result

Gene information

Detail information of AfisC3G00714

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G00714	chr3	124745275	124750845	-

Sequences

CDS

>AfisC3G00714
ATGGATGCGATCACTCAGGCATATCTTTTTTACTTGCTTGGTTTGACCTTCTTCTTGAACCATAAAAATACAGTCATCCATGACAAAGGATACGATGGATCCAAAGTAGATGTTTGGTCATGCGGTGTTATTCTTTTTGTATTAATGTATGGTTATCTTCCCTTTGAGGACTCCAATCTTATGTCGCTATATAAGAAGATTTCCAAAGTTGATTTCTCTTGCCCTGCTTGGTTCTCAACTAGTGCGAAGAAACTTATAAAGAAAATCTTGGATCCTAACCCCAAAACACGAATTACTATGTCGGAGATTAAGGCGAACGATTGGTTTAAAAAAGGGTACAAACCACCTTGCTTTGAAACTGTGGATGTTAATGTAGATGATGTTCATAATATCTTCAATGACAAAGAGGAATCAGGAAATCTTGTAGTTGAAAGTCGGGAAGAAAAGCCTTCTGTAATGAATGCCTTTGAACTCATTGCGACATCTCAAGGTCTCAATTTTGGGATTCTATTTGAAAAGCCTGCGGAAACAAGGTTTACTTCAAAGCTACCACCAAGTGTGATTCTTTCTAAGATTGAACAAGCTGCCGCGCCTTTGGGATTTAATGTTGAGAAACACAACTATAAGTTAAAACTGCATGGCGAGAAGATAGGAAGGAAGGGCCATTTATCTATTGCAACAGAGGTGTTTGAAGTAGCGCCTTCATTGTGCATGGTGGAGCTTCGTAAAGCAAAGGGCGACACGCTAGAATTTAACAGCTTTGGGAAGTTTGCTGTACAAAAATATTTAACAATAGTGCATCTGAGAGGGGAGGAATCCTTGTTTGGTTCTTTGGAGCAACCAAGACAGGTGACTCCTCCTCCAACTCCTCCTCATTATTTCCAGTGTGGTGTTCTGAATTCACCTCAAGTTTCGGCTCTACCATCTACTCAAAGATTAAGTGGTAACTATGGCAATTTAGTCTGTTGTGATGGCTGCCCATCTTCTTATCACAAATCTTGTTTGGCTTCCAAGGGACTAGAGAACGATCTTTTAGTGCAGTGGTCTCATGGAGCAGGTGGCATAACTCTTATGCTTTGCAAAACCGCTCAGGTTGTTGGATTCACCATTCTATCAAAGGAGGGTTCGTAA

Protein

Gene

>AfisC3G00714
ATGGATGCGATCACTCAGGCATATCTTTTTTACTTGCTTGGTTTGACCTTCTTCTTGAACCATAAAAATACAGTATGTTTGGGTCATCTAGCATGCTTGCCAGGCTAGATCAACTTCATACTGTTGATTTAGGCACGACCATCGTAAAGACCTGTAGATTAATCACTTTAACACTACAAGAAAAACTATTTTTAGTGCATTAATTGGTGGCGTTTTAAATTTTATGCAACTGTTGGTAATTTTACAATATAAAAATAAACAAAGAAACGCGGCTAATTCTCCCGCCGGTAATTCGTGGAACTTTTTGGTAAAGTTTTTTGTGGCGGTCCAAATTTCCTTTACCACTTTTTCTTCTTCTCAAACTACTCCACTTACGAGCCCTAATTTTCCTAATTCAAAAACTAAGACCGAACTAAAATAAAGCAAACGCGATTTTAAAAGCAGAATTCCAAGTTTCTTGATCGGGAACTGTGATTTCTGAATATTTGGGTGGAGCCATAAGGGAGTACATGTCAAAAAGAAGGATCGATATGTTGTTAGAGGAAGAGCAGAGGAACCAACAAGCTGAGACGCCTTCTAAAAGATCCTTATCTTGATCGAGAACTGTGATTTCTGAATATTTGGGTGGAGCTAAATCGCTAAAAGATCCTTATCTTGATCGGGAACTATAATTTCTGAGTATTTAAGTGGAGGGACCGATACTATGCTTCTTATTTGTAAGTAGTGTGCTGTGGCATTATACCCTTAATTATAATCAGGTCAATTTACTCGATCGTTTGCTCAATCGTTTTCTTTGTTTTATATTTATTATTTATACCCTTAATTATAATCAGGTCATCCATGACAAAGGATACGATGGATCCAAAGTAGATGTTTGGTCATGCGGTGTTATTCTTTTTGTATTAATGTATGGTTATCTTCCCTTTGAGGACTCCAATCTTATGTCGCTATATAAGAAGGTGAAGTTCTATACTCAGTATTTATTCCTGTATATGTTATATTCCCTTTTGGAATTTGTAAGTAGTTTTTATTGGTTTTTTTTTACAGATTTCCAAAGTTGATTTCTCTTGCCCTGCTTGGTTCTCAACTAGTGCGAAGAAACTTATAAAGAAAATCTTGGATCCTAACCCCAAAACAGTAAGAGTCTTGATTTTGCACTTTTGGACATTTTTTTCTGTATTTACTTATAAGTAGTCTAAACAATTTCAAAGAGGCTAATCGTTATTGACTGTTTGACAACTTACAATGAGGTGATATAAGCTACATAGAAATTGGTAAATCATAAGCAACAAGTACTTGTTTATGACATACTTCATCTTTTACGAACTTTCTAACTTATCTATGCAAACCGTTGAACTTTTTGTTGTTCACTTTAAACTAATTACGACTCAAAGCTATCTTGAAGTACTTGAAAATTATTGTTTCCAAATCGGCTTTTATTTTATTTTTGTCCATAAATTTTTTAAGATAAACCCAATAATTCTAGTTTGGAGCAAACATCTTATGGCTTTTAAGCTCAGTGCTTCTGAGCTCTATATACACGTGTTATGCCCTTTTACTTTGTACTTCAATAATCTGAGTTCCATCAATTAACTTGTAATTTTCTCTTTGCAGCGAATTACTATGTCGGAGATTAAGGCGAACGATTGGTTTAAAAAAGGGTACAAACCACCTTGCTTTGAAACTGTGGATGTTAATGTAGATGATGTTCATAATATCTTCAATGACAAAGAGGTTATTTTACGAACTCCTCATAGTTATATCATATCATAGACGACTAAAGTCAAATACAATTCATGAATTGCTAAGCATGTTCTTTATATTGCAGGAATCAGGAAATCTTGTAGTTGAAAGTCGGGAAGAAAAGCCTTCTGTAATGAATGCCTTTGAACTCATTGCGACATCTCAAGGTCTCAATTTTGGGATTCTATTTGAAAAGCCTGCGGTATATATTATTTATATCTTTTAAGTCTGTATCTGATTTTATTTTTTTATTTTTTTAATCTGTTATAATGGAATATTTTGTACATGCAGGGAAACGTGAAATAGGAAACAAGGTTTACTTCAAAGCTACCACCAAGTGTGATTCTTTCTAAGATTGAACAAGCTGCCGCGCCTTTGGGATTTAATGTTGAGAAACACAACTATAAGGTGCTTTTTTTTTGGAAAAAGGTGTGCGCTTCTACTTTTTTACTTCAGATTTAAAAAAAATGTCACATGACAGTTAAAACTGCATGGCGAGAAGATAGGAAGGAAGGGCCATTTATCTATTGCAACAGAGGTACGTAAGTCGAACATAATACCCGTTTCTCATGGAAAATATGATAGTCGTATGTTTACTTAACTTTCTATATATTAAATAAAGGTGTTTGAAGTAGCGCCTTCATTGTGCATGGTGGAGCTTCGTAAAGCAAAGGGCGACACGCTAGAATTTAACAGCGTAAGAAACTTAATACTATGTATTTGAGAAACTCTACCAAGGGAGAGTGTAGCTCTACTCCCTTTGAGTGGTTGAGAGAATAGACAATGGTTGCAATGTTAGTGACAATTATTGCTGGGTCTAATCTCTCAACCAATCAAAAGGGGAGTATTGTCACACTCTATCTAAAATAATTCAGTTTTTTTAATTTTCGTGGTTTTAATTTATGTTTTATGATTTCTTGGTTTGTCTTTATGACATTAATTTGCTAACGTTTGTGATATTATGTTAGTGGAGAGAAGTAGTATCAAATTATCTATGTTGGTTTGATATTAATCATGCAGGTGCGAAACAATTTTCAACTATCAATGTCGTGAACTTGTTTGCTTCTTCTTCCCACAAGTCACAACATGATGTTTGGTTGGCTGTACTAAATTTTAAGCAATTACGATTGCACAGTCGAACTAGACTATGTGATTTAATGTTTGTGCATTTCGAATCTATAATTTAAAACAGATCCATTTACGATTTCTAGATGGTTTAAGGTCAAGAAGCATGCATCAACTAGTCACAGTACTCTAACTTATGGAAAATATTTGTTTTGTGTTCTGACTTATAGAAATATATAAATTTGGTTAAGCCGGGACTTGAATATGAACTAAGATTACTTGTCATGTTCTTTAGTATTGCATAGATAAGCAACTTGATTTTCTTTCTGATCAGGCATACATAAATTTTATTTTAATGTGAGTAAGCATGTTTGTATGAGTATGTGAACATTTTTGTGTGTGCGTACAGGTGTGATATGAGATGGATCTGGTCATACAATGAAGGCATACATGATCTGGATAGGGATGTGCACATGCAAGGCAGTAGTAGCATGTGATGATGCATGGAGTAGCATCTGATAATCCATGGAACAAGCTGATATTTTTGGTATGTTGCCTTCTTGTCAGTTTGGGAAGTTTGCTGTACAAAAATATTTAACAATAGTGCATCTGAGAGGGGAGGAATCCTTGTTTGGTTCTTTGGAGCAACCAAGACAGGTATTATCAAACTTATTATTTTCTAGCCTTGGTGAAACTAAGTTCTTTGATATGTTGCTTTGCGATTTTTCATTAGATAATGATCCATAGGTACTTCATTTGGACTATTACTTCAATGTTCTGTTGGCTTTTATACTGCTAAGTGATGGCTAGTTAACATAGGTGCTAAAATTTTATGTAATAGGAGCAGATACTACGGTTGTTGTACCACAACCTTCTTTCTCCTTTTTTATTAACAAATTGCTTTAGGCATGCTTCATTGGGAACTGCATATTTGCTAATATTGACTTCCTTACCCTCTTCATCAGAAGTTTCTATTTGAATATTTAGTTTTTTTATTTCATCTAATGTGTCAGGTGACTCCTCCTCCAACTCCTCCTCATTATTTCCAGTGTGGTGTTCTGAATTCACCTCAAGTTTCGGCTCTACCATCTACTCAAAGTGATCTTCTTGAGGAGGAACCTCCTTCTCACAGCATTCTGATTTGGCTTTTGAGAAACTCCTTGCTCTACTGGAGAGTCCAACTCATTGATTGTGGGTGACTTGTTATGATTATAAGCAATTTCTGGGCTAATTTCGACAGCATTTGTAAATCTAATTTTGTTGCTGCATTATTTTTTTTGGGGAACTCATAGGATTAAGTGGTAACTATGGCAATTTAGTCTGTTGTGATGGCTGCCCATCTTCTTATCACAAATCTTGTTTGGCTTCCAAGGTAAGATTTGTGTACATAATTTTTAAAAAAAACTTGAGATAAATGGTTGTACTTGTAACCGAATAAGGTTAATGGGTTGGTTTGGTGTCATGGCAGTGCAAACCTGCAAACCTCGGTGTATAACTAAAATTGTAACATCCAGAATTGAACTTAGAATATATGGAGGTTTGATGTTTATTACATACGACATTACCTCTAGCTTTAATTATTCAATAAACTAGTACCTTATTGACAACGTACCTGTCATTTCTCTCCTTATAATCATGTAGGGTAAATACTGAATGTACAAGTAAAGAGAAAAAAATACAAATCTTCCCATTTTATACGAACAAAAAGGAAGCATTGTTTGAATCTATACTATAAAAATATAGCACATGCAAAATATAGATATTATTGGAAAGATCATTATAATGGTCAAAACAAATCTCATGTCTGATTCTGTTCTAGCGAGATATTGCATTTTGATCATTAATTTCTTAGTTAAAACCATTTTCCACATGACTTTGTCATGTTTATTTATTCGGTAACAAATGCATCAATCGAGGTATGAAATGTCTTTAAAAAAAAGGAAAAAATACAAAGAACATTTAATATGTTTTTTTTACTGCGCAATTAGATTAAGAAGGTGTATGTTTCAAAATTTTGGTAAATAGGCCTCACAAACTATTGTCCCAACAATTTACTTTATTACTAGGGACTAGAGAACGATCTTTTAGTGCAGTGGTCTCATGGAGCAGGTGGCATAACTCTTATGCTTTGCAAAACCGCTCAGGTATATATGTTATGTTAGTATAAGAATACTGTATCTTATATTTTACAAGTGATTCAAATTTCAAACAACTAAAATCTCTTTAGATATCATATCTAATTGTTGTGAGAATTCAAATTTTAAAACTTGAAACTTAAAACTTTTAAATTAACTTTTAAAACTTAAAAATCAAAGCTTATAATTTAATTTATTTAAAACTTAAAACATATAAAATAAATTAACTTTTAAAAATTAAATTCAAAATTAAATTAACTTTTAAAAGTTTAAACTTAAAACTTTAAATTAACTTTAATTTTACTTTAAATTAACTTTAAATTAACTTTAATTTTACTTTAAATTAACTTTAAATTAACTCTAATTTGAAATTAACTTTAATTTTAAACTTTAAATTAACTTTAATTTTAAATTAACTTAGAACTTTAAATTAAATTAAATTTAAAACTTAAAATTTTAGTACCTTCAACTAAACAGTTAACTAATTGCTTTACTGTTAACTAATTGCTTTACATATTATGCATTAAATTACAATTTACAAAAGTATTATGAATTTAGGTGCTTACATTGTCATTTTTTTCTTGCTTAGGTTGTTGGATTCACCATTCTATCAAAGGAGGGTTCGTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	AIZ68217.1	2.3e-105	CBL-interacting protein kinase 23-like protein
Swissprot	Q6ZLP5.1	5.4e-96	OsCIPK23
trEMBL	A0A0A7LU83	1.6e-105	non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G30270.1	67.50	2e-90	329	ATCIPK23;CIPK23;LKS1;PKS17;SnRK3.23	CBL-interacting protein kinase 23

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G00714	AT1G30270.1	240	70	2	25	256	202	441	67.50	2e-90	329
AfisC3G00714	AT1G01140.1	239	88	3	25	256	190	425	59.00	1e-77	287
AfisC3G00714	AT1G01140.3	235	86	3	25	252	190	421	59.15	7e-77	284

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	25	109	53.5	1.9e-14
PF03822.11	NAF	Domain	150	205	66.7	1.4e-18

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005267	F	potassium channel activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005986	P	sucrose biosynthetic process
GO:0006979	P	response to oxidative stress
GO:0007584	P	response to nutrient
GO:0009414	P	response to water deprivation
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009705	C	plant-type vacuole membrane
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009749	P	response to glucose
GO:0010107	P	potassium ion import
GO:0010118	P	stomatal movement
GO:0010167	P	response to nitrate
GO:0010325	P	raffinose family oligosaccharide biosynthetic process
GO:0010540	P	basipetal auxin transport
GO:0019593	P	mannitol biosynthetic process
GO:0042538	P	hyperosmotic salinity response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048364	P	root development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network