result

Gene information

Detail information of AfisC2G09398

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC2G09398	chr2	1562614681	1562630066	+

Sequences

CDS

>AfisC2G09398
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Protein

Gene

>AfisC2G09398
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Functional annotation

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nr	XP_010926956.1	3.1e-161	zinc finger CCCH domain-containing protein 45 isoform X1
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trEMBL	A0A6I9RIS7	2.2e-161	zinc finger CCCH domain-containing protein 45 isoform X1

Best hit in Arabidopsis

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>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g141073.t1
Allium fistulosum	AfisC2G09398
Allium sativum	Asa6G00368.1
Arabidopsis thaliana	AT1G30460.1; AT1G30460.2
Oryza sativa	LOC_Os06g46400.1

Pfam domain

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PF04146.12	YTH	Domain	259	393	156.6	1.9e-46

Gene Ontology

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GO:0070063	F	RNA polymerase binding
GO:0070555	P	response to interleukin-1
GO:1900363	P	regulation of mRNA polyadenylation
GO:1990247	F	N6-methyladenosine-containing RNA binding
GO:2000031	P	regulation of salicylic acid mediated signaling pathway

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14404	CPSF4, YTH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4	EC:-	mRNA surveillance pathway	ko03015

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network