result

Gene information

Detail information of AfisC2G06395

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G06395	chr2	1034296508	1034306438	+

Sequences

CDS

>AfisC2G06395
ATGCCTGCTTGGTGGCCACGCAAAAGCAAATCCAAACCCAAAAAAGGCGAATCCGCAAGCTGCAGTTCATCCCCGCACCCGAGGACTGATGAAATCCCCAAACTCAAGACGTCGAGCAATAATAAGAAGGAGAAAGCGAACAGCTTCGATGAGGCTGTAGCGAGAAAGGCGGCCGCAGCGGTTAGTAACGTTCATGGTCAGGTGTTTGCGTTCGGGCAGCACCCGCTTCCCCGGCCCGTGTCGTCGCCGTTGCCTTCGGTGCTGCGGGAAGTTTCGGCTGCGGGTTCGGTGTCTGCGTCCGAGTCCAGTGTTAGTTCTTCTGGTTCTGATGAGACTCCCGATCTTACCTTTTATAGATTTGCTGCTGCAATCAATGTACCGAAGGGCGATAATGGTTTAGCATCCAAGCATCCAAGAAGCATATCTGTATCTCCGAGAAAGGATTATAATCACCCAACCACCTCAGAAAATATTTTCAATTCAGTACATGCTATGAGAGGTAATAAACGCCCTACTTCTCCTATGCATCCAAAATCTATTGGTGTATGCCCTGGTTCTCCAAATATGTGCCCAGGTTCTCCAAAATTAAGGTGTGATGATATGAAGAGCCCTCCTCATCCACTCCCTCTTCCTCCAGGCTCACCCGGGTCTTCTTCGAGGTCAAATACTTCTACTCAGTTGAGTCCTTCACAGTGGAAAAAAGGGAAGTTGTTAGGAAGGGGAACTTTTGGTCATGTGTATACAGGGTTTAATAGAGAAAACGGGCAGATGTGTGCCATTAAGGAGGTCAAGGTTATTTCAGATGATTCAAATTCAAAAGAATGTCTCAGGCAATTAAACCAGGAAATAACATTGCTTAGTCAGCTATCACATCCGAATATTGTGCAATACCATGGCAGCGAATTGGCCGATGACACACTGTCAGTGTACCTTGAATACGTTTCAGGTGGATCCATTCACAAATTACTTCAGGATTATGGTCCTTTTGGGGAGCCTGTAATACGTAGTTATGTTAGGCAAATACTTTCAGGACTTGCATATTTACATGGGAGAAATACCGTACATAGGGATATTAAAGGTGCAAACATACTTGTCGACCCTAATGGTGAAGTTAAGCTTGCTGATTTTGGCATGGCCAAACATATATCAGCTTATACTTCAATACGCTCTTTCAAAGGAAGTCCTTATTGGATGGCTCCCGAGGTTATCATGAATGGGAACGGTTACAATTTGTCGGTGGATATTTGGAGCCTTGGCTGTACAATACTTGAGATGGCAACATCTAAACCTCCATGGAGTCAGTTTGAAGGGGTAGCTGCAATATTTAAAATTGGGAATAGCAAAGATATACCAGATATTCCAGATCATCTTTCTTCTGATGCAAAGAATTTCTTAAAGCTATGCTTGCAGCGAGACCCAGCAAGTCGGCCCACGGCAGTTCAATTGTTGGATCATCCTTTTGTTCGAGATCAACCTTCAAACAAAGCCACAAAATTAAATGTGTTCAGGGATCAATTGCCTTCTATTTCTGCCGAGACTCAGAGACTGGGCGCCATGGATCTTTCTCCAAATAGAAGTTTATCGCCTCTACGTGATAGCAACTACAGAGTTGGACACATGGTCGAGTTTCCTTCATCTTCTCGAAATCAAAGTGATTTACTGAACACGAGAATGAACATGTCTCTACCCGTATCACCTTGCTCAAGCCCGCTTCGTCAAATCAATCAATATACCAGGAGTTGCTTGCCTTCACCTCCTCATCCTGTATATTCAGCAAACGCGGTAAACTATGGTCCGAGCAATTATGCTCTGTATCCTTCGAAACATGGCAGCAGTATGTTTGATACATGGGAAGAAGCGCCTCAGTTAAGAATGCAATCGGTGTATGGCTCTCCTAGAAGATGA

Protein

Gene

>AfisC2G06395
TTCTCTCTCCTCCAACTACTCTCTTGCCGAAAGAACCATGCCTGCTTGGTGGCCACGCAAAAGCAAATCCAAACCCAAAAAAGGCGAATCCGCAAGCTGCAGTTCATCCCCGCACCCGAGGACTGATGAAATCCCCAAACTCAAGACGTCGAGCAATAATAAGAAGGAGAAAGCGAACAGCTTCGATGAGGCTGTAGCGAGAAAGGCGGCCGCAGCGGTTAGTAACGTTCATGGTCAGGTGTTTGCGTTCGGGCAGCACCCGCTTCCCCGGCCCGTGTCGTCGCCGTTGCCTTCGGTGCTGCGGGAAGTTTCGGCTGCGGGTTCGGTGTCTGCGTCCGAGTCCAGTGTTAGTTCTTCTGGTTCTGATGAGACTCCCGATCTTACCTTTTATAGGTGATCGTTCTTACTATTCTGTTTTTGATAATTTAGGGTTTTGGGTTATTTGGTAAACTGTTAAAATTTCGGGGTTAGCAAGTTGTTCCGATGAGCAGTAGATAGTTTATGGTTAAGAAGTGCATGATTTGTGTAAAAAAAAATTTTGTTCTGTTAACAACGATACACTTATTTTGGTTTCGGGGATTGCAAGTCGTTGCTGTTTGATTTGAAAAAGACTGGATTTGCATCAATCTATGAATGTTCGGCTGTTGCTTCTGTTTAATCATATCGTGCATGTACAATTGGATTATTTAGAGCCTGTTTGACAATAAACTATTTTGAAACTTCTTAAATCAAGTTTTGAATGGTAGTAGTTTTAAACAACTCCTCATAAAAAAGTGTTTGGATGTAATTTGATTTTAAGTAATAATGTTAGATCAAAATTGCTTATGAAATTGCATCATAAGTCATAAGCAACAACTAGTTGCTTCTCGGATTTCTACTTATTAGCTAATTTTGCAAGCTACTTATAAGCAGTTCCACTAATAAGAAGTTTCCATACACTAAAAGGAATTAAGTTACTTGCAAGTAGTTTTGAAATTGCCAAGCATGTTCGTAGAAGCCACTTCGTAACTTCATGAACAAATTTTTAGAGGAAAAACACCATACCTGTATGTGTGTCCTAGTCCTAGGCTCCTAGAATTAATGCACCCATAGAATTTCAAATATAGGTAAGGACTAAAGTTGGTCTTAATCTTAGTTTGTTTTACAATTTTAATGGTTATGTTAGATTTGCTGCTGCAATCAATGTACCGAAGGGCGATAATGGTTTAGCATCCAAGCATCCAAGAAGCATATCTGTATCTCCGAGAAAGGATTATAATCACCCAACCACCTCAGAAAATATTTTCAATTCAGTACATGCTATGAGAGGTAATAAACGCCCTACTTCTCCTATGCATCCAAAATCTATTGGTGTATGCCCTGGTTCTCCAAATATGTGCCCAGGTTCTCCAAAATTAAGGTGTGATGATATGAAGAGCCCTCCTCATCCACTCCCTCTTCCTCCAGGCTCACCCGGGTCTTCTTCGAGGTCAAATACTTCTACTCAGTTGAGTCCTTCACAGTGGAAAAAAGGGAAGTTGTTAGGAAGGGGAACTTTTGGTCATGTGTATACAGGGTTTAATAGGTACCGTTTTTATTTTGTTCTGCATTTCATTGGTTAGTTTTGTATCAAGTTAGTGTTTGTATATTAATTTTTTGAGCATTAAACTTTTTAAACCACTATAAAATATAGCTTCAAACTGCACTAATGTGACACTCTAACACACTGTATAGATACACCCTTCTCCCATACCAAAAAATTCTTCGTAGTTTCTGATGGAGAAGGGGACAGTTTGTGCATATAGTCCGTATAAACTTTGTCAACATTAATTTTACTGTTCTGCTATAATCACAATAATGCAAACTGATAAAAACGATCCGGTTTTATTGTTTGCTGTAGAGAAAACGGGCAGATGTGTGCCATTAAGGAGGTCAAGGTTATTTCAGATGATTCAAATTCAAAAGAATGTCTCAGGCAATTAAACCAGGTAAGTTATTTTGTTATCTTGGGGGTGCGATATTGGATTTTCATGTCCAAAATTGAAAGTCTTGTTTGATTGACATTCTTTGTGCAATTTTTACACAGGAAATAACATTGCTTAGTCAGCTATCACATCCGAATATTGTGCAATACCATGGCAGCGAATTGGTAACTTCTGAACCAACTAAAATCGGATTACACAAATTACATGCTTCCATCAGTCATCAGTGAATTGTGTTTTATTCCAGAATCTAGCTACCTAACTGTTATTTGTTTCACTTGGATCATGATGATTTTAGCATTGTCTTCTATAAAAGTGCATAGGTTCTTGATACCATTTTTAGAATGTCACTTAGACCAACATATTCGTGGGATGCTCAATCTCCCTATGAGATGATTGTTGCATTGATTCATTCTCATCCTTCTAGGCAAAATATCAAGTAACGGGATTGATTCCGTTACACCTTTCCAATGGAAAATGGATTCAATTCATTTGTCTATAGGCTAGTTCCAAAGGAAAATTAAATCGTCTAACCAATCACAAATTTCTTGATACAGGCCGATGACACACTGTCAGTGTACCTTGAATACGTTTCAGGTGGATCCATTCACAAATTACTTCAGGATTATGGTCCTTTTGGGGAGCCTGTAATACGTAGTTATGTTAGGCAAATACTTTCAGGACTTGCATATTTACATGGGAGAAATACCGTACATAGGTATTACATTGTTTCCGTTGAGGTTACATAAAAAAGGTTAATATTGTTCCTCAAGTTAACGTTCATGAGTGATTTTTGCAGGGATATTAAAGGTGCAAACATACTTGTCGACCCTAATGGTGAAGTTAAGCTTGCTGATTTTGGCATGGCCAAACATGTAAGCTGTCTCTTTTATTATTTTGCAGGGATAATTTTGATATTTTTTATACTTTTGAGAAAATATGCATTGATTCCGTCACACGCTTAGGGTAATTACCAAAGACATGTATGCCAACTTGTGACATTTGCTTTCAATTAAATGCCATGCCACACGACTATCATTTGGGCATATATCATCACCTTTTATTGTTTAATTACAACTCAATAACAACCTTTACCATCTGATATCTCACTATAATATCCTTTTAACAATTTAGCCAAACTCCGCATTATGACATAGGCATTTAGGCATTTAGTGCCATTACTACTACATGTCCAGCTGTGCTCATTGCTATGTTGCAAGCCCAATTTAGAAGTAAATTTAGGTTGTTGCTTCTTTTATTAAAAAAAGTCCATTCTAAATAAGAATTTATAAGATGGTAAAACTAAAAGGTGTGTAATGTTTCAAAATTTATGTTTAAAGCACCCGTTGTTTTAATTACTTTGAGTATATAAAACACGAATTAAACTCAAGATTTCTGTTAAGGGAACAATCTCATTTACATATTTTTTGAACGATATATTAGAAAAAAGTTATTTTATAGAAAAAAATTAAAATTATTATAAAATCAACATAAAGAATATATTCAAAAAACAAAGTAAAAATGAAAATTGAACTTGTATTAAAAACTTGCCGAGCTAACATAATCAAAAAGTCTTTAGCATGTATAATGTATTAATTATTCTTTATTATGTAATGTGATGGTATAAGAAGTATGCCCAACCCCATTCACTTGAAAAAACAACAGTGCCATATATTTAATTTCAAGATTCCAAAAAATATAATAAAAGCAAAACTTGACCAATAGGTTTAGGTTGCAGCATAGTAATTGAATGAAAGGTGGTAAGGTGTATTTTCAATTTGATTTCAGATTCTTTTTTTAACCAATTTCTGTTTTATTTGTAGCTTTTAACAAATATTGTTATTACAACAAAATTTTGACATCAATGTATTGTATCGTGACGCCAAAGACAAAAGATCATACTAAAAAAGTCACCAATCAAAATAATTAAATTTAACTTAGTAAAATAATAGAATGCAAAGAATGTATATATTACCATCTTTAGAGTTTTCATGTTACAACAGAAAATTATAAAATATTTCAGAGAAAATTTTAATGCAGTAGTAAACAAAATAAAGATATGTAAATTCTGTAGCGCGCGTGTGTTCGTTCTTCAAATCAAAGAAGTGGAAGGTTTCAGAAACATAAAATTTATATCCTTAACTTTTAGAAAATTCTTTTACAAGTCATCATCATTTTACATTTCAGTAGCAAGTCCATGGAATTTATCAAAAAGTGAAGCATTACTAAATGATGATTAGATGTGCCGAGTTTGATGTTGATGGATACGAATCAATGAGAGAAGTTGATTATTGTCGAAGATTGGTCGAAGTTTGCCTTTGGTGATTGGATTTAGAGTTTCAATCACAACATGAAATTAGGATTTTTGATAGAGGTGATGGAAGAAGTCTGATTGGTACTGTTAGATGCGGATTTTGATGAGAGAAGTCAAGATTTTAGATGTGGATTTTGATGTAGAATAGAGTATAGACTAGTGGCGAGCGGATTTTGTGGTTGTTGTGGTGGCAAAACTTAATTAAGGTTGGAACCGGTGCAACATGGGAAATATTTGGTATGCTAACAATTTATGAAAATACGAGTGTTTTTGCATAAATCGTATATACATATACATAAATATATATATATATATATATATATACAATGCAAGTATTTTGCATATATTTGCAGTGCAACACAACAATGAATAATTGTATTGCAATTTTTGTATGGCTTATAATTATGATGAATGACATGACAATTATTTTGAATGACAAGTATCTGCGTTACAAATTAGCATTATTTTTTAGACATAGAAGCAACAATTTTTTAGATTCAAATTTGACGTTTATCAAAATTCAAAAATGTTAAATTCGACATTGATAATGATTGGAAAAAAAATTACAACCTCAATTTCAGTATCTCGAACAACAATTTTGTAAAATATAAATATAGAAATTTGGTCTAAAGTGTTTTTATGAAAGAGATATAAGACAAATGTTCTTTCTAAACAATGAGCCAAAAGCCTTAAATATTTTTTCTCTATTCGATAAATAAATTTTG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	ONK77419.1	7.5e-202	uncharacterized protein A4U43_C02F6330
Swissprot	F4HRJ4.1	8.4e-142	MAP3K alpha protein kinase
trEMBL	A0A5P1FKF8	5.4e-202	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G53570.4	61.81	6e-143	504	MAP3KA;MAPKKK3	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G06395	AT1G53570.4	432	139	6	170	591	148	563	61.81	6e-143	504
AfisC2G06395	AT1G53570.1	437	134	8	170	591	148	564	61.33	2e-142	503
AfisC2G06395	AT1G53570.3	435	138	7	170	591	148	563	60.92	4e-141	498

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	233	488	244.5	1.1e-72

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000186	P	activation of MAPKK activity
GO:0000919	P	cell plate assembly
GO:0001568	P	blood vessel development
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004709	F	MAP kinase kinase kinase activity
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0007257	P	activation of JUN kinase activity
GO:0009524	C	phragmoplast
GO:0009793	P	embryo development ending in seed dormancy
GO:0010098	P	suspensor development
GO:0010103	P	stomatal complex morphogenesis
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0022622	P	root system development
GO:0071260	P	cellular response to mechanical stimulus
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0043123	P	positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
GO:0043622	P	cortical microtubule organization
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048046	C	apoplast
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900745	P	positive regulation of p38MAPK cascade
GO:1902065	P	response to L-glutamate
GO:2000071	P	regulation of defense response by callose deposition

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K04421	MAP3K3, MEKK3; mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3	EC:2.7.11.25	MAPK signaling pathway	ko04010
			GnRH signaling pathway	ko04912
			Neurotrophin signaling pathway	ko04722

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network