result

Gene information

Detail information of AfisC3G03896

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G03896	chr3	697262719	697267086	-

Sequences

CDS

>AfisC3G03896
ATGGGACGTCGATCCTTTGATAAAATATACCGCAAGATGGGAGAAGGCACGTTTGGTCAAGTATTGGAGTGTTGGGACATGGAAAGTAAAGAAATGGTAGCCATAAAAATTGTCCGAGCTGTAGATAAGTATCGCGAGGATGCTATGATCGAGATTGATGTGCTTCAACAGCTTAAGCAGCATGGCAATTCTTCTGGCCGTTGTGTGCAAATACGGAACTGGTTTGACTATTGTAATCATATTTGTATTGTATTTGAGAAGCTTGGACCAAGTTTGTATGATTTTCTAAAGAAAAATGATTATCGACCATTTCCCATTGATTTAGTCCGCGAGCTTGGCAAACAACTATTGGAATCGATAGCATTTATGCATGATTTGAATCTTATTCATACTGATCTGAAGCCTGAAAACATTCTTTTCGTGTCTCCTGAGTACATAAAAGTATCAGATCATAAGGCTGGATCCTGCTCTCTAAGATTACCAAAATCTAGCGCTATCAAAGTAATAGATTTTGGCAGCACAACAAATGATAGCCAAGATCATAGTTATGTTATATCAACAAGACATTATCGTGCTCCTGAGGTTATTTTGGGATCTGGATGGAGCTATCCGTGTGACATCTGGAGTGTTGGTTGCATAATTGCAGAACTTTGCACTGGGGAGGCATTGTTTCAAACCCATGAAGATTTAGAACACTTGGCTATGATGGAGAAAACATTAGGTCATTTGCCCCAGCACGTGCTTCGGAAGGCCGATCGACATGCTGAAAAATATATTAGGAGGGGTCGGTTGAACTGGCCAGAGGGTGCTGCTTCAAGGGACAGTATAAAAGCAGTATCTAAATTGCATCGCCTTGAGACCCAACTATTGCAACACGTTGATCGCTCAATCGGTGACCTTATGGATCTGTTAGAAGGCCTACTCGAGTATGAACCATCAAGGCGGTTGACTGCTCATGAAGCTCTAAGGCATCCTTTCTTCACAAAGAGACGTCGCTCAAGGTCTTAA

Protein

Gene

>AfisC3G03896
ATGGGACGTCGATCCTTTGGTAATTTCCTCGGTTATTGATGAAATTTGTTTGTTGTTATTTACATATTATGTGTGAGAGACATGCGATGAGTTGTCGGTACAGGAGATCTGGTAAAGTTTGCTTTATTCGTAAATATGAAGCAAAATTATTTTTCTTATCTGTGTTCGATAACTCGAACCATTTTTCTCGGTCCGCTATCTGAGTATTGCGTTTTATTTGCAAAATATCAGATCATGGAGGATTAGCTTACCTTACGGTTACCTCTACTTATGATTTGTTTATTACCTTTTCTGATAAGCTGGAAAAGCCACTAATCAGTTCTGCTAAGAGAAGTTTAGTTTGTTGACAGGAAAATTGTTTCTTCTAAATTTGTCCTTTTTCTTGAGAAACTGAGTTAAGACCATGAGGTGACTATGTTTAAAATGATACCAATAAGAGATTTGTGATGTTTCAGATGGCGTTAGGTTTTGCTCTTAAAAATCTTGATTAGGCTTTGGTCTCTAGCGTTAATTTTAATACGATGTTTTATTGTCGATATACACGCCTTTCTATTTCTCTTAAGCTGCGCTTAAGTTGTCACATTTAGTGTTGATCATTTATTAGCTGCTGTTGAATGAAACAGATTTTATTATTTTAACTGTCATGAATCATGAGTTGTACGACGAAAAGCAGGGTTCTCAAAATATTAGTTCTGTTTGCATCATCAGTTCTAACCGAGCAATTTTTTTTATTTAGAAGCGAAATTTCTTTGAAGTTACAGCAGAAATTGGAACAAATGTTTTGTTGTTTTTATGTAAACTTTAATTTCTTTGCCAACTTACTTACAAATTTGTTTTACGTATGAAATAATGGCTTTTTGTAGGCTCAGATAGGAATGTTTTCTGAAAAGGATGCCCTTGGAGACTTGACAAACTTTGTATCATCGATTTTACCTTTATATGATCTCAAAGTGACTCAAAAGGCCTTCACTCCAAAGAGGGAGGATGATAAGGATGGTCACTACATGTTTAAGATTGGAGATGATTTTACACCTCGATGTAATTACATTGCTTCTTATTTATGCAACTTGAAATAAATTGGTCATTATTCACTATCCTCATCCAACTGTTGCATAGGAGTTTCACATAGTTGACACCAAACCATGGCTTGCATTTACTTCTTTGTTACTTACTCAATTCATGTTTACATATTTGCAGATAAAATATACCGCAAGATGGGAGAAGGTTAGAATCAAATGCTCTCGTGATGATGGATAAAGCTGGTTATTATTTTGTATGCTATCCCACGGTATTGATTTGATGTATTTGCCAGGCACGTTTGGTCAAGTATTGGAGTGTTGGGACATGGAAAGTAAAGAAATGGTAGCCATAAAAATTGTCCGAGCTGTAGATAAGTATCGCGAGGATGCTATGATCGAGATTGATGTGCTTCAACAGCTTAAGCAGCATGGCAATTCTTCTGGCCGGTTAGTTCTTTATACACATTGCTTTTGTTTGCTTAATTTATCGTTGTATTGTTTGGAATAAACTATATCTCCGAGCTGCTTATTTTTGCAGTTGTGTGCAAATACGGAACTGGTTTGACTATTGTAATCATATTTGTATTGTAAGTTCATAATTGATTCATGATAATATTCCTGTACATGCAATTGAAAAAAATGGACGTTTGAGTGTGTTTGGTTTATCGATTGATATTAACAGGTATTTGAGAAGCTTGGACCAAGTTTGTATGATTTTCTAAAGAAAAATGATTATCGACCATTTCCCATTGATTTAGTCCGCGAGCTTGGCAAACAACTATTGGAATCGATAGCATGTGTGTAGACATTACTCTTAAACCTATTGTTTTCATACTTATCATATTGGTGTTCATTGTTTGCTCATCTCTAAGTTTTATATCTAGTCTCTACGACCATAATAATGCAAAATTGTATTCTCAAGCATTTTGCATCGGTTGCCTTTAGGTTTAATACAAAAGCCATAAAGTTGTACGAGCTTCCAGAAATTAGTGTTTTTAGCTTTAGTGAAATACATGTGTTTGACAAAAAAATTTATGGAGGTGCGTAAAACATCACTTTAATTGCACAACATTGTCGGGGCTTTCAAAAAAAAAATTTCCTTTTTAAAGAATCTTTACTTGGAGTTGAGGAAGTTTTTATGATCAATACAACAACACATTTTAATGCCATATTTAGGAATCCTGAGTTAAATTCTATATATGATACTAAGGAAAATGTTGTATTAGGGTGGTCAGGACGTGCACTGGCTAAAATGTTTAGGAATCCTGAGTTAAATTTTATATATGATACTAAGGAAAATGTTGTATTAGGGTGGTCAGGACGTGCACTAGCTAAAAGCTGATAGTCCTATATTGATAAAAATGGCATCAAATGTTTGTATTAGGATATATTTGTCTACCACAGTGGATGCATGCTTGTGTGGCAGTGTTGCAACTGCATGTTTTGCTTGATGCATCTCTCTTAACATCAGATATTCACAACTTGTTAACTGTATATTTTTTTCTGCCTCTCTCGCATCTTGCAGTTATGCATGATTTGAATCTTATTCATACTGATCTGAAGCCTGAAAACATTCTTTTCGTGTCTCCTGAGTACATAAAAGTATCAGATCATAAGGTACCTAATTGAGTGGATCTGTAATAATGTTATAATACTAACGGATTGGTCGTGCAGGACAGAAAATTGTATTTTGCTATAGCATTTCTTCTTTGAGCCACGAAAGTATTCTAATTTTAGAATGAATAGGTTTAATTTTACTGATTGTATGGTAATTGGTTGTTTATCAAGGCTGGATCCTGCTCTCTAAGATTACCAAAATCTAGCGCTATCAAAGTAATAGATTTTGGCAGCACAACAAATGATAGCCAAGATCATAGTTATGTTATATCAACAAGACATTATCGTGCTCCTGAGGTTATTTTGGGTAGGAGTTTGATGCCTTTGCTTTTCTATAATACACACACGCGCTCTTTTTCCGCATCCCTCTATTTAATGTCATATCTTAATGTTTTTGCAATGGACAACAATCGACTGAAACACCCATGCTATTATCAGGATCTGGATGGAGCTATCCGTGTGACATCTGGAGTGTTGGTTGCATAATTGCAGAACTTTGCACTGTAAGTCATCTTGGTTTGTTCCTCCCTCTTTGATTGAGTTGATGTTTATGAAGAAGTTGCGAAACAGGGGGAGGCATTGTTTCAAACCCATGAAGATTTAGAACACTTGGCTATGATGGAGAAAACATTAGGTCATTTGCCCCAGCACGTGCTTCGGAAGGCCGAGTATGTGATTTATTTTTTAGCGTTCAGGGCAGTTGTTTGCAATTCCATGGATTCATTTTGGGTTTTTTGTCAGTCGACATGCTGAAAAATATATTAGGAGGGGTCGGTTGAACTGGCCAGAGGGTGCTGCTTCAAGGGACAGTATAAAAGCAGTATCTAAATTGCATCGCCTTGAGGTATCATAGCTTGTGTCATGATTTCATTTTGTGGTAATGCGGTTTTTTTTGGGTGATGTATTTATTTTGAATATAATCAGACCCAACTATTGCAACACGTTGATCGCTCAATCGGTGACCTTATGGATCTGTTAGAAGGCCTACTCGAGTATGAACCATCAAGGCGGTTGACTGCTCATGAAGCTCTAAGGCATCCTTTCTTCACAAAGAGACGTCGCTCAAGGTCTTAAAGTGGAAATTTTGCTTCTAACTTGATGCTATTGACAAGTGATTTTTTTAGCCTGCTTTGCAAAAATGAACAACAGATTAAGCCATGCTGTCAAAGATGAAGTATTTATTGCTGACCCTGGAAGAGTGTACATATTGTTGGGTTGAAATTTTTTACTAGAGACTTACATCACTGCACTTCCCATATTCCTAGGATCATCTAATGAAATGGCAACTCACCATTTCTAATTTTTCCTGGATTCCTTCAATTATTTAATTTAATTACCTTGTATATAAAATCACCTGTCATTTTTGCTGGCAGACATGAGGATGTTTTTATTGTTGATGATGCCAATACTGATAGAAATTGATATATGCTTGTTTTTTAGAAAATTGATGCAGAAATAGATGCATTGCTTGTTTATTGAAAAAAAAAACCATGATAACTGCTGTTAATTGTTTCTCAACAAATCTTTATCAGCAATACATGCAACTGTCTCGCTCATTTTTACTGGAGACCGACTGTAAGCATCTTCGTTTTGCTGAAATTACTCCCTCCAACCTCCATGGTAGCCGTATTGTATTAATATCGTATATTAATATTGGTGCAATCGGTCTTCTTTTGTTGGTATTGAAAGTGAGTCTGAGTGCCGGTGTTGTTATCTCCACTCCTCGTGAGAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020260293.1	2.3e-154	serine/threonine-protein kinase AFC2-like isoform X2
Swissprot	P51567.1	1.3e-141	Serine/threonine-protein kinase AFC2
trEMBL	A0A5P1F342	4.2e-153	Protein kinase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G24740.1	71.43	3e-144	508	AFC2;AME1;FC2	FUS3-complementing gene 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G03896	AT4G24740.1	329	89	1	8	331	99	427	71.43	3e-144	508
AfisC3G03896	AT4G24740.2	324	88	1	13	331	1	324	71.30	2e-142	501
AfisC3G03896	AT3G53570.4	332	91	2	8	331	116	447	70.18	5e-140	493

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	10	327	171.0	2.7e-50

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0004325	F	ferrochelatase activity
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0004712	F	protein serine/threonine/tyrosine kinase activity
GO:0004715	F	non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0006397	P	mRNA processing
GO:0006783	P	heme biosynthetic process
GO:0008283	P	cell proliferation
GO:0009535	C	chloroplast thylakoid membrane
GO:0010212	P	response to ionizing radiation
GO:0018108	P	peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0031969	C	chloroplast membrane
GO:0043484	P	regulation of RNA splicing
GO:0044822	F	poly(A) RNA binding
GO:0045111	C	intermediate filament cytoskeleton
GO:0046777	P	protein autophosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K08287	E2.7.12.1; dual-specificity kinase	EC:2.7.12.1	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network