result

Gene information

Detail information of AfisC2G04365

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G04365	chr2	720102861	720124418	+

Sequences

CDS

Protein

>AfisC2G04365
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Gene

>AfisC2G04365
ATGGCATTTTTTAAGAACTATGATAATAATATAATGGATGCCGAGAACAACTTAAATGGGAAAGCTGAGGATAATGATACTGAAGAAAACTACACTTCATTGGCAAGTATCAGACAAATGGACTTAAATTTTACGGACCATGATCACGAATTGGAAGAAGGCAATCATCAAATTAAAGGTGAAACTTCAGTTGTTTATAAGGATGAAAACATTGATTTTGATGAGAATTTAAGACCTAGAAAAAGAACAGGTCAGTCTGGAACTTGGGGTTCTAGTTTTTGGAAAGATTGTCAACCATTGGGAGGAAGCAAAAAGGAAATAGCAGTTAACGAAGAAGATTTGACTGCAGTTAATTCTGAAGACGATGATCAAATATATAGGGGAAATGCCGATGTGCCTGTGGATGAAATGCTTTCTGATGATTATTATGAGCAGGATGGAGAGGAAAATAGTGATTCTTTGCGTGGTCACGGTCCAAGTTTTCCTAGTGTTTCAAGTTCTAGGCTGCCACCTAGGCCATTACCAACTACGAGGAATGTGGTGAAGAGCTCAAAAAGCATCAACTATGCAGAACATGATTACGAGGATGATGATGACGAGGATAGTGATGATGATGGTGATGGTACTCGTCAACCCCACTTATAGCTTGTTTCCTTATGTTTTTGTTTTAATTTACTTGAGCCGTTTCTATAAGTGATGCTTTATTTATTTTTTGTTTGTTGCAGAAGATGATCCAGATGATGCTGATTTTGAGCCCGACTTTGCTGAAGAAGTCAAGCCCACCAAACAAAAGGTTTGTACATGCTTTTTTTTGCCACCCAATACTCATATATTTGTTCACTGAAATGTTGACTTTTGTCAATGTAACTTTTATTTTCTGTAGCTCCTATTTATTATATTAAAAAGTTTCTCGAGTATTACTTAACTGTCGATGCATGTGTAGAGTATATTCAATTGAAACTTGAGTAATAAAGTTGATCAGTTATAGCTGGTAGCGGTTACATTTATACATTTTCTCTTAGTACCACCATCGTTGACATGAGGTCTTGAGTCTTTATAGTGAATGTTGTACACAAGTTCGAAATAAAATATACCATTTTTCTCAAGAACATAATTATCAAAGGTGCGCTACGGCCCGCGGCGCAAGGCGCGGCTCAAATGGCACGCGACGCAAAAATGGCACACCTTTCGTTCTATTATTGTTTTTTACTTCTATTTTACTTATTTTTCAATTTTCACAATCCAAACTAATCTCCAACAATGGTTGAATGTATTATATAATTTTTGTACAACGATACGATTACACTTCGAACTAAACTCCAATAAACTTTTAACTGTTTATTTATACTATTGCTGCACCTAACTACTAGACAATTGAAACCTAGATTCGCGATTCCGATCCGAACCTAATGGGTCTTGGGTCGGGTTGGATCTATTTGATGAAAAATAACATAAAGAATCGATCTGACCAGGAAGATTGGACAAAAAAGCGAGAAAATATATGTTTTTTTATTGTTATTACCCAGTCGGATTCAAACCGACCTAATGTGAATCGAACCTCGGGTCGTGTCATTGTTTTAAAGCATACAAATTAGACTCGACAAAATCTAACCCAAATAGAATCGAGATTCGTCATATCGGGTCTAGATCCGACCCGACTGGTCTAATTACCATCCTTGCAGTTAACAAATAATCTCGTCGCATTCTTCAAATTAATCTCGAACTAACTTCAAACTATATGTTCTAATTACCATTGCACTGAACAAGTAATTTCGAATGGATGCTTTTTCAAATTAATCTCCAACGAATTTCGAACCGTCTGTTCCTATTACAGTCGCACCAAATAGTTATCTATGCTTTTACATTTAGTTGGTCATTTCTTTTAATATCACTCTATATTCCTCTCTGTGATTATATCATGTTCATTATGTAAGGTCTACTTCTAGCATTTTTTTAAGCATTGCACAGTCTTCTTTGATGTTCATTTGACTTTTATTTTAATTGCTTGCTAAGTATTTGCATAAATTGCTATAGACTTTAAAACATTATTTCCTTGGGTAGAGGTTTTGAATTATTGTTATGGTTCATCAGTTAAATTATTACAATCTTCATAGAAACTTACATTTTCCTTTCATATGCACGTCAGACTAAAATGTCTGATGATGATTTTGACGACGACGGTGATGATGAAGACGCTGATGATGATCTTGATCTCTTGGATGAAGAATTGGAGTATTGTGACAGTCGTTCACAAAGAAAGCGGCAAAAAGTTGGACGCAAACCAAAGACAGCAAAAGATAACAGATCCTCCATAAATAATCGGAGAAAAAGAGAGAGAGCTGTATTCGAGGATGAAGAATCCTCTGAAAAAGATTCTGAACACGACTCCAATGAAGAATTTAGTCGAAAAAGCAGAAAGTTGGCAACGAAAAAGACTGGTTATCAGTCTTCAAGTTCACAGTATATAAATTCACACAGTAATGAGATTCGTACATCAGGCAGATCAATTAGAAAAGTATCCTATGTTGAAAGCGATGATAGTGAAGAAGGTGAAGATAAATCAACCAATCCTCAAAAGGTGAGATATTTTGTAGAAAATAACAGGATAAGGTTACATCAAGACATTAAGCTATCAAATATACTGGAATATGTGTATCTATAGGTCTCATTTCACATACCACTTACATCTTTTTAATCTGTGAAGGGTTTACTCCTGCTTTTACTTGTTATGTTTCTGCAGACATCTATTGATTGAAGTTTTTTAACTACTATTCCATGACTATTAATGATATATATCGTGTTTTGCAACTATATCATGAACCACATTTGCTAGCAAGAATTCGTTTACTTTATTTTCTTTGCTTTGTACAATGGAAGCATATTGGAATTGCTCCCGGAAGCCATTCACAACCGAGTTACACGGTTTTTCATAATCTTTGACTCTGTTACTGCAATGGTTCCAATTCATCACTTAATTCTTCGATCAAGTGTTTAGTTGACTACATAATTGAAACTAGGGGAATTTTCTGATTTTCTTTATGATTAGGTCTGGAAATATTTCAGTTAAGGATGTTTTGTAACACCCATTATGTTTAAATTTGTTTGAGGTCGCAGATGATGATGTACTCTGTTGTTTCATTGAGATTGACATGCAATTAGTTGTAATCAGCTGTACTGGAAATTAGGATGAATACCCACAACAAGAGGCAATAAAACGGCATTTTAAGCTTAGTATACATTAGAATGCGATTATTTGTCTAATTTTCAAGTGAACAACTTATTGTATTTCAGTTCTCATGTATGATAAGGGTCACGATGCTTATACATTCAAAAACTTTTCAAAATAGAATCTGCTTGAAGTTGGCGAGGAAGACGACGGTGATTCAATTGAGAGAGTTTTATGGCACCAACCGAAAGGCACGGCAGAGGATGCCATTAGAAACAATCAGTCTACCCAGCCCTGTGTTTTGACATTCCAGCCAGGCTCTGATCCTGAATGGGATGATGTTGAATTCTATATAAAATGGAAAGGTCAGTCATATTTACATTGTGAGTGGAAATCGTTCTCAGAGCTCCAAAATGTAAGCATTGATAAACATTTCTGTAAATGACATTACACATTTCACCCCCCTCCAAATTAGTTTTGTATCTAATACTTTTTATTTTTATTTTTTTATTTACAGCTTACTGGCTTCAAAAAGGTTATGAACTACATAAAAAGAGCAAATGAAGAAAGAAAATTTAAGAATGCCCTTTCACGGGAGGAGGTAATTATATCTATTATTATACTTTACACAAAACCCGAGACTCTTACTTCGTTGATAGTGAAGAAAACAGCGTTGATTTTTGTGTGTTGGTGAATGCTTGGAGTACTTCTTTATGTAATTTTCTTTTAGTTGGAAGTGAAGAATTTCTTTGTGAAGCCCATTATTTCTGTGTCTAATAATGGAAATTAATCCTGCTATGCCCATTTATCATGTTTTGTTATCATAATTTAATTATCTTGTACATCATTCAGTCTTTAGTTTTATTAATACTTGCCAGATACATCTTTTGTTTACCTCTATCCCAGAGTATAGTCTAGTACTTTAATTGCAGAAGGCAAGATAATCATAATTTTGGATGTAACCAAGTCAAGAAAGAATGATGTGCTTATATAATCATACCTTAAACGGTATGAACCTATACCATCCACAATCCATTATATTCAGTAATACCATTGAATCAGGATAGAGGTAGTACTAACAAATGGACTTGGCGGGGATAACCCAGCATGTAATTTCTCTACTACCTCCTTAATTGGCCAGGTTAGGCCTGTCCTATTTACAAACAGAATAGCTTGGTCTGCATTTAGCGCAGCATCCTGATCCACAAAATAATAAAACACACTGCCATAACTAATTATTTCTATGTTGAAATGCAAAATGCATATTCATGCTTAAACATTTCATGTTTTGCCGGTGTTTTTTTTAACACATTTGATGGATAAATTTGAAAGCATTCCTATATTTAAATACATAGCAACTTAAACCAGTGAAAGTGGGTTAACCTTGGTGCATTGGAGTCATGGGACTGGGTTATCCAACTTAACACTTATGTGTCAACATGATATTTTTGCGGTGTTAGTTACCGTGTCATGGGTTAAATTGTGGTTTTGGTGGGGTGATTTGGTAGTGCTGGTGGCAGGGATTTTTTTCTTTATGACATAGATCAAATTTATGAGGTGTGCAGTCTAGCATTGATAATCAGTGCTGTAGGCTGGAGGACATGTTGACTTGTGACATGGAATACATGCTGTGTTAGACTTGACTGGTTTCTGGGCATGTTATGGTGGGCTTCTTCCGATCCAACCCATTTACTGCTTCTAAATCTGGGAATTTAATATTATTGGATCTGAATTTGGGTATTAAGGATAGGCTAGGAACAATTTACAGATCTATGCTATCTTAAAACTATTCAGTAAACTATAATTTTGTGAGGGAAATACTCGATGTAAAAGC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Best hit in Arabidopsis

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Ortholog group

Species	Genes
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Gene Ontology

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GO:0005813	C	centrosome
GO:0006368	P	transcription elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006974	P	cellular response to DNA damage stimulus
GO:0007051	P	spindle organization
GO:0007476	P	imaginal disc-derived wing morphogenesis
GO:0007517	P	muscle organ development
GO:0008026	F	ATP-dependent helicase activity
GO:0008094	F	DNA-dependent ATPase activity
GO:0008285	P	negative regulation of cell proliferation
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009755	P	hormone-mediated signaling pathway
GO:0016581	C	NuRD complex
GO:0016584	P	nucleosome positioning
GO:0019233	P	sensory perception of pain
GO:0021895	P	cerebral cortex neuron differentiation
GO:0030874	C	nucleolar chromatin
GO:0031492	F	nucleosomal DNA binding
GO:0032993	C	protein-DNA complex
GO:0033993	P	response to lipid
GO:0035042	P	fertilization, exchange of chromosomal proteins
GO:0035093	P	spermatogenesis, exchange of chromosomal proteins
GO:0036091	P	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress
GO:0040027	P	negative regulation of vulval development
GO:0042766	P	nucleosome mobilization
GO:0042826	F	histone deacetylase binding
GO:0043923	P	positive regulation by host of viral transcription
GO:0043967	P	histone H4 acetylation
GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0045111	C	intermediate filament cytoskeleton
GO:0045595	P	regulation of cell differentiation
GO:0046695	C	SLIK (SAGA-like) complex
GO:0048364	P	root development
GO:0048477	P	oogenesis
GO:0048557	P	embryonic digestive tract morphogenesis
GO:0051297	P	centrosome organization
GO:0060218	P	hematopoietic stem cell differentiation
GO:0060303	P	regulation of nucleosome density
GO:0060850	P	regulation of transcription involved in cell fate commitment
GO:0061628	F	H3K27me3 modified histone binding
GO:0070062	C	extracellular exosome
GO:0070615	F	nucleosome-dependent ATPase activity
GO:0071441	P	negative regulation of histone H3-K14 acetylation
GO:0071894	P	histone H2B conserved C-terminal lysine ubiquitination
GO:0090571	C	RNA polymerase II transcription repressor complex
GO:0098532	P	histone H3-K27 trimethylation
GO:1900050	P	negative regulation of histone exchange
GO:1901700	P	response to oxygen-containing compound
GO:1901798	P	positive regulation of signal transduction by p53 class mediator
GO:2000104	P	negative regulation of DNA-dependent DNA replication
GO:2000616	P	negative regulation of histone H3-K9 acetylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11367	CHD1; chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1	EC:3.6.4.12	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network