result

Gene information

Detail information of AfisC2G07360

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G07360	chr2	1181021124	1181026737	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC2G07360
ATGCTTGCAAATCTATCGAAAAGGAAGCTTTATGTACAAGAGGATATAGATGATGTAAGGAGAGAGATACAAATAATGCATTATTTGTCTGGGCATAAGCATGTGGTTCAAATAAAAGGAGCATATGAGGATTCATTGTATGTGCACATTGTGATGGAGTTCCATAGTGGGGGTGAGTTGTTTGATAGGATTATAGAGATAGGGCAGTATAGTAAGAGGAAGGCGGCCGAGATTACAAAGATTATTGTTAGGGTTGTAGAAGCTTGTCATTCGCTTAATGTTATGCATAGGGATTTGAAGGCAAAGAATTTTTTGTTGGTTGATAGAGACGATGATTTGTCGCTCAAGGCTATCGATTTCAGATTGTCTGTTTTCTTTAAACCTGGTAAGAGGTTTAAATTTTAACTAGGTATAAATTTGAATATATAAATATTTGAAATGGAAACAAATTTATATTACTGTATTTAGTAGCGCAAGCAGTTTATATGGATATAGCAAGTTGGCCTACTATGTCATTCATATATGTAGCAATATATTTACTAAAATATGGATTTGGGTCATATGTGTGGTGAAAAATCACAATAGGAATACTCTAAATATTACGATCATTTTGTTTACAGTTTACTGCATTATAGTTTTCATGGATCTGAACCGTTTAGCTGAAAATTGGTAAGGGTGCATTTTTCCCTAAGCAAAAGTGGTCGCCGAAAGGGGTATTATGAACGGTGCACGAACAATGAAAGTTCGATAAAATGAGAATGTGATTTTGTGCAGCGAAAGAGGAATGATTTTTTGTATGAATTTTTATTTTTATTTATTTAAATTATTTTAAGTATTTTTGAATAAATATTAATATTTGATATTAAATTATAAATTATGTATAAAATGAAAAAAAAGTGCATGCTATGAAAATAAATTTCGGTACGTTTTATTATAAAAATATAAGTTCAAAAATAATGTTACATCACATCTATTTCGATCTAAATTGCTAAACAAAATAATTCAACATACATTTAAGTCCATTCTCCTTGTTCAATATAGAACAAACTAGTTGATAATTTCTCGGCTCGTGCGCAAATATTACTACAAGCTCCCACTCCAGATAGTCGTCGAGAGGCAATCAGTTTCTGATACAATTTTCATTAGTTTATTTGAACACGTCAGAATTTAGATCGACGTCTCTCAAAGTACATGATCTCTCTTGATTTGCCTAAGATGATGGAGCGTCATCAAACATCCATCATGGAGTAGTGGCGGTGAGATTAGAAAGCAACTCATTCATTATATAATAAAAGAATATCAAAGTATAGATGGACGTCGAAGTGAGCTGGAGGTATTAGAGGAATGTTGTAAACACACTTGCATTCCTTTATTGCGTCGTCATACATATCGTCCAGCTGTCTGAATTTGGAAGAGCATGGTTTTGAAGCGGCGAGAGCATGTAGCAGTTGTCTGCCACTATTCTTGATCTTATTGAACACAATATATTTCAACCAACGAAATGTCTTCCGCTATTTGTAGTAGTTGGCTCCATGACATCTAGACATGTTTCATATTATTTCATTTGTTTTCCATATAGATGATGGTTAAATTATTGCCTAAGCGCTTGTTGAACTCGACTGTGGTATCTGCGACCAATTGCTAACTCGTCCAACTCGAGTATCTATTCGTGCTAAACAGGTGTTTATGAAAGCTAGCGTTTTTTGAGAATTCCAATCGATGACTGTTTGGATCGAAGAGTCAGTGGAGGAGGTTGACATTATAAATTCAAAAGAATTCTAAAAAAATATACATTGTACAAAATTGTGAAATAAACACGATTAGAAAATAAACCACTTAGACTTTGATTGAAAAATGCTAAAAGTGGGTTTGTTTTTTCGGTTTTGGGATGGTGGAGGAAGAGAATAGGGTGGGGATTTATATAGGTGGAAAAACATCTGTTTTATATCAAACCCTAGGATCTCGATGCGTATGATGCATCAAAACCATCCGGTACAAAACACTTCAGTTGAACGGTGATTTTGATTCTGCTAGTCCATTTCAATTTTCGACACGTCCGGACTGCAAACACACCCTTATGTTTGTGTGTGTGTAACCATAATAGGAAATGTGAGCTTCAAAAATATAACGAGACTCGGTAGAAATTCAACATGTTTATTTATGGTAATGGTTACATGATGATCAATGAGTTCAAAATTACCTATTAAAATTAGGTCTGTCAATGGTATGAGTTTTGACCTGAATCCACCCTGTTAACGTGGGTATGGGTTTTGCTCCAACTACCTAGATCTGACCCGGTTACCACTGTGGTTTGGTACGGTTTGATCATAACCAGACCCGGTTTGGTCCTGACTGGATTATTAGTTTTTTTATAGTACCAAAACATGAGTGAATAATGTTATTTGTTTACTATTTTGTTTGTATGCATGTAGATGGTTTTGCCTCCTTCTATTGTGAACTTGGCTTCATCACTTGTATGTTAACATTGTTTGTGAATATTTTTTACAAAATTATGAATTTAAAATATAGTTTTCCCATAAATATTACGAGTTGGGATATTACACAACGGGCTTGAAAAGCCCGAATAGCGGCTCGGGTATTGGGTTTAACCCATCGAGTTCAGGCCAGACTCGAGTTTTAATTATTATAACTAGGTCTGGGTCCAGGTTTAAAGATGCTCGAACTGAACCCGGTCCGTTGACATGCCCAATTAAAATAAAATCCTTATTTCTAGTTAACCGATTATAAAAAAACAATGTATAAACATTCAGTACTGCCAACAGCTAAGGCTTGTGGATACAAATATCAATTACCGTTTAAACTCAATCTGTTTACTGCACTACCTATAACAGATGGATTAAAGTTCCACCATTTTCTAGTGAATAAGTTTATTTATTTAATTGGTACATTCCTGTGCTGATAATTGTTCTTCTTTCTTCCATTTTTTCCCTCCTTTCTTTGTACTAGTGTGTAACTCGTGTGTTGCACACGGTATGTTATAGAAAAATAATATTACATATAATTTATTATGCAAAATCCGATGTATTTTGTTAGAATAAATGAGTTATAAATTGAGATTAATATATTTATAACCGTGTATTTTTGTTATGAGATTCATATATTTTTATACTTGAATAAATATAAATTATCATTTTTGTTGATAAAAACAAGTTATATATTGATTTATTATTTTTTAGGATTCATTATTTATCAATCAAATAAATGAAAATAAGTATTCTTAATAAATTTTGAAATTAGTATTTTTATAAAATTTCATAAATAAATATTCATGTACATATATTCTAAAATTGACATTTAGGTTTTGATACATTTAGCTGAAAGATAAATGATATATATATATATATATATATTAAATTTCAAATATTACTTGAGAGAATGACGAAAAATACCTAAAAATAGAAGTGTAATACCAAAGACTTGATGTATTTGTATGCACTTATAGTTCTTGCAGCACATATTTATCAAATAATTATATGATAATATTAGAGCGATAATATATATATTTATTTATATCCTAAAAGAAATATTAAGTGAAAATAAGACCTGAAACGTTATAAATCACATTGTCATTTTAATTATGTAAAAAAATGATTTTTAATCCATTGTTTCATACTTTACTATTTTTATTTTATAATAAAACTTTTCAAAAAAGATTTAACATTTATATAAAAAAGATAATAAAATATGAAAGAAAAATATTTCTAATCAAAATATGGTATAAATTTTGTCCATTGATTAATTCAAATTACGAATATAAATAACTAAAATGTAACTTTTTATACCAAAATGTACTAATTGAAAATATTTATTCATTTTTCAATATTACAGAATACAAACATTCATCATTTATCATTAATTGTAATGATATTCCATTGTAATGTTATTCTTCATAAAATATAATTTAATAATGATAAAGAGTCCATTTGACGTACCAATTTTATGAAGGAACAACGTCATATATGTTTGTAATGAGGTACCAATTTTGGAAACAAAGTTTTTGTATATATTTGTTTACAATGAAATACCAACTTTAGAAAGAAAAAATTATGTCTATTTTATTATTATTAAATAACTAATTTTAGAAAGAAATTTTATGAACTTAAATGTAGAAAAATGTAAAAGTATCAAGGATAATTTTGTATATAATGTGAAGATATTAAATTATATGGACTTAAATGAAAATATAGGTTTACCATTTAAGTCAGTACAAATGTGGTATACACATTGAATTATCATTGGATTTAGTTAAAAAATTAAATTCAAGATCAATTAATAAATTGAAATATATGAACTTGAATGTAAAATAATATAAGAAAACATAGAAGAAATCCGTAAATAACTGTACAAATTATTGAATGTTGGCATTTAAATGAAAAATGATAGGAGAGAATATCAGTTCAACATTATAATAGTTCGTACATAACTGTGGAAATTTAAAACTATTTGAACATGAATGAAAAATTAGTTTTATCATTTTTGTCAATATGAATGCGGGTGCACATATTGAATTGTCACTTTTTAAAATTTATTAGATCAATTAATGAATATTCGTTAATTGTATTTATTTAAAAAGCTTGAATTTAAATCACCTTACTAAATTTAATATATATGGACTTAAATATAAAATAACAGAAAAAACTTGGAAGAAATATATAAATAATTGAAAAAATTAGTATTAAATTTTATCGATAGTAGAGAGAACCAATAAAAACATGGTAATAATTATAATAGCAATGAATTTTAAGTATGTCAAAATAAAATATATAGAGAGAATTAAGGAGTGGGAAGGAAATTCTTAGAATTAATAATCGAGCTTTGAATTCTTCTGCTTTACTATTATTTAATAGATATGTGTTTGTTTGTGCTTAATGTTTATATTTGGAAACATATAAAATAGTTGTTTTCAAATAGATGGTGTATAGATTACTATTCTCCAAGTTTATAGACACAATGGTCACACTATGAGATATATGATTGCTGGATATGCTTTTCCTTGTCTCTTAGAGACATATAGTATTTGAAGACAACATGATATCATACATGTCGAATACTACAGCCATTTCACCCATCTGCATAAGATTGTGAGATGATGATATCATAACAATTAACAATAATCCAATAAATACTCCACTCCTTGTGATATTTCATATAAGGTGTTCAAGGATGTAGTTGGGAGTCCATATTACATAGGCCTGAAGTACTACGTAAGCATTATGGACCAGAAGCTGATGTCTGGACATCAGGAGTTATACTCTACATTATGTTGAGTGACGTACTGCCTTTTTGGGCAGGTTTGATTATATCAGTCATTGCTTAAATTAGCACTTCAAAGCAGGTTTATCCGTATAACAATGCATATGTTTAAACTTGCTGTTTTTCAATGTTAGAAACACAAGGGATATTTGATGCAGTATTGAAGGGAGTCATTGACTTTGAATCATTTAAAACTCTACTTTACCACTGGTCATCATTTTCTGTCACTCACCACCACTACATTCCAGAAAAAACTAATAGGATATCGTTCCATTGTGGCCTACCCTCGCGTCAGCAAAGCCTCATAGAGTGGCCGCCAAACCCACTGATGACTGCATAG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020272649.1	6.5e-74	calcium-dependent protein kinase 26-like
Swissprot	Q9FXQ3.1	2.0e-75	Calcium-dependent protein kinase OsCDPK7
trEMBL	A0A5P1EED5	4.7e-74	Calcium-dependent protein kinase 26

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G17290.1	72.92	8e-77	283	ATCDPK3;ATCPK6;CPK6	Calcium-dependent protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G07360	AT2G17290.1	192	46	2	4	189	115	306	72.92	8e-77	283
AfisC2G07360	AT4G35310.1	192	45	2	4	189	127	318	73.44	1e-76	283
AfisC2G07360	AT4G38230.2	221	72	2	4	218	84	304	64.71	4e-76	281

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	14	182	123.3	9.7e-36

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005777	C	peroxisome
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005789	C	endoplasmic reticulum membrane
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009789	P	positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010359	P	regulation of anion channel activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019252	P	starch biosynthetic process
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:1902456	P	regulation of stomatal opening

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network