result

Gene information

Detail information of AfisC3G01110

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G01110	chr3	203041025	203047158	-

Sequences

CDS

>AfisC3G01110
ATGTCTTGTTCATCTTCCGATTCGGGTTCGGGCGAAGAAGACGAGGGAATCGATTCGTATAGGAAGGGAGGCTACCATGCGGTGAGAATCGGGGATCAGTTTAATGGTGGTAGATATATTGCGCAAAGGAAACTTGGTTGGGGCAATTTTTCTACTGTCTGGCTTGCCTTTGATACTCAGAACAAGAAATATGTTGCCCTTAAAATTCAAAAAAGTGCAGCACAATTTGCTCAAGCTGCACTCCATGAAATAGAAATTTTATCAGCAATCGCCGATGGAGATCCCACAAATTCCAAATGCATCGTTCAATTGCTAGATCATTTCAAGCACATTGGTCCAAATGGTCAACACGTATGCATGGTATTTGAATTTCTAGGAGACAGTCTACTGCGTGTTGTGCGCTATAATCGGTACAAAGGGATCGGTCTTTCAAAAGTCAAAGAAATATGCAAGTCAATCTTATATGGTCTTGATTACCTTCATAGAGAACTCAGCATAATTCATACAGATTTAAAACTTGAAAATATTGTTCTAATCTCAACCATTGACCCTTCTAAGGACCCTATAAAATCAGGAACTACCCCTATTCTGGAAAAACCTGAAGGCAACCCAAATGGAAGTACGGTGGTTAATATCATTGAAAAGAAATTGAAGGAGAAAGCCAAAAGAGCAAGAGCAAAAATATCTCAAAGAAGAGTTTCAATGGTAGAAGCTCCTGTAAGGGAAAAAACACAGAGGAGTTTAGAAGGGATTGATTTTAGATGTAAAATTGTGGATTTGGGAAATGCTTGCTGGAGTGACCAAAAATTTGCGGAAGAGATACAAACAAGGCAGTACCGATCTCCTGAGGTTATTATTGGGTCTGGATATTCTTTTTCTGCTGATATATGGTCTTTTGCTTGCATTGCATTTGAGCTTGCTACTGGGGATGTCTTGTTTGCGCCAAAAATTGGACAAGGATTTAGTGAAGATGAGGACCACCTAGCTTTGATGATGGAACTCCTTGGCAAGATGCCTCGAAAGATTGCTATATCAGGATCTCGATCTAAAGACTATTTCGACAGATACGGTGACCTCAAAAGAATCCGCAGACTAAAATACTGGCCAATGGACCGTCTACTCACAGAAAAATATAAATTCACGGAATCCGATGCAAAACAATTTTCAGAATTTCTATGCCCTCTGCTTGATTTTGCTCCTGATAAAAGGCCAACAGCTGCCCAATGCTTGCAGCATCCTTGGATTACAAGCACAGACTCAAATTCCTGCGTTGAAAGCAAATCAACTGGCATGAAAAATCTGGAAGCAGGTGTGAGTAAGCTTAAAGTTAGCGTGGGTAGATGA

Protein

Gene

>AfisC3G01110
CTAACCACTAAATCCAAATCCCTAATTGCTTGGTCTTTTCCCAATCAACCCTCAACTTTTCCATATTTACACTTGTAATGTTCAACATCATTCTCCCCCCTTTACATTTGTAAAGCTCACCTAGATTCTCTTTAACAATCTGCTCCACCCGAAAAATAAAGCAAACCCATTTCAATTAATCTAGTTCCGAAATAAAAAAATAATACAAGATCATGTCTTGTTCATCTTCCGATTCGGGTTCGGGCGAAGAAGACGAGGGAATCGATTCGTATAGGAAGGGAGGCTACCATGCGGTGAGAATCGGGGATCAGTTTAATGGTGGTAGATATATTGCGCAAAGGAAACTTGGTTGGGGCAATTTTTCTACTGTCTGGCTTGCCTTTGATACTCAGAACAAGGTAAATTTTATTCCTTTATTATATGTGTATGCTTTTGGATGATCGATCTTGTTTAATTCAATTTGTAGTGTAGATCTTGTTGGAGATTATGCTCCTTTCATTATTTCTTTTCATGTTTTGATAATCTGGGTTGCGTTTTAATTATAAATCATTGTCGAGACACGCTTTAGTACATCCTATGAACGCGTTTCTTTGCTATTAATTATTTTTGAGTTAACATAATATTTGTGCGTTTTATGTGAATTTGGTGCCCTATTGTTTGTTTGCAATAAAAGTATTATTGATTGTTTATTGTTGATCATTTATTTGCCATCAGAAATTTTGTGCTGATCTAGTGTTTGTATAAGTCAATGTGCATTGGATTGAGTCCTCAATAGGTAAATAACACTCACTAGTTTTAAGTTTCTCCAAATAGTTTACATTTTTATTCAGCGTTAATCACTTTGTTTTAAGTGTCATATGAACACACCCTAAATGATACACTGGAATTTAATGCCTCACTTGATGTTTGTTTGACATCAACTCACAGTAAGGATATTATAATTAATTCTTCTATATAACTTACCTTCTCACCTACCGATGAAGAACTTGCAGTGATTTAATAATTGTTAATTTCTTTTAAAAAAAAGAGTGGTAAAATAAAAGCTGGGCTTTTTATATTCAAGTAGCATGGGGTTATATGAAAAAACTTGCCTTTTATGATTTGCTGGCAGTTCATTAAAAATTGGAGCACAGAGTTATGTACTGTAGTAAATGTTGGAAATTGAGAAATTTACTGCTGAGTAACTTGGTTTTCAGATAGTTTGTGCTTCTTATGGTTTGTTCCTCTATATAAGAAATAAAAGTCATATTTATTTACAATTTTGACAAACGTTTTAAGAAACTCTTGTTTTGAATGTTGGCATGTTGATTCTTAATTTCTGATATTTTATATGCTATTTGTTTTGATGATCAGTCTCCTTAATTATTATAGCATGCAATAAAATTATACTTGAACCATGTTCTCAAAATGAACTATCTGTGCAAGACTTGGTCTAGTGATGTTATTTCTTTTGCAAATTGTTTGTTAGTTTAGTGGCATTAGTGTTGTTTGTCTTAATGTGATGTCTTAGTTTTTCTTTTAATTTGCGGATACTGTTGTTATGCTGATATAGTCAGTCTTTTACTACAGTGGATATGATATTGGGATTATATTAATTAGTTTTACCTCCAAGTTCAATGCGCATATGCTATATAAGAAGTGGTTATTTAACCATTGGTCATGCAGCGAGATTAACACACACTCTCTCTATAATTTTTACTACAGTGGATATGACCTTGTCATGTAGTTGATAAGTTTGACTACCAAGTTTAATGCACATATGTGATTAAAAAAGATGGTTATATAGCCTTTTATCATACAACAAGAAGATTTCAATATTTCCTTTCTCTTAGACATATTTACCTTTTCAAATTTGGTTAATATGTATGCCTAGAGGTTCAAATGTGTTATCAATAGCAACTCATACTAAGTGTTTTACCAATGATCATTGAGTTCACACACACACACGCATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGAAAGCTAATTTCAAGTTTAGCTTAACCAAATTGTTTAAAATATTTAGTTTTACTTACGATTATCAAGAAGTACCATTAATTGAAAAACATATTTTGATAAGGGAAGTTTTGTCTCAAATCCGTGTTGACTTCTAAATTATGTCAAACATCCCTCCTAACCATGTATTATAAACTGGGTCCCTATTTTAAAATTTATTATTACATACCATGTTATATACACACCATTATCCCTAATACAGATTTTTTTTAAAGGTCAAAAATAAAATTTTGTTTCACCATAAAATCATAAAATTTATGTTCTTCCTAACAAGATTCATAATAATGTATAAAAATTAGTCGAGATGTAGGTAATTGCATATATTTGCAATTTCTATTTAGTATTACATACATTTATACCAATAAAATTTTAGTGAAATATATGACAAATAGATCTTGTTTGAATGGTTATAATACTTGTGGTTTAATGGTGGTAATAAATTTTCAATTGATTGTTCCAATTGTGAGTGAAATGCAAATATTTGCACCGATTATCTCAAATTGCAGTTAACTGCAAACATTTAGAGTTTTTTCTTTGGATTGCAAATACTTGCGCTAACAAAATTTAACCAAAATACATGACATACGAAATTTTTTTGATAGTTTATAAAACTTGTGATGTACCGGTGAAAATAAAATTCAATAAGATGTTTCGAATGTGAGATAAGTGCAAATATTTGCATTGTTTATTTCAAAGTGCACTTAGCAGTTAATAATTGCAATTTCTGTGTTGCATCATAAATATTTTTGCAAATGTATGTTCCAACAAACATTTTCCAACAAATCGATCAAAATATAATATGTGGATATTATGATCACTAGAGAACCTTTTGGGATTTCTACTGAAAAATACAAAACTTAAGCTGTTTTCCCGGATTCCATGATGGGGAACAAATCAAATCATTTTGCAAAATTTGTTCGTCATTGTATGGATGATTTGTCTTAGATTTTAGTCTGTTTAATTTTTTCCTTGTGCAATTTCTCTCAGTCGACTATATTATATTTCTTATTTCTAGCATGATTCACAGACTGAAGATGCATTTATTTTGTAATTATTGAATCTGATTTAACCAAATGCCAAAAAATATACATTTACTTCATCGTATGATAAAGTTAATCTGATATCATTATTTATTTCCACAGAAATATGTTGCCCTTAAAATTCAAAAAAGTGCAGCACAATTTGCTCAAGCTGCACTCCATGAAATAGAAATTTTATCAGCAATCGCCGATGGAGATCCCACAAATTCCAAATGCATCGTTCAATTGCTAGATCATTTCAAGCACATTGGTCCAAATGGTCAACACGTATGCATGGTATTTGAATTTCTAGGAGACAGTCTACTGCGTGTTGTGCGCTATAATCGGTACAAAGGGATCGGTCTTTCAAAAGTCAAAGAAATATGCAAGTCAATCTTATATGGTCTTGATTACCTTCATAGAGAACTCAGCATAATTCATACAGATTTAAAACTTGAAAATATTGTTCTAATCTCAACCATTGACCCTTCTAAGGACCCTATAAAATCAGGAACTACCCCTATTCTGGAAAAACCTGAAGGCAACCCAAATGGAAGTACGGTGGTTAATATCATTGAAAAGAAATTGAAGGAGAAAGCCAAAAGAGCAAGAGCAAAAATATCTCAAAGAAGAGTTTCAATGGTAGAAGCTCCTGTAAGGGAAAAAACACAGAGGAGTTTAGAAGGGATTGATTTTAGATGTAAAATTGTGGATTTGGGAAATGCTTGCTGGAGTGACCAAAAATTTGCGGAAGAGATACAAACAAGGCAGTACCGATCTCCTGAGGTTATTATTGGGTCTGGATATTCTTTTTCTGCTGATATATGGTCTTTTGCTTGCATTGCATTTGAGCTTGCTACTGGGGATGTCTTGTTTGCGCCAAAAATTGGACAAGGATTTAGTGAAGATGAGGTCTGTTTCTCTTTATGTTTATGATGAATGCAGTTAATTGTGTTAAATGCGCATATTTTGGTGCGAATAGCTTAATAGTTAAATATTTGATCTGCAACTGGATAATCACGTGTCAACTCTCTATTTTGGGAAGAAAGGAATAACTATGTCTTTTATTTAGAAAGAATCGAAAAGGAAAATGTGTGCAGACTTTTATTTAAATTTTCTATAAAATGACGGAAAGATGCTAATCCTTGAGAGTGCGAAAAAAGAACTGAAGATACAGTAGTGACTGAAACAAAGTTATTTTTCACTGAATATTACAATAGTCACTATATAGTATTGCTGCTCTAGAGAATATATTACTTGACTGTAGGTATCTTGGAAGAAATTCCATTATGTGTTATTCTGTAATAACATAATCCATCAAATCTTCGAGGATCAACTCTATCACACATGTTTCTAATAATGAAATATACGCAATGGTTATTGATTAGGTTTAGAACTTACTCATAAAGAACATCTCTTTTATTTCTCCTGCCTTGTTTTGTAGTTGTTTAACCCATCTCTTTGGTCAATATGAAGGCAAAGGTTGTCCGAAATTGATTTTTTTACTTCACCTAGAATATTTAATGAGACAGACTTGCAAAATAGTCTTGCTAATAGTCTCTTTACTATTTGAACTAGGATATGGCAAGAATAAGTAAAAAATCATGTATGCCACATGTAATAGAAACAACTCCTGGTTACGTATTTTGACTCATGTTGCTCTTAATGCGTTCTAGACTCTTTTTTTTAATTATGTTTCTCTTTTTTCCTGATCTAAATTCAATTGTGTGCACCTCAATATGGTCCATCATATTAAATTACAAACATTAACTTAATCTGAAAAGCGACATCAATGCGCTGATGAACATATTTGCATATCATCATGGTATATCCAAACATCAGTCATATCTTTTATACTTACATCAATAGTCTGAATAATAACGTATTTTCTTAAAAATAGATTCATCGAAGTTATTTTTACAAGTTTGTCTTCTGCAAATCAATGCAACTATTTCTTGAATAGAAAATCCAGAGTCATAATTTTGCATCATCCTTTTTGCAGGACCACCTAGCTTTGATGATGGAACTCCTTGGCAAGATGCCTCGAAAGGTAACATATTCCTCTGGACACAAAAACTTGTAAACCAACATAATTTTGCATCATTCTTTTTACTAGTAGGTGTAATCCTCTCAAAACGTTTTGATCAGTTAAGAATTCAAATTCCGATCATGACAAAATTTAATTTTGATTTTAGTTGGAAAATTAGATATTATGTGTTCGTCTCAGTCATGACAAAACGTTCATGTGTTTTTCTTCTTCTAATTTATTTGTGTTTATTATATTTTCAATATCAATCATTTTACTTTTTATTTTTACTGTGTTTTACATTCATGCATTCAGTATCTGACTCGGTTTTATGATGTGTGCGCGCGCACGCACCGCAAAATATGAATTTGATGATTTAAATTCAATGTATGTTTTTTATAATTCGAGCATAAGCGCATCACCTGTGCCAAATTATTTATGTGATTGTTTTCTCGAATTTGCAGATTGCTATATCAGGATCTCGATCTAAAGACTATTTCGACAGATACGGTGACCTCAAAAGAATCCGCAGACTAAAATACTGGCCAATGGACCGTCTACTCACAGAAAAATATAAATTCACGGAATCCGATGCAAAACAATTTTCAGAATTTCTATGCCCTCTGCTTGATTTTGCTCCTGATAAAAGGCCAACAGCTGCCCAATGCTTGCAGCATCCTTGGATTACAAGCACAGACTCAAATTCCTGCGTTGAAAGCAAATCAACTGGCATGAAAAATCTGGAAGCAGGTGTGAGTAAGCTTAAAGTTAGCGTGGGTAGATGATATGGCTTTTTTTTGAAGTAATTTTTTTGTAATATTTTCATATTCACAATATATATATATTGAGTTGAATATACTGATATGGGTGAAAGATAGCGTCAAGTACCTTTTTTTTTTTGCTTTGGAAGTCCTGGCAAATTTTTACCTTTTTTGGCTCTGGAGTTCTGATCACTTGTGAGTAAATGTTGAGTGGTGTAAGTTGTGTGATTTGTATTGTGGTTTTTACAAATTGATTTATTTATTTGTTATACCTAATAATTAAAGTAAAGAAGGTTGATACATTGTTGAATGATA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020261015.1	1.3e-213	probable serine/threonine-protein kinase sky1
Swissprot	Q45FA5.1	2.1e-94	Serine/threonine-protein kinase SRPK
trEMBL	A0A6V7QNH4	1.9e-198	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G35500.1	72.14	0.0	652		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	bit score
AfisC3G01110	AT4G35500.1	420	114	3	17	434	16	434	72.14	652
AfisC3G01110	AT2G17530.3	409	101	2	17	422	16	422	74.08	642
AfisC3G01110	AT2G17530.1	409	101	2	17	422	16	422	74.08	642

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g184617.t1
Allium fistulosum	AfisC3G01110
Allium sativum	Asa2G01060.1
Arabidopsis thaliana	AT2G17530.1; AT2G17530.3; AT4G35500.1; AT4G35500.2
Oryza sativa	LOC_Os09g37949.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	41	178	72.3	3.5e-20
PF00069.22	Pkinase	Domain	255	415	69.8	2e-19

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0007059	P	chromosome segregation
GO:0000245	P	spliceosomal complex assembly
GO:0000287	F	magnesium ion binding
GO:0001525	P	angiogenesis
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0005730	C	nucleolus
GO:0006468	P	protein phosphorylation
GO:0007517	P	muscle organ development
GO:0008284	P	positive regulation of cell proliferation
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009792	P	embryo development ending in birth or egg hatching
GO:0010628	P	positive regulation of gene expression
GO:0035063	P	nuclear speck organization
GO:0035092	P	sperm chromatin condensation
GO:0043525	P	positive regulation of neuron apoptotic process
GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0045070	P	positive regulation of viral genome replication
GO:0045071	P	negative regulation of viral genome replication
GO:0045087	P	innate immune response
GO:0045787	P	positive regulation of cell cycle
GO:0048024	P	regulation of mRNA splicing, via spliceosome
GO:0060537	P	muscle tissue development
GO:0071889	F	14-3-3 protein binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08832	SRPK3, STK23; serine/threonine-protein kinase SRPK3	EC:2.7.11.1	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network