result

Gene information

Detail information of AfisC2G00935

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G00935	chr2	127768867	127776299	+

Sequences

CDS

>AfisC2G00935
ATGGGGAGATCACCAAGCTATGATGCAAGCTTGACTAGGGGACCATGGACAAAAGATGAAGATGTGATGCTAAAGAGTTGTATAGAGAGAAATGGAGTTGGAAACTGGAAACAGCTGCCTAAGCTTGCTGGGCTAAAACGATGTGGCAAAAGCTGTAGACTTAGGTGGATCAATTATTTGCAACCTGATATTAAGAGAGGAAACTTCTCGGAGGTGGAGGAAAAGCTCATTATAGACCTTCACTCGGTTTTTGGAAACAGGTGGTCCAGAATTGCTGCTCTAATGGAAGGCAGAACAGATAATGAAATCAAGAACTATTGGAACACAACTATCAAGAAGAAACTTTTACAGAAAGGGATAGATCCAGTGACTCATAAACAAATGGCTGACTTTAACATACATGGAAATTTTTCGAATCTCATCGCAGCTGCTTCAAACTTGAATAACACTGCATCAATTCCTTTAACAAATAATGCTTTTCACCAGATTCCACCTAATATGCAACTTCTTCAAACTCTTATATATAGCAGTATCAATAGCTCTCTTATTCCAAATGTGGAAGCAATGAATCAACTGCAATCATTCATCGCTCTTCACAGTCTGAATCAGTCACCTTTCGGTTTATCTGTTCCGAGTACCAACCACGTTGGTTTGTTAGGATCATTGATTAATTGTGGTGTTTCTAGTTTGAATGAATTTGGCGTGAACAATAGCAGTGCTGGCACCAGTACTGCTAGTACTTCCTATTATAGCTCCCCAACTACAATTGCTATGCCTCCTTTGCAAATGACATCTCCTATTGCTCTTGGCGATCTGAATGAGTCGTCTATCGGCTTTCCTGGTCCGAGCACTAGTACTATTACCATTGCTGACACTACCATATGTGATTTTAGCTCCTCTACTGCAATTGCTATGCCTTCTTTGCAAACAACTACAAGTACTATGCCTTTGCAAATGACATCATTAAATATGTTAGAAATTCAAGCATTAGAGGTGGTCGATTCAGGTGATTTCCCAAGTACAACTTCCAATGGACAAACCCTGGGCTTGAATGATCTAGACTTCAGTTTTAATGTGGAAGAAATGTTACAGCTTTTGGATACACAGATATATCAGGACGGGAGCTGCTGA

Protein

Gene

>AfisC2G00935
CGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCTCTTTTTCCATTTTGCTGTCTTTCATTTGACGCACGTTTTATCAAATATTGCCTTTTTATCGACGGCGGACGTGCCTCCTTCTTCCTCCCTCTCTTACCCACCCTACCTTCTACCACTAATCGGATCCTAATTTTCCTTGTCGAAACTCCGGTAACTTTTTTTTTGTTATATATTGCATTAGATTAATCTAATTTGCTAAAATCTTTTCCATTTCCTCCAGGTTTTTTGTGCCGCCATACTTAACTCAGCGTATGATAAGTCTGTAACTATCAGTCTATCACTAGCTCTGATAATTAACTCTCTTTCTTTCCCCGTTTAATTATCGATTTGCTTTGTTGAATGATGTTAAATATAATGTGTACTGTTGATGTGTTGAAGTGTTATCATGTTGTAGGAATTAGGATTAGTTGCTTGTTTGAAAGTTTTTGGTGTACATTTGTCAACTATGTTAATTATGATGACGTATTTATAATAATACATTCTTGTTTTAATGTACTTTCTGACTAGATTAGATCGGTTTGGGCTCGTCTATCGTTTTCTACTTATAAGGGAATCGATCTCAAATGAAACGAACTGCCCTTTAGTAACTAAATGTGAATGGATCTCATAGGAAGTGAAGAACAATCGTTTGACTGCAATACATAATGTAAAAGAATTTTTTTGGACGCTGTTGGTTGAAGAAACATAATGTTGTGAAGAAGACAAGTGCTGCAACAGAAGCTCAAAGGATTGAACTTTCTCAAGACAATAATGAAGGAAATCCAGATGATGGCCAAGCCAATATTTAGATTCTCTATATACTTGGACTAAGATTCTGTACTGACTAGGAAGCACGTATATTTATGATGCATACAATTCGCATGTTTGTTTTTGGTTCTTAAAGAAAACATCAGGTGTAATCAAAGGCCTGTACATACCATCAAAGTTTCGGTGCTTGAAACAAGGTTGAAATCGTAAGTTAATCCACTGGACATAGTACATTGTATACTTATTGTGACAAACTAGAGTAAAGTGAATTTTGAAATATATTATTCACATATTGCTTCTTATTAACATTACACACACACATTAACATTACACACACGGGCGCGCACACGCTCGCGCGCGCACACGCACACATAGGTGCATTTTATCTTGGTTAGAATCTTGATTATAATTGGGTGTCCGTCATCCACCTTTTTTATAACAAATCTGACTCTCCTTGTGGATTAGAGTATTTTCCTGGATTTATAGTGGATGTGAAGTTATATGATTCTACCTTAAGCAAGACACTTGTAGATTTGAGTATTTTATTTTAATTTCTCACACTGTAAATTTTATTTCTTTTTCATCCTCTCAGATACTTTAACTTGGTTTTGGTCAATAACTATCATACATCAGATGTCTGGAATATTGATTGAAGGAAAGATGGAGATCCAGTCAGGTAAGATGTAAAGACTTATAAGACAGAATTTCAGTTTTTTCCAGTTTTACATTTCTCGCCAATCCTTCTGTCTGAAATTCAAATATAACATGAAAAAGCGCTTTCCCACACTATGCATTAGACGTCAAGCGCTTCCCTACTTGTATTTTAAACCAGTTTCTGCCTTAAGTGTTTGTCTTTTGTTGGATTTTAGCTAGTAAATTGTCAACAACATGTTATTTGGTAAATATTAGGTTGCTAGACAGAATCATGTTAATCTTACCTTTTGTTACATGAATTTATCGGACCAAATAAAAATATTTTCTTTTACTAGTAGATTGAATTTGTCAAAATTTTCAATGGAAAGAGTAAGATACTTGACTTGAGCAGGAATAAAACAAAAGTCAGACTTAAATCATGGACAAATGACTATCTATTAATCGATGCAATAAACAAATTCAAAAGTTGAACAACTTAATATTATATTCAAGTACAGTGGATTAACTGAGCAAACTTCTAGAGGTCTACTTGTTGTCCTCCTTCATTAATGCTAAAGAAGCTATAATATTGTGTTATGTCTCATATCGCCTAGTATGGGATACGTTATGCGTATATAACTCATTAGACACCATTCCTTTGCAAGTTAGTTTTTAGAGGTGGGTTCTACCTAATTAAGTTCGTTACAAGTGGTATTAGAGCATGTCACCACTGATGAAAGTTGAAGTCACAGGGGGCCTTTATAATTGTTCATGAAAAGTCTTTGTACTGTCACATAAAGACTCTTAGTTTGTAAGTGATATCACATGAATACGTGCTTGCCCTTCTTTCCTGTATTTGTTAACTGAGATCATAGGGACTATTATTATTAGTATTGGCTAATGATCACATTAAACAATAAGACTGAAGTCAGACATTAAGAGGAAAAAAACAGTTTAGATGATGATAGTAAGGACAAATGAGTCCTGCAAAAACGAATGTAATAAAAGCCATTATAGATTTCAATGCAATCACCATGAATCGTTCTAGAAGTTCAACTAGGTTGGTAAACTGGCATGTGCGAAAGTCAGACATCATGAGCTTCACTAAAAGTTATGATCAGAAGATAAAGACATGTATGTATATTCGTTTGCACATGAGAGTATGTGAATTACTAAATTTCAACTTTTCAGGATTTATTAAAAGTGAGTAGGTAACTATTCCAACCTTAAAGAACAAAATGAAATAAACTAATGATTCTTGTTAATTTTGTTGGGCACTGGATAATGAGACAAGACCTATTCAGTATAAGATTATTAGTATTCTGTTATTCTTTTCATTACTAACCATGTTAGTTAATTATGTTTGTCCTTATAATAGAGTTAAGATTGAAGTGCATAAAATCTAACTCTCAAATTTTTAGAGTTTAGGAAGGGGAATACAAAATCAAAATCAAACTGCCCTTAAGAAATTGCATCATATAGCTTAAATATCAATCATTTTCTTTGTATTCACTGTACGTATATGAATCATATCTAATAACCCGTGACAAGTGCAGTTTGAACAAATTATGTCTTCAATACGTGCATTAATTCTGTTTTATCCAACCATTCATACCAAACCTAAAGTTTTATCATTCAATTCCTTGTTAACTAAGAATTACATAGTCTTTAACTCCATTTTTTCTTATGCGTTCACATTGCCTCTACTGATTATTTCGATTAATTGAATAGTTGCCTTTATAAAATAGAGATTGGTTACCTACTCACCTAGTCATTCGAGGATGTTAGTTTAGTATAATATACGACAATAGATTTGATGATGCAAGGAAATCTATGACCCCACTACCATATTGGTCTTTATTGGAGAAATAAAATGATGTATAACACATCAGATACCTATGGCACAAAATTATAATCAGCATCTATTCCAAATTAATATGAAATCCAGCGATCATCATAAATAAGAAAAATTGGATTCTGTCCAAAATAGAGTAAATATCACTAAAATTGAAATAAGATGCTATTCCCATGTATTTTGAACATTTTATGTTCTGCAATACAAATGAATTTTAATTTATCTCAAAGATATCATTATATTTTTACCTAACTCCATAATGTTAACGTAATATTTTTGTTCTTAGTTGTAAAATGGACAAGTATTGTCAGAGTTCGGCTAGGACTTGTAATAAATACAATTTTAGTAGGTTGGTGCAAGAAAGCCAAATGTTTTTTTTGGTTTATTGGTGATACACCTGAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACATCAAAATATATGTTGAATACCTTTGTTTAGATTCCTGAATTTGATTCTGCACGCGCGTCCACATATTACATGTAAAGTTCTTAAAGTACATGTGTGTGCGTATTTGTGTTTGTGTATACACTGACACATATTACACGTAAAGTTCTTAAATGTAGTACAATTGTCATCTATATATACATGGTTAATGTTGAGATGTGTATTATTTCAACGTGCAATGCAACTAATATGTAGGAGTATGTAGAAGAATGTTGTTTGTCCATTTTTTCCAGTATTGGTGACAAAACGTTGTTTTTGAACTCTGATAACAAACTGTAATTCTATTAGCAGTTTGTTATTTTGAGGGCGCTACATAATTATTGTAAGTATGTAACTAATTTATGGATACTATAGCATGTGTCCCCACCCACACACATGGGTCGGCTATTTGGACACAAAATTAAACACAAAAGATCTGTACCATTGGTTTTTTTGGGTCCTTATATGCAAGATGGAAATTAGGGGGCAATCCAATGGTGGAGATCTATTGTGTCATCAATTGTGTGTGTGTGGTGTGTGTGTAACAACTTAGTAATGCATGTCATGAACCTCAAAGCAGTGATCTCAAACAAATGTGCCATGTAATAACAAGATGCAACAAGTTCAGAGTGGTTTCACTCAGCTAACATGCACATGTGATATACACACATGCAAGCACACAATATGCATAACATACATATAAATATCATGTGTGTTAGTATATATGATACCATGTATGCACATATAGAACTTTATTAGGTACTCCAACTTTAACAAACCACCCATGTCCTATCAGTCAACTATTAAATATTATTTGATCTTCTAACATTATTCAGCTAATCCAATTCCTTCGAAATTTCTTAAGATCATTTGATCACAGTGACTGTTATAGATCTTCAAATGTTAGATATCAGAAAGTAGAGTACTTGTCCTAAAAGATATTTGGTTCATTAATTGAATACAAAAATTTGATAGATAATGTTATGCTATTGCAAATTAAACTTGTGTCGATATAAAGTGGGTACATGAAAATATATAATCTGTTATTTATTAATTAGCGTCATATAGCAAGCCACTTTCCTTTCTACTTTATGAATATCTGTTCTTTATAACAACTAAATGTTAATTTAGTTCGTGAGATGACATACATATTGACTCTTTTCGATGGTATATGTCAAATTGGAACGCATCAAATATATTAATAGTATCACATTAAAGAAATTGCATTATATGTAGACCTCTCGCATAAAAAATCATATGATATCGGTACTAGAACACACAAACA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020240778.1	4.3e-56	transcription factor MYB39-like
Swissprot	Q9SBF3.1	1.0e-46	Myb-related protein 92
trEMBL	A0A7J7G526	4.2e-53	Transcription factor MYB41-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G16770.1	55.80	7e-51	197	AtMYB9;MYB9	myb domain protein 9

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G00935	AT5G16770.2	181	67	4	1	174	1	175	55.80	7e-51	197
AfisC2G00935	AT5G16770.1	181	67	4	1	174	1	175	55.80	7e-51	197
AfisC2G00935	AT5G10280.1	148	57	2	1	147	1	146	59.46	1e-48	190

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g311389.t1
Allium fistulosum	AfisC2G00935
Allium sativum
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	13	60	49.8	2.5e-13
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	66	109	51.6	7.1e-14

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000981	F	RNA polymerase II transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0001135	F	transcription factor activity, RNA polymerase II transcription factor recruiting
GO:0016049	P	cell growth
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006357	P	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009753	P	response to jasmonic acid
GO:0009800	P	cinnamic acid biosynthetic process
GO:0009909	P	regulation of flower development
GO:0010200	P	response to chitin
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0030154	P	cell differentiation
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0080091	P	regulation of raffinose metabolic process
GO:1900384	P	regulation of flavonol biosynthetic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09422	MYBP; transcription factor MYB, plant	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network