result

Gene information

Detail information of AfisC2G01913

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G01913	chr2	275964039	275972444	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC2G01913
ATGGGTGATGACATTACCGAAGCTCATTGGGTAAGTATCCATTGCTTGGAGCATAGTGGTGTAGATGGAATTGAAAGGCTTGTATGAAATTTGGTATCAAGGTGGAGATTGTTAGACATGATACCAATTTCATCGAAGAAGAGAATGCCAAGGTAGAAGTAGGAGTCCTTGAAGCCACGGTGTTGCGGAGAAGCTTGGAGGCTGAACCAGAAGTCTAGTTCAGTGGAGAAAATGTCGGACCAAAGATTTGGTCCGGTGGAGTTCGTTCGGTGAGAAGGTGACCTCGTTCGGTGGAAGACCGGACCAGAATTTTGGTCCGGTGGTAGTGCTTCGATCGGCAGTGAAGGCAAGAGTAAGTCTCATTCGGTGATGGGAGATGCCGGACCAAAGATCTGGTCCGGTGGTGATTAGGGGTTGCCACTCCAAATATCTCGTCCGGTGGTGATGGGATGCCGGTCCAAACTTGCCATTCTAGATATTTCGTTCGGTGCTGAAGCATGATCGAACCAATGATTGCCGCTCTAGATCTATGGGCTTGTACCGAACCAGTAGCATTGATGTGGACTACTGGTCCAAGTGATGCCGAACCAAGTTAAGGCCGAACCAAATATTTGGTTCGGTATTGGACCATGCCGGTCCAGATCTTGAGTGTTGTTTGCCGAACCAAATGCTATTGTGTTGTTTGCCGGACCAGATGTGTCGAACCAAACCTCAGGGCGGCTATATAGCAACTACCCCTCCTCATTTCTTCACTCTATAAATAGTGGAGCTTCTGGACAACAATGGTAGCCATCCTAGAGAGCTAAAACTCTGCAAATTATTGTCTGTGTTGTAAATTCTTCTTATGTATAGCCTTTGAAAGTGAATCAATCTTGTAACTCTAATCTTTCAGTGATTAATAAAATCTCCTCTCCCCAAATGGACATACACTGCCTTGCGGTAGTGGAACCACTATAAATACCGGTGTTATTTATTTTTCTGCATTGCATAGATCTGTGACTGTCTGTTCTGTTGTTTATCTCTATTTGTTTCGTCTCACTACAATCACAATCCAGTTGTTTTCCGCTGCATTGGGTTTTTTATTCCCTTAGACTGATCACCTGAAGGGATTTTCCCCAACACTATCACACGTTACAACTACAATGGTATCACAACTCATAGCTATAGCATCCTATAGCTATCATATGCCAAGTGGCAAATCTGTAATCAAAATGGAAAATGATATTTTGTCTCAATAAAGCAGTTTCTTTTTGTCTAACATGTAGGCATGTCCTTTATATACTGGTTGCTTTTGTTTTATAATAGTAATTCCTGGCTCTAGCCAAAAATTAATCTTCATTTATAAATAATTTCCTTAATTACGTTCTTAATCTAGTACGGTTTTTTAAACTAATAATTCATATTAAATTGAAAATTGATGGTAAAAATTCATCAAAATATTTAATTTTGATATTTTTAAATAATAATTTACATCCGAATTTAACCATTTCCACTTGAAAAATTCATGATAAATTATTTCATCCAAAAATAATGTAATTAAGAACACATTTTTATTTTACCATTAGAAACATCATATCAAATTTCGTGACATATAGATATCATTAAACCATGTTTTACCTTAAAACATGACTAAATTCCTTTTATTTAAATCATAAAACATATTTAAAGCCATTTCTAATTGTTCAAACATGTTTATCAACATTAAAATCATACACTCTAAATCAAATCCAAACCCAAATGGATTTTGAAAGTTTTAGGGAAAAGTTTATCCACCTTAGACTAGAAAAGCTTTGAAATCTATGTTTAAGTTGAAAGCTTTGCCTTTGATTTCATATTTCTCTTTTCCATGAAATGTGGTTGACCTTGGTTTTATAATGAAGTTTGTTTTTTTTTTCTTTTGTTTTACAACGAAGAGAATAAGAATGTAAAGAAGGTGGTGAGAGTTATTTATATTAATGGTCTTAAATCCCACTCATTTATTCTCATTAATCTATTTTCCTAAATAAAAGATTTTCTTCATTCAACATTCATATTTTAAATCCTTTACCATTCAAAATTAAAATTTATTTGTCTCATTAATTAGGTCGACTTTAACTGACTCTAATTACCTTTGGTTCATTTAATCAACTTTTAAAAGTGTCATATGCTTAATTAATCCAATCTTCCTTAGGTAATTCTTGCAATTAATTTAATTCCCTTTTCATTTTCCTTATTATTGATTTATTTCCTTCTTTACAAGATTCTTTATATTCAAATATTAATTTGACTACCTTATATATATAGCGCATTTAATTATTTCTCATTCATGTATTTAAATAGATTCTCATTATATACGGTCAGATTTAATTACATGCAAATACTCTTATTATAAGGTCTTTTGTGTTCAATCCTTCATCGCCTAATTAAAAATATTCTTTATTCAAATATTTATATTTCCCTTTTATACGTACGATTGAATTTAATTACCTTTGATTTAAGATTTTCCTTGTAAAAATATTAAATCTTCTTCTTACCTATTTACATTTGAATTTAATTATATCTAATTGCCTTTAATTACCAATTAATTAATTTCTATTATTCAGGACTAAATTTAGTTACACCTTATTTGATTAGATTCCCTACTTTTTCATTCAATCTCGTATTCACAAAGTAAATAAATGTCCCCTATATATTTAACTTGTTTATTCCGTTCATTTTTTTAATGTAATCAATTAACCTTAATTCTTATAACTAATTTTCATTATAAATTATTCATTAATTTATAGGTCGTTATATTAAAAGTGTTGGAACCAAACGAGAGGATGGTGAAGATATATTTGGAATCAACTAGATATGCAGCGTACTTGGTCAAGGATAATGAAGAGATAGTGGTTTTGCTTGAAACTGCATTGTTTAAGCAGAGAATAATGTTTTAAAGATTCATTTTTGGTGAGATGGGCTAAAATTAAAATATTTTCTCATAATATTTATGTTAATAAGATTTCTGATCTCATAACATCAAATTTATCGAAGTAATCACGCTTTAAATACTTACGTGATTATGAACTAGCTAATTAACAAATATTAAATTGCCTAGAATGTAGTAATTATGTTGTTGTATGCTTACGCAATTATGAGGGATATCATTCTACCGTTTTATGAAATGTCTTAATAGTTCAATTCAAATTGAAAAAAATCCAAACACATATCATAGAAAAATAAATGCTGAAAATAAAGACATGAAGAATTTACATGGTTCGAATATTAAGGAATGCTACGTCCATGGGCTAAGTGAATCACTTTGTTTGTTTCTTTTCTTAGTGCAAGCTTTAAAATCAATGGATGTCTTAGTTTAACTTCTAGAGTATTTGATTTGCTGAATAATGTGATCCATTTTTCCTACTACAGTCCTTTCCTTTTACAGCAGAAAAGATATCACATGGATTACTGACGTCGTATCTTGTATTTGATAATCGTCGTTAGAAATTGTCACATTTCCATCCGCTTAGTTGATTTGATGTCCAGAGATTTTTGATTTGGATTTAGGCGGAATGGTTTGGTTTAGACGGGATGAATTTGGGTTTAGGTGGTAAAATTTGAATTCAATATAAGGGGTTAGGAATGCTGCCATTGGCTCCTCGCTGCTTAGCTCAGATTGGTGCAATATGGTAAGGAGTTTGAATTTGTTATTTAAATGCGTAGCGCTGTGCTATGTTGCTTGTGCAGTTTTTGGCAGATATGGTTGAGGCACATTATGCTTTGTTGAGGAATTATTTCTAGCGACGCATCCTGGAAAAGAGGTTGCGTCGTTCATTGTGTGAAGCCTTTTGGTTGTGCAGCCTAATTTATAAATTGTTGGACTTTGAGTGTTATATACTGAAACTTGTGCAGTTCCTATTTGGTGTAGCTTTCATCCCATTTTATCTTCACTATGCTACTTTGCCTACCGACTCCTTTTACTTTAACATGTGCTAGATATTTGATTGGTTGAAAAATAAAATTTCCCATATTTCAATTCTTACTTTCACTTTCAATTTCTTCATTAATATTCATTTTTGGTTTTTTCCATCTCAAGTGCAATCTTCTTTTGTCTGCAAGTAGTGGCGCAGTGGTTGAGACACTTGCCTCCTATTAACGAGGTCGCGAGTTCGGTATTCGTCTGCCCTATTCCCCTCAAGGCACGGAGGTGGATTCCCATAAAACCATTCAATCATGGTTGGGAACATCAAATCTCTGTGCTGGGGCTGGCTTAAATCCCTCCTAGGGTTCACTACAAGAAAACCTACTTTTGGTTGCAATTATTGGTAGCGTTTGTAGTGTAAGTGCTACCAATACTATATATGTATTTTTTTTAATGTTTTGCGGTGTAATTTTATGGTTTGGCTCTTGTCACGTTTTTTAGGAATGTTTCCCTCCCGTGTTTCCTTTTTCCCTCCAACGTTTCACTTTTTCCCTCTTTCCCTCAAAATTTCCCTCTTTCCTCAAAATTTCCCTCTAGAAGTTCAGAGATCGCCTCGGTCAATCTCCCTTCCGCTGGTTTGAATATCGATCAAATCTCCCCTCCGCTGTTTGAATATCGATTGAAACTCCCTCCGCTGGTCAATAGAGATCCCCAAAATCAACCACTAGATCGAATCTGTTGCTGCTGATCATCAGCATCTCCTCGGTGGAATCTCCTCTTCGCTTTGTTCACAAGGCCCGACTCTACAAATACAAGTATTTGTTGGTAAATTCAGATAATTTCTTTTCTGGTTTATAAAGCTCTTGAGTTTCACATTCAAACCTGATTCTCGTTTACAAAATTCGAAGTCCCTTCCATCATGAGATGAACTGATTTGTCTATTTGTTATTGTTTTAGGTTGTTGCGATTAAGCAATTGAACAGAGATGGAATTCAAGGAAGCAAAGAGTTTTTAGTGGAAGTTCTTATGTTGAGCATGCTACATCATCCAAATCTTGTTACATTGCATGGATATTGTGCCGAAGGAGACGAGAGGTTATTAGTTTATGAATACATGCCTA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260999.1	5.4e-93	probable serine/threonine-protein kinase PBL21
Swissprot	Q9LDZ5.1	5.3e-85	Protein ALTERED SEED GERMINATION 5
trEMBL	A0A6V7QPJ7	8.7e-93	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G20650.1	73.60	1e-85	311	ASG5	Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G01913	AT1G20650.1	197	52	7	203	98	294	73.60	1e-85	311
AfisC2G01913	AT5G18610.2	193	49	11	203	108	300	74.61	5e-85	310
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	10	197	128.3	3e-37

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0016021	C	integral component of membrane
GO:0002221	P	pattern recognition receptor signaling pathway
GO:0004675	F	transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity
GO:0046658	C	anchored component of plasma membrane
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0040007	P	growth
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:0090404	C	pollen tube tip
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network