result

Gene information

Detail information of AfisC2G07731

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G07731	chr2	1258969748	1258980194	-

Sequences

CDS

>AfisC2G07731
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Protein

Gene

>AfisC2G07731
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010923730.1	5.8e-93	probable transcription factor PosF21
Swissprot	Q6S4P4.2	4.4e-37	Transcription factor RF2b
trEMBL	A0A6I9RB88	4.2e-93	probable transcription factor PosF21

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G38900.2	52.08	2e-103	373		Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G07731	AT4G38900.3	457	159	17	21	440	61	494	52.08	2e-103	373
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AfisC2G07731	AT4G38900.1	463	159	18	21	440	61	500	51.40	2e-101	366

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g242991.t1
Allium fistulosum	AfisC2G07731
Allium sativum	Asa5G03259.1
Arabidopsis thaliana	AT2G21230.1; AT2G21230.2; AT2G21230.3; AT4G38900.1; AT4G38900.2; AT4G38900.3
Oryza sativa	LOC_Os08g43090.1; LOC_Os10g38820.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	342	400	36.5	3.5e-09

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000828	F	inositol hexakisphosphate kinase activity
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GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0005829	C	cytosol
GO:0051019	F	mitogen-activated protein kinase binding
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GO:0051170	P	nuclear import

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K20557	VIP1; transcription factor VIP1	EC:-	MAPK signaling pathway - plant	ko04016

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network