result

Gene information

Detail information of AfisC2G04689

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G04689	chr2	774381779	774389241	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC2G04689
ATGGGAAATCAGGTACAAAATCGCTATAGGCACGACACTGGGTCTTGAAAATTTTCACGAAAGGTGTCAGCGCCGCATAATTCATCGAGATATCAAGTCTGCTAATATCCTCATTACTGAAAACTTTGAACCACAGGTTACTTTTGAAGTAACTACAGTAGTTTCCTGGACATATAATAAAATTAGATAAAACTATGTTTGAATTCTAATGCAGATTTGTGATATTGGTTTGGCACTGTGGCTGCCTGATCAGTTAACTCATCACATTGTTTCAAGCTTTGAAGGCACTTTCGGGTATTTATCCTCGGAAAGATTCAGTTGAAGCTGCATTCATATATATATTTTCCTGTTACATTTGTGCATGTGTACAGATATCTTCCTCCAGAGTATCTCATGCATGGTGTAGTCAATGAGAAAACAGACATATTTGCATTAGGCGTTTTGCTATTAGAGCTTGTGAGTGGGCGTAAAGCTATAGATTCTTCGAAACAGAGCCTATTAATGTGGGTATGTGAGTGTGTATATGATTATGCAGAGTTAGAATTTTGTGCAATGTATGTATATAAAATCATCTTTAACGGTGAAGTTAAATATCACAAACTAAACTGTGGCACTTAGGCAACTTTGACTAGCCGTGGATGTGTTAAATTTAACTAGATATTTCTTTAGGAAAGGCCACTAATTTAAAAGAATGCAATAGAACTTGTCGACCCTTCTATGAATCACGTTTACGACAGTGAACAACTGAAAAGAGTGATAGAAGTTGCTTCATTGTGCACTCAGCATTCAGCTTTGCTGCGGTCTAGGATAAGCGAGGTATGTTTTTCTTTTGAACGTTGCTTGTATTCTAACTGAATTGGTTTGTGATTCTTGACTATGTTGAATATTTGCAAGTTTTGACCCTGTTAAGAGGGGAAGAAGCGAAATCGGATGATAGAGTGATGCACAAAAAGAAGGTGAAAAGGAGGACATATTCGGCAAAATTACATGATGCTGAAGATTATCATGTAACTAGGTATATGAGTGACATTAGTCGGCATAGACAGATTGCTTTAGATTTCCTCTGAAACTGTTGTTTTCGTTATTGATGGTGTTTGAAATATGATGATCATAATCTGTAGCCTTGGGTCTTTTGTTTGCCTGTTGCCTATTTCATGCGTACCTGCCATTTTGAATTCGCAATTACCCTATTACCTTGTTTCATCCTTTGTACAATGTATGTTGCTTTAAAAAACTGGTCACGCCTCCCCGTTGCCTTGAAAATTTGAATGCGCCTATCCTTGTAGCCTAGAAATTGGTCACGAAAAATGGAAGTGGTAGCTAAAGGACATCTTGGAGTGCAGAAGATTTGTCATGGTAGAAAGGTTGGAGATGGAGAAAAGGTTGTTTGGGTGGAGGATGTTCTTAATCCGGACGAGCCACTTTTTGATGCACCTCAAAATGGTCATTATACATTGTCCGAGTTGGTTGATGGTGGTTTTGTAGTTTGGCCGGAGTGTCGTATTCGTTGTTTGTAAGCTTCTAGATATGTTGTAGTAGTGAAATTTGAAGTTGTCACAATGAACTTTGTAGAATTTGATATGTACTATTTTGTACGTTTGATGCTTTTTAACAATTTGATGATATGTTAGTTTTGAGTTTTAGTTTCGTGTTTTCTATTGTTATATATTCGTATAGATATAGTTGAATGAAATACTATTAGATGCTGAATAAGATGGTTCTGCTATACCAAATTTGTAACACTTATAAGTGTTGGTAATTTTGCTATTTACTTATACAAGGAATTCCTAACGCTTATAACCATTGGAAATTGAAAAATTCCCAACGGTTATAACCATTGGGAATGTGAAGTAATTCCCAACGGTTATAACCATTGGGAATGACCAAAATTTGTAACGGTTATAACCGTTGGGAATGACCAAAATTCCCAACGGTAATAACCGTTACAAAATATGTAAAAAAATTGTAACGTACCTGCTACCAACGGTTATAACCGTTGGGAATTAGATTACCAATGGTTATAACCGTTACAAAATGACAGATCTGGTGTTGTGAACAATAAATGTTTATTAAAGGAATTTATCTATGATAAATAAATCTTATGAATATGTTTTATATAAGTGATTTTATAAACTAGATTTATAAAACATGCTTTATAAAGGAATTTTCAAGAATTTAAATTTCGGTATTTTTGAATGGAATTTCAAATGATTTTTGGAAAGAGGAACAATATGGTATTATTTCTAAAATAGGATTTTGAAAATGAAAAAATAATCTTATGATTAATTAATCCGAGTGGCTCGAAAGTAACTAAAAATGGATAGGAGATGTATTCGGATGGTAAACGCTTCTCTTAAATATTCCCCTTCTTGTGAAGGAAATATGTGATACTATTGGTAGTACCCAGTTCCTTGGTATCATTTTTAAGTTATTCGATCAATATAATTTTCTAAAGTTAAAAACGATAATGTGAAACATTAATTGAAAAATTAATGGTTGTCAATTTTTATCAAAGTACATTATCTTAATTAATAAGCATGGGTATGCTTTAATCTTTAAAAGCAATAGTTAAAATTAATAATGAATGATTTTGGGTTTGTAGTAAACGATGTTTAAGCAACATTTGTTTTTAAACCCTTAATGACACTTTGGAAGAAATCTTATGGGTAAATTTAGATATTTAATAATGGGATTTTAAAAGGTAATAACAAATATTGGAATCTTTTATATAAAGATAGAAATGTTATAAATTCAAATTTATAAAAGAAAAGAGAGTTCATTATAATATATTTTCGATAGTAATTGTTTTAATCTCTTTGATTTTATTTTAAAGCAAGTAAAACTTGTTATGTAAATTATGAATATACTTAGAACATTTAAATAAGTATATAAATACTTTTTATGTATTAAAACTGGTATTAGTAAAGTGAATATATATAAAGGAAGTTTCAATTAATAAAGAAGTGTTAATTGATAAAGAATTTTTTAAATAAATACAGAATGCTTTCACAGTTGATATTAGCTAAAGGAAGTTATGGTGATGTATCAATTTAATGAATTATTTTGAAATTGCGTTTTCCAGAAAACCACTAAGATATGTTTAAAAATATAATATAATAAAAAGATATTTGTCTTTCGAAAAGAAATGTTTTCTCAAACTAGAAATATTTGGAAATAAAAATAATAAAATGGTTATGTATAAAGAAGCATCTTTATAAAAGTTGAATTTAAGATGAAATTTTTTATGAAGTAATTTTGTAAGAATTTTTTAAAGATTATTAAATACATATGAAGTATGTTGATTATTTCTTCGCATAATTTAATCTAAGATTCGAGTGTGGAACTTTGATGTGTTTACACCGATCCAAAAAAGGATTTATCACTCGATTCTTGACGACGAACATTGATGAGGGTTGGTAGTTAGATACTTGAATTTTCTATCATAATTGAGAGCTATGCAAGGAGAACTAAATTTTATCAGAAAAGCCTGGTCAAAGTCCGCACTAAAGGATCAAGAGATCAATACTAGTTCGGAAGTAAAGTTGTGAATTCAGATATAGATATTGTGTATGGATGATCTATATACATCATACATGTATAAGTTTAAAATTAAATATTTTGGGCAAACCTTTTGGTTTTGTTTTGGGTAATTTCGGGGATGAAATTCTTTTAAGGGGGGAAGTCTGTAACGACCTGCAAATTTATCACTTTGATAAATTTTATTATTTTTAAAATTTTTAAAATAAAAGGTTGATAATACAAATAATATTGTTTTGAGTGGTAATAAGTAATGGTAATCTTATTTTGAATGAATATTTACAAAAATATTTTCCTCAAAATTTAAATCGATAAATGACCTAAAACTATTTTATCGGTAAACAGCTCTATAATAGTAAAACATCGCGCATGGAGCTGGATACATACACTTATTTTTATAATTGAACAAAAATATGAAATAAAATCAATTGATTTGTTTTTGAAAATAAAATGTGTTTTTAACGTTGTTAGTAATGCCCTTAAATATGATAATTGATTTATTAAATTTAAATTAAGATGTAATGATTTAATAATTATTTTAATTATCCAAATAATTATTATAAATGATGACAATTCATTTTGAATAGTTATCAAGTGATAATAAATCATTTTTAATAGTTTTATAAAGATATATATTTGATTTGAAAATATAAGGAAAAATCGATATCGCTTTTTCGGTATAATAGCAATTATTGTACATAATTGTTAATATGAATTTACATGGTTTTATAATTCAAATATGATCATTTTAGTTCATCTAAAATGATAAGAAAATGTTTTTCAAATTTTGTGTACAAATTATGTACGTTAAAGTATAAGTGAAAATGTAATCAGGAATCGGTTCTCCGATTGGCAACGATTTATCGAACAAAAGTTGTTCGGAATCAATGCAACGTTGTTTATATGTCATGTACACATATATAACATACAAATGCATCCACTAACATGCACATGAACATATGTATACATACATATTTACTTATGCACTTAAAAATACATACATAATATAAAATATATAAGATATTTTAAGCAAGCTTCCTCCTTAAGCTTACATAAGTCAACATATGAATACATGAGAAGATGGAAGTCACGGGCACATGGAGGGGACTTTTGCCGTGCCTAGGGAGGGGGGAGGTGTGTTTCTGAAGCCTTGAAATGGTGATGCAAAAGGTGATGTGTGCATGTCTTCTTTTACACTCTTCTTTTCCTATAAATACCCTACCCTCTTCTCTTCATTTTCATTCATTTTCTTCTTCATATTTTCTAAGCTTTGTCTTCCACTTTAATGGCCTCCCCCTCTAAATAAAATAGTGAGCAAAAGGTATGGCAAAATATTAGTAAAATATTTGCACATGTATATGTCATCGATCCACTTCAAAACCAAGCTAAAACACCTCCTCTTCTTCTTGCAAACCCACGGCCATCCACCATCACTGTAACGACCCCGGATTTTAAATAAATTT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK78567.1	4.5e-32	uncharacterized protein A4U43_C02F20180
Swissprot	Q8RXC8.1	1.5e-27	Protein ROP BINDING PROTEIN KINASES 2
trEMBL	A0A5P1FME6	3.2e-32	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G05140.1	52.03	3e-30	128	RBK2	ROP binding protein kinases 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G04689	AT3G05140.1	123	34	1	4	101	282	404	52.03	3e-30	128
AfisC2G04689	AT5G35960.1	123	34	1	4	101	272	394	52.03	6e-29	124
AfisC2G04689	AT5G18910.1	123	40	1	4	101	330	452	47.15	2e-28	122

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	4	88	40.1	2.5e-10

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0007169	P	transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006073	P	cellular glucan metabolic process
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0009505	C	plant-type cell wall
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009623	P	response to parasitic fungus
GO:0009664	P	plant-type cell wall organization
GO:0009814	P	defense response, incompatible interaction
GO:0009826	P	unidimensional cell growth
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0012505	C	endomembrane system
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0030154	P	cell differentiation
GO:0048509	P	regulation of meristem development
GO:0048653	P	anther development
GO:0051020	F	GTPase binding
GO:0071369	P	cellular response to ethylene stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network