result

Gene information

Detail information of AfisC3G02594

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G02594	chr3	454887556	454891827	-

Sequences

CDS

>AfisC3G02594
ATGTCCAAAGCAGATCCTGATAAGCTGATGATCAAAGCCGATAAACTATTTGATGGGCTAAATTATTTAGGTGATTCTGGTTTGAATTCAGAGAGGTATTTGGCTGTTTCTTATGTGGATGTTGGTAGCGTGCATGATGATAATTCTGGCGATGTTGACATGGTACACGGTGTTGATAAAGTGCACAATTTAGTTAATTTACGTAGTGTTTCAAGCTTGGGTCTTTCAGAAGCTTTGGTTAATGGTGCGGGTGAAAGTGTAATGGTTTTCAGCATATTTGTCAGGGTAGTTATTCCTGTTATGGATTGGGAGAGTTCAAAATTTTCTAGACCAACTCTTGCATTTATACTTTTCATTTCTCTAGCTGTATTTCCTTCCCTAATCTTGCCTTCTGCGCCAAGTATGTGGCTAGCTGGAGTTACATTTGGTTATGCTTATGGATTTGCTCTGATCATGTCTGGAATAATTATAGGAATGTCATTGCCATTTTTTATTGGCTTGCTCTTCCTCCGCTGTAAAATACATAATTTGCTTGAAAAATGTCCAGATAAAGCAAAAATCATTAGATTAGCTGGGGAAGGAGATTGGTTTTATCAATTTCGAGCTGTCGCCCTAATTAGAGTTTCTCCCTTTCCATACCTCCTTTTCAATTATGCAGCTGTGGCTACAAATGTGAATTATTGCCCTTATATTTGTGGTTCTATAGATGTGTTTGCTGGTGGGGTAGATACATCCTATATAGTGCTCGAATGGAGTATGACAGAACTAATAAGAAATCTAAAATCAATGAAAAAACTTCAAGATGAAGTGAGAAGTGTCTGCAGCAGCGGTAACACAGACTTGATCAGAGAAGGTGACTTGAGGTCAATGAATTTCTTAAAAGCGGTAATCAAAGAAAGTATGAGATTACATCCTCCAGGTCCGTTATTACTCCTAAGAGAAGCAAGGGAAGATTGTCAAATAGCAGGGTACCATATTCCCAAGGGAACCAGAGTTATAACCAACGCATGGGCAATTGCACGGGACCCGGAAATTTGGGACGAACCTGAAGATTTCAGACCAGAAAGATTCTTGGACAGTGACATAGATTTTAAAGGCAATAATTTTGAGTACCTTCCATTTGGTGCAGGTCGTAGGATTTGTCCTGGAATGAATTTCTCGATGCATACAGTACAGCCAGCTCTTGCGAATCTTGTACGTATGTTTGATTGGGAGCTTCCTGAAGACATGAAGATTGAAGATTTAGACATGGAAGAGGCTCCAGGAACAACTATTCGGAGGAAGAACAGTCTTAAACTATATGCAAAGCGATTTGCCTTTAAGTAA

Protein

Gene

>AfisC3G02594
ATGTCCAAAGCAGATCCTGATAAGCTGATGATCAAAGCCGATAAACTGTGAGTTACTTTCATATTCTTGTTTCTTTTCTTTTTGTTTCATTCAATTATTATTCTGTAGTTCATATCTTAATACTAAAATCTTTAACCTGGTTAAACTATGCTAAAAAAGCAAATGGGAATCGGGATTTTGATTCGAACTGAATCTTCGAGAATTTTCTGGGCAAGTGTGGAATGAAGCATGATGAAGCACCGAATCACGCATGAATAAAGCAAGCATGAAATGTGGCCGGATAAATAGAAGGGCGTGGCCAAAGCACTAAATCAGTGTGGACGTGAGAAAATATCGGCATTGCAATCTTGTGCTTTCTTGTTGCTCCAAGTTATGAGAACCGATGCACACAATTCCGGCCTTTTCTCTAGAGTAAGAAAACCATACACCCTTTTATTTTTTCCCTTTAATTTGAACTATCATTTCTAGTGTTTTTTGTTCAATGTTTTGGTGTTTGTCTGATTTTTTATTAGATTCGCCCAATAGACAAGAAATTTGATTATCAAGTAGGGAACTTTTAAAATTTGCTGATAATACCAAGAACAACAATATGGATGAAAACACAAAGGAAAGCAAATAAGTGAACAACAATGGTGAAGATCCATAAAGTTTAGACCAAATCCTGACATACTTGTTCCTAAGTTTAATGTTGATGGCCATGTAATTTATAATCCATATTTTTTACTAACATTATACTTTAACAATGATTTCATCAATCTTTGTATGTGATTCATTGTTTATATTTTCTTTATTGTATAAATTTTGTTAACATTAGTATGAATTACAAAAAAAATGGCGATCCATAAAGTAATTCTGACGTTGGCAATTCCTTGGATGTAAAGATTTCAAAGAATAGATTGAATGATGAGTTTTTGGATGGGTTTATTGTTAATTGTAAAGACTTGGGGATAAATCCAGTTGACCATTTACATGTAGATTCATTACCGTCTGATCCATTTGTAATGAATCATATGTGGAAATTTCATTGTCCTTAAGAAGCTTCAGGCTGTGACAACCAAATGAAAGAGATTGATCAATATATGAATAGTCTTGAATATATCAAAAACAGAAAATGTACAACAATAAGATATTGTTAGTTGAGTTTTGTGATTACCACTTCAAACAGATTTGATGGGCTAAATTATTTAGGTGATTCTGGTTTGAATTCAGAGAGGTATTTGGCTGTTTCTTATGTGGATGTTGGTAGCGTGCATGATGATAATTCTGGCGATGTTGACATGGTACACGGTGTTGATAAAGTGCACAATTTAGTTAATTTACGTAGTGTTTCAAGCTTGGGTCTTTCAGAAGCTTTGGTTAATGGTGCGGGTGAAAGTGTAATGGTTTTCAGCATATTTGTCAGGGTACACATTGCGGTCATCAGTTTCCATTTACATGCTGCTTTTAACATTGATTTCTGTAATTGATGTACTTGTGATTTTATCAGCAATGTCTTGCATTAAGTGGCTTCTCACTCCTATAGGTTCCCTTTGCTTTTTAGACTCCACCAATAATTTTGATTATCAACTGCTTTTACTACCTCAAATTTGTTTGAAAGTTGTGCATGAGGAGGATTAAAATTTGTTTCAATTTGTCTTAATTACATGTATGTCCTTTGCTAATATTGGCAACATATTGCATTTTAATTTTCAAGTGACATCTTCTGTTAAGTATCATCTAAATTTTGGTAGCAACATTGCTGATATTTGTTGATGCAATGAGTCATTATTTGCTGTAAAAATTGGTGAAAATTAATGAAATAGCAGTTAATATCAATATTTTGTGTAAAAATGTGTTGAATACATGAAAATATTATTTTCTTCACTTAGGCACCTCACCTGTCGTTGTATTTTATTTAGAACTTTTATTCATATGGATCAGTGTCATTAAAACTAGATACAAAATTATAAAGTCTCATTTGTCATCAATACCTATCTAGGTAACAAAATCTTACATAGTTGTGTTATGCATAGTAACATATTATTTTATGATTCATGAAATATGTCTTTCGCATGATGGTTTTTGAAGTACTTGTATATAGAAATCTTTTCACTTTTGAAAGATTTTTATATTTATTTAATAAATTATCATAAATTATTCCAGTATCCTGGTATTTAGAGATGTTGCATATAGGTCTCTGAGGGATATTTTGCTGATACTGATGTTAACCACTTGTCTCTGCTCGGAATTTGTATTTCTTTTCCTGCAGGTAGTTATTCCTGTTATGGATTGGGAGAGTTCAAAATTTTCTAGACCAACTCTTGCATTTATACTTTTCATTTCTCTAGCTGTATTTCCTTCCCTAATCTTGCCTTCTGCGCCAAGTATGTGGCTAGCTGGAGTTACATTTGGTTATGCTTATGGATTTGCTCTGATCATGTCTGGAATAATTATAGGAATGTCATTGCCATTTTTTATTGGCTTGCTCTTCCTCCGCTGTAAAATACATGTGAGCCATTATCTTTTGTTCATGTAAATCAACTGATAATATGTGACAGCCTCTTTAAGTTCTTGTTTGTTGTCGTACTACAGAATTTGCTTGAAAAATGTCCAGATAAAGCAAAAATCATTAGATTAGCTGGGGAAGGAGATTGGTTTTATCAATTTCGAGCTGTCGCCCTAATTAGAGTTTCTCCCTTTCCATACCTCCTTTTCAATTATGCAGCTGTGGCTACAAATGTGAATTATTGCCCTTATATTTGTGGTTCTATAGTAGGGACTATACATGAAATATTTCTTACAATATACAGGTAAGGGCTCCTTTCATACCATTTATTATTTTATAAATATCATTCCAGGACAACACTGCTCCTTTCATACCATTTATTCCAAATTCTGCTATTTTAATTACCTTGGACTTGAATCCTGGACCTGCATATCGAAAATGACTGCTTTAATTGTTGCCTTTCACAGAAAGAAGTTGCGTTGTCATGTCCCCATAAATAGAAGACCCCTAAAATGTTCGGAAATCTTAGATTTTCTCTCTCATTTTTCTTATATTGAGGTTTTTTGCATATAAAATACCCTTGTATGTTAATTTAAAATTGTTAGATTTTAATTTTCTATATAGATTTGACAAGTATAAGTTAAAATTATAAAGAAAAATATGTTGAAACTAGAATTATATTTGTTTTATTTTTATTTTACTGATGCATTAAAAAATTTATTCGAAAATAAATGTTAGCTTTTGTTTTGAGCGAACTTCTAACGTTTTGTCCAATCTATAAAGAAATTCGAATTTCTAACCTTACTCCAAATAAAGACAATGATGAATAATAATAATAATATTAATGTTTTATTACCGGTTAATGAATTCAAAAATCTAACACAATGGTCTTGTTATGTGCAAAAGATAATCTTGATGTATGTGTATCGCCCACATCTTCAAAATTATTTAATATGTATACATACATACACATACATACATATATGTGTGTGTGTGTATATATATATATGTATGAATGTTGTGTGTCTGTTTGTGTGTGTGAAATATGTGTGTGTGAGAAATATGTACAAAAGATAATTTAATAAGTAGATTTGAATTTCACTTTTTACATGAAGATAAAATTTATAATGATCCACATTTGGAGGTTTCTCTTATATGATATTTAGGATGTGTTTGCTGGTGGGGTAGATACATCCTATATAGTGCTCGAATGGAGTATGACAGAACTAATAAGAAATCTAAAATCAATGAAAAAACTTCAAGATGAAGTGAGAAGTGTCTGCAGCAGCGGTAACACAGACTTGATCAGAGAAGGTGACTTGAGGTCAATGAATTTCTTAAAAGCGGTAATCAAAGAAAGTATGAGATTACATCCTCCAGGTCCGTTATTACTCCTAAGAGAAGCAAGGGAAGATTGTCAAATAGCAGGGTACCATATTCCCAAGGGAACCAGAGTTATAACCAACGCATGGGCAATTGCACGGGACCCGGAAATTTGGGACGAACCTGAAGATTTCAGACCAGAAAGATTCTTGGACAGTGACATAGATTTTAAAGGCAATAATTTTGAGTACCTTCCATTTGGTGCAGGTCGTAGGATTTGTCCTGGAATGAATTTCTCGATGCATACAGTACAGCCAGCTCTTGCGAATCTTGTACGTATGTTTGATTGGGAGCTTCCTGAAGACATGAAGATTGAAGATTTAGACATGGAAGAGGCTCCAGGAACAACTATTCGGAGGAAGAACAGTCTTAAACTATATGCAAAGCGATTTGCCTTTAAGTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_010911660.1	4.7e-70	cytochrome P450 71A1
Swissprot	Q42716.1	4.7e-59	Cytochrome P450 71A8
trEMBL	A0A6I9QLI0	3.4e-70	cytochrome P450 71A1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G26210.1	51.67	9e-59	224	CYP71B23	cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 23

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G02594	AT3G26210.1	209	99	2	230	437	292	499	51.67	9e-59	224
AfisC3G02594	AT3G26230.1	198	94	1	236	433	297	492	51.52	7e-57	218
AfisC3G02594	AT3G48280.1	203	97	3	234	435	285	483	49.75	1e-56	217

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF09335.8	SNARE_assoc	Family	129	234	43.6	3.3e-11
PF00067.19	p450	Domain	235	419	216.4	6e-64

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0002238	P	response to molecule of fungal origin
GO:0005576	C	extracellular region
GO:0005783	C	endoplasmic reticulum
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005794	C	Golgi apparatus
GO:0009507	C	chloroplast
GO:0019825	F	oxygen binding
GO:0016709	F	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen
GO:0044422	C	organelle part
GO:0044425	C	membrane part
GO:0044550	P	secondary metabolite biosynthetic process
GO:0098542	P	defense response to other organism

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network