result

Gene information

Detail information of AfisC2G06976

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G06976	chr2	1118931240	1118941451	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC2G06976
GGTTTTATTTTGCTCATTAGGTTAAAGTTGGAACTTATACCATTAACGAAATGTATGTGATGCCAAACAAAAATTGAGATTTCTAAATACTGTTCGATGGATACTTATGAATTATGAACAATTATTTGATATGTACCTGCGTATAATTAAAACGTTTCAATGTTGGGAACTACGGTTTTGATGCACAATTTGTTTTGAAATCTATTATTTGGACCGAATAGAATATGTGCTATATGAAACTAGAATGTTAATGTTCTCCACTATTTACATTGAATAATTTTTTTTTTGGCAGGATGTCATTAGTAGATAACGAGGAACATGCATTGTATAGAGAATGTTGTATTTAAACCCAAATGATTATTCAAAGCGCAATTGCCTGTATTCCAACCCGAATGTTTTGAAATCTATTATTTGGATCGAATCTTACAGATTCCAACCCGGATCAATTAAAAACGAAGAACATGATTGCTTGTATTCAAAACGCGACTTAGCCTCTGTTTGTTTTTAACCAAAAGTTCCGAAACCAACTTCTGATTTTTTTTGTTCTGAATGCTGAATAATGTTGAATGCAAACAAATAACTAAGTGATTATTCAAAATTCAGCCATCATCATTCAGATTTCATAATTCAGCAATCAGAATTCAGTGTACGGACCCTTAGTTTGCAAGATATAAAAAGATAATTCTTTTCAAATTGGAAATTCATTGATAAATTGTGCAAATCAAAACATCAAATCGATCTCGAATCAAGAATGACAACTCTAGAAAAGTGAACGAATGTATAGAAGGAATTGATCAGAAGTTTGCAGCATAAAAAAAACGCTGATTAAATTTCAAAAAAAAAAGAAGGGAAAAAGCAAAAAAAAGGCAGAAAAGAACCGTGCTTGGAGCAAGAATAGAGGTATGTTTTTCCCAATACAGCTCTCTCTCTTGCTCCTTGAAGCTCTTACGAGAGCAAATGATTTGGTTTTATTAGCTAAATAGCTACAATAATCTTGTGCTAGTAGCTACAGTAGTAAATCTGCTTAACTATTATTTTCTTTTTCCAGAAACCTTTGATTTTTTTTGTTCTATTGAATATCGATAAGAACGGTAGCTAGATAATTGGTTATTGCTCAAGTTATATGCTAGCTACAATCATCTATTTTAGCTCTTTTGTTATTATATTTGTTTCTATACTTTGTTTTTGGGTAATAATGTTAGCCACTGTAATTTTGTTGTTGTTTGAAGATTCCTACATAAACATTGAATTCCATTTTTCGTCAAATGATGAAAATCTGTCCTAGCTCTCAATCAAACTTCATCAATCGCCACGAACAGTCGCTTTAAAGTCGTGGTAGCTAATGTGCACTTACTAGAAAACATTCAAGACAGGGGCTTCAATTAATGAACTGGGGAGTAAGGGGAACCTTATCAGTAGAGGACCGAAGGCCAGTTCATTGATTGGGCGACATGGGAGGTGATTTTGTTACTGTGGGAATCGACATCTCCTGTTGGTCGCCTCTTTCGAGCTATAAGTAAATTAGGCAACGTGCGTAGTTGAGGATTCAGGGTATTTATAGCGATTCACGCTTTGGATTCCGTTTCGATTCAACATTTAAACTTTATGATCCACAATTTGAATGCCATATTGAAATCATTGCTTATGCGGTATAACTGGATTGAGACTATTCAGATTTTAGTGGGAGTGGTCTCTTATTTCATATGTATATAGATTTCTCAAACTAAAAGTAAATTTAACCGGTTTTGAAGTAGGTTTGAATAAATAAATGAACTATTGAAGTATCTTAAGTTAATGTTTACTACTATGTATTTTGACTTCAAGAAAAGTTAATGTTGGTTTGAATGTCATGTTACACTTATTTCATTATGTATATACTACTGAGCATAATTTAAAAAAAGTTATACATGTTCTTCATATGGTTAAAGTAGATTATCATATATCAAAATCATAACTTATAGATAGCAGTTAAGTAAAGATATTACAATTGCGAGTAACTGTAGCATTTTGGACCATTACCGTGTATGTGATTTCTTTTTTGTCACATGGTCGTAAAACATTTGTGACATCAATATTGCGTTTGATTTGCACGAACAATTTCTTTGACTCTCATGGAAGCAATTGGTTTGTAATCAATGGGGTAAGATGACCAAAAGCAAACGTTAAAGTATAAAACTCTTTCGCCTTATTATAAAGAAATGACTAGATATATTGTGCTAATGATCTCTACAGCATCGCCGCACATGAAGCTGTGAATTTATAAGTGAAATTAGGTATTAGTCAATTTCAATAAAGTGTGTTGTCAATAATGTAAATATGGTGATGGAAAAATTTGGTTTTATATCGTCTCATGTAGTATAATTTATATGTTGAATTTGCTCTATTAAAAACATCATTATCAAGTATAGTACTTTCACAGGGAAAGTGCGAACTAATGACGCTAAGCCGAACAATAATATAAGAGGGTTTGTAATCCGAAGTTGGTCGGAGTATAGTGTTATATTTGTATAAAGTAAGCATAACAATGTATGATATAACTGAAATAAAAAAACATAATGCTGCTAGTATGATTAAATTTTAGGATGTTTGGCTGCCCCCCATTTCTTGTATGAGGCTTTGCCACTGCATATGTATATGTTATTTTGACATTAAATCTCTAGTAACATTGAGTGTTGTAACAATGTGTTTGAGATTTATAAAGGTGAATGAGGGTCAAAATTTTGTATGTATAGTGTTTGTCTTATGGTGCTAGCACAAACATAAAGATGCACTAATAAGGACTAAAATCGAATTAAGTTGGTTGTCAAGTGTCAACATAAACATTTTGTTTTTAGAGATCCCATCAACACAAAGGTACATATGGATGAGCCATATGTGTATGATAGCTCATATTTAATGGATGTTATTTGATTTGATCATTTAGTGTATTGGTACATGACTTCGGTTTGTGCTCATAAAGTGTCATGTCATGTTTCCATTTGTAAACTAAGTTTAGACCATGAATCATTTACAGGTAGTTATTCATAAAATAAATTCCTTGTAAAACTCATAAGCATGATTGAGCTTCGAATGAGTTTTTTCATTATTAAGGAGACAACTCGTATGTGGTCATTATAAAAGAGTTCTAATATGCATGCTCTATAACGTAATTGAGTGGATCAAATGGGAAAATGTAAATGCATTTGCGTTTTGCCACAGTGGGAGCCAATCAATGAAGAGTAATTATGCAACAATGAAAAAAGCTCAATTCCTCTATCCCCATACAATCACAACCGTTCATTCCATTAAATTTATTTATTTATTTATTTAGCAATGAAGGATGGAGATTGTATAGGGATAAGGGGCACACGGCTTTTGGAGACAGTGGAATTGAGCTGTAATTAAAACATGAGAAATGTAAATGATTAAGTAAATTCAAAGGTCTCCTAACTATGATGTTCGGGTTATGGAACCTCAAGAGCCTACTATTGCCTGTATAAAAGCTTCTGTTATATCCATCAAATATCAGTTGGTTAAAAATAAGTTCATGTTAGAATCACAAGATAAGCAAAAGTATGAACTAAAGTTTATTTTGTGTTAATAAACACTGTCATAATTTCTCACATGCAAATAACATTTTCATAACATACTTTATTCTATGTGATATAGAGGTTTTTAAGCAGGATTGTCAAAACCTAATGACTTCGTACCACGTCCTCAAGTCATAGGCAAGCCGAAGCAATTTAATTGCCAAATATCAATTTTTTTCAAGCTAGAGAATTGTCCGTACTATAACAACTTACGTGTTAGTATTTTGTGAAATATGCTACAGCTTCCTCGAGTAACATAATTCTTTGGTGCTGCAAAAGTATCTTTTGGATAGCTGGCTGACCCAAGCATCGTGGGATCGGTGTGAGAGTCAAAATCGAAAACCTCGTGAGTTCCTAATACATTTTAATTCATATGTTATGCTTTATTGACTTTTAAACTACATAAAATAAACCTCAATTGTTATTACTGAAAGTTTTTTAACAATTTAATGTATATAATGTGATTATTTGGGCTATTTATAGGGGTGTAAAAGCTTCAGCAAATATATGCAGACATTGAAATCAACAAGGGTTCTCCGATAACAGTATCTTTGTATATTCCATTCAGAGTAGTAGATGTACACCCAAACGGTGTAATTTTCATCTCCCTGTCAATCATTGAAATCCGAATTTACATTCCTTGGTTTCGACCAAATAGTTCATTTTGCTGGTTTATTTTCCAAGTATCGTACCTTTAGCTTGCTACTAGAAATATATTTGTATCCCAATTGAAATCTTGTTTGAAAAACATCATGATAAGTGCATTGATTTCAAACTAAATATGGCTGTTAAAGTCTGATTTATGTCAAATGTATTGAAAATAATGAGAAAATCAATTTTGTCTCCACAGACTTAAATAGAGAATGTATCCACAATTCTTCATATTATTATGCATGTTGCATTTGTTGTGAGTGTCATGGTTATTTATTTTGAACTGATGGTATCTTGTTAAATCCATTTCACTATCAAACTTCAAAAATTCTGATCCATTTTTTTTACATTTGTTGTCTAAGCCAGAGTGTTTTTTTTTAATGTTTTTATAGTTTCATAGAAAATAATTGAAGAAAGAATCAATGGATAAGGGGAAATTGGAAAACGATTTTTTTTTATTTAAAAAAAAATTGTTAAGAGAAGAATTAAAGAACTATCATTTTTATAATCTTTTTTTTTCATGTATTTTATCTACTAAAACCACCTGCCTCTTTATCTCTAAACCCTAAACCTCTAAATTAGGGAAAAAAATGTTGAAAAATTATGATTTTGGAGGGGAACTCATCCAAAATTTCATTTTTTCAGCCTTCATCAGCACAAGATTTGGAACGGATATATATTATTGTTTGGACTTTGGAGAGTGGAAAATAGAGGTGAAGAATGGAGTTGCATCAAAGGAAAAGACTGGGGCAATGGATTAATCGTGATGTGGAAGGAAGA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	KAF3785082.1	5.2e-35	ODO1 protein
Swissprot	P81394.1	7.2e-34	Myb-related protein 315
trEMBL	A0A4S4CXW0	2.7e-33	Myb-related protein 315-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G14340.1	53.73	5e-33	137	AtMYB40;MYB40	myb domain protein 40

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G06976	AT5G14340.1	134	57	3	29	159	43	174	53.73	5e-33	137
AfisC2G06976	AT5G26660.1	159	78	2	29	180	43	200	45.91	7e-33	137
AfisC2G06976	AT5G16600.1	146	49	2	29	153	43	188	52.05	1e-32	135

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	53	95	55.0	6.1e-15

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000981	F	RNA polymerase II transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0001135	F	transcription factor activity, RNA polymerase II transcription factor recruiting
GO:0001944	P	vasculature development
GO:0003682	F	chromatin binding
GO:0016020	C	membrane
GO:0050832	P	defense response to fungus
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006357	P	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009611	P	response to wounding
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009733	P	response to auxin
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009739	P	response to gibberellin
GO:0009751	P	response to salicylic acid
GO:0009753	P	response to jasmonic acid
GO:0009800	P	cinnamic acid biosynthetic process
GO:0010089	P	xylem development
GO:0010091	P	trichome branching
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010214	P	seed coat development
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0045893	P	positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0045892	P	negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048364	P	root development
GO:0048658	P	anther wall tapetum development
GO:1901348	P	positive regulation of secondary cell wall biogenesis

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09422	MYBP; transcription factor MYB, plant	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network