result

Gene information

Detail information of AfisC2G07926

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G07926	chr2	1293194863	1293202764	+

Sequences

CDS

>AfisC2G07926
ATGGTTGAGAGAAGAGCTAGTTTGTCCGTAGAGGCCATAAATGGGTTAGAAATCCTAAAGCGTAAAAGACTCCAACGGAAGCTGGGTATTATATCTAATGGCGTGAATGATACAAATATTATTACAGAAAATGCTGGGAATAGTTTAAATTATTCCAGTTTACCAAAGAAGAAAATGCATAAAAGCTCATCTGGTGATCATATTAACGAGAGGGATCCATTTTCAAAACACAGGGTGGAAAAATTTGACATGCCTGATTTAGAATGGATTAGTGAGGTCCCCGAATGCCCTGTTTTCTACCCATCCAAAGGAGAATTCGAAGATCCATTGATTTATCTCCAAAAGATTGCGCCTGTTGCTTCTAAATTTGGCATATGCAAGATCGTTTCTCCAATAAGTGCTTCAGTTCCTGCTGGTGTTGTTCTGATGAAGGAAAAATCTGGGTTTAAATTTTCAACCAGGTTGCAGCCTTTTCGACTTTCTGAATGGGATGTGGATGACAAATATACCTTTTTTATGAGTGGAAGGAACTACACACTTCGGGAGTTTGAAAAGATGGCAAATAAGGCTTTTGCTCGAAGATATTCTTGTGCTGGATGCCTACCTGATAAATACCTGGAAAAGGAATTTTGGCATGAAATTGCCTATGGCAAGACTGAAACTGTTGAGTATGCATGTGATATTGATGGGAGCGCCTTCTCATCTTCCAAAACTGATGAACTGGGGAAAAGCAAATGGAACTTGAAGGACCTTTCACGGCTCCCAAATTCTGTTCTGCGGCTCCTTGGAGCAGCTATTCCTGGAGTGACTGATCCTATGCTTTACATTGGCATGCTATTCAGTATGTTTGCCTGGCACGTCGAAGATCATTATTTATACAGCATTAACTACCATCACTGCGGAGCATCCAAAACTTGGTATGGGATTCCTGGTATTGCAGCTTCTGACTTCGAAGATGTTGTTCGTAATAATGTATATGAAAAAGATATGCTAAGTAGTGAAGGGGGAGAGGCAGCATTTAGTGTACTATTGGGGAAGACCACCATTTTTCCTCCAAACATTCTGCTAAAACATGATGTTCCGGTGTATAAAGCTGTGCAAAAACCCGGAGAGTTCGTCGTCACTTTTCCTCGTGCATATCATGCAGGTTTTAATCATGGTTTCAATTGTTGTGAAGCAGTCAACTTTGCATTGGGTGATTGGTTTCCGCTTGGTGCAATGGCTAGCGAAAGCTATGCACTTGTCAAAAAATTGCCCTTGCTTCCTTACGAAGAACTCCTCTGTAAAGAAGCAACAATTCTTCATCAAAAAATGTCAAAACTTGATCTAAACGATCCTGCACCTTCAGCTGAAGAATTGACAACTCAAAAGTGCATCAAAGTTTCATTCATTCAGCTAATGCGGTTCCAACACCGTAGTCGATGGTTGCTCGGCAAGTCAGGAACACGAATGCAAGCTTCTGATACTGCAATGTTATGCAGTCTCTGTCATCGCAGCTGTTATTTATCTTATGCTGCATGCAATTGCAACGAGCAACCTATATGCCTTCATCATGCGAATGATACAGCGAGCTGTAGCTGTGGTTCTGATCGTATCATCTACTTGAGGAGTAACATCTTAGAACTGGAAGCAGTTTCACTTGAATTTGAGCAAGAAGATGGTATACTAGATGAGGTTAAAAAGCAAGCACGTGAAGTCACCGCTGATGGGTATTATCCCTATTGTGATATCAAATTTGAAGCAGCTTCTGAATTTAAAGAACAAGCTCAGGGTGATGTGCAGCCACTTATAACTGAATCATCTTCATCATCAGGAGTATCTGAAAGCCATTTAGCCTGCATAAATAAGTGTGAAAATAACAATACAACAAAGTTTGTTCCAGTTAGATGTTCCATGTACGAAAGTGAGGATTCAGACACTGAATGTTTTAGAGTTAAACGCAGATCAAGCTCGACCTTACAAAAAAGACGAGCTGCAGATTCTGTGAGCTCAAATATATCCCCAAATAAGGCAAACAAAAGACCAAGGCATTCAAATTTTGAAAATTCTGCTAGCAGTAAGATATCTTCAAAATTCAACCATTTTCCAAAAACTACAAATTCAGAAGTTGACAACAGCTGTAGGCGATTTAATTCAATTGAAGCTAGGAGAAAGGAGGACAATCGACAGAATTTGAAACCAATTCGTTTGAAGTTTAAATTTCCCTTGCATAGCTCGAAATGA

Protein

Gene

>AfisC2G07926
GTTATCTCCAACAAACCCTTTCTTCTTCTCCCGCCGAATTATTCGCCGCCTTTATATTCCCCTCCAACCGACGAATCTTCCACCAACTCCTCAATTTCCGCTCGATCCGGCGATCCGTTCTTGTTGTTTTTGCGAACGGTTGCCTGATTGGTAATGCGGGTTCAAAGTTGAACGGATAAGATCTGTTTGCGTATAATTTGAGCTGTTTTCTTCATTCAAGGCGGATCTGCGATCGTTATGAGATGGTTAGTGAATTCATTTTCCTTTATCTGAATCTACTTTGAAAAATTTAGGTTTTAACCGCTGTTGGCTGTAATCCTTTTTTTGTTCTTGATTGTTTTTTTCTTCTTATGCTGTATGTATAATGTTTGCTAATGTGATATTGTTTGTATTTTTGTCTTTTCATATTGTTAATTTTCTTCCTTTTTTGTAGCTAAATTCATTTTAGCAATCGTCCCCTTTGTTTTATACTACTATCTTATCCGTATTTAATTACTGAAATCTGATATTTTTACTCATAAATTAAATTTCTGTAGCACTTATCCTGTTTCATATAAACGGAAACTGTTAGCTTTCTAGTAAAATGTTTTATAAATTTGGAAACTAGATATCTGTTTGTGATGTGATGTTTCCCTTATTCATTTCCATTTTAAGTCAAGGTTTTGTATACAGAAATGTTGAATAATGGTGTACAGAAATGTGTGCTGAACATTTCTTTTGTACAAAAGCTTTTACGATAGCCTTAAAACCCAAAAATACTAGCCATTTGTAGGAGAAAAGCTGACATTCTTGCCCCATCCCTAGAGAATAAGACACGATTAAAAATTTGAATTATCCAATTTTTGTGTGATTATTTTTTAGTTTGTTGGGAAGCAACAGTTTTTAATAATTGCATGAATGATTGATTTTGTGGCCCTAAGCATATGTGCAGGCTTTCACATTAGTTATTGAGAAGCATGATAATATTTCAATCATAGTGCATTTGCATGATACATTCCATGCCGGTACCAGAACGTTGTACACACATCTTGTTATAAATTCTGATGATTGTGAAAGAGAAATTAAATTGGACAAGTAGCATGATTGGTTAGGGGAAAAACTTGATAAGTAGATTTTCTGTCAGTGGATAAGTGTTACGTTTGTTTGTATATTATTTTAACCAAAGAACCCTTGTTACTTTTCTTTTTTACATTATTCAACGAAAAACTAAATTCAAACATTAAATTCAAACATTTAAAATTTGAATTTCCATATTATAAAATTTTGAAGTCTAAAAAAAAAGAAATATAAATTTCAGAAAATTAAATCTTTAAATTATATTATATTTCAAGTTTCAAGAATACAATATTTCAGAGAATTTAATGTTTAAATAGTTTACATTGTCAATGAATTCGACTTTTTAATATTTGAAATTTTCTAAAACTTATAGAATTGAAAAGAAAATTGATTTTTTTCTGTTTTAAATGAAGGATAATCTTTGTTTAATTTTTAAAAGGGTGAAAAGGTTATTTTAATTGTTTTTACTAAGGGAAACAATATTTCCTTTCCCTTTATTCGTTAAACATCCCATTAGTCATGCTCCTTATCCAAAATGTTTTCTCATTTAGCAGTCACAAAACCTTGATGGTTTATGTGCAATATATTGAGAAAAAAAGTCTGAAAAACTATCGTCATATTATAAATTATAGACACCTTTTCTGCTTTTACAATAGCTGTAGCTTTTGGGATATGGTTAATAAAATGAAAAAATCTACATTATTTCTTTTGAGGTTTGCTATCTTAGGTTCCTGAGGAAATATTAATGCAGATAAAAAATTTAAAGAAAGAATTAGCCATTTATGATAAATTGATACATCTTTTGAATGGATCCCACAGGTTGAGAGAAGAGCTAGTTTGTCCGTAGAGGCCATAAATGGGTTAGAAATCCTAAAGCGTAAAAGACTCCAACGGAAGCTGGGTATTATATCTAATGGCGTGAATGATACAAATATTATTACAGAAAATGCTGGGAATAGTTTAAATTATTCCAGTTTACCAAAGAAGAAAATGCATAAAAGCTCATCTGGTGATCATATTAACGAGAGGGATCCATTTTCAAAACACAGGGTGGAAAAATTTGACATGCCTGATTTAGAATGGATTAGTGAGGTCCCCGAATGCCCTGTTTTCTACCCATCCAAAGGAGAATTCGAAGATCCATTGATTTATCTCCAAAAGATTGCGCCTGTTGCTTCTAAATTTGGTAAGTATTTCTTTAAATATTCACCTTACTATCAGAAATCATAGATGCGTGACAATTTCGTCTCTAGTTTTTTTGCCCCTAGATGAGATTTATTAGTTGAGTATTATGCAAGTATGAGAGGACAAGCTCAGTAGAAGTTTATTTGATGTGGTACTTTGATATGTTATGTTAACAAGTTAGAGAGAAATTTGTACATATCTTGACTAGTTTACGCATATTATAATATATTATACCGTAGTCTCATAAAAGGGATAAATAGTACTCTCTCTGTCTATCAAGTAAAACCCACAACATGCAGACTTAGAGTACAAGATGCATGACAAATTGATGAAGGAAAACAAACATCTTGATTGTAAGATGCTTGGTACATCTGTTTACTCTTGTATTCTACAAACGCTGAGCAATGCAGAATCATATATAGCTAATATTGCATTCCATAAGATCAATATTATTTTACAAAAGCGTACCAATTAGTTATTTGCTCAAGTGTCAATGACCAATGGGAATAGAGTAGGAAAAGGGAAAAGATATTAGTTGAACATGTACACTAAACTATTTCAGGAAGCATAACTCAAAGTCTAAACCAGTATGTTAATCCATGTGAAGCACATTCAAGTAAAATTAATATTTTGAGCCAACTAAATATTGTAGAAAATAGAATCAAAACATAGTTTGTCATGGCACTGATTAATCTTAGTTTTGCAAAATTAAGGTACATGAAGGGTATTATAAGTTCTGATTTTAATAGATTTGCCAACATGTGTCATGTCTATAAATTTGTTAGATTGTATTTAGTGAAATTCAACATATGGTCTCTGTTAGATCAAAATTGTAAGCAATTCCGACTCCTGCTTGAGCATTGAATGTTGAGATGAATGTAACTATACAAATCAGTGGACCAAACTGAAGGTACATGTATATTTATTAAGAGGTGGATTAATTAAGGGAAAGAGAAGTAGAAGAAGGGAGTACAATTTTGTACACACTACTTTTTATATACGGTAGACGAACATCTATTATTGGTCATACCAATACAGTAGATGAGCTCCACCACATTTTCTATTTTGTATCAACCAATCAAAGTGAAGTGCTATGCTTACATAAAAGTGTAGTGTACAAAATTTACTCGAACAGGGAAGTTCTCACATTGCGTAGTGCGCTTGATAGTTAACTCTAATGTAAGCAAGACTTGTTAAATTAATCGATTGCAATACTGATAACTTACTATCATTTGAGCATATTGTATCGTATTGCCTGAATATGGAGATATTTTTTCCATACTAATATATAGTGGCTGATTTTAGACTCTACGCAAATCCCTAGTTAGCCTAGCTGTTGGAATGAATGTGTATGCATGAACGTTGTATCTCCTCAATTGCTAGGCATGCATTTTTTTCGTTTCCCTTTTTAGATTAATAAGCATCAATGAGACAAGGTGTCAGGGTCATTGCTGTAATTCTAGTGATTTCTCATTTGCATAATATAAATGAATAATATGGGATTCAGCTCTACTAGTTGGTACTCTTACTCAAGGTTATCAAAACGGGATTCAAATCGTAAATCGTAACGTTCAAATTTTAAATCAAAACGTGATTTAAATCTTAAATCGTAGATTTAGTAGGCCCATGTTTTAAGAATTATAGATACTTTAAAATTGATTATGATTTAAGAACTTTACATATAAAACTTAAAATTCCGTTTTTTCTCTTGTTTCATTTTTATTTTATTTAGAAAACACTAGAATTAGAATTGTGGATGATAAACAAAATGAATATATAAATATGTATTAAATGATTTTTCTCAACTGCGGTTTTAACTGAGTTTGGATCGGAATATGTAAATCGAATCGGAACGGGAGAGATCCGATCCAAAACGGGATTTAAATCGTATGATTTTAAGATTTTTGATAACAATGCTCTTACTTGTCATCAGGTGTGTTAAACTAATGCACACAATCTTTTCCATACATGTGTTTATAGTTTGAACCGTCTTTATGTTTTATCAGAAAATATCGCTCACATATGTTTTCGCATGACAAAATATTGCTATTTGTGTGGATATAATGCAATCTATAGTCGTAGAACACATTTAACCCAGATCGAATGTTATATGCATGTTGAATAATACTGTTATGCAAAGAAAGCATCACTGTTTCTTTCGACAACTCTACTATATATGTTTCTTCTGAACTCTTTAATCCTGAATCAGGCATATGCAAGATCGTTTCTCCAATAAGTGCTTCAGTTCCTGCTGGTGTTGTTCTGATGAAGGAAAAATCTGGGTTTAAATTTTCAACCAGGTTGCAGCCTTTTCGACTTTCTGAATGGGATGTGGATGACAAATATACCTTTTTTATGAGTGGAAGGTTCGATCCTAATTAGCAATTGTAGGTTATGTTGATATAACTTGATAAAATGTAATTTGGGATTATTGGTATATCTGTCTAGGAACTACACACTTCGGGAGTTTGAAAAGATGGCAAATAAGGCTTTTGCTCGAAGATATTCTTGTGCTGGATGCCTACCTGATAAATACCTGGAAAAGGAATTTTGGCATGAAATTGCCTATGGCAAGACTGAAACTGTTGAGTATGCATGTGATATTGATGGGAGCGCCTTCTCATCTTCCAAAACTGATGAACTGGGGAAAAGCAAATGGAACTTGAAGGTAGAATTCTTTCTTTTATTAATTCTCTTAGTCAGTTGTCCTTGTTTAGCTACTTACCTGGCATGATTTGGACCAGTCCTTTTTTTTTGGA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020241989.1	1.3e-261	lysine-specific demethylase JMJ706-like
Swissprot	Q336N8.1	6.1e-192	Protein JUMONJI 706
trEMBL	A0A8B9A9D2	2.3e-236	lysine-specific demethylase JMJ706-like isoform X2

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G46910.1	52.81	0.0	727		Transcription factor jumonji (jmj) family protein / zinc finger (C5HC2 type) family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC2G07926	AT5G46910.1	712	272	13	1	656	1	704	52.81	0.0	727
AfisC2G07926	AT4G20400.1	594	306	17	93	599	53	633	31.65	2e-64	244
AfisC2G07926	AT1G30810.2	583	291	22	53	553	15	581	33.28	2e-63	240

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g197648.t1; g197649.t1
Allium fistulosum	AfisC2G07926
Allium sativum	Asa0G02300.1; Asa3G01323.1; Asa3G01328.1; Asa6G01319.1; Asa7G02421.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa	LOC_Os02g46930.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF02375.14	JmjN	Family	97	129	48.4	5.9e-13
PF02373.19	JmjC	Domain	273	396	132.0	1.1e-38
PF02928.13	zf-C5HC2	Domain	493	544	37.2	2.5e-09

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000792	C	heterochromatin
GO:0003677	F	DNA binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0010629	P	negative regulation of gene expression
GO:0031324	P	negative regulation of cellular metabolic process
GO:0032453	F	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0032454	F	histone demethylase activity (H3-K9 specific)
GO:0034720	P	histone H3-K4 demethylation
GO:0042221	P	response to chemical
GO:0045815	P	positive regulation of gene expression, epigenetic
GO:0046914	F	transition metal ion binding
GO:0048439	P	flower morphogenesis
GO:0048573	P	photoperiodism, flowering
GO:0048581	P	negative regulation of post-embryonic development
GO:0051213	F	dioxygenase activity
GO:0060560	P	developmental growth involved in morphogenesis
GO:0060603	P	mammary gland duct morphogenesis
GO:2000242	P	negative regulation of reproductive process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11446	KDM5, JARID1; [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase	EC:1.14.11.67	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network