result

Gene information

Detail information of AfisC2G00978

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G00978	chr2	132890451	132904130	-

Sequences

CDS

>AfisC2G00978
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Protein

Gene

>AfisC2G00978
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Functional annotation

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nr	XP_020245416.1	1.9e-144	protein LHY-like isoform X1
Swissprot	Q6R0H1.2	9.8e-82	Protein LATE ELONGATED HYPOCOTYL
trEMBL	A0A6I9SDF1	3.2e-122	protein LHY-like isoform X1

Best hit in Arabidopsis

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AT2G46830.1	39.30	4e-77	286	AtCCA1;CCA1	circadian clock associated 1

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g412059.t1; g61981.t1
Allium fistulosum	AfisC2G00978
Allium sativum	Asa3G03443.1; Asa7G01587.1
Arabidopsis thaliana	AT1G01060.1; AT1G01060.2; AT1G01060.3; AT1G01060.4; AT1G01060.5
Oryza sativa	LOC_Os08g06110.2; LOC_Os08g06110.3; LOC_Os08g06110.4; LOC_Os08g06110.5

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
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Gene Ontology

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KEGG pathway

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Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network