result

Gene information

Detail information of AfisC3G02427

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G02427	chr3	421195116	421203608	+

Sequences

CDS

>AfisC3G02427
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Protein

Gene

>AfisC3G02427
TATTCCCATACCACTACACTTGCTTTAAATTCTCTCTTTTTCCCTACCTGTTCTCATTTTCTGCAACTTTTAATTTGCTTCAACAATATTCTTATTTCGATAATGTGAATAGAGAATTACAAGCTGCAATGAAGAGATCGCTCCGGTTTTCTCTGCTTTTTGTTTTTGCTGTTGAATGGGGATTTTTTCTTTTGTATTCCGAATCTTTTCCAAACAACGAAGGTATGTTTTGTAAATTTTCTTATGGCTTTCGTACTTGGATTTGAAATACGTTTGCTCTTGTATAATTCGATTTTTATAGTTGGGAATTTAGGAATTTTTATCCATTTCGCGTTTCACTTATCTAGGCAATTATACTAGCATTTTTTATTTTTAAAATTTCAATGATGCAAAAGTATAACTGCCCAACTAAAAAGACAAAAAATTGAAGTAGTTGAGTAGCTTTTATATTGGATCAGAGCGGTCTAAATCCATCTAGCATAGAAGATTGATTATTTTGTTAAGTAATAAATAAATAAATAAATTTTGTAATTTATTTTAGGAAATATCCTATGGAATAAATTTCCTGAACCGTTTTTGCAGTTTTCGCATTAAAAGCTTTCAAGAAAGCTGTATTTGATGATCCACACTCCATATTATCTGACTGGGATAGCCTGAACGGGGATCCTTGCAATTGGACTGGTGTCATTTGCTCAAAATACGACAATAGTGTGCTTGCTTTGTAAGATTACATTTCAATTTATCTCATTACATCTGTAGGTATGTGCACATATCACTATATTGAATGTGTGCTTACTTCAAATTGCCAAAATAAGCATCCAAAATTTCACTTGCGAATTTTTGCTGGGACTGTCTGATATCTTGATTGAAAGTTATGTGCATGCTTATTCAATGTTTTCTTACTAAATATGATCCCCACTGTTTAGATAATTTCAGAGTAAGCACAATGGTCCACAGTTATATATGTGATACCTGTAAACCATATCATATTATGACACTCTTTAGTTTTACTTCACATTTCATCCGATGTGAAAATTGGCATATTTACCGTCTCTTACTTCGGAGCGTTCCTATTTACAATACGAAAGTGTTGAACAATCACTATTAATACCGTTATGAAGCAACACATACTTTTTAAAGTTGGTAACAAAAAAGAAATATGATAGTATGGATTTTCTTGTTTGTAATTATTTAAAAGAATTATGGAGATAAAATTTCGACCCCTGCAGAAACCTTAGCCATTCATCACTAAAAGGCTTTCTGGCACCAGAACTTGGTTTATTAAGCTTTCTCCAAGAACTGTATGTTTGATACCTTCACTCTAGTAAAACCTATTTACATGTGTTGCTAAATTCATTTTGATTTGGGATATTGCAATGCTTAATGTTCAGAATATTGGATAACAATTTCCTTCTTGGAACAATTCCTAGAGAAATTGGCTTATTGAAAAGCCTTACTTTGTTGGATTTGAGCGTAAATCGGTTATCAGGTCCTATTCCTCGTGAGATTGGAAACTTGGTGAAGCTTAAACACATGTATGGATAATTGATTAACTTCATATTTAATAAACTGGTTAAAATATTTTGTAGTTTTAACTTGTTATTTTATTTCTTTCGTTCTCTTCTTCAAAAGAAACCTTCACTCAAATGGGCTCACTGGTGATGTACCCCTTGAACTTAGCAATCTCAGGAACCTTGTTGAGCTCCGGTTGGACCGAAATAGGCTTCGTAGTATGTAAGTGGTATAACTTTTTCTTCTGTACTTTTCATGATTTGTGATAATTTTCTTACAAATAAGTTTTGACTCGGTTTTTTCTCAAGAAAAATGTTTCAAAGTAGACGATTCCTTCAACGAAGATGCTGAATATCTTACCTAACATAGGAGAATTAGGTAAATATAAGTAAAACATATTTTGAACAGATTAATTAAGCTGTTCAGGGAAAGATTTATGGGTTAGCTATTACTTGTTATTTTCCTTAATGAAAGAAGAATATGACTGAGACATGGCTGACACAGAAGATATAGTAATCTCAGACCGGTGAGAGGTGTATCGATAACTATTTGGCATCACTGTTATTTTTATTAGGCTTGTTTGACCATGGTTAGGATACCATATATAACGCCTGTGCATGCATTGCATTATCACATGTCTTAATCAAGTCATTTACATGTGTCAAAAAGTCCAATGTACTATCCTATTTCCATTGCATTATCACAGGTCTTCAATTGATTTAAAATATCAGAAACCATGAAATTCCATCTACTATCCTATTTCCATTATCTAAGGAAAATATCAATAGGAAGTTGTCTGTATTGAAGCTACTATCCATGATTATATAAAACTAAGTAGATGTCGAGTTTGCTACTAATAAGGTTACTACTATCATGATTGTTAAAGATCGACTTAAATATTTTGTTAGATCCTGATTCAAATGATAGAAAGCAGCATGAAACTGCAAAATTATACGAGGTGTTCTTACTTTGATGTTAAAAATGTTAGTTTAACCTGTATTCAATTTACTATGTTAAAAAAGGTTTTTGTCTTCTCTTCAGATTTTCCTTGCATACTGTTGGAACAGGTCGTTGCCAGTCACCTCGGCTTCAAGTTGGAGACTTTTCTTACAACTTTTTCAGTGGAAAAATACCACAATGCTTGCTTTATCTTCCAAAGTAAAATTCCATATTCAAATCTAACATACGTGCATCAAATTTTCAAATTCTGCATAATAATCCTCATATCATGCAGGTCAAGCTTTCAGGGTAATTGCTTCCAAGATAAATATTCAAGCTTGCAGAGATCTTCTGAGACATGTAAAGAAAAAAATTATCTTAATAACCATCTCTCTTTGGTCTTCAGTGTTGTGCATGTCATCTATTATCAATTCTAAAAATTATTTCAAAAGGCGAACAAAAAGTTTTAATTTAATAGCATTTAATATTTATCATGTTGTAAAAGAGTGGGTATATGAATATGTTTTATTTTATTTCTTCAAATTGCAGTGGATCCATTTAAAAGAATTCTGAGCAAAACATAATTTCAATGTCTCGTTTGCTCTTTCCTTATGAAAACATAAGAATTACTCCATTGATGATATTCCCTTTATTCCACGCCTCTCCTTCTATTATTAATAGTGGATATCTCTAAATCAATTACTATTTTTCTGTAGCAATCCATACTTTTTTAAGGTGTTGCATTTACAGCTTCAAATGATTATATATTCGTTTATTTCGTACAGGCCTAGCAGAAAAAAGCCATGCTCGTCCAAAAAAGAGAGAGAAACCTTTTCATGAAGTATCTATGCATCAAAACTCGCAGCAACCAAAATGGCTTATGATATTTGAAATTGGAATTGGAATTTCAATAATTGTTTTCTGTGCCTCCGCAACAATGGTTGTTCTTTGTAAATTTAAACGAACATCCCATGTCGACATCCCATGGAAAAAAACTTTAAGCTGGAAAGATCAGAAAACAATCACAATTGGCGGTATTATACTTCTTATGCAATATTAGTCTTGATCAAATTGATAGAATATTGTCGGTGTACATACTGACATACATGGTACATACATGCATGATGCAAATCATGTTTTGTACTGCATACATAAGCTACAAATATATTGCTTATTTAGTTCCATGACATGTTTTGAGTCGTAAACCTTTGTCATAACAGTATAGCACCATTGAAGCTTCCAGTTCATGGATACTTTAAAGTTTAAACATATCTACTTGTTCTTATATGAAAAATGTAGCAAAATGCATTCTTCGATTACATTAAGTTCACACGCAAGCTGGCATTTCATACACTTTATAATGATATCATTATCATATATACAGTTAAGTGATTTACATATTATTTTAGATCTTAGGGAAAATTGCAGAAAGTTCTCCATTACTTTGCACCAATAGCAGGAAATAAGTAAAATAAGCGAGAAACTCATCTTGATTGTATGTACTTTATTAAGTTTGGACAAATGTCACAAATTTAATGCTATTTTGAAGTTTCAACAACTATGCAAGAATGGTGAGCTAAATGTAGTTAGGTTGAGTTATGATTTTATGTTTTCCCCATGCCTGGGCAAAATGTAAGGTGATATGTTGTAACAAGTCCTAACAGTGAAACACTGTAAACGAGCACATGCATATTGCTGCAATTTTTCTGATATCCATTATTTTAGTTCTATCATTTTTCCAAATTTTAGATATTTTTCTTATATATGCGATTTATTACTTTGTGAAACAGACGGTGAATTGCTGAAGGGCGTGTCAAAATTTAGCAGCCACGACCTTGAAGCAGCTTGTGAAGATTTCAGTAATATTATTGGATCTTCTCCAGACAGTATTGTATATAAAGGTACTACCAAAGATGGCCTTGAAATTGCTGTCATGTCTCTATGCATCTCAGAAGATCAGTGGACAAACTACTATGAGTTTTACTTTCAGAGAAAGGTAACTTATAGTCCTTATAATTTATTATTGTTCGGTTATTACGAAAACACTATATACATTTTTTCTTTTTCCTATTAAAAGAAATGGAGTTTTTTGCCATCATTATAATTCCACATGCCTCCATTTTGTTTTTGCCCACTTCTAAGATAAGGCTTAAGTCCCTGTGATCCATTTCCGATGAAGTGATAGCTACAAGTAATTAACTAACATTTGGTAAAATGCATGTTGCAGGATTTACCATTTGAGAAACCTGATATGTGAAATGCTGTTTCTTTTGAAAAATTTAAAATAGTGATAATAATTCAGTATTTTATCTTGGAACAATGTATTCATTGCCTAGGGAAAATTATGTATACTTATAAATATACATATATGTATATGTAATTATGTGTGACGTAACTTGAACTTAATTACGCTTCTGACATTGTTAAAAAAAAATCAAAAATTGCCAAACAACATTATTGCTGACTGGAATTTTCTGTTTTGTCATAACTTTCGATGGAGTAAGGTAAGGACTTGAAGTTCATGAATTACTCTGCTGACCCAAGCCATT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020273853.1	1.4e-200	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g63430
Swissprot	C0LGH8.1	1.1e-138	Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g63430
trEMBL	A0A5P1EE68	1.0e-200	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G63430.1	48.58	2e-179	625		Leucine-rich repeat protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G02427	AT1G63430.1	667	305	9	5	636	1	664	48.58	2e-179	625
AfisC3G02427	AT1G63430.2	691	305	10	5	636	1	688	46.89	5e-175	611
AfisC3G02427	AT5G41180.1	658	306	11	10	636	11	653	46.50	4e-161	565

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF08263.9	LRRNT_2	Family	28	69	45.2	7.2e-12
PF00069.22	Pkinase	Domain	353	604	50.5	1.6e-13

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0000166	F	nucleotide binding
GO:0005515	F	protein binding
GO:0003723	F	RNA binding
GO:0005576	C	extracellular region
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006725	P	cellular aromatic compound metabolic process
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0009628	P	response to abiotic stimulus
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GO:0010008	C	endosome membrane
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GO:0010467	P	gene expression
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GO:0016571	P	histone methylation
GO:0018024	F	histone-lysine N-methyltransferase activity
GO:0043067	P	regulation of programmed cell death
GO:0044710	P	single-organism metabolic process
GO:0045087	P	innate immune response
GO:0048229	P	gametophyte development
GO:0048437	P	floral organ development
GO:0048438	P	floral whorl development
GO:0048827	P	phyllome development
GO:0060255	P	regulation of macromolecule metabolic process
GO:1901360	P	organic cyclic compound metabolic process
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network