result

Gene information

Detail information of AfisC2G02329

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G02329	chr2	345926478	345938795	+

Sequences

CDS

>AfisC2G02329
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Protein

>AfisC2G02329
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Gene

>AfisC2G02329
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_018680522.1	5.9e-155	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103983097 isoform X2
Swissprot	F4IXE7.1	2.5e-94	Repressor of silencing 4
trEMBL	A0A804IUP8	4.3e-155	(wild Malaysian banana) hypothetical protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G05380.1	48.02	4e-135	479		Acyl-CoA N-acyltransferase with RING/FYVE/PHD-type zinc finger protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g44260.t1; g535925.t1
Allium fistulosum	AfisC2G02329
Allium sativum	Asa5G02116.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF16135.2	Jas	Family	773	843	81.6	3e-23
PF00628.26	PHD	Domain	886	927	31.9	7.9e-08

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0000792	C	heterochromatin
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GO:0000980	F	RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding
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GO:0043972	P	histone H3-K23 acetylation
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GO:0097536	P	thymus epithelium morphogenesis
GO:0098532	P	histone H3-K27 trimethylation
GO:1901798	P	positive regulation of signal transduction by p53 class mediator
GO:2000410	P	regulation of thymocyte migration

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network