result

Gene information

Detail information of AfisC3G00401

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G00401	chr3	68338045	68344195	-

Sequences

CDS

>AfisC3G00401
ATGGGTCTTTGTTGCAGCAAAAAAGACAGAATCCCCAAACAGAATGTATACTCATACAAAAGACCCGAACCATCTAAACCTGCACCACCACAACAAAGCAACCCACAACCCACTCCATCTCAACCCATTACCCATTATGATCCACCCAGACTCGTTAAGCCTTCTGCTCCGAATCCTCAACCCACTTTCCAACCAGACACGATTCTTGGAAAGCCTTACTCGGATGTAAGATCCTTCTACACTTTAGGCAAAGAACTAGGGCGTGGCCAATTTGGAGTAACATATTTATGCACGGAGAATAGTACTGGTCTTTCGTATGCATGCAAGTCGATTTCTAAAAGAAAGCTTAAAAACATGAACGACAGAGAGGACATAAAGAGAGAGATTCAAATAATGCAGCATTTGACTGGTCAGGCTAACATAGTCGAGTTCAAAGGGGCTTATGAGGACAGACAATCTGTGAACCTTGTTATGGAATTGTGCGAAGGCGGAGAGCTGTTTGATAGGATCATTGCTAAAGGGCAGTACACGGAGAAGGCGGCGGCTGGGATATGTAGGGCAATTGTGAATGTGGTTAATATTTGCCATTTTATGGGGGTTTTGCATCGGGATTTGAAGCCCGAGAATTTCTTGCTTGCTACTAAGGATGAGAATGCTATGCTTAAAGCTACCGATTTTGGCCTCTCCGTGTTCATTGAGGATGGAAAAATATACAGAGATATAGTAGGAAGTGCATATTACGTTGCACCTGAAGTACTAAAGCGTAAATATGGAAAAGAAATAGATATATGGAGTGCAGGCATTATCCTCTACATTCTTCTTAGTGGTGTACCTCCATTTTGGGCAGAAAACGAGAAAGGAATATTCGATGCTATATTGGAAGGCAACATCGACTTTCAAAGTTCACCTTGGCCATCTGTATCAGAGAGCGCCAAAGATTTAATCAGAAAAATGCTCACTCAAGAACCTAAAAAACGAATTACTGCAGCTCAAGTCCTGGAGCATCCATGGATAAAAGATGGTGGTGCATCTGATAAGCCTATAGATAGTGCAGTCCTTTCAAGAATGAAGCAATTTAGAGCAATGAACAAGCTTAAGAAGATGGCCCTCAAAGTTATTGCTGAGAATCTTTCTGAAGAAGAAATCAAAGGACTTAAGCAAATGTTTGCTAATATGGACACAGACAATAGTGGCACAATCACATATGAAGAGCTCAAAACTGGTTTGGCTAGACTTGGTTCTAAGCTTTCCGAGACTGAAGTAAAGCAACTCATGGATGCCGCTGATGTTGATGGTAATGGATCAATAGACTACCTCGAGTTCATCACAGCAACTATGCACAGGCACAGATTGGAAAGAGAGGAGCATCTATACAAGGCATTTCAGTATTTTGATAAAGATAATAGTGGGTTTATAACTAGGGATGAGTTGGAATTGGCAATGAAAGAACATGATTTGGGTGATGATGTCACGATCAAGGATATTATTTCTGAAGTTGATGCAGATAATGATGGTAGAATAAATTACGAGGAATTTTGCACAATGATGAGAAGTGGAGCTCAACAACCTATGAAGCTTAAGTAG

Protein

Gene

>AfisC3G00401
GTATCGTCCACGGTCAATCGTCGATATCAACTTTTGTTGGGTTGTTTTGTTTGCTTCTGAATAGCAATCTTCTAGTAAACGTAATAAAGTCTCCATTCTTTTATTTGGGCTTTTCTTGCACTCATACGCAATCAAAACCAATTTCCAAACTTTTTCTAATATTCTTCAAAATATTCGTAATTTGTTTCCGCGTTTTCTCTGCCCTTATTTTTAAGGTGCAAAGTTTTGAACTTTAAGCTCAAAAATCCAGTTCAGAGTTGCTTGCAGCCACTTCAGGTGAAAAATATTCATCTATATTCTGTTTTTTTAATGTTGATTTTAGTTTGGGATTTGGATAATTATATTCGTGTTCTAGGTACTGTGCAAAATCCAATCTTTTATCTGTAGTGTTATGGATGAATTATAATACCTCTGTTTCTATTTCCTTTAGCCAAGATGATATTAATTTAGTACCCAGATCTGCATTTTTCATTAAATTGTTTATCTCAGGTGATCCAGCATAGTGAAAGCCGTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGAGCCCGTCAAGCTAAATACGCCGAAATGACGTATTTCACATTTGATTCTAACAAGTTCATGTACCGAATTAATGTGATTACATATGTTTCTACTAGATAATTTGAAAGTGGCATAATTTTTAATTCTTGTAGAATGCATTGCATTATGATGTACATATTACCTCTCTCATCTATGAAAAAATTTCCGACTTTTGATAGCAGCATGAAATAATGGTTTAAAGATCATAAAAAGAAACTGAATTATCAAGAAAAAAATTGAAGAAAATGCGTGTTTATTGCAGCAAGAAAGTTAATATATAGAAGTGATTCTGTATTATGGTAAGAACTTGTTTTATTAGATTGTTGTAAAGTGGCATAACTTTTGTTTAGTCTTGAGCAGTTGGGCTTCTTAAGCTGTTAACTAAGCAAACACATTGCGTCATGATTCATTCATGTGCTGGCATTTCCAGTACTCGGTAAGTGCATATAAAATAGATGGTTCAAAGAATAAAAAATAATTAAAAATTCCAAGAAAACAAATGGAAAAAAAATTGGTCTTTGTTGCAGCAAAAAAGTTCATGGAATAAATCAAAGTAATCCTATGTTAATTGCAATAACTTGTTTTACTGGATAGTTGTAAAGTGGAATGCTTTTTAATCATTCTCAAGCATCTTAAGCTGTTAACAAAATGAATACGTTGCATTATATTTCATACATATGTGATATTTCTGATTTCTGGTAGGTACATAGAATAGATGGTTCAAAGAACAGAAAAATAAACCAAAACTCCAAGGAAAAAATTTGAAAAAATGGGTCTTTGTTGCAGCAAAAAAGACAGAATCCCCAAACAGAATGTATACTCATACAAAAGACCCGAACCATCTAAACCTGCACCACCACAACAAAGCAACCCACAACCCACTCCATCTCAACCCATTACCCATTATGATCCACCCAGACTCGTTAAGCCTTCTGCTCCGAATCCTCAACCCACTTTCCAACCAGACACGATTCTTGGAAAGCCTTACTCGGATGTAAGATCCTTCTACACTTTAGGCAAAGAACTAGGGCGTGGCCAATTTGGAGTAACATATTTATGCACGGAGAATAGTACTGGTCTTTCGTATGCATGCAAGTCGATTTCTAAAAGAAAGCTTAAAAACATGAACGACAGAGAGGACATAAAGAGAGAGATTCAAATAATGCAGCATTTGACTGGTCAGGCTAACATAGTCGAGTTCAAAGGGGCTTATGAGGACAGACAATCTGTGAACCTTGTTATGGAATTGTGCGAAGGCGGAGAGCTGTTTGATAGGATCATTGCTAAAGGGCAGTACACGGAGAAGGCGGCGGCTGGGATATGTAGGGCAATTGTGAATGTGGTTAATATTTGCCATTTTATGGGGGTTTTGCATCGGGATTTGAAGCCCGAGAATTTCTTGCTTGCTACTAAGGATGAGAATGCTATGCTTAAAGCTACCGATTTTGGCCTCTCCGTGTTCATTGAGGATGGTACTTGTTTTGTCTTTCTTATTTATTTTATTGGAATTTTTCCTCTTTTCCAATTTCGGACCACTTTTAAGAAGTTGTTGCAAAACAAAACCCTTCCAATATATTTTACAAATGTTTCTACGATGATGATGCTAAGTTAGATTTTATACCGGCATGATTTCAAATAACGGCAATCTTTTTTTTAAGAATTAGTACTGGTGCGATTAGAACGCACCAGTGTATATATAAAAAACTGACGAAATCGCATTGGCGCGATTTCAAGTCATTCCAAAATGAAATATTGCCAGCGTGCCAAAAAATGGCCTTTATTGAGGATGGTACCTGTTTTTTGTCTTTTAAATAATAATGATGATGACATACTTTTGTGGTTATTTTTTACAGTATCAATTTGGATAATAACAATCTCTCTTAAAAAATGGAGGAATTTTGGTTGTTTTTCAGTGAAAAGTATCAAATGTAGCAATATAGCGGGGAACTTTTTATGCTCTATTTGAAGCGTCAAAATTCTTCTACAACACGTGGTGATTGTCATCTGTCCAAAATATATCTAGTTTGCAATAAAATAATAATCAAAGTTATAAATATATTAATTTTTAGGGGTTATTTGTGAAATGCACTCATAGATATGTATAAGTAACAGATTTGGAGTAGGAATGTTGATGCTTCAAGCGGATCGTCACAAAATTCGCTGAATAAATTACAGAAATGTTAGTGTTCATATTTACTCATATGTTGTGTTTCATCCAAACTAATACTGTCAGTAGTAACCCTCTTTACCTTGGATATAATTTGAGGAAATATGGTTTTGTGGAATTGGTTATGTACTATTTGCACAAAGTAAGGCATATCTGTTCTCCATAATTTGCCAGAACACTTGTTTTAACTTCTGTTTTCACAATATGTTGATTTTTTTTTTAAATGATAATATGAATATCCAGCTAAATTGGACACTGTTTGTAAACTTTTGGATATGTAGATTCTTCCATGCGTTTAAGAATCTCATTTTTGTACTTCCCAATATATATGCTTATATTTGGTTAGCTTTCTATCACATTTAAGCTCCTATTAATCATGTGTAACTACATACATATCTTACTCTCTAACTTGACCATCTGTGGTTCTCCATCCAAACTCCAATCTTCTATTAATCATGTTTGACTATATACATAGCTTCTGTATGCATCAATGTTCTCTAATTTAGCAATAGTTTTTATCTCTAACTAAAAATTACCACATAAATAGATTGTTGAATACTGTTATCGCATCTCATTTCAGGAAAAATATACAGAGATATAGTAGGAAGTGCATATTACGTTGCACCTGAAGTACTAAAGCGTAAATATGGAAAAGAAATAGATATATGGAGTGCAGGCATTATCCTCTACATTCTTCTTAGTGGTGTACCTCCATTTTGGGCAGGTAAAACTAAGTTACAGAAACTATGATCATGTATTTCTACACTACACATCCTTCATATTAGCATTATTTGATCTTTGCAGAAAACGAGAAAGGAATATTCGATGCTATATTGGAAGGCAACATCGACTTTCAAAGTTCACCTTGGCCATCTGTATCAGAGAGCGCCAAAGATTTAATCAGAAAAATGCTCACTCAAGAACCTAAAAAACGAATTACTGCAGCTCAAGTCCTGGGTATGTATGTTTGTGTTTGTGTATATGTGTAATATGAGTCTGTACAATATAGTATAGACAACTACTTGTACTTTGTATAGTTTTATATCAAGTTATTCTTAATATTGGCAATATTGTCCTTAGACCAGAGAATTCAATCTGAAAGAGTGATAACGATAAAATTGTTAAATTCAGCCTTAAATACAAATAGCAGTTGAAAGTGAGTCATTATTTGGAAAAAAAATTATATCATACAATCATTGAATAATTGCATGAATGATTTCTATTCAGAGCATCCATGGATAAAAGATGGTGGTGCATCTGATAAGCCTATAGATAGTGCAGTCCTTTCAAGAATGAAGCAATTTAGAGCAATGAACAAGCTTAAGAAGATGGCCCTCAAAGTTAGTATTTCTAATAAAATGTTTGCAAAATTTTGTTTTATTTACCGTGCTTCTTGAAATATCTAACACATGAAGAAAATTTATAGGTTATTGCTGAGAATCTTTCTGAAGAAGAAATCAAAGGACTTAAGCAAATGTTTGCTAATATGGACACAGACAATAGTGGCACAATCACATATGAAGAGCTCAAAACTGGTTTGGCTAGACTTGGTTCTAAGCTTTCCGAGACTGAAGTAAAGCAACTCATGGATGCCGTAAGTTGTCTTTAACCTTCCATCACAAAAATCTTGAAACCCTAGGGTTCTGAATTTAATTTCAAATCGAATCTCTTTAGTTACAATTTAATCATCAAAATAAAATTAAAAAAATAAAACTCAATTGAAATCCCAATTGAAGAACATTATTTTATTCATGCTGAAATTAAAAAAAAAAAAATTAAGATGCTTAAGCAGTAGGTTTAGGTTTAAATGCTGAAATAAGAAATTATATAAATCCATGCTCTTAAAACAAAATTAAGAGGAAACAAAAGGGAAATCAGGCTTTAGGAAAAATCAGCTCAAAAATCAACAAAATTTCAGCTTATATATTGTTGTTATGGAAAGTAGAATCAATGGATTCACATACTTAAATGTTATTTGATGACCTATGTAAAACAAAATATCTTGAATTCAAGCATATACACACATTAAAAGTCGAAACTTTTGAAATTTTGATTTATCTAGTTTCTATCCAAAAATTGAACTTTTCGAATTATGATTTATACCTCTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTCAAAATTCACAAAGTTAAATAATTTATGATTTCTGTTTTTATTTCAGGCTGATGTTGATGGTAATGGATCAATAGACTACCTCGAGTTCATCACAGCAACTATGCACAGGCACAGATTGGAAAGAGAGGAGCATCTATACAAGGCATTTCAGTATTTTGATAAAGATAATAGTGGGTAAGTTTTTATTCATATATTTCATAAAATGAGAGAGACTATAACTAAAACACAAATTTTGATGTTGAATTCATGTTAAATTTTTGCGACAGGTTTATAACTAGGGATGAGTTGGAATTGGCAATGAAAGAACATGATTTGGGTGATGATGTCACGATCAAGGATATTATTTCTGAAGTTGATGCAGATAATGTAAGAGAGCTTATTTGACAATTGTTTATAAGTAGTCATAAGCAATTTCATTTCTACCACTAAATTACACCAAAATTTCAAGTTATACAGTGAGACACTACTAATTTTACTATCTATATAAAACTGCTCAATATGATAGTGATAAAAAACTGTTTTCAAATGGGTTCGAAATCGATTTGAAGAATGAGTTTTCTTTTTCAAAAAGTAATACTCCTATGCTTATGTTCAGAAATTCATACTGTGTATTACTTAATTCATGATGTGGTCAGCTTCATTTTAAACTTACAGAATTAGGTTTCACTTGTCTTTAAAATTGTTTGAAACTTTGCATTGCAATGAATGATGTGCAAATGACTTCCTAGTAAGAAAACCATGCAATTGTCAAATCATGAATTAAGTATAACATAAGCATGAGTTTTGGTGGTCTGTATAGTAAGAAATTTTTTTCTTCAATATGGTACATTACTGCTTAATGAAATAGGTTAATGATTTATTTTCATATGTATGTATACATAGGATGGTAGAATAAATTACGAGGAATTTTGCACAATGATGAGAAGTGGAGCTCAACAACCTATGAAGCTTAAGTAGTCGCAAGGGAGATTTAGTTCTTTGTTTGGACTAAGCTTTTTTCCCCGGTACAAATTGGAAATTACAGAGGTAGTCTGAGTTTGTATGATGTTTCAAGGGCGCTGTATTTGTGTAATAACATGATATTTTATGATTAGTGTAAATTATATTCGTTTACTTATGTGTCGTCATGTCACGTTACAGTTTGGGTATTGTATGTCCTTGTGCGTATTTGTGCTGTATTGTGTTAGTTATTGGGGGAAAATCCAGAATTTTGAACTCTAGAAAAGTGCATATGTACGTATGTACATCACATATTATATGCATAACTATATGATACAATATAAAATATTTGTACTTTAC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020273550.1	1.9e-243	calcium-dependent protein kinase 19-like
Swissprot	P53683.2	1.2e-226	Calcium-dependent protein kinase isoform 2
trEMBL	A0A5P1FEF8	5.8e-242	Calcium-dependent protein kinase 29

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G04720.1	73.77	0.0	810	AtCPK21;CPK21	calcium-dependent protein kinase 21

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC3G00401	AT4G04720.1	530	120	5	4	523	3	523	73.77	810
AfisC3G00401	AT3G20410.1	525	116	4	29	523	14	538	72.19	791
AfisC3G00401	AT1G50700.1	528	130	5	1	523	1	518	72.54	790

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	80	338	247.9	9.6e-74
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	385	445	47.8	1.3e-12
PF13499.3	EF-hand_7	Domain	454	517	48.2	9.7e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0005773	C	vacuole
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009738	P	abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010359	P	regulation of anion channel activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0046686	P	response to cadmium ion
GO:0019903	F	protein phosphatase binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13412	CPK; calcium-dependent protein kinase	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network