATCTTGATGCTTTAATATCAGTAACTTCAGATGAGGATCTCCAAAATATGATTGAAGAATATTATGGTCTTGAAAAAGCAGATGGGTCTCCAAGAATTCGTATATTTTTAATTACTACAAATGAATTGGATGGAAGTTCTATAGATACAATAGGCCTGCATAACAACTCAGATTATCATTATGTTGCTGCTGTGAATAATATACTTGATTCGAACCCCACAAATGAGTCCAGTGCAAATGGTTCTCCTAGTTATTTCAAAGACTCTTCTCACTTTCAATTTAACCCTCATATTGCTCCTAATGCATCAAACCTACTAAATGAGAAGGAGAATGAGAGTTACCAAAAGCAATCGTATGAGGATCATTTTGTGACAGATCAATCATTTGAGAATTATTATCGGGGAGATGTTGAGAAACCAAATAATTCTCCTGGTATTCAATTTCATAATCAAAAGTTTGTTCGTACTGATAAACCCAATATTCAAGATAGAGGGTTTCATTCTGAAATGGCACGCAGACAACAAGGAGAATCATCAAATGGAATTTCAAATGATTCCATTCATCTTTATCAAGGAATAGCTCATGCTTACTCTGATCCTTTGATTCAAGAACAAGTTCTAATAGATGCATCAAAAGAGACACAAGTTTCTCAAATTCCTTGCCAAAGTGGCTTTAGATATCATTGCGGTGAAGTTATTGATGAATTTGATTCTGGGTCACATGATTTGCACTTGCAACATAATTTAGTAGGTGATGTGCTACAGTTGATAGATGAGAAAGCAACTGCCCCGCCTCAGTATAATAACATGTGTCCAAATGGTGTTCCAGAAGCTCTACATAGTTATATTCCTACCACATCACTGACGGTTCCAAATTCTTACTCGGACACTCCTAAGGATAACTCATGTGGTGATGTGATGGCATTTTCACCTACTGTATCATGGCCAAAAGATTCGTCGAGTCAAAATAAGGAGAAAGATTCTAACATTGTCAGAAGTTCTAGAAATTTGGCATACACGTCTTCAGATGACCCCCTTTCTTATCTACCAAGTAGCATTATGTCTCAAAATCAAGAAAAAGATGAATTTTTGAGGCATGGTGTTTCTCTTCTCGATCAGGTTATATATATGCAACCGAAGTTGAGCGTTAGAGAAAATTCAGATAATAATTTGATGGTAGAAGATGTGACCGATGATGTTCCTCATGGGGTACGTGAATCACCACATATCATCCCTGTAGTTCACGAATCATTAGATAATTCATCACCGGAAGTAAACTATGCAGAGAGCAACGGTCCAGGCTCTGGATGTGAGGATGCTGCAGAATCAGAGATGGAGGAGCCTTTCACTGATGCTGCTACAGCAGTTAAAGAAGCAAGTACATATGGTTTGCAGATTATAAACAATGTGGATGTTGAAGAAATAAGAGAACTGGGTTCAGGTACGTTTGGAACTGTCTATTATGGAAAGTGGCGAGGAACAGACGTAGCAATAAAACGTATCAAGAAAAGTTGTTTCTCGGGAAGAGCATCAGAACAAGATAGATTGACAAAAGATTTTTGGAGAGAAGCTCAAATCCTATCAAAACTTCATCATCCAAACGTGGTTGCTTTTTATGGAGTAGTTCCTGATGGAACAGGTGGCACTCTAGCAACTGTTACTGAATTTATGGTGAATGGGTCACTAAGGCATGTTCTACTACGAAAAGACAGGTACCTTGACCGGCGCAAAAGGCTTTTAATTGCCATGGATGCAGCATTTGGAATGGAGTACTTGCATTCGAAGAATATCGTTCATTTTGATTTGAAATGCGATAACCTTTTGGTAAATTTGAGAGATTCACAGAGGCCAATTTGCAAGGTTGGGGATTTTGGACTGTCGAGAATAAAACGCAATACGATGGTTTCTGGAGGTGTTCGAGGAACTCTTCCCTGGATGGCACCAGAGTTATTGAATGGTACGAGTAATCGAGTTTCTGAAAAGGTTGATGTATTCTCCTTTGGAATTGCAATGTGGGAAATCTTAACAGGAGAAGAGCCCTATGCAAATATGCACTGTGGTGCTATTATAGGAGGGATCATGAACAACACGCTTCGACCCCAAATTCCGGAAAACTGCGACCCCGAATGGAAAAAACTAATGGAACAATGTTGGTCATCGGATCCTTCAGCTCGACCTTCATTCACAGAAATCACTCACAGACTACGGACCATCTCTTCTTCTTTACAGCCCAAAACACACAGTAACCTCAACCGATGA

Protein

Gene

>AfisC2G00093
GGGCCCGTATTCCGACATTCCTTTTCAAATTGCGGCCACCGGAATCTACGCATGTTCTCGGTTCTATATTTTCAGCGGGTGAAAAATTGGGTGTAACAATGAATATTTTCGACTTAAACTGTAAAAAATAATAATAGTTACTATTTCCTCCTCCTTTATTGGTGCCGCCTTCTACTCACTCTCTCCTCGTCCATCAAATTAAAATTTTATTTTCGCATTTTTCATTTTCTTTTTTCAAAAAATAAGATTAATCAAATTATACAGAGGCAATAGGCAAACGATTGCGTTTACTTTCAGCTGAAGATTGTGGACAGAGAAGTACCAAGGTACGATTCTGAGTTTTGTATTTTAGATTTTAATTGAAGGTTTCATAGGCTTTTTGATGATTTTAGTGGATTTTTTATTCTGATAATATTACACCTGTTATTTTGCGTGTAATATTATTTCGCTGTAAAAATTTGAATTTGCAGTGTGCCGTGGTATAGTTGAGCTTTTAAATTTGACCAATTTTAGGGTTTTTACAGTTGCATGATTTAGTAGTTAGAGGATAGTATCCATTTGATTTGATTGATCTGCTGGTAGGGTGGATATATTTATATCGGATGAGCCAAAATTTCAGCAATTGAACTTTGTAATTGCAAGTACTTTGTAATTGCAAGTAATAGTTTGCTTATATGGAATCTTAAACTATAAATCCCAATTTGTTTCCATAGTGTTTTAATTTTGACATCTGTTTCCATGTTTGTTAATATTGTTATTGATGAATTAGGGATAAAATGTATATTAACTCAAATGCCTGAAAACATTGTGAATGCAGACCTTTATTTCTTTATACTGATTTTGATGGTTGGTCAAGCAAATTGAAGCAAATTGGTGGAAAAAAAACATGTATAGAATGCAACTGAACAAAGTTTCTTGCTATTGGGGTTTTAAAAGATGGAGACAGTAGAAATTTATTATTGTTCAATGATAATAAATAGCATTTGCAGTTCAATTGATGGAGGGTGAAATCCCAACTTCGTATGATAATAATCAGAGTATTCCACATAGAAAGCTGCATAATATTTCAGTTCAAACTGGTGAAGAGTTTTCTATGGAATTTCTCCAAGATCGTGTAACACCTAAAGCATTTCAACCTAGATCGAACATTGACCCTAGTTACAATAATTTTAATCCTAAGTTATATGTTAAAGATAAAAATCCTCCAAATGGCATCAAGTTCAATGAGAATTCATTCGAAGCAAAGTATGATCATTCTACTTCAGTAAAGCTTAAGTTCATTTGTAGCTTTGGAGGAAAAATACTACCAAGACCAGGTGATGGAAAGTTAAGGTATGTAGGTGGTGAGAAAAGGATTATATCTATCAAGAAGAGAAATTCGTTAAGTGAATTAATGCAGAAAACATTAACTATATGTAAGCAACCTCACACTATAAAGTATCAACTTCCTGGAGAGGATCTTGATGCTTTAATATCAGTAACTTCAGATGAGGATCTCCAAAATATGATTGAAGAATATTATGGTCTTGAAAAAGCAGATGGGTCTCCAAGAATTCGTATATTTTTAATTACTACAAATGAATTGGATGGAAGTTCTATAGATACAATAGGCCTGCATAACAACTCAGATTATCATTATGTTGCTGCTGTGAATAATATACTTGATTCGAACCCCACAAATGAGTCCAGTGCAAATGGTTCTCCTAGTTATTTCAAAGACTCTTCTCACTTTCAATTTAACCCTCATATTGCTCCTAATGCATCAAACCTACTAAATGAGAAGGAGAATGAGAGTTACCAAAAGCAATCGTATGAGGATCATTTTGTGACAGATCAATCATTTGAGAATTATTATCGGGGAGATGTTGAGAAACCAAATAATTCTCCTGGTATTCAATTTCATAATCAAAAGTTTGTTCGTACTGATAAACCCAATATTCAAGATAGAGGGTTTCATTCTGAAATGGCACGCAGACAACAAGGAGAATCATCAAATGGAATTTCAAATGATTCCATTCATCTTTATCAAGGAATAGCTCATGCTTACTCTGATCCTTTGATTCAAGAACAAGTTCTAATAGATGCATCAAAAGAGACACAAGTTTCTCAAATTCCTTGCCAAAGTGGCTTTAGATATCATTGCGGTGAAGTTATTGATGAATTTGATTCTGGGTCACATGATTTGCACTTGCAACATAATTTAGTAGGTGATGTGCTACAGTTGATAGATGAGAAAGCAACTGCCCCGCCTCAGTATAATAACATGTGTCCAAATGGTGTTCCAGAAGCTCTACATAGTTATATTCCTACCACATCACTGACGGTTCCAAATTCTTACTCGGACACTCCTAAGGATAACTCATGTGGTGATGTGATGGCATTTTCACCTACTGTATCATGGCCAAAAGATTCGTCGAGTCAAAATAAGGAGAAAGATTCTAACATTGTCAGAAGTTCTAGAAATTTGGCATACACGTCTTCAGATGACCCCCTTTCTTATCTACCAAGTAGCATTATGTCTCAAAATCAAGAAAAAGATGAATTTTTGAGGCATGGTGTTTCTCTTCTCGATCAGGTTATATATATGCAACCGAAGTTGAGCGTTAGAGAAAATTCAGATAATAATTTGATGGTAGAAGATGTGACCGATGATGTTCCTCATGGGGTACGTGAATCACCACATATCATCCCTGTAGTTCACGAATCATTAGATAATTCATCACCGGAAGTAAACTATGCAGAGAGCAACGGTCCAGGCTCTGGATGTGAGGTATAGGCTTTTACGTATTGTTTTACATGCATATTTTGGATATAATTGTTTTTGGGCCTCTCTATTTTTAATTTGTAGTCACAGCTCGATTTAAACAAAGAGTAAATTAAAACTGTATTTAGTAATTTATGCTAATTTTTAAGTATGAGTTAGCTAAAGAAATGAAGTATGAACAAAAAAAAGTGTATGCTTCACACACGCTGGAAACATTCTGCTATAATTATTGTATATATAAATCATTGAATTTAAACCGAAGGAATTGCCATACTCCTTGTATGGAGTGTGAGCCAATACATTCATCTTGATTGGCGGATAGAAAATCATCCAATTTTTTTGGAAGAAATACAAATATCAGTTGGATCTGCTATTTCCATCAATTAAGATCAGTGCATGGTCTCACTGATAGCACTCTTTAGTTAATATACTGAAGTGGGGTTTCTTTTGATTTATTTATGTAATGTAGGATGCTGCAGAATCAGAGATGGAGGAGCCTTTCACTGATGCTGCTACAGCAGTTAAAGAAGCAAGTACATATGGTTTGCAGGTTAAAGTCATGAAACTTGTGTTATATATAAACTTAATGTTAGTGAAATGGGATGGTGTTAGTGAAATGGGATGGCACTAGACACTTAATGTTAGTGAGATAGGATGACACTATTTTAACAAGTACAATTATAGGTTCTGGATAAATAAGAATCGCTTCAGAATTTTTTTATCACTTGCATGTAATATCTTTACAGACCTTAACATATAGGGTATCTTGTTAATAACCATGCTTCTACGAATGGCCTTCAAAAAAACTAACTGATTCGTTAATTTGTGGCGATGACTGGCATCCTGCTTGAAATTTAAATACACACAACGTATGTGATGCATACAATGTACATGTCTGTTAGAAAAGAATTGAAAAAAGAGCAAGCTATTGCTGTTCCTGAAATAATAACCTGTTTCCAACCTAAGTATGCCTAGCTTGCAGTTGAGAAGGATTCCTTTTAGTAGAGAAGTATAATCTATTGAGATTTCCTTAAGCTGTGCATTTGTTAATGAGTGATATAAGGGATTGAAACACACCCTGATTTTTATTTTCCGGAAGTTGTATTCTATATTCTATTCAATACAGGTTTTGGTAGGATCAACACAAGAAAATCTTCTTGGTCATATTTTTTATCTACAATGTCTATACATCAAGTGATTGACAGGTATTGAATTCTGTAAAGTTACGTGTAACAGATTATAAACAATGTGGATGTTGAAGAAATAAGAGAACTGGGTTCAGGTACGTTTGGAACTGTCTATTATGGAAAGTGGCGAGGAACAGACGTAGCAATAAAACGTATCAAGAAAAGTTGTTTCTCGGGAAGAGCATCAGAACAAGATAGATTGGTATTTAATTCATTTAAGTTTCAGCATAGTCTTGTTTTACACTGGCTTCATTTTATAGATAAACACAAACTAAATTCATTGGTTGAAAGGCTTGATTACATTAGCACCTCCTAGGTACCGCAACATAAACAACCATGTTAGAAGACTACTGCATATCCACTTGACAATGTATGCGGAAACAAAGAAGTGAAAAAGGTCACCAAGTTTGAACGATCTCGACCATGAACCTTAGTTACACCTTATGCAATCCAAGATTCCAAACTGTAATAATATTAATTGGCTAAATATGGATGTTTCAATTTGGTCTATTGGTTATTATTTTACACATATCGAGCCAGTGATCAAGTATGGAGGCTTCTCTTCAAGATTTTCGTGAAACAAATTTACATCCTACTGTAATAAATAATGAAACAATGAGAGTGACAATGAAGAAGTCTGAAGTAATGTTTCATCATTTAATATTGAATGTGCAATTTTCATTTTCTTTACATTTTATTGTAAACTACATTACACGATATTACAATTGTTTGGTGTCAATAAAATGGTGATTAGATGGAATATCATGTTTGTGTCCGTCTCATTGCTGGTTTCTGTGTATTGGATATTGAGGTCATTATTATTTAAACATAGAAATGGCATTTTTTTTCCCTTCTCCATTTGTGGGTTTTGTACAAAAATTTTGACATGCAAATCATAAGTTTTGTGATCTTGTAGACAAAAGATTTTTGGAGAGAAGCTCAAATCCTATCAAAACTTCATCATCCAAACGTGGTTGCTTTTTATGGAGTAGTTCCTGATGGAACAGGTGGCACTCTAGCAACTGTTACTGAATTTATGGTGAATGGGT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020271406.1	6.3e-263	probable serine/threonine-protein kinase roco5 isoform X1
Swissprot	Q9C9U5.1	5.4e-49	Protein SUGAR INSENSITIVE 8
trEMBL	A0A5P1EG54	4.6e-263	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G04700.1	71.86	5e-154	542		PB1 domain-containing protein tyrosine kinase

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G00093	AT1G04700.1	366	86	3	544	898	680	1039	71.86	5e-154	542
AfisC2G00093	AT1G04700.1	239	92	7	26	226	30	267	45.19	1e-42	172
AfisC2G00093	AT3G24715.1	314	73	0	592	905	803	1116	76.75	2e-150	530

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g539217.t1
Allium fistulosum	AfisC2G00093
Allium sativum	Asa4G03577.1; Asa5G00161.1
Arabidopsis thaliana	AT1G04700.1
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00564.21	PB1	Domain	108	190	69.8	1.3e-19
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	627	888	218.4	8.8e-65

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000165	P	MAPK cascade
GO:0016020	C	membrane
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0004871	F	signal transducer activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0010182	P	sugar mediated signaling pathway
GO:0031323	P	regulation of cellular metabolic process
GO:0034654	P	nucleobase-containing compound biosynthetic process
GO:0044093	P	positive regulation of molecular function
GO:0048518	P	positive regulation of biological process
GO:0060255	P	regulation of macromolecule metabolic process
GO:0080090	P	regulation of primary metabolic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network