result

Gene information

Detail information of AfisC2G02647

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G02647	chr2	407096866	407106565	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC2G02647
ATGGGTAGTTTTACGGTAGTATGTGAGGTGATTGCAGTAGTTGGTTTGACCATCATGGTTGTTAGCTGCTGGAATTTGAGAAAAGCACGAAATTTGCAGGGCAGAGTTCCTCTAGGCAGCCTTGGTTGGCCAGTTGTCGGTGAGACTATTGAATTTGTGTCGTCTGTAAACTCTTCTTGCCCTGAGAGATTCATTGATAAACGCAGAGACAAGTTAGTTCCTAGTTTCATATTTCATTTTTCTTGCATTATTATTATTGTTATTGGCAATAATGTGGTTAATTTAATATATTTTACACAAGTAACATGCACAGAAAAAATTTCTGGTTCAGCAATGATATGCATGATAAATTATGACGTTTTACTTCTTAATATAAATTAACAAATGCATGCCTTGAAAACATCGTCTATTTAGCTGTTTGAGACAAATCCTACAACCTAACCATCGCATTTTTAGGATGAATTGAGTTCAGCTTTCAGATCTAAGGCAGTAATTTTTTTTTAAAGCGCATCATTATATGAAAAAAGATGCATTTCATAATGCATAAAGCTCGTATATTGTTTCAGTTTTACATATTATTTATAAGCAGTTGGTATATCTTTCATATGGCAAAAACAAACTCCAGAGCAAAACTAGAAAATAAAATGACTAAGTGACAAGGGGATAATTTATTTTCATTTTTTCTTCTTCTTTCTTTCTTTTAACTCATTAGTTTTATTTTTTGAGGAGATATATAATGATAAGTGATCATGGGGAAGACGGATAGGGTTAAGTCTGAGATCCAAAGTGAACTTTTGGAAAGGGTTATGAAGTTGAAAGGGTAGTTTATTTTTGTAATTTGAAAGGACCCCGAAAAAGGATTGGAAAAGAAGTTAAACAATTAGACTAGCGTTGTTTGAAACGAGACGGCGTAGAAATAAAGAGGAAAAGTCATTTCAACAAAAGGGGAATAGGAAGGGAGAAATTTTTTTGCATTTTCCAAAATGTAAAAAATATGAAAAGGTCATTTTTAATTTTAGATGTTAAAATCATTTTGCAAATCGACTGTTTTTTACCCTCTCTCATCTTTCGTGCATTTTAAAATACACGTCTAAAGCGCAAAATATAAAACTCATTTTCCAACTAAACACTACTTAAATGTTTAACTAATGATACATTTTAATTTTTATTAGTGGTTAGTTTAATATTAGCAATAATTTTGTATGTATGTATTTTGTGTAATAGGAAATAGATTGGAGAAAATAATTTAGGATTTTTTTTTTTTGAAACAAGGAAGTGATCAAAAATTTTAGGCTGAAGGACAAAGTAATAATACATGTATATAACATGTGTTTAAAAGTAATACTATATGTATATATTGTAAATATAGTACTTTTGTTGTAAATATAGTACTAATTTAATTAGCATTTACACAGATAATGTTATATTAATATAACTTTTTTTTAATGTTTTCCCTTCGAACTACACTTTCGAGGTGGTGTCCTTGGCTCAAAATTTTTTCCAACTTTGTACTTCTAATTAATTTGTACTCTTTGCATAATATGGTATTTTTTTATTTTACGCATGTATAAAAGAATTTGAAAAAAAATTATAATGTTTGATTTCTAGGATAAGTTTAAATTTTATTAAAAATTAGTTCAATATTATTTCATGTGTGTTGTTTTTGCAATATGGTAATTTCTAATTTCGTGTAAAAATAAATAAAATTTGAACAACAAATTGTTTATTGTTTACAAGTACACATCTGGGTCCTCTTCAACAACCCTCTAGTTGGATTGCAGGGGCAATGCATCTGCAAATGACATCGACATGGCCGGTTAGGCTATGGGAGTTTAAAGTTCAATACCACCAATTAAGGTGTAGCGTAGCACTCCGTCGAAAAACCAATATATGTTTATTAGTGTTATTTTTCATTTTTATAAAAGATAAACATTTTTACAAACTAACATAATTATTAAAAGATCAAATAAAAATACTATAGCAACAGCATTTGACACAATTTATCTCAACTTTTATATCTCTCCCCGATTTAAACCTTAAATGTAAACACAATAAGGTCCAACAATCAAGATATATTGTGTCGAATTGTATTTTATTTTGCGTCTCAGTAGCTGCTCCAACTATTATTAATTATCTTTTTTATTAACTATAATAATCATGACGACGACAACAATTGTTGTTGTTAAATGGAGCACGTGTCAGATGCGTCGCATGCGAACGAAACGGAGCTTTTCAGCTCCTTCCGTTCGCAGGGTCTGGAAGGGGAATAACTCCATTCACATGTCCAACATGTCAGATGGGGGATGTGATTACAGAGGATTGTGAAGTGTGAGCACACTTAATGTATGAAATATTTCATTTTACATTACATTTACACAGTACATGAAATTCATATTGTTCTAGTTTTCCATGTTATTTATAAGAAGTTGTCACATATTTTGTGTGAACAAAAACAAAATCTAAAGCAAAGGTAAGAAAAAAGAATATATTTTTTCTATAAGTAGAATGAAGAGTAGTCATTGGGTTGAACCTATTAACTCCAATTTTCCTTATTTAAGACAAAAAACCATTACTTAAATAAAGAAATAATTAGTAAACCTTATTTCTGTGATGCGTGGGATCCATAATGTTTCATATTCTCTCTTTTGTAAGTATGACTTACTGACAATTCTTTAAATAAGTGTAACAAAAATCTACTTGAAAATCTACTCAAAAATTAAACCAAGAAGCCCACCTTAGTGGCCTTGGGGTCAGAGCCTGGCACAAGGAAGTAATATTTGGGTGAAGCATCAAACACAGCTAGTAGGAAAAATAGAACTCCCAAGAATGTGTATGAATTTTATATAGGACCTAACTGTCAGTGGTAGTACAATATGATGAATTGAAACGTGTTTCGCAATAATTTTAACCTCACAAAACTATTTTCAACATTTGAGGTTGCATAAAATAAACATGATTTGTAATAATATGTGCATTAGGTATGGTAAAGTTTTCAAGTCGCACCTCTTTGGTAACAAAACAATAGTCTCGACGGACCCAGAAGTCAACAGATATGTTATGCATAGCTCTTTTGAAGCATTCATCCCGTTCTACCCAAGATCTTTAACTGAATTGGTAGGAGAATCATCAATACTTCTGATTAATGGAAGCTTACAAAGACGGGTGCATGGACTTATCGGAGCTTTCTTCAAATCCCCAAGTTTGAAAGCTCAGGTTACCACGGACATGCAGGTTTACCTTAAGGAACTAATGCATGGTTGGAAAGATGACCAGCTTGTGCACATACAAGATATCACCAAATCTGTGAGTTGAACTTTTTGCTGCAAATGAATAGAAAATAGTAAAATGAATGAAGAAACAAACACATAGTAGAAAAGAGAACTGAGAGAAATGGTTATAACAGTTGAGATCTAAAATATGTAAGATACATTGTGGACAGATCACCTGCATGATGTAAGAGATTGAACCGGGTCCTCTTTTGGTAGTTTGACTCAGTATAACTGATAACAGTACTAAATTATGTTACGTGTATCCTAATAGACCTTTTGGGTTAATATCATTTCAGATGGTGTTTCAAATACTTGTGAAATGTTTGATGGGTTTAGAACCAGGAGAAAAAATGCAGTTCATGAAGCATCAATTTCAAGTATTCATTTCAGGCATCATGTCCATACCCATCAAGATACCTGGAAGTAAATTCTACAGATCACTTCAGGTAAAACTTAACTTATCTTTGAACTATGGCCATTTGTATCATCCTGATTTACTGACAGTGCCTTTGTTCCGAAATTTAGGCAAAAAAGAAAATGATGAAGCTTGTCAATGATATCATTCAAGAAAAGAGAAGGAACAAGTGCATGTGTGCACCAGTTGACATTATCAATGTATTGCTCAGTGATGGAAGTAATCAACTAAGTGATGATCTAATTGCCGACAATGTAATCGATTTAATGATACCCGGAGAAGACTCTGTACCTGTACTCATAACACTGGCAATATATTACCTCAGTAACTGCCCAATGGCTCTCCAGCAACTAAAGGTACAAAAGAACGAGACAATTATACATAAAATTAAATATTAATTAGTTTCCGTTTAACAAAGATTTATGATGTGCACAGGAAGAAAACATGCAATTGAAACAGAAAAAATACCTCAGTGGAGAAGATTTACAGTGGATGGACTACATGACCTTGTCAATCACTCAGAACGTATGTTTGCAAGTATTATAAAAATGTTATACACACTCCCCTTATTCTCACTTACTCATTCATGCGACACTTATCACTTTTGCATGGATTCCTTGCTAACCAAGTATGTGTGTGTATGTTATTGCTATAAAATGTTGCTCTGTACTTGTAAACAGGTTATAACAGAGACCTTAAGGGTAGGTAACATAATATCTGGAATAATGAGGAAAGCAGTGAAAGAGGTAGAGATAAAAGGACAGATCATACCTAAAGACTGGTGTGTGTTTACATACTTCAGATCAGTTCACTTGGATGGGGATTTATATGATGATCCTTTCAAATTCAATCCATGGAGGTGGAAAGTAAGTGGAAGAAAGTGTTACCTCTTGTCCCATTCAAGGAAAAAAACTGCTGTAATCTGTAATGTTTACCTCAATGTATATTTTGAAATTGACAGGATAAGGATGTAACAGCTTCAAGTAGCTTTACTCCATTTGGAGGCGGTCAAAGACTTTGTCCTGGGATAGATCTCGCTAGACTAATAGCTTCCATCTTCCTCCACCAACTAGTCACTTGCATAGAGTAAGAAAAAATATACACCGTATAACTATGCTGTTTATCAACCATACCAATAGATGACAGAAATAGCATTGTATTTGTCTCTCAAACGAGAAAAGTTTAAAGCTCAAGTTCAGTATGAACTATGAAGTAAAATCATACATGAATTTTCGAACTTAGGTTGTGTTTTCAAACTTAGACCACAATAAGAACATCGTGCTTTTCGCAAAAAAGAATTATTGACAATGTAAGTA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020259218.1	3.9e-176	cytochrome P450 90D2-like
Swissprot	Q94IW5.1	1.3e-160	C6-oxidase
trEMBL	A0A804L0Y6	6.4e-173	3-epi-6-deoxocathasterone 23-monooxygenase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G13730.1	57.69	3e-150	529	CYP90D1	cytochrome P450, family 90, subfamily D, polypeptide 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G02647	AT3G13730.1	442	173	4	35	463	50	490	57.69	3e-150	529
AfisC2G02647	AT4G36380.1	442	207	4	36	462	69	510	49.77	4e-132	468
AfisC2G02647	AT5G05690.1	443	260	6	36	466	31	470	37.92	8e-91	331

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00067.19	p450	Domain	37	444	163.5	6.4e-48

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0001578	P	microtubule bundle formation
GO:0005783	C	endoplasmic reticulum
GO:0005506	F	iron ion binding
GO:0022900	P	electron transport chain
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009647	P	skotomorphogenesis
GO:0009826	P	unidimensional cell growth
GO:0009911	P	positive regulation of flower development
GO:0010224	P	response to UV-B
GO:0010268	P	brassinosteroid homeostasis
GO:0010584	P	pollen exine formation
GO:0019825	F	oxygen binding
GO:0016125	P	sterol metabolic process
GO:0016132	P	brassinosteroid biosynthetic process
GO:0016709	F	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen
GO:0044425	C	membrane part
GO:0044446	C	intracellular organelle part
GO:0048366	P	leaf development
GO:0048441	P	petal development
GO:0048657	P	anther wall tapetum cell differentiation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network