result

Gene information

Detail information of AfisC2G03625

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G03625	chr2	575183804	575189533	-

Sequences

CDS

>AfisC2G03625
ATGAAGAAGAGCAGCAAAACCCCGAATCCCAAATCCAGATCCCGAAGTACCTCCAAATCGGTGACAGCTGTGGAAAGTTCACCGACTACTGACCTCACCGTCTACTTCCAGAAAGTTAAGCTTGTGAAAGAACCCGACGAAGCTCCTAAAACTGCAGCTGATGCCAACAAATCTGAAGAACTTCTAATTCTTAGCCAAGATTTCTTTAGTACTCCTGATTATATAACGCCTGAAATGAACATGTCTGATTTTAGTAAGGAGGTTGATGTATGCCCTAACTCGCCGGAGAAGTCTGTTAGAACTAAGGCTAAGAGGCACAGAATTGATAGCAAAAGCAATAATGGTGAGTCCCTTGAGCCAATGACTAATCTGCATATAGATACATTGGCTTCAGAGGAACTTAAAAACACCTCTGGAAGTGGATCCAAAAAGAAGCAAAATTATGTTCCACAGTCTGCAATAGCTTTACGCTGCCGTGTAATGCCACCTCCATGCATCAAGAATCCATATGCAGATGCAAATTCAACTGTTGATATGGGTATATTTGGCGACAGGAGATCAAAAGTAATAGGTTTCCCTCAAAATATTGGCGGTGATGGTCTTTCACGATACCGTACCGATTTTCATGTTATTGAGCAAATTGGCTGTGGTAATTTCAACCATGTTTTCAAAGTTGTGAAAAGAATAGATGGCTGCATGTACGCAGTAAAACATAGCATTAAGCAGCTGCGCCATGACAATGAAAGGAGGCAGGCATTAATGGAAGTTCAAGCTTTAGCAGCTTTAGGGTATCATGAAAACATTGTTGGATATTACACCTCATGGTTTGAAAATGAGCAGCTTTATATTCAGATGGAACTTTGCGATGACTGCCTGTCTATTAATAGAGGTCATACAATTGGAGGTGGAGAAGTGCTTCGAGTCCTATATCAGATTGCAAAGGCATTAATGTACATGCATGAACGAGGTATAGCTCATATGGATGTGAAGCCGGATAATATTTATGTAAAGAATGGTATTTATAAATTAGGTGATTTTGGCTGTGCAACCCTCCTGGATAGAAGTCTTCCGATAGAGGAAGGAGATGCACGGTACATGCCTCGAGAGCTGTTGAATGATACGTTTGAGCACTTGGATAAAGTCGATATATTTTCTCTGGGTGCAACTGCTTATGAGCTTGTGAAAGGATCTCCATTGCCTGATTCTGGCCCTCAGCTTTCTTATCTTAGAGAAGGCAAGATCGCTTTGCTTCCTGGGATTTCTATGCAGTTTCAGTGCTTACTCAAGGCAATGATGGACCCTGATCCAGCTAAACGTCCTTCAGCCAAAGAAATAATTGAAAATCCAATATTTGAGAAGGGATGCAAATTCTTCTGTTAG

Protein

Gene

>AfisC2G03625
ATACACTTAAATTGTGAAACAATTATAGAGATCACTTGTAATAATCAAAATAACTAGAAGTTTTACGTAAAAAATAAAATTAAACGCCATTTTTTAACTCTCCCGCCAATGCGACAACAAATAATCTTATTTCAAAATACATCTATAAATTCATTACGTACCTCCATTATTTGATTATTATTACCAATGAAAAAAACCCTAGTAAAATATACTTAGAATATTCATCTTCTCCGTGAAACCAAATCAAATTCAAAGAAGTAAAATGAAGAAGAGCAGCAAAACCCCGAATCCCAAATCCAGATCCCGAAGTACCTCCAAATCGGTGACAGCTGTGGAAAGTTCACCGACTACTGACCTCACCGTCTACTTCCAGAAAGTTAAGCTTGTGAAAGAACCCGACGAAGCTCCTAAAACTGCAGCTGATGCCAACAAATCTGAAGAACTTCTAATTCTTAGCCAAGATTTCTTTAGGTATGTTACCATTTTTGTCTGTTTATTTTTCATGGATTTCTTCTTAATTTAACTCTTCTTCTTCTTGTCTTTTTTTATTTTATTTTATTATTATTTTTATGCAGTACTCCTGATTATATAACGCCTGAAATGAACATGTCTGATTTTAGTAAGGTGAAAATCGTGCTGAATTTATACGTCTGGGTTTCGATTGGTAAATTGTTCATAAGATTTGACCTTTTAATTGTTTTGGGCGTTTGTAGGAGGTTGATGTATGCCCTAACTCGCCGGAGAAGTCTGTTAGAACTAAGGCTAAGAGGCACAGAATTGGTATGTTTTCTTTTATCTGGTCGAATTATTCTTTCATTATTATAAGCTCGTTTAACTGATTTGTGCTTTGATCGTTTTCTTAACCGTCCAACAATTTTTACATACGGACAAAGATTAGTGTACATGCAAAACATTGATTGCGCATGTGATGTGTATAGTTGGAAGTCCGTTTTGAACTTAAGCAGCTGATTTTGTGGAATAACCTTCAAACTTACTTGATTGAAATGGATTGAAACGAGTAACTGAACAAGTCATAAGATAACAAAATTAGGTAACTGATAAAACAAATGAGAGGAGTAAGATGTCAACTAATAGCATCAGGGACAATTAATCCCATCTATACAGAGAGTGCAAGAACAGCTGCTGCATAGGTCAACTGTCGTATATGAACGCTATGTCAACCAGTACAAATCTTAATGGAAGTATGTGGCTAGTGTATTTGCCACTAAACTGATGGAAGTTTCAATCAAATGCCTGTTTTGTTTACTGGTGATGGTGTATTGTTACCCTGCATATGATTTTGAACAAATGTGACAATATAGTCCAACAGTATAGCTGAAACAGTATGATCTTTTAGGAGCTTCTTAATAATTTTTCTTAAACACTATAAAACTTAGCTACTAAATCTAAATCATGTATCTTTGTTAAGTTCTTATAACTGTCATGATTCATCAATACCTTTGAAATACGATACCACAACCAAAATTTTAGGTTATTTATTCAAATTTATAAAATACAATTGTACATGTTCTAATATCTCACTCTTTGTTTTTGTTGGTATGTTAGCAGATAGCAAAAGCAATAATGGTGAGTCCCTTGAGCCAATGACTAATCTGCATATAGATACATTGGCTTCAGAGGAACTTAAAAACACCTCTGGAAGTGGATCCAAAAAGAAGCAAAATTATGTTCCACAGTCTGCAATAGCTTTACGCTGCCGTGTAATGCCACCTCCATGCATCAAGAATCCATATGCAGATGCAAATTCAACTGTTGATATGGGTATATTTGGCGACAGGAGATCAAAAGTAATAGGTAATTTTGATTACTCCCTCTTATTTTTCTTTTGATTGTTTATGAATATTATATGCATCCTTTTGACTTTTGTCATATATCCTGAACTGAAAAAGGTTGACATATACATCATGAGTTACTGTTTGCCTAATGCGATGGTTTACGCATAAAAACTCCAAATTGAATATTATTACATGCTTATGACTGTATTTAGGAGCTGCTTTATTTTTATAAATAAGGTGTTACATGATAGCCACAAATAAATGGCCAGACCAATTGAAAGACTGTTTACTTGATCATGATCTTGATGATATAACTTATCACAGTCATCAAATTTTATAAGATTTTATCTACGATTGCTTTCCCAACCAACGTTTACAAAATATAAATGTTTTTCAACGGCAGGATAATTTGGACATAAATCAGTGGGCGAAATGTTTTGACACCTAATGAATACTTTTATATCCCTATTCCAGAAAGAGAAATGGGAGAATTTTTTTCAGCATTATCATTTTATACAGTGCATATTGAATGTCACTTCATTCACAAATCAATCTTACATCATCTCCTACCATCTTCTTTCCCATGTGCATTACTATTCTGTTGTGCAGTCTGCAACAAAAATTTGAATATCAAAATTTAGAGTTCTTTTTTCACTTCCAAATGATTATGGATTTCTAACTGCGCAACCTGTGGCAGAATTGCTAACTGTATTTGGAGTCCCTTCGCGTAATTAAAATACATGGTTTTTGTTTTTGCAGGTTTCCCTCAAAATATTGGCGGTGATGGTCTTTCACGATACCGTACCGATTTTCATGTTATTGAGGTTGCCAATTGTGCTTTTTAATTCCCCTTTTATTCGAATAAAAATTATTTTGATGTTGAGTTGTATGTTTAATTTAACAATAGTATCAACATTTCAAATTATGTGATCGATGTTGGCTTCACTTGTGGGTTACAATGATAACTTTTACGGTTAGAACCTTAACAGGACACATCTTATAACTAATTTTACCAACAGTGCTAATCATGACAGTTATAAGAACTTAACAAATTTAGTTATAAAATTAGTTATAAAATTTAAGCGTAAAATTAGCAGGATATGAAGGATCTCTCAATTTGCAAATATATGTTCAATATCATGGGATCCGTCGGTAATCTTTCTCCCACCCCTGGTCCCCAAGAGTAATGCTAACCCAAGGAACAAGACTTTAGTAGCATGAAAAAACTTTACTGACTTCTGTAATTTTCATATTTTCCAGCAAATTGGCTGTGGTAATTTCAACCATGTTTTCAAAGTTGTGAAAAGAATAGATGGCTGCATGTACGCAGTAAAACATAGCATTAAGCAGCTGCGCCATGACAATGAAAGGTATCATCTTTGTCATATTTAAATTTCATGAACTTCAACATAGCTATTTACCTTTAGAAAACCTTCGGTGGTTACAATGAAAAGAACAAAATATTTTGACCTCTGATTAATTTACCTTACATTCAGAAATCAGTAGATATGTGAAGTACAATATGATTATAATTTAGTGCTCAGTGCATTCGATGAAGCAGTCAAAAGATATAAATGTCCATGTTTGCTGGATTAAATTTTCAATACTGACAGTCAATGTATTTTGGGCACTGTTAATGTGTCCTAAGAGCACATATTAAGAATCGTATTTGTTTACTAAAATACAAAAGAATTTATTCTAAATACCTATTCTATCCTTACAGCATAAATAAATATGTGGAATTCAGTGGGAGCTATTCGAGTAATTTAACAACCTTAACATGTGCCATGTTAACATTTTCCAACTTTTATAATTCATAGATAAATGAAGTTGTAAAAATGTGATTCGATTTGTATTTCAGGAGGCAGGCATTAATGGAAGTTCAAGCTTTAGCAGCTTTAGGGTATCATGAAAACATTGTTGGATATTACACCTCATGGTTTGAAAATGAGCAGCTTTATATTCAGATGGAACTTTGCGATGACTGCCTGTCTATTAATAGAGGTCATACAATTGGAGGTGGAGAAGTGCTTCGAGTCCTATATCAGGTTTCTTAGACATCGGCGTTTTTTTTTTCAGCTATAATTTCCTTAGGAGATACGACAAATTTGCAACCAATTTTTTTACTTACGAACTTTTTGATAAGGTGTCTTATGCACAAAATCTGTTGTATGTTTCTGTATTTGGTTAATATATGAAGAGTTTTCAATTCTGAAAAGAACCTTAGATTCTATCAGAAAGTTCCTTGGATTTTTTATTGAGTTATCTTTTAAGTCAAACCTAATATCTTTTCTTCCGAATTCCTTTGCTATAGGTTTTCTAAGTAACAAGTATTGTAAAGACAACTGAATTTTTACACCATTATGTTTGACAGGAACTGTGAACATAATAATAGTACATAAATTTATACATAGTCAGTGATTCATTTTGCCAACATTATGTTATTTTTATAATGTGCATTGAACTGTCTACAGATTGCAAAGGCATTAATGTACATGCATGAACGAGGTATAGCTCATATGGATGTGAAGCCGGATAATATTTATGTAAAGAATGGTATTTATAAATTAGGTGATTTTGGCTGTGCAACCCTCCTGGATAGAAGTCTTCCGATAGAGGAAGGAGATGCACGGTACATGCCTCGAGAGCTGTTGAATGATACGTTTGAGCACTTGGATAAAGTCGATATATTTTCTCTGGGTGCAACTGCTTATGAGCTTGTGAAAGGATCTCCATTGCCTGATTCTGGCCCTCAGCTTTCTTATCTTAGAGAAGGCAAGATCGCTTTGCTTCCTGGGATTTCTATGCAGTTTCAGTGCTTACTCAAGGTACAGCTTACAACCTAAACAGCAGGCAAATACACATATTGCAGTATGATTTTATTAACAAGAAAAAAGTCACAGGTCCCTGTTTTTGATGTTGTTATACAAAAAGTTCTTGCAGAAATAAATAGGTAAATTTGGTCCCTATTTTTCAAAAATAAAAAAACGCAAAATGTCTTGCACTTTTCTGATAGAAAATGCAAGATAACTTGCACTTTTCTAATTTTGAAACGAAATTTTCGAATTTTTCGAAAATTTTGAAAAGTGCAAGTTAACTTGTACTTTATCAAAAAATCGCAAGCTAGTTTGCGCTTTCTAATTTTGAAAATTTTAAAACTTTTAAATTTTTTGAAAAGTGCAAGGTAACTTGCGCTTTCTATCAGGAAAGCGCAAACTAGTTTGCGCTTTCTGATTTTGAAAATTTTAAAATTTTAAAAAGCGCAAGCTAATTTGCGTTTTCTTATTTAGAAAAAAATAGGAACTTAATTTACATACTTATTTCTACGGGGACTTTTCTTGTAACACCATAAAAAATATGGACTTTTCGTGCAAAGCCTCTTTTATTAATACTAATGGTCTTAGTATTAATTATTGATACATTAATTTTACAGTAACAAATACAATTACCAATTAACATAGCAATTTGCATTAAATAATAACACTGAATTGATATTATATCTATGTAGGCAATGATGGACCCTGATCCAGCTAAACGTCCTTCAGCCAAAGAAATAATTGAAAATCCAATATTTGAGAAGGGATGCAAATTCTTCTGTTAGTGAATGATGGTAATGGTTGCGTCTGCCGTTGTACTTGCACAAATTTTGTAAAGATATGCCTTGATATAAAAGGCAGATGTGGATGTCATTATTATATTGGACTTGTATCCATTCATGATTAAATATGTAATATCATGTGATTGTGAACATCATGACAATAGCATCAATTGTCATTTGCAAACGTAAGTTGCGGATATTTTGTTGTTTATGGTTCCGTTGTGTTGGAATGAAACTATGGTTATATAATCAAGCAATGGTTATCATAAGTTTTTGTACGTTGGTATGTCTTGAACTCTTGACTATCCTCGAATTATAACATAGGTTCTCTCTATC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020254629.1	1.1e-173	wee1-like protein kinase
Swissprot	Q6Z829.1	2.0e-145	Wee1-like protein kinase
trEMBL	A0A6I9S9P5	2.5e-161	wee1-like protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G02970.1	56.63	2e-134	476	ATWEE1;WEE1	WEE1 kinase homolog

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G03625	AT1G02970.1	415	166	4	53	453	83	497	56.63	2e-134	476
AfisC2G03625	AT3G20860.1	255	166	7	207	449	14	266	29.41	2e-20	97.4
AfisC2G03625	AT4G19110.1	284	168	8	208	452	4	284	26.06	3e-20	96.7

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g538995.t1
Allium fistulosum	AfisC2G03625
Allium sativum	Asa6G01374.1
Arabidopsis thaliana	AT1G02970.1
Oryza sativa	LOC_Os02g04240.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	208	451	160.4	4.9e-47

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0005515	F	protein binding
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0007050	P	cell cycle arrest
GO:0007088	P	regulation of mitotic nuclear division
GO:0007143	P	female meiotic division
GO:0018108	P	peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0033314	P	mitotic DNA replication checkpoint
GO:0060631	P	regulation of meiosis I
GO:1904145	P	negative regulation of meiotic cell cycle process involved in oocyte maturation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K06632	WEE1; wee1-like protein kinase	EC:2.7.11.1	Cell cycle	ko04110

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network