result

Gene information

Detail information of AfisC3G01130

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G01130	chr3	205594072	205613046	+

Sequences

CDS

>AfisC3G01130
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Protein

Gene

>AfisC3G01130
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260854.1	4.4e-83	transcription factor E2FB-like
Swissprot	Q9FV71.1	1.8e-57	E2F transcription factor-1
trEMBL	A0A5P1F2Z9	2.7e-82	E2F_TDP domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G22220.2	46.60	1e-61	234	ATE2FB;E2F1;E2FB	E2F transcription factor 1

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

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PF02319.17	E2F_TDP	Domain	138	201	83.9	5.5e-24
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Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000122	P	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
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GO:0019760	P	glucosinolate metabolic process
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GO:0071466	P	cellular response to xenobiotic stimulus
GO:0072332	P	intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator
GO:0098534	P	centriole assembly
GO:1903251	P	multi-ciliated epithelial cell differentiation
GO:1990086	P	lens fiber cell apoptotic process
GO:1990841	F	promoter-specific chromatin binding

KEGG pathway

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K06620	E2F3; transcription factor E2F3	EC:-	Cellular senescence	ko04218

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network