result

Gene information

Detail information of AfisC2G01751

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G01751	chr2	252566566	252580540	-

Sequences

CDS

>AfisC2G01751
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Protein

Gene

>AfisC2G01751
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_008789526.1	8.6e-257	helicase-like transcription factor CHR28 isoform X2
Swissprot	Q94BR5.1	1.2e-215	Protein SNF2-RING-HELICASE-LIKE 2
trEMBL	A0A8B7C164	8.1e-257	helicase-like transcription factor CHR28 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G50410.1	52.66	0.0	818		SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein / zinc finger protein-related

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC2G01751	AT1G50410.1	845	321	15	102	874	144	981	52.66	818
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00176.20	SNF2_N	Family	192	558	233.9	1.9e-69
PF00097.22	zf-C3HC4	Domain	597	628	22.2	8.7e-05
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Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0045934	P	negative regulation of nucleobase-containing compound metabolic process
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network