result

Gene information

Detail information of AfisC2G00223

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G00223	chr2	23795655	23799193	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC2G00223
ATGAAAATATCAACAACCCATGGTTCAAACGAATGCAATCCTTCCAGATGTGGGGATCAGTACATAGGCCATCCTTTCACATTAAAAGGCGATCCTTCTAACTGTATTGGAGATGAAAAGTATCAGCTGTCATGTATTGGAAACAAAACATTCATGGGAGTGCCTTATGATAAGTATATTGTTACCAACATTTCTTACGACAATTTCACCATTAATATAGTTGATACTGAGTTAGCAAGTGGCAAGTGCAATCTCCCTTCCCAAGCTATAACTCCTGGTTTCTTCCCAGTTGGGTTTGATTTGAAAATTGATTTTCTGTGGGCTACGTTCATAAACTGTTCAGAAAAGCTAGACAGCAATTTCTTTGGGACAGCAATTCCCTGCCTTAGTCAAAACAACAGATTCATTTATGTTACGATTGATTCTGTTGCTATATCATGTAGTTATCTGACTATGGTTCCTATTACGTTTGATGATGTGTACAATAATGGAGGTGATATATTTGGAACCATGAAGAATGGGTTCACCCTTTCATGGACAGAGAAAATTTCAAGATCCAAAATCATACATGACTGCCTTACTCAAGCTGTACCGTAAGTAGCCATATTATCTCTATTTTCAGTCTTCATGTTATCTCTTTTTCACAAATTATAGTTTATTGATTGCAACAAATTGTTAATTATCTCCTCCTAATATTTAGTTCACGTTAAAACAATTGTATTCACTAGCTATTTAACCAATCATAAAAAATTTAAGCCATTCACACTTTGAATGAGAAATATAACTAATTTTTTGACTAATGTTAAATCTATAATATACATTATACATGCATAATTTTGCTACCCTATATTGCAGGGAAGCTAAGAGGCACACAAATTATCGGAATTATTATGATCGATTCAAATTTCTCTTTCAAATTGAGTTTGAATTCGTATATTGCGCAGAGGATAGTAAGGATTCTACTGTATTTAGATGCTCCATTGCTTTTGCTGTGTTGATCAACATCGTATTTCTGTATTTCGGTAATTGCTTCAACATAATACTCAATCACAACAAAAATACAGTTTCATGTCTTTTTAAGTAATACAAGTTGAAGTATCTATAAACAAAACTGAATTGACATATAGGAATTACATGTATTGTGGATGCATGACATCTCTCTACTATTAAAAAGGAAAATTCAATGAATAGATTTTCACGGTGTCCTTTTGACATTCTTAAAATACACTACATTTGTCAACGGAATCTCACTATTAGTTTACAATCTCCACCACCACCATTTTCACAACCATTCATCAACAAAATTCACTATCAATTTGCATGAAATAAAATACCGTGATCAACGAAACTTTTGCATTTATAGCACACATCCGTTCACAATTTTTTTATTAAATAAAAAGTAAATATTTTTAGCTATTAGATGCACATACTTGGGATTTACGCTAGTATCGTTAATTTTTCTTTTATTGTGACGGTCAACTAACAAAAAGATGGTATGTTTTCACCGTGATATCTTTTTTTGCAGCGATGATCATACCAGGAAGACTTATAATAGCACCACTATGTATACTCGTCTTTCTCCTCTACGAATTATTAAAAATGCTTTCACCTATCGACTACATAGAAATTTTTCTACGTAACCAACAACGAACAACGCTAACACGGTACGTGTACGCTGACATAGTCGCAATGACAAGCCATTTCAAAGATCGATTAGGACAAGGTGGATTTGGAACAGTCTACAAAGGAGAGCTACCTGGTGGTTATTTTGTTGCAGTCAAATTGTTGGGTAACTTAAATGATAATGGCGAGGATTTTATCAGTGAAGTGTCCACTATTGGTACGATTCATCATACAAATGTTGTTCAACTGATTGGGTTTTGCTCAGAAGGTTTACATAGAGCTCTTGTTTACGAGTACATGTATAATGGATCTCTGGATAAGTATATTTTTTCTTCGACTCGGAAATTCACCACAACGAAGCTAAATGAGATAGCTATTGGTGTAGCACGGGGAATTGATTATTTACATCGAGGATGCGATATGAGGATTCTTCATTTTGATATTAAGCCTCATAATATACTCCTGGATAGTAATTTCAACCCGAAAGTTTCTGACTTCGGACTTGCAAAACTTTATTCGAAAGACACTAGCTTGGTTTCTACCTTTGCAGCAAGAGGTATAGTTAGAAAACTACTTGTTATCCTAGAATAAATTGGCCATTTGAAAATGAATATATATTTTGGTGCTACAACCTCCGCTATGTATCTATCTTTATGGGTTTTTTCATTTCTTTTTTCCAACAGATTATGATATTGTTTACATAATATATGTTTCCGTTTGGTTTCATTTGTAAAATGAACAGAACATGGGTTATTTATTCAACTACGTGTTGAATATAAGTGGGTCAAGCATGATTTTTAATGCTCTAATGGTTGCATCAAAAATTTCTCAATGAAAATTAGTAATATCCTATTGTTAAGTATTTTTGTTCATATTATTTATCTCATGCTGTAGGAATATTCTCAACAAAGTTAATTCTTGCCAATCCCATACACAACATTATATTTATATTGAATACATTCATAAAAATATGTTCCTGGTTATTGATATGTAAATTCCTCTCTGCCAGTTTCTTTAAAATGAGTCCGTTCACAACAGGTACTATCGGATACATGGCACCAGAACTTATTTCAAGAAGTTTTGGACTAATATCTTACAAGTCCGACGTGTATAGTTTTGGAATGCTGCTTCTAGAAATGGCAGGTGGAAGAAGAAACTATGACTCACGGGTGGAAAATTCAAGTGAAGCCTACTATCCCTCGTGGATTTATGACCGACTGAATAAAACGACAAATTTAGAAGTGTTGGATCATAAGGTCGAGCCTGTAGACATTGAGATGAAATTGTGTAAAGTAGGATTATGGTGTATTCAAATGTCGCCATCTTCCCGTCCTACAATGCTTAGAGTTATAGAAATGTTGGAAGGTGATGTCGAAGATATGGAAATGCCACCGAAGCCTTTCTTTTCTTGTTCTTCAGACCATACTACATGGGGACAAAATTCGTTTCAAATGTGTTCTAATGAAATATCCACGATTTATGAGAGTGAGTAGCATTTATCACTGATTTTAGTCTAGTTTCAGAACTATATATGATTTCTGAAGTTTTAATAATATGGATTTCGCTTTCTTCCTTTGCAATGTGAATTCTTTAGACGAAGGATAACTACGGACATGGGTATGCAAGTTATGCTAATAACAACCATATTGTATGAATGGTACATATAAGATATAATGAACAAACTGAAATGATAAAGATAATATCGATGTGCAAAGGTGTGCATGTCCAGAAAGCTATCGGAGGTGAGCCAAGTTCAAGTGGTTTGCCTGGCTGCCTATACCATTCAACAATGTATGCCCAATCAGTGCACAATAGTAAAATATATGAGAGTTATAATTCATATGTGTACTTGTATATTGACTTTAATTTATATGTGCATTGACTGAACATACAATCATGATTCATATACATCACCC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020251698.1	9.9e-191	rust resistance kinase Lr10-like isoform X1
Swissprot	P93604.1	2.7e-100	Probable receptor-like serine/threonine-protein kinase LRK10
trEMBL	A0A5P1FW25	4.1e-186	non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G66920.1	34.62	5e-85	312		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G00223	AT1G66980.1	315	151	4	287	592	778	1092	49.21	4e-85	312
AfisC2G00223	AT1G66920.1	598	329	12	16	597	38	589	34.62	5e-85	312
AfisC2G00223	AT1G66920.2	306	144	4	298	597	294	597	50.33	1e-84	310

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	313	576	158.6	1.8e-46

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0006968	P	cellular defense response
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0031625	F	ubiquitin protein ligase binding
GO:0044710	P	single-organism metabolic process
GO:0044763	P	single-organism cellular process
GO:0046777	P	protein autophosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network