result

Gene information

Detail information of AfisC2G03165

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G03165	chr2	492161971	492170200	-

Sequences

CDS

>AfisC2G03165
ATGAGGAAAGTTTGGATTTTTATGATGTTTTTCATGTGGGATTTATGTTGTTCAATTAATGATGAAGGACGGGGTTTGTTGAAAATTAAAGAAAAGGTGGAACTGGATCCATATGATTCATTATTGAATTGGAGTATAGATGTGGTCAATCCATGTTCATGGTTTGAAGTTGAATGCTTCAGTGGAGGAGTTGCATCTTTGAAAAAAAGTGAAAGTAAAGCTGCCCGGAGGCTTCTTCAAGTAGGCGGTGAAGATACGGTCATGATTCATCTTGTTAAAAAACACAAAAACAAACATAAAAAGTCGTTACCAGCAGCTGCAATATCACCCTCATTATCTCCGATCGGTTCAATTGCACCATCTCCTCATATTGAATTTCCGACCCCTGTACCAGCACCTTCATCACCAGTGGCATCACCATCTCCATCACCAGTGGCATCACCAGTAGAAAGTCCCGAATTAAACACTTTACCACCATCTATGGATAAAATTTCTCCAGTCCGTCAAGAACACCAAAAAAGGAGCACTAATACGTGGAGAATATATGTGCCAATTGCTGCAGGAGCTTCATTTCTCTTTGCTTTTTCTATAATCTACTTTCTCTGTTGTCGAGGAAGTAGAGTTGTTACTGTTAGACCCTGGGCCACTGGCCTAAGTGGCCAATTGCAGAAAGCCTTTGTGACAGGTGTACCATCTCTTAAAAGATCTGAACTGCAAACAGCTTGTGAAGATTTCAGTAATATTATTGGTTCTCTATCAGATTGCAAGTTATACAAGGGTACTCTATCTAGTGGAGTTGAAATTGCAGTTATCTCTACTTTGGTTACTTCTTCAAAAGATTGGTCCAAACAATCAGAATCTCACTTTTGGAAGAAGGTTTCTGTGATGTTTCTTCTTGATAATAAACAAATTATGTTTTTCAATATTAAATTTAAAATTTTAATTTCTATGCAGATATCAGTGCTATCCAAAGTGAATCATAAAAACTTTATGAACCTCTTAGGCTACTGTGCAGAACAAGAGCCATTTACAAGGATGATGGTGTTTGAGTATGCCCCCAATGGGACTCTTCATGAGCATTTGCATGTAAAGGAAGCAGAAGAATTAGATTGGGGAGCACGTCTGAGAGTAGCCATGGGTATAGCATATTGTCTAGACCATATGCACCACCTCGATCCACCCGTTTATCTAGAACATCTCAACTCATCAACCATATACCTAACCGATGATTATGCATCCAAAGTAGGCGACGTTATATTTTCTAAAGACCCGATCGAAGTTCATTCAGATTCGAAACCTCCATCTCAGCCAATCATTGTACACAAATTTGGAATGTTGTTACTGGAATTACTATCGGGCAGGGTTCCATTTTTACTCGAGGAATGCAAGTCTTTATCTATTGAAGAACTGATCGATCCAAATCTTAAAGAATTTCAAGGAGAAGACGCCAGAGCATTGTTTCAGGTTATACGAGCTTGCTTGAATCCAGATTTAAATGTTAGGCCGACTATTTCACAGGTTGTTGCAAAGTTAAAGGAAATTACATCTATGTCGGCGGATATAGTGACACCAAAAGTGTCACCATTGTGGTGGGCAGAGATTGAAATTCTATCTTCCTGA

Protein

Gene

>AfisC2G03165
GTTCTCTTCACATGATGTTGAGAGCAAACAAACGTACTTCGCCAGAGCCACAAGTCCATATATATTTAGTTATTATTAGTAAATTCCACGACCAAATAAATGTTGGTCAAAAGTATTGGCATACAATTCATAAATGAAAGAAAGGAAGATTAAATCAAATTAATGGCATCACTCAGGAACTCTGCTTTGAATACTTCCATCTTTCTCCGCGTACCCAATTTTACTCAATTTTCCATTTCTTCCACCTCTAGCTAAAAAGTTTAGTCTTTTCCTGTCATTAAGCTTTATTTTTTATCAGATGAGGAAAGTTTGGATTTTTATGATGTTTTTCATGTGGGATTTATGTTGTTCAATTAATGATGAAGGTAAGATTACTCTTTAGCTGATGGTTATCATCACTTTTATATTTCATCTATATTTTTAGCATGGTTATACTTCTTGCTTGAATTTTAGGACGGGGTTTGTTGAAAATTAAAGAAAAGGTGGAACTGGATCCATATGATTCATTATTGAATTGGAGTATAGATGTGGTCAATCCATGTTCATGGTTTGAAGTTGAATGCTTCAGTGGAGGAGTTGCATCTTTGTGAGTAATTAATCTATTTCTTTAAAAGTTCATAATCATTGTTTCTCATATGCACATATGAAAAGTCTATTATTGTTGCTGGAGTTCGACTTTTAGTGCATTGTAAAAGTTTAAGCCAACATTCTAGTCTCTTAGATTCCCAATTATATCTCTTTCCTAAATTCTCCCATAAGCTTAACCGCTGTGTTATGTATATTTTATTGGGGTTATTATAACTCAGTATAATTGGTTCATTAGATTAAGTTTTTACTTGTTGCATATATATCTTCATTAAGTAGCCCTACAAAATAGCATGATCCATTACTCTATGGTAAGTTATATAATATTAAGATGGTATTAAGGGGACACTATTATTTACCAAGGATACGAGAGTTTAGTTGAAATAATTTATGTTAAGACGGGGCTAAGAGCATCTCCAGCAAAGATGAGGTTCGATACTACAATTCGCAAGATCATAACATGTAATCGTTGAATTTCTACAATAGGCAAAAATAATCAGGCCCTCTTTCAGTGTATAAGAAAATTCGAGTATTCCAATTGACAAACATCTCAAATCAAACCAGCACAACGGAAGCGATGATCGAACAATGGATGTGCTAAAACAAATGGGCAATAAAATTGATGGTGACTAATAACATCCAGGTCCCCTAATTTCACAAACAATAACAATCACATGTGCAATCAATAAACAAGTAAATTAGAAATAAGGGAGACATAAGATTTATAGTGGTTACACTATCAATGTGCTTCCACTTAGAGAAGAGAGGATTATATTATTGAGAGTTTTACAAGAGATTAATATAATTTGATATAATGGAGGGTAGCCTAAAACAATAGATGAAGTAATTGCTACCACCTTAAATTAGATGATGTATTACGTTATATAAACACCTAATTAAGTCCCATCGTCAGATTAACTCACCAATACATCACAACCATTGATGTAGAAGAAATCTGGATCAAAAATACCCAAACTAGACAAATCTGCTCGTTAGACGTGGGATGTCATAAGATGCATGTGACTGGTCACCGCTCTTTGTTTTGATGCAGGTTTGTGACTGGTAAGGTGCCAAAACATGCAGGTTGCCAGTCGCAATTTCAGCAATGCTGTTTTTCTGTAGGTTGAATACTATAACGTCCATAACTTTCAAATCATAACTCTAAACGACGAATCATTGTCGCCACTACGATTTAAATGAAATTCTCTTTGATTTGATATATTGTATTGCATATTTCAAGACTTCACTTTGATATAATATGTCATCAAAACAAAGCCCATACCAACTCCACTGTCAATCAATAACCAATCTTAACCAATAGAATATGTCACTTTCCCAATGAGCTTGCGTATGACCATCACTAGTTGCACTCCGCTAACAAGTGATAGGGGCACCTAGCACTTTAACAAAGGAATGGTTGATTTTACACAATTACCAAAGTCTATAGGATTAAAAAGTTTAGTGTATGTTAATGTGCATAGTTATTCCTTCATGAGTTTTTGTAAATTAAGACTTAAGAGCTGTATACCTAATTGACTGATGTCAATGGAAATTACAACTGAATGGAAATCAAGCGATTTCAGACATGTATATTGGTTATGTTACCAAATACCAAGCATCACCGGAAGTTAGCAGTTTTTTTTTGTTAAGTCAAAAATGTTGACTACATCATTAGTATGGCTATTGTTTAAAAAGGGTTACTAAAAGTTTACAAGAAAGTGAACGGAGCAGGTTAATAAATTTATTAGAAGCGTACTGAAGCTGCCGTGATGATCTCGCTCTTCTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTATTTTTATTTTTATTTTTTGGAAATATGTTTCTTTTTGTCAAGTACAAATGAGGTTGCAAGGAAAGTAATAGATGATTCAATCTTAGTATTGACTTCTGATTATGTACTTTGTTAAATGCTACACTTCTTTTCAGTGAGTTTGTTCTCAAAAGACTTGGTTTCATATACTAACTGAGTTTTCTAGTCATAATTGCTATAAATACTTAAGATACCATTTCCGGTTGAAAATATGTTAGTATTGTTATATGAGGTACATAGAGGTGAAATCTATCAGTTGATTTGTTCGAACGTTAATTGCCACACACACAAGATTGCATTGTTTGAAGCTTTTCACTTCATTTTTCTCTCATTGACACTGTCATTTTTTTCTTTATCTTTTTTGTTTTTTACATAACATTATTATAAAAGACACATTTTTAGTTTAGGTTAATCTTTGAAAGAACTCATTTTAGATACAGGCCTTTGGAGAAAAATTATTTCAACAATAGACCTCATATGAAACTTATTACAAAAATATGCTTCATTTTCTGCTTAGTATATGCGTGTTTAAAAAATGTGCATATACAGTTTCAGAATTCGGACACACACACTTTGCAAATGCCCATGTACAAATCTGAAATGTGAGCATTTTAAAAATGCGTATATACTAACTCGAAAATCAGGCCTATTTTTATAACAAATTTCCTATGAGACATATTATTGGAATAAGTTGTTCATGGGGGACTAATTTTATAATTAATTCTTTTTTGAAACTATTAGCAAAAATAAGCTCATTTTGAAACTATTTTAAAAAATAGGCTAGTTCTGCCAGTTCAACGCTAACTAAGAGCGTTTTCTTAACAGTGCAATTACGAATTGCATCCAAAAAGGTATAACAGATGCACTTGGGGTTCGCACCCATTGGATCTATTGTGTTGTCATGAAAGAGGGTGGAAGCAGTTTATCCTCTTACCTTCAGAAAATTAATTTTACATTGGCACAATTGGTAGTTGCACCAATGTAAATTTAAATGGTGCAATTCTCGATTGTGTCCATAAGCTTAGCTATCAGCTCATTTTAACTGGCAAATCAAATTATTTTTGCATAGTTTTAACACTAACCTAGAAATACAGTAAGTTCTAAAAATTAATCTAAATTGAAAATTTGTCCTATTTCAAATCATTGAATCTTCACATAAATGTTCCATGAACTTGAGTATATATGCTAGAAGTGGCTACCTGTACCTTACTGAAGTTTATATACGTTTTTGTGATTTCTTTATTAGTGGTTTGCAATCAAATAAACATATATTTGATGGCAGGATCATGATCCCTTATAAGTGATTATCTAAACAGAGAACATTACATCACCACTGGCTTCAGGAAAACAAAGATCGGTGACTTGAAAAGAATCAACAAGCAACCAAACGCGCTGTGTTAATATAGTGGACAGCCTAGCACACATTACTACAAGCAATAGTGATTAAACAAAATAGCAACTTCATAAAAAGTAATCACTTGGGAAAGCGTAAATTTAAGGAGTAATGGGAAATATCTAAATTTAGTATAACGAGTAATGTGCACAATGTGCACATGCACATACACATGATGTAGATTCTAGGGATACGATATGAAAAATTGAAAGAGTGTTTGTGTAACATTAACGATGGTTCACACGATGAACTAACCCATGAATACTATACAATCAATTCCTTCAGTAGAGACTATTAACTGGGGATATCCATGTGATCTAATGATATTACATGATATATGCCATATACATAATGATCTATTAAAAGAAATAAATATACTTCTTTCTGTTGACTAAGGTCATGAAAAATAATTTTTGATGGTAAATATATGCACATAACCTTAACACGGTTGCTCATGTACCCAAACTTTTTTGCATCGTTAGACTACCTGTCTTAAAATTTAGAAAAATCAATTGATTGTAGCACTCAACAATGCTCATTAGATTATAAATTGGCTTGAGATAAATCTGCAGTTTTAATACGATAATGATTTTTTTTTCTTTGCCTTTTTATTTTAATGTTTACATGTAATTGTGTCAAAGTAGCACTTAGTTTTGCGCCTTTGTTTATAACAAGGTTTTGGACATGATAGGTTTGTTTTTCTAAGATGACAATGGTGTGATCTTAACAATCCTTGATAATAGCTGAGCAACTTCAACGATCCTTATCCAGTTGTATATATTTAATTTTGATGCCAAGAACTCTGCAGAACAATTATTTTCTAGAGTTGTCCAAAAGAGACTGGGAAATGCAGAAGCTCAAGCTGTTGGACTTCAACATGATAACTTGTGGAACTATTCCTTTATACCTTGGCAGTTTATCATCTCTCCTAAAAGAATTATCAGTTCAACTGAAAATGTTGAATGTACTCTTCTGAACACAGTTTTTTGTCCCTTTTTTTTTCCCCCTTTTCTTTTTTTCTTCTCACTGCATTCTTGTGTTATGGTCAGGGATTGTGCCCTTCAAATTAGTGAGATACAAGTGCACACATATAAATCTTGATTTTAAACATCATTGTTTTGTTGGGTTACTGTTAACTATCAATATAACATGATGTTTGTTTGATAGCTTAACGCAATGCATATTTGAATTAAAACT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020274380.1	1.9e-134	protein MALE DISCOVERER 1-like
Swissprot	C0LGQ4.1	2.3e-92	Protein MORPHOGENESIS OF ROOT HAIR 1
trEMBL	A0A5P1E9S0	1.4e-134	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G18640.1	45.79	2e-95	346	MRH1	Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G03165	AT4G18640.1	404	167	7	159	539	301	675	45.79	2e-95	346
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AfisC2G03165	AT2G40270.2	441	191	9	130	539	73	481	42.40	7e-93	338

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g519093.t1
Allium fistulosum	AfisC2G03165
Allium sativum	Asa6G05041.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	20	59	26.9	4e-06
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	318	391	38.2	8.6e-10

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003006	P	developmental process involved in reproduction
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0003723	F	RNA binding
GO:0016020	C	membrane
GO:0006952	P	defense response
GO:0005576	C	extracellular region
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0016491	F	oxidoreductase activity
GO:0006970	P	response to osmotic stress
GO:0006996	P	organelle organization
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0010038	P	response to metal ion
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0010467	P	gene expression
GO:0012505	C	endomembrane system
GO:0016070	P	RNA metabolic process
GO:0044249	P	cellular biosynthetic process
GO:0044711	P	single-organism biosynthetic process
GO:0048765	P	root hair cell differentiation
GO:0050794	P	regulation of cellular process
GO:0090406	C	pollen tube
GO:1901576	P	organic substance biosynthetic process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network