result

Gene information

Detail information of AfisC2G01531

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G01531	chr2	215021464	215026851	-

Sequences

CDS

>AfisC2G01531
ATGAAGATTTCATGCGTGGATGAAGAAGAGGAGAATCATCAACAAAAAACGGTTGTTGTTGGCGTAAAAATGGATCCTCAGAGCAAAGAGCTCTTAACGTGGGCGCTTGTTAAAGCAGCTAAAGTCGGAGATAGAGTAGTGGCACTTCATGTGATTCCTACAAATTCAGAGGTTTATGGTGGAAAAATTTCTTCTCTTCTGTCGATCGTGAAAGCTTTTGATTCTCTTTTAGCTGTTTATGATGGGTTCTGTAATCTTAAACAGATTGATCTGAAGCTAAAATTATGCAGAGGATCTTCTACAAGAGAAGTTTTAGTTCGCGAATCAATTTCTTATGGTGCTAATAGTCTTATATTAGGCGTTAAAAGAAGTAACTGTAAAATAAGATATTTATCCACCTCAACGGCAAAGTACTGTTCGAAAAAATTATCTAAAGATTGTTCTGTACTAGCAGTTAATAATGGCAAAATTTTGTACCATAGAAATTCTACAGAATTGAAGCAATCCTTGAAGAAACAAAAAGATGAAAACCATAATCATCTGTTTATGACTGATGAACGACTAATAAAGAATCATGACGCATCTAGGCTTTCTTTACAGTGTTTTCCTTTCTCTTCGCCATCTCATTCATTTACGCTTAAAGAAGAGAATGATCAAGATTGTAGTGATTTGAGAGAGAGCTGTTCTTTGGCTTTAGTCCCATTAAATAAATCCGAATCTAAGTCAAACTCAAACTCGATTCGTACTCTTATTGTTCGTGAGTTGGATGAAGCAAAGCCACTGAGAAAAACTGTGTTAAGTGACAAAAATATAAGAGATGGGGATGAAAAGTCTAAAGTTTCTGTTTTTCAATGGGCAAAGAGACTTCCTAGTCAGTATATGGCACCAATTATTGGTTATTCAGGTGGTAAAGCAGTAGTCCCTTTTGAAAGAACTGATTCATCCTGTTCATCTGTTACAATGTGTGAAGAAGAAAATGAAATTCCAGCTGAATTGAAATCTCTTCAAAAGAAGCATTCGTCGGTTTGTAGGTTGTTCAGCTATAAGGAGCTTGTATCCGCAACATCCAATTTCTCTTCAGATAATTTGATCGGGAAAGGAGGAAGCAGCCAAGTATATAAAGGATATTTATCCAAGGGAGAAGAAGTAGCAGTTAAACTGTTGAAGCAATCTGAGGATGCAGTGAAAGTTTTTGTATCTGAAATTGATATTATCACTACACTACATCACAAGAACGTTATCTCTCTACTTGGTTTTTGCTTTGATAGTGACAATCTTATATTAGTCTATAATTTATTATCAATGGGTAGCTTGGAAGAAATTCTTCATGGCAATAAAGGGACAAACAATGTTCTAACTTGGGTGGAGAGATACAAGATTGCATCAGGTGTAGCAGAAGCACTTGATTATCTGCATAATTATAGCACTCAACCTGTGATTCATAGGGATGTTAAGTCCTCAAATATCCTCATAGCCGATAACATCAATCCTCAGTTGGCTGATTTTGGACTTGCATTGAGGGTATCACCATCTTTGTCACATATGACATGCAATGATGTTGCAGGGACATTCGGGTATCTGGCTCCTGAATATTTTATGTATGGAAAAGTTAATGATAAGATTGATGTGTATGCATTTGGTGTTGTTCTTCTTGAACTCCTTTCTGGGAGGAAACCCGTCAATTCTCAATGTCCTAAGGGTGAAGAGAGCTTGGTATTATGGGCAAAGAAAATTCTACAAGATGGAAAAATGAAGCAGCTGGTTGATCCATTCTTGAAAGATGAATACGATAATGAAGAACTGGAAAGGATGATTTTAGCCGCTTCCATTTGTATTAGAAAAGATCCTCGATCACGACCTCCTATAGCTCTTGTTCTAAAGCTGCTACAAGGTGATCCCGACATCATTCGATGGGCAAAAATGCAAGACAGCAAGGAAGAATCCGATGAACTTGAATTCGACACATCGCCTTCAAATTCTAAAATTCAGTCTCACATCAACTTAGCTTTACTCGGTGTGAATGATGATACCTTCTCATCATGCAGCGTTGGTACCTCAGTTGATTTTATCAACACGAATGCTTCTCTTGAAGATTACATTAAAGGGAGATGGAGTCGCTCTTCGAGTTTCGATTGA

Protein

Gene

>AfisC2G01531
GATTTTTCTTATATATAAATTGATGGGCAAAATTTCACAAAAACGACCCTCAAAATAATCCAAAAAGTAACATGAAGATTTCATGCGTGGATGAAGAAGAGGAGAATCATCAACAAAAAACGGTTGTTGTTGGCGTAAAAATGGATCCTCAGAGCAAAGAGCTCTTAACGTGGGCGCTTGTTAAAGCAGCTAAAGTCGGAGATAGAGTAGTGGCACTTCATGTGATTCCTACAAATTCAGGTACTTTTGATCCAAACCCATTTGATGAATCCCGGTTATGTTTTGATTGATTGATTAAAGACCGGAATTTGTGTTGCAGAGGTTTATGGTGGAAAAATTTCTTCTCTTCTGTCGATCGTGAAAGCTTTTGATTCTCTTTTAGCTGTTTATGATGGGTTCTGTAATCTTAAACAGGTTCGTGATTAATAATTATATATCTACCACTGAACTCCATTTTTTGAATGAGTACATTTTGAGATTATTGAGTAATAAATTTATGCTTACGCAGATTGATCTGAAGCTAAAATTATGCAGAGGATCTTCTACAAGAGAAGTTTTAGTTCGCGAATCAATTTCTTATGGTGCTAATAGTCTTATATTAGGCGTTAAAAGAAGTAACTGTAAAATAAGGTGAGCGTAACAAATTTCATTTTGTACTTTGATTGTTGAGTTTCAGTGCTCATATCTGTTAATTTCGTTAGGCTAATTTATTGTTTTTGATAGATATTTATCCACCTCAACGGCAAAGTACTGTTCGAAAAAATTATCTAAAGATTGTTCTGTACTAGCAGTTAATAATGGCAAAATTTTGTACCATAGAAATTCTACAGGTATATTTTAATTCACTTATCTTATTTTAGTTTCACTCACCATCACAAATTAATAAGCTTACCTTAATTTAAATGCAGAATTGAAGCAATCCTTGAAGAAACAAAAAGATGAAAACCATAATCATCTGTTTATGACTGATGAACGACTAATAAAGAATCATGACGCATCTAGGCTTTCTTTACAGTGTTTTCCTTTCTCTTCGCCATCTCATTCATTTACGCTTAAAGAAGAGAATGATCAAGATTGTAGTGATTTGAGAGAGAGCTGTTCTTTGGCTTTAGTCCCATTAAATAAATCCGAATCTAAGTCAAACTCAAACTCGATTCGTACTCTTATTGTTCGTGAGTTGGATGAAGCAAAGCCACTGAGAAAAACTGTGTTAAGTGACAAAAATATAAGAGATGGGGATGAAAAGTCTAAAGTTTCTGTTTTTCAATGGGCAAAGAGACTTCCTAGTCAGTATATGGCACCAATTATTGGTTATTCAGGTGGTAAAGCAGTAGTCCCTTTTGAAAGAACTGATTCATCCTGTTCATCTGTTACAATGTGTGAAGAAGAAAATGAAATTCCAGCTGAATTGAAATCTCTTCAAAAGAAGCATTCGTCGGTTTGTAGGTTGTTCAGCTATAAGGAGCTTGTATCCGCAACATCCAATTTCTCTTCAGGTGGCTCTTTATATTTTATTGATTTGATAACTTAATTAAGAGTATAATCCGAGTACGGTTATTTATAATGTAAAGCTGGAGCACTACTATATTTTGGAGTTAGAAATGACTATGTGAAGCAAAATGATACATATTGAGAGCATCAATAATACTGTCACTGTGTCTAATTAAATATCGAGAAGATCAAAAATGCTACTTACCAGGTTTAAGTTAATAAATAGTTACCAAAACTATACATATTGAGAGGATTGAAGGTGTATGTTAATCTTGTTATTCAATATATTAAAAATGCGTGGTGCAGATAATTTGATCGGGAAAGGAGGAAGCAGCCAAGTATATAAAGGATATTTATCCAAGGGAGAAGAAGTAGCAGTTAAACTGTTGAAGCAATCTGAGGATGCAGTGAAAGTTTTTGTATCTGAAATTGATATTATCACTACACTACATCACAAGAACGTTATCTCTCTACTTGGTTTTTGCTTTGATAGTGACAATCTTATATTAGTCTATAATTTATTATCAATGGGTAGCTTGGAAGAAATTCTTCATGGTAATTTTTCTATTATAATGACAGTTTATGACATTGATGCATGTTTTTTTTCCTCTTAAATCTAACTTTGTTTCGAATGTTTTATCCTTATGCTAGGCAATAAAGGGACAAACAATGTTCTAACTTGGGTGGAGAGATACAAGATTGCATCAGGTGTAGCAGAAGCACTTGATTATCTGCATAATTATAGCACTCAACCTGTGATTCATAGGGATGTTAAGTCCTCAAATATCCTCATAGCCGATAACATCAATCCTCAGGTATAAATAAATAGTATAACCTCTTTAATTTGTTTTAACTTGGAAGCATTTTTGTTTACATTTGCTTGGTTTAATCCCTTCAGTTGGCTGATTTTGGACTTGCATTGAGGGTATCACCATCTTTGTCACATATGACATGCAATGATGTTGCAGGGACATTCGGGTTTGTGTTATATTTTGTTTAAATTTTAATAAATAGGTTTTTTGTTCATGAATTCTCTGTATTTTAATGTTAGGTATCTGGCTCCTGAATATTTTATGTATGGAAAAGTTAATGATAAGATTGATGTGTATGCATTTGGTGTTGTTCTTCTTGAACTCCTTTCTGGGAGGAAACCCGTCAATTCTCAATGTCCTAAGGGTGAAGAGAGCTTGGTATTATGGGTATGTTTTCATGCACAGTGTACTTATTTATCAAATATTAACTTAATATTGTTCCATCTCATTAATTGGTGTGCTTAGTTAACCATACACTAATTTATTATTATTTGGATAATTCAAACACCAATAATTGTTTTACCTACACCATAATTTTTTATATAAAATATTAGACAAAAATCCTCATATATCTAATAAAAAAATCAATATTAAAGAATCACTAATCAATATTATTTCTTTCATAAAGCAATCATCGGATAAATTAAATTTGAATTCCTTTCAGGTATCAAGTTCTATTTAAAAAGTATCAAGTTGTTTTTGTGCGTGGTCAATTTTAACAATTTCCACTTCAAATTAAATATGAAATATAAAATTTCAGATTTATTACTAAAATTAATATGATTCATAGAGTACTACTATCTTTTACTTAAATTAAATCAAGTTTAAATTTAACGTCAAAATTTAGTAAGGTTAACATGTTAATATTCAGAAATTTAATTTAATTTGTTGTATTTAAATAATCAAATAATTTTGAATTCCATTTGAAGTATTTGAATTTGAAAAATGAAATTTGCAAAAGTGAATTTGGGAAACTTAGTTTGATTATAGCATGAAAGAGAGAGAAATTTAGTGAAATGAGATAAGGCTTTGTTTATTCCAAATGAGGGTAGTTTTGTACTATGTTTTGTGTATATTAAGTAAAAAATGTTGAAGAAAGTAATAAAATCGAGTGGAGTGGTTTAGTTGTATGAATTTTAGAATTTGAACATTATTACTTGGGAAAAAAAGGTATCTCCTCTTATAAAAACATAATACATTTAGTAGTTTGCCATCACGTTTATTTATTTGTACATTTTTATACAGATCCTAGTTTTAAAAATTTGCGCGTGCAAATATTCGAATATTTGGAATCATTATTTACCATGATTAAAGATAATTTATTGAAGTTTTTTATTTCAATTCATTTATTGACGTTTCCTTATTAAGGGATTTAATTTGTTGAAGTTTCCCAGTCCAGAGATTTAGTAAATTGAAGTTTTCCAATATATCAAATCAAAACCAAATATATGTTAGGGATTTGAAAATTTTCTCGATTTAGGATTTTAATTAGATAGAGACGAAAATGAGAGATTAAAAGAATATAATTTGGGATGGGGCCTTAATTTTATCTTTTTATGGTAAAAGCAAGAAGGATAATTTGGTCCTTTTAAACTATAAATTACAGTACAAAAATGGAAATATTCCCTTATTGATTATTATTCTTGTCACATAAATTTCATTTCATAACCATTGGGTTTGTCCTCTTAGTAATTTTAATTTATTATATTAATTGATGTTCACAATTATGGTACTAAAACACCAACATGATACGCTCCTAATAAACCAATATGATACATGCACATTTTGTTTTCCAAAAAATATAATCCGCGATTATACCCAACAAAACACTAGTAATTCGAGGAGTTTTTTCATGGGGATAGAAACCTAAATTATGGTAACTACCGCCAGACCAATAAATGTGTCATGTACTTAATCCCGACATGATAATCCCATTTATTATGTATTGACTATTCCACCTCTTTATTCCACGACTGGATATTGATTTAATTAGATGATCACATAATTATTAGGAATGATAACACAATATTTGGATTATTTAATACTTCCCCTTTAATATTTGGTTTTGTGTTAAAAATTAGTAGAGATTTCACAGAACTGGAGATCAGTATTCAAGTTATTCCCATATTTCTCAAAATTAGTTGATACAAAATCCAATATTTAGCTAGAGTTATACTACAAAAAACTTATACCAAGGCCCCCGATACTATTAACAAAATGTACAAATTTCAGGCAAAGAAAATTCTACAAGATGGAAAAATGAAGCAGCTGGTTGATCCATTCTTGAAAGATGAATACGATAATGAAGAACTGGAAAGGATGATTTTAGCCGCTTCCATTTGTATTAGAAAAGATCCTCGATCACGACCTCCTATAGCTCTTGTAAGATCTCGTGACTCTTCTTTTCCTTCCTTCCTCTTTTAACAAAACTTTTAACATATATCATCGATAAAACCCTTTATGGAATATAATTCTTATACTTTCATTCAAGAGTACTTATGATCTATTTATTAGCATGATATTGTTTTAATATGCTTAAGTATAATATTTTTTGCTTTATATGACAATGTCCAACCTAATTTCAGGTTCTAAAGCTGCTACAAGGTGATCCCGACATCATTCGATGGGCAAAAATGCAAGACAGCAAGGAAGAATCCGATGAACTTGAATTCGACACATCGCCTTCAAATTCTAAAATTCAGTCTCACATCAACTTAGCTTTACTCGGTGTGAATGATGATACCTTCTCATCATGCAGCGTTGGTACCTCAGTTGATTTTATCAACACGAATGCTTCTCTTGAAGATTACATTAAAGGGAGATGGAGTCGCTCTTCGAGTTTCGATTGACTGAATACAATTACATTGATTGCACATTGCCTGTTGTACATTTATTTACTTGCTCTTTTCTCAAATGTTGGAGGTTCTGGATGTGAGGTGTTATCCTGCGCCCTCCTCTTTTCCTCTTTCAGCACATTGTTACAATTTGTATAACTTTGAAATCTTTGTTATGCAATGTACTATTGTTCTTGACCAAAGGATGGCTCCTTGATTATTGAATATGATATGCTATTATACGTTGACCC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020245982.1	1.7e-239	receptor protein kinase TMK1
Swissprot	Q8H1G6.1	2.8e-61	PTI1-like tyrosine-protein kinase 1
trEMBL	A0A5P1E7Z8	4.0e-222	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G77280.1	46.94	7e-179	624		Protein kinase protein with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G01531	AT1G77280.1	769	325	15	10	711	42	794	46.94	7e-179	624
AfisC2G01531	AT1G21590.1	761	326	16	17	711	13	756	46.25	2e-167	586
AfisC2G01531	AT5G63940.1	722	334	11	18	711	22	703	44.32	8e-161	564

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00582.23	Usp	Domain	16	150	37.9	2.1e-09
PF00069.22	Pkinase	Domain	360	624	157.2	4.4e-46

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006979	P	response to oxidative stress
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009623	P	response to parasitic fungus
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009860	P	pollen tube growth
GO:0012505	C	endomembrane system
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048768	P	root hair cell tip growth
GO:0051020	F	GTPase binding
GO:0071369	P	cellular response to ethylene stimulus
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network