result

Gene information

Detail information of AfisC3G02552

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G02552	chr3	446518939	446546580	+

Sequences

CDS

>AfisC3G02552
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Protein

Gene

>AfisC3G02552
CTTGTTTAAGAAAAATCACTAAGGTATCGGGTCCTTCTTAGACACCGCGTTTGCATCGATTGTCAAAGTCACGGTTGAACAATTCTTTCTTTACTGCTCCAGTAAGCACGCGGTAAGCTTAAAGGGTGGTGACGACAAACATCCCAGATTATCATAAAGTACTAGTTGACAACCTGCATTTTCTTTTATTTCTTTTCTTTAATTATTTCTTTTTTTGTTTTTTGCTTTCTTCCTCTCCACACAGGAACCTGCGCTTCTTTTGCTTTGCTAACTTGCGTGACTCTCTGATATTCAAAGGTACCGTCACTGTTACTTGTTAAATTTTGTGATTCGATTGGATTCCTACCGAAGGTTGATTTATTGTTGGTCCTGTGGTGTGTTTGTAAGCGAAATTGCGATTGTACAACTTTCTAATGATTTTAATGGATTGAGATTCATTCATGTAATAATATTTCTTGATGTGGAACTGGATTGATTTGTTTACTTATAAATTCCAAAAAGGCCTTTGACTTCTTGATTATGATGAACTCAGCTGTAAAACATCTATACTATCTAGTTGCATTTCAGATATCTACCTTTTTTTTTTAAAAAAAAAACTTTACTTTTTTTTATAAGATTGCCATTTTTTGTGTTCAAATAATAGTTAAAACATAACGAAAATAGTTTAAAAATAATCTTGAATAAATAAATTGTATAAAGGAAATGAAAACGGAAGAGCCAATGTGGGAAGCTGAAAAGTGCAAATATAAATTACATTTCTGAAAAAAAGGGCATATATAATATACAGTTTTAGATGTGGATAAATAACTTGCTTTATGGATAAGGATACGAGTAACTAATTTTTTTGTACATTTATATCATATTTGCCACTATGAATGAAACGAAATTGAAATGCATGTTTCAGAAACAATGTAGAATTGTAGAATATAAAGGTGCAAACATAAAAAATAAATAAACTGTTTTATAACTTCAATTCTAGTTCCATCTTCTTCGTAAAGTCAAAAAACCAACTGAACCGAGGGTTTCCAAATTGAAACCAAAATGTATATGGAAAAAATGCAAATCAAATTAGAATATAAACAGGTCAGTAAGATTACTGTTCCACTAATTTTTTTGAACCAATTCCTCGTAGCTAGAGCTCATGTATATAGAAGAATTTCATTGTAATGTGTTTTGTTCTATTGTTTATGTTATCTTCTCTGATTTGAATATATGAAAAATTCTTCCCTTATGTTTTCAAGTTTCATGTCAAAAGTACATAGTAAATACTGGATTACTGCATGACTTAGCTTACGGTACCAAATTCTTAACTTAGATTAGAGTTTTCAGAAAGGTAATTCATTAAGATGTCGTGCTTTGGATGTTGTGGTGAAGAAAATGTGCATCAAGCTGCTGATACAGGGAGACCATATACTGCACACCATTCGTCAGGTATCAATTTTATATCTGTTGTGTCATTTATGATCAGTTGAATTTGTCCATTTAGATAATATACATGGTTATTTTTAGTATAGCCGTCTTTAGAAATAGGACATAAGCATAACCATCTTTTCAATGATGATAATGAAATGTTGCTATGTTGTGTTCCGTTAGTAAGATACTAACTACTACCTAACCGGTACACTAAAACATGCGTTGTAAGTACATAACCATTCTTGCATTTATTTTATTCTTCCATGTTTTGACTCAAAACTGTGAGAAACAGTAGCCCCTAACATGAAGGTTAAGAGTTGTTATATGGCTCTTTTTTGCGAAGAGGGACAACCAAGCTTAAAAGGTTGGCCAATATATAATATAACAAACCAGTTGCACATATAGCATAGTGATTGCACAGAAACAACAAGCATAAAGCTTTATACATCCTATTATCCTGTATAAGCTACCCAGGGCACACGTGTACGCGCGCACGCGCACTCACGTATATTATAAAACATAATTTCATGCAACACATAACAAAACATAACATGAAATAGATACAGCTAATCATCATTGGTCATCCAATTCTGCCTATCTTTGTTGAAGATACAAAGCAAGTCACTCAACTTCCATACAGCCTTGGCAATCAGCAGACAGATCATGCACATTGTCTCTATGAGAATGTGTCCAGTCAGTAATGTGAGTCATCATAGATCAGAGTGAAACATATTATACTCTATTTGTTGCTAAAACATCTTTGGGTTTCCCTCGAGCCATAATATCCAACGATATGCAAGGCTTACAATGTCATGAAAGGTTTTATGATCTTGTGGCAAGAGTTTTCTTTTATTATCCCAGTAAAAGCTCTGATCTTTTATTGTAAATTCAGCCTGCAGTCCATAGGATATTATACATGTCCAAATTCTCCTGGTCATTTTGCCATAATGGAAAGATGGTTCTGAGTTTCCAACTGATCCGTCGAAATGGCGTAAAATATTCAAGTGGAAGTTCTTTGATTGAAATAACTCTGTACCATTTACCGCTTAATTGTGGCTTTTTTGCTTCAAGCATGGTTGTAAAAATCGCTAGGTAGATGCTAGGTGATAGACATGAATTAAAGATTAATCATTTAGGTGTGCATTAACTGGGGATTAATCGCAATTAGATGTTTTTAATAAAATTAGCTATTTGTGATAAAAATTTAAGCATTAAACATTGAAAATTTTACTTTTTAATATCCTTATATTTAATATTGAAATTATGTCTTTTGGGTTTTGAGATAGATGTGCATGCAATATTCCATTTTCTAATGACCTTTTATGTAGTTTAGCATGTAATTTTTACTGCTATGAATGGTGAAATAAATGTTTAAACAAAGTAGCACCAAAAATAGATGAACCTAAACAACTCTGTAAAGACTTAGGCTGACGTAGGCAGACCTAGTCAGACTCTGGTAGGCCTAGGCGGGATTAAGCGGAACTTGAAGGGCGTAAGCAGACCTAGACAGGTCTAGGTGCTGCCTAGGCGGACTCAGTCGTGGCCTGGCCGCCTAGGCCCCTAGGTGAGTTGGTAAGCGCCGCCTAGCCCGATTTTTACAACAGTGGCTTCAAGCGACTTCCTTTTCAATCAGCGAAATTAACCACCAATCTAATTATTACTTCTACTAATCTTTACTTTTAAATAATACCGTAATTTTACTATTCTTCACTTAAGTAAAAAAAACAATGCTTATCCTCTCTCTGCAAAAGTAACTACGGTAGGGTATTCTCAACTTACATGTAACATTTCAATGGAAATTAGATTCTTTTTAGGATTCCCTTTTTTTATGAAGTTGAATTGCATGCTTGGGAAGTTTCTTGCGTATTGTGAATTTTTAGTTGGTTAGGGATTTTAGCATCTTCGTAGTTCTTACTTATAATGCTGAAGTCGTATGTCATGTACATATATTTGCTTTTATTTATTTATTATTATATCTCCATTATAATCCAAACCCGGAATAATTTGCAGCATTATAGTTTACTTCTGACATGAATTTATAATTTATGCTACAAATAAATGCATTGCTAATTTATCAAAATGTAAGAGTCCATAATGCATGAGTGTGATTTAGAAAATAAATATATTGTTAGTTTACCATTCTATTTAACTACTGCAAGGGACAATGATACATAGTTGTAGTTTATTTAATATATCTTGCACTAGAGCATATAATATCATCAAGTTAAAATTATTACTTTTAAGATAATAATTAGAAATTTAATTGTATATGCAGATAAATTTCGAATATAAAATTATAGCGTGCAATAGTCATGAGATGAACTCGAGACTCCAAGATGTAAATTTAGCATGTAAGTTAGAGATGTTACTCGATACTTTGTCTCATGAGTGAAAACACCAAGAAGAAATGCAATCAAAATTTCCAAAATTTAAAACTTGTTCAACATCTTAATCATAAGCCACGTGCATCATTACGTTGGGAATAATTTAAATCTCCACAAACTCGTATAAAATTCATTTTACAACAAAAAAGATAACAAATGATGCTTGTATTTCAGTATTATTTTTTAAATTAAAAAATTCTAACCACAATCAATCTCATTATCTATATCACCCATTTATACCAATCTAACCTTTGATGCTCTTTCGTTGGTGGAACCCAGTGCACGAGGCTCCCACACGATAGCGGGTTCTGATGAGGTTGATAATATACGCAGCCTTTCTTTTGCATTGTTAAGAGGCTGTTTCCGAACTCGAACCTGAACGTTCAGATCACCATGCGGGTGACCTAACCATTGCGCCAAGGCTTCACCTTTTGATGCTCTTTCAGTAACTTCTCTAAATTGAACCAATGTAGTTAGTTCTATAGCTTACTCGATTGAAAATTCCATCTACTTATTGTGTGGGTAATAGGCATCAATTGTTATATCAAATTTGTTTGAGACGATTGGAAATAGTGTCGGGAACTCCATCAGTGGAAGAATGTTAGAAAACTGAGAATCCATCCCAAACAATCATTTCATATATATTTTGAATTGGAATAAGCTTTACTATGTTTTTCAAAAGTGAAACATATAAGTTGAGTGTGGTTGTCCGTCATAGTACAAATCAGTAATTCAAGTTTCCATAAAGTATCTTTATCTTCAGTATGACTGTTATGGTAATAATAAATTTACCATTACCATACCAAGCAACTGATAATTAATATTGAGCTACATCGGTATATCAATGTCATCGGTATGATAACGGTAAATTAATCATTTTAACGATAAATATAGCAGTAAAGAAATGTCAAAAGCAGCGGCAACAGTAAATTTACCAATTATATTAATTATGTTTTTTCTCTATTTAATTTAATCCCAACCACGAAATTGAGTTAGAATCAGGAACAAATTAAAAAAAAAATCATTATCAAAACTTTAATGCATTAAAATTTTAATTTTTATGTACTGTTAATTTTGCCATTACCAGTCAATGATATATCAATTTATCGGTATACCAACGTTCATTTTATCAACGATAACAGTAAAGTATAGGCAATCATTCTTGATTTATCAATAGTATCAGTACGGTAATGGTTTTCTCAC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Best hit in Arabidopsis

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g304290.t1
Allium fistulosum	AfisC3G02552
Allium sativum	Asa2G02053.1
Arabidopsis thaliana	AT2G47060.1; AT2G47060.2; AT3G62220.1
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Pfam domain

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Gene Ontology

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GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0006979	P	response to oxidative stress
GO:0007166	P	cell surface receptor signaling pathway
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009626	P	plant-type hypersensitive response
GO:0009816	P	defense response to bacterium, incompatible interaction
GO:0009860	P	pollen tube growth
GO:0010068	P	protoderm histogenesis
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0035420	P	MAPK cascade involved in innate immune response
GO:0042335	P	cuticle development
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048367	P	shoot system development
GO:0048768	P	root hair cell tip growth
GO:0071323	P	cellular response to chitin
GO:1900150	P	regulation of defense response to fungus
GO:1900426	P	positive regulation of defense response to bacterium
GO:1900459	P	positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway
GO:1905393

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K13436	PTI1; pto-interacting protein 1	EC:2.7.11.1	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network