result

Gene information

Detail information of AfisC2G00387

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G00387	chr2	50132301	50138604	+

Sequences

CDS

>AfisC2G00387
ATGGGTAGTAGTGATGCAGATAAGCCAACAAAGGCAAACACAGTACCTCCAGTTGCTGCTGCAGCAGCAGCAGTAGGGGCACAACCGGAGCAGGCACAAGCTGGCAGTTCCAGTGCTGCTACCCCAGCAGTTTATCCCGATTGGTCAGGGTTTCAGGCATATCCACCAATACCGCCTCATGGATTTTTTCAACCTGGTTCTCAAACTCATCCTTACATGTGGGGACCTCAGCCCCTTATGTCTCCATATGGAACCCCACCATCTCCGTATGTTATGTACCCTCATGGTGTATATGCACATCCATCTATGCAACTGGCATCACACCCTTTCAGTCCTTATGCTATTCCTCCTCCAAATGGCAATGTTGATGCTTCTGGAGCTGTGGCTACTGGCATGGAAGTAGATGGGAAGTCATCTGATGGTAAGGAGAAAAGTCCAATTAAGAGATCAAAAGGTAGTTTGGGTAGCTTAAATATGATTACAGGCAAGGGCAATAATGACATGGGTAAAACGTCTGGAGCCTCGGCTAATGGAATGTCACAAAGTGGCGAAAGTGGGAGAAGTGGAAGTGAAGGTTCAAGCGATGGGAGTGATGACAATTCTCATAATGAATCTCGTCTGAAGAGCCAAGGAGAAAAGGAGTCTTGTGGTGCGGACACACATCAAAATGGTGTTGATGCGCATAAGAATCAAAATGGAGGGCCAACCCATCCTTCCTCACAAGGATTGTTAAGTCATCCCATGCCAATTATGCCTATGCCAGCTACTGGTATTCCTGCTGGAGTAGCAGGTCCAACCACAGCCCTAAACATTGGAATGGAATATTGGGCTGCTCCAAATTCAACAGTTGCTTCTGTTCGTGGAAAGGTGCCTGCTAATTCTGTAGCTGCAACCCGTGAGAATGCTCCATCTGAGCTTTGGCCACAGGATGAAAGGGAACTGAAAAGGCAGAGGCGAAAGCAGTCTAATAGAGAATCTGCACGTAGATCGAGATTACGGAAGCAGGCTGAGTGTGAAGAGCTAGCTCAGCGTGTTGACGTGTTGAAAGAAGAAAATGTCGCTCTCAGAACTGAAGTTGATCGAATAAGGAAGGAATATGAGCAGCTTCTTGCCCAAAATACATCCCTTAAGGAGAGACTTGGAGGAGTACCTTTAGGTACCGATGATACCAGACACGGACGAGATGGGACTCACCAACCTATGGATTCTAATGCAGGACCCCAAAATGGTCTTTAA

Protein

Gene

>AfisC2G00387
ATGGGTAGTAGTGATGCAGATAAGCCAACAAAGGCAAACACAGTACCTCCAGTTGCTGCTGCAGCAGCAGCAGTAGGGGCACAACCGGTATTTAATTTTTTAGACACATGTTATTTATTTTTAGTTTTTTTGGCAAATTTTATTATGTTTGAGAAATTGGATGTTTCAATTGTCTAGGAGCAGGCACAAGCTGGCAGTTCCAGTGCTGCTACCCCAGCAGTTTATCCCGATTGGTCAGGGTTTCAGGTAAATTTGGATAGTTTCGAGTAAATTTGATGGACATCTGTAGATTTATTTCATAATCATAGTTAACACGCAATTTGATTGTTTGCTTCACATATTTGTTTTGTATGAATAATATCAACTGCAACATACATGCTATTTAATGATTGATGCACATTTGAACAAAAAGGAAACTTGTTCTTGGTTTCCAAACTACTGATATATGAATTGCATATCTAAACAATGTGCAATGAAGTTATATGAAGTATAAACCTCTTAAATAAATAAATAAAAACCATAATATTTATTTATTTTTATCGAGCCTGTCTTACCTTATACATTTGGGTTGAACTTTGGGCCCATTTTGTTTACTTATACTATTACTCTCTTAGAAGATAGATATCTATGGCAAAAGGAATTTCAATCATTTCATGTAGTTGATAGTCAGAGTAATAATGGAAATAACTGAGAAAATGTGCTATAGACTCAGATTGACATTTCTTAACAAGTTTGGTTCCTAAAGGCGAGTAAGAATGACAAATACTTAAAACATATGAACTGGAAATTTGTATAGTTGCTATCAGATTATCAGTTATGTAGTTCTTATGTAATTATTTGCTTTATGGAAACAGGCATATCCACCAATACCGCCTCATGGATTTTTTCAACCTGGTTCTCAAACTCATCCTTACATGTGGGGACCTCAGGTGCTTTATTTTTACTCTAATGGGGCTCAAAATGTTTAATTTCTGAATTTTTTTATTTATGTTTTCAGCGAAAAATAAATAAATGACAGCGTCATATTCAACCTTAAAGTGTAGTAAATTGCTTTTTACTGCATTATGTTATGTACTAATGGCTTAACTTAAATTATAGAAGATTATTTTTAACTGCATTATGTTTCTACCAACGGCTAAAACAATATTACTGATGAACCCTGGTTAAAAAAGCTTGACAGTCTTCTCATGAATGCAAATTCAACATGACTGTCCAATGATGAAAGTCCCATTTTGGTGATCTTTTACTTTCCAGGCAATCTTCCAATGAAGCAAAACAAAAGAAATAACACGTCATTAACTCATTATTGTTGAAACCAGATGATGGATGCATAGATTATTAAATGAGCATTGTTAATGTGTGCCCTAAGGGCGCATGTTAAGAATGATTATTATATGTTAAAGAACAAAAAAATTATTTCAAATACCTATTTTATCCTTACGCCATAAAAAATAGGTGGAATTCAAAGGGGGTTATTTGTGTAATTTAACAACCTTAGCATGTTAACATTTTCCTTATTAAATTACAAAAAGAGCAATTTCTTTGTTATGTTCTCCATTATTATTAGCCGAAAAATTCCCATATTTGATTTTTTTCTTAATCTTCGAAAGTCAAGGAAACTGAAAGTTACTAACTAGATTTTTCATTCCTAATTTTGAAATTTGGCAAGAAATTACTTTCTGAGCTAAACCAGCAAATGAATCACAATTGGCTAAACCAACTCATCTTGTGGTATAGTACCTTCATCTATGGTGCCTGCCTTCCTTGAAATTAAGGGTACATAATCTTAAGCAGTGTAAACGTCTCATATATAAAATTAGTCCATGCAGTGGATCTTCAATGAACATCTTGAGAATTAAAGTAGCTGGTATATTAGTGGCACAATGGCGTGTGCTAAGTCATCTAGGGGTTTATATCATATAACTATCCATATCTATAACAATGCTGAAGCAGTCCCACTGTTTTTATATATATTTTCCTTTTATTTTTCTCAGCCCCTTATGTCTCCATATGGAACCCCACCATCTCCGTATGTTATGTACCCTCATGGTGTATATGCACATCCATCTATGCAACTGGTATGTTTCCATATATATTAAGCATGTTCCTTTCACCATTTTTACAAAGCTAGGTCACGTCAGATTAACTGTGCACTTGATAACAACGTTTACCTTGAAATTAGGTTAAACTCTCTCGAAAGTTACCAGAAACAGTTTTTATTAATAACGAGCTCTTTGTCATATGGAATGCACATGCATATAAAATTAGGGTTGTCGATGGGTACCCGAAAAATCCGATATCCGTCCGAATCCGTATCCGAAAATGTGATAAATATCCGTTATCCGAAAAGCGGATACGGATATCAAATATCCGAAAAGCTTTTCAGATACGGATATGGTTATTGTGGTATCCGTATCCGAAAAATATCCTTCCGATTAACTGATGCATATATATATTTAATTAAAATTATATTTAATTAATATATGATTTTCCAACTATTTCCTAACCATTGGATGTTACTACAATATGGTTTTTTGCTCATTTTTAGTGAAAACAGACAGTTTTCGTATTTAATTTTTGAATATTTTTGGATACACATACGGATATTAGTATAAAACAATGTTTTATCATCACATTTTTTATTCCTTTGTTTTTTTATGAACATTAGTACAAAAATTATTTTATGTTGATCCAAATCTTTTCATTTATGCTTTTAAATTTATTGATTATGGGCGGAGCGGATAAATATCCGATATCCGTCCGTATCCGAAAATTAAGCGGATACGGATATCCGATATCCGAAATTGATTTCGGATACGGATACGGATATGGCACTATCCGTATTCGAAAGTATCCGTTGATAGCCTTGTATAAAATTATCATTGATAAAAGATATGATGATGTAAAATCATTAGATTTCAATTTTTGTATATAGTTTTAATACACATAAATCAAAATATATAAATGTAAAGGATATAAGTATTTTGCTGGAACTGGAATTTAGACTCAACCTCATTTATACCATACATGTTAATTTTCAACTAAAAGTGAATGTTAATTTTGTCATTACTGTGATTTAAACCTGTGATCTCATTTATATATAATGGCATTCTAGAAAGATTGCGGTTGGGCCAAAAAAAGAGTTGATTAATTGCATCAAAAGAGTTTACATCCTCCATTTGTGCACCACTGTACATGACTTTTTCTCTAATGCTATTGGCTCTTTTGAATTGACTCATATAATTCGTTTTTTtGCTTTTTGACAGCCAAAAACCAATTCATTTTGGTTTTCGAAAAGCCAAAAAGCGACTTATTTAAGTCGATCCAGACGAGCATTATACATAATATGTTTTGATTGAGTTAATTTTGGACATTTCAAATATGATTCAGTTTATGCTATAAACTTTGGTAATCGTGTTCTTTTTAACGTGAAAACTTAGCAGGCATCACACCCTTTCAGTCCTTATGCTATTCCTCCTCCAAATGGCAATGTTGATGCTTCTGTAAGTACCCTTTGAATCCATGTTTTTAGTAAAGATTATGCATGTACCGAACAGTATCAGGATTATACACTTTGGTAGGCCCAACACTACAGAGCTTTTTTCAACGTGCGCACACATGAATTAGCATAATAGTTAAAAAATTAGAAGTTGTACAAGGACGTAAATTCATGTCATATTATGTTTGGTACTTGGTGTTTTCTAGGGAGCTGTGGCTACTGGCATGGAAGTAGATGGGAAGTCATCTGATGGTAAGGAGAAAAGTCCAATTAAGAGATCAAAAGGTAGTTTGGGTAGCTTAAATATGATTACAGGCAAGGGCAATAATGACATGGGTAAAACGTCTGGAGCCTCGGCTAATGGAATGTCACAAAGGTCGTATATCTTGAATAAATGTGTATCAAATAGGTTCATTCTGAATTTAATAATTAATTTAGCAATTCATCTTCTTCAGTGGCGAAAGTGGGAGAAGTGGAAGTGAAGGTTCAAGCGATGGGAGTGATGACAATTCTCATAATGTAAGTCTCAATAAGTATTGGAATAGTAAATGATCAGCATGCTTGCCTTTTTCATAATGTATGCTTATGTTTTTATCATAGAAATTTTTTTCATGTGCACATGGTAAGATTTTTTATTCAGTTCATATGTTCTTATTAAATGCTGCTTATATTTAAATTCAATAGAAGAGGTGATTTTGTATTTAAACATTAAAATATTTATCCTCTTGTGTAACACATGAACCTGACGTTTGCTCAGTGGGGGAACATTTTACGCTACACGTTTAGCTTTTCTATCCGAAATACAGGGCTACAAGGCAACCATGTATTTTGTGTATGCCTTGCAATCATAGCCATATATAGATACATACAGGCATACAATACCATCTTTCTGAAGCAAAATTTCATATTATATATACCATCTTTCTGAAGCAAGATTTCATATTATATATACCATCTTTCTGAAGCAAAATTTCATATTATACATACATACATATATGTATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATACCATCTTTCTGAAGAAAAATTTCATATTACATATACATATATGTATATGTATATGTATGTGTGTGTGTGTATGTGTTATATATATATATGTATGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATATACCATCTGAAAGTTTGTCATGAACTATTTATTCAACTTTTACATGTTTGTACTTGAAAAATTATTTTCTCTCAGGAATCTCGTCTGAAGAGCCAAGGAGAAAAGGAGTCTTGTGGTGGTATGTTGATTTTTTTTTCTTCTCAAATTATAAAAAAACCAAATAACACAACAAGACATCACAAAATTCTTACTGTGCATATATTTACAGCGGACACACATCAAAATGGTGTTGATGCGCATAAGAATCAAAATGGAGGGCCAACCCATCCTTCCTCACAAGGATTGTTAAGTCATCCCATGCCAATTATGCCTATGCCAGCTACTGGTATTCCTGCTGGAGTAGCAGGTCCAACCACAGCCCTAAACATTGGAATGGAATATTGGGCTGCTCCAAATTCAACAGTTGCTTCTGTTCGTGGAAAGGTGCCTGCTAATTCTGTAGCTGCAACCCGTGAGAATGCTCCATCTGAGCTTTGGCCACAGGTGAAACTTTATTTGAACTGAAATGCATCTGTCAATGATATGATGGAAACATGCATCCTCGATTCACATAACATGCATCCTCGATTCACGTAACATACATATGCTCTGTAATATGTTCTTTTAATCTCCTAATTATCAAATCAATTTTCAAGTTTTTCAAGATAAGTAGAAATATCTTGTATTTGTTGAAAAACTGAAAAGGTGATATTTATTTTGAAATTAGGATGAAAGGGAACTGAAAAGGCAGAGGCGAAAGCAGTCTAATAGAGAATCTGCACGTAGATCGAGATTACGGAAGCAGGTAAACATCGTAGTAGATTTGTGAAATATCTGCTTCAGTAAAATTGAAATATGGTATTGTTGTGTTCTTTTAGGCTGAGTGTGAAGAGCTAGCTCAGCGTGTTGACGTGTTGAAAGAAGAAAATGTCGCTCTCAGAACTGAAGTTGATCGAATAAGGAAGGAATATGAGCAGCTTCTTGCCCAAAATACATCCCTTAAGGTATGAATTCAGATAAAGTTCAATTGCTCAGCTATATTATCTCAAATATTGCCTTGGAAGAACAACATTTAATCTAAAAAATAGTCACTATAAATATATTTTGTGAATATAAAATAAATTTCGCTGTATCGTATATCATTCTTAGATCAAGACCGTCAATTTGATTTAATCTCTTGTACGTTTTTCATTGTCAGCTCAGCAATCGCATCCTGAAGGAACTTTTGCATATGTTGCAAGTAGTTATTTAGAATTATGAAAAGATTTTGTGAGTACGACCATTCCAAATATGGAAATATACCTCCGTTGATAAACCGATATCAGTCTACAAATAAATCCAACCTATGGTTTGAACTCCATTACCAATAATTTATACTTGTTCGTTGAAAACAAATTAGTATATTTTTTTACACATAACATCCATGTAAGATTTGAGGAATTTCTAGACGAGAGCATTCATGTATTTGTCTTAAAATTAGATAAATGTAGAGCGATCTTACTATTACTTGTCATTTATGTGTCTTAAATTCACAAAACTAAGCTGCATTTTGCAGGAGAGACTTGGAGGAGTACCTTTAGGTACCGATGATACCAGACACGGACGAGATGGGACTCACCAACCTATGGATTCTAATGCAGGACCCCAAAATGGTCTTTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_019705679.1	3.6e-72	bZIP transcription factor 16 isoform X3
Swissprot	B6E107.1	5.8e-51	bZIP transcription factor 1-B
trEMBL	A0A6I9R3V7	2.6e-72	bZIP transcription factor 16 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G35530.1	54.55	9e-92	333	AtbZIP16;bZIP16	basic region/leucine zipper transcription factor 16

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G00387	AT2G35530.1	363	139	12	33	384	29	376	54.55	9e-92	333
AfisC2G00387	AT1G32150.1	394	149	13	1	384	1	366	52.54	3e-87	318
AfisC2G00387	AT2G46270.1	348	170	14	44	380	29	326	33.62	1e-32	137

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g415092.t1
Allium fistulosum	AfisC2G00387
Allium sativum	Asa5G00596.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa	LOC_Os12g13170.2; LOC_Os12g13170.3

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF07777.8	MFMR	Family	1	103	80.2	1.1e-22
PF16596.2	MFMR_assoc	Disordered	143	282	145.0	1.6e-42
PF00170.18	bZIP_1	Family	311	373	76.8	8.9e-22

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0042802	F	identical protein binding
GO:0009637	P	response to blue light
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0019760	P	glucosinolate metabolic process
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09060	GBF; plant G-box-binding factor	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network