result

Gene information

Detail information of AfisC3G04054

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G04054	chr3	725241483	725252163	+

Sequences

CDS

>AfisC3G04054
ATGCAGAAGTCAAATGTAAAACAACTTTATAGTACTGAAATATCTGGAGTTATGTCATCATCTCTTCCTGTTTTACCTATTTCTTTAGAAGATAGATATCCAATATTGTCAAATTCTCAACAAGCTTCAACGGAGCGAGTTTTCAGAAGCAATTCTATAAATTCCTTTAATACTTCTCATGCCTCAAATAGTGGAGTAGTTGGTCCTTTATATTCATCATCTACGTCTGGGCTCACTTCTAATCTTCAGTTTTCATCACCTAGGCCATTGAATGTTTCTCCATTTATTTCTCAACCGCAAAATAGCAATTTAGGTTCATTCCAAACTCAGTCAGCCAACTATAATACAGAGTCAAATGAGATTAACTGGGGTCAGGGCATTCTTGATTATTCAGATGATATTGATAATAGAAACAATCAAATCTCTAGTAGATCTGTTATGGGTCCTGATGTACTATGCCAGCAAAATGAGTGGTGGACTGATTTAGTGAATGAAGATTGGAAGGATATTCTCGAAACAAGTGCTACAGAACCTCAGGCGATGGTTGTAAATTCAGCTGTGCCAGCTTCATCAAACGTATCAACACAGTTACAACAAGTCATCCCTTCTCATTCTGGAGAACCGGGCGCTGTCAATAGTCCATCTACTTCAAATAACGGTGCTGCATCACGACCTCGCATGCGGTGGACCCCTGAACTCCATGAACGCTTTGTGGAAGCTGTGAATCATCTTGGTGGTAGTGAAAAGGCGACGCCTAAAGGTGTGCTTAAGTTGATGAAAGTAGATGGATTGACTATATACCATGTGAAAAGTCACTTACAGAAGTACAGAACAGCTAGGTATAGGCCAGAATTATCTGAAGGGACATCAGAAAAGAGAAGTAACCCAGTCGGTGATATTTCATCCATTGACCTGAAAACGGGAATTGAACTTACTGAAGCCCTGCGGCTCCAGATGGAGGTTCAGAAACGTCTTCATGAACAACTTGAGATTCAAAGGAAGCTGCAACTACGAATTGAAGAACAAGGGCGCTATCTTCAGCAAATGTTTGAAAAATCATGCAAATCTGGATCTGAGAAAACCGCAACATCTTTAGCTGATAATGATAATGCAGAAGAAGAACTCCAAACAAAAGACGAGCAACACAGTAAAGAGAAGGAAATTGCAACTGAAGGCTCAAGGGAAGTAGGAAGAAAGGAGAAGCTAATCATGGATGAATCCCAATCTTCACCCAAGCGTTTGAAAAGTCAAGACGTGGAAACTATATCTGAATGA

Protein

Gene

>AfisC3G04054
CTTTTTTTTCCTCCTTTATCTAGGCTGAGATGTAATTGGGACTTCCACCCGGCCCCCGACCGAATATTTTCTCTCTCATCTAAATTCGCAGCTTTTTCTTTTCTCCCCTCGCGTCTCCTCGCTCTCCTGAAAGGTAATTTCCACACAAAACCCATCTCCTTTTTTATTCTAACCTTCATATTTCATTGTTGTACACGTTTTTCCCACCAATATTCGATATTTTATGTCGTGGCTGAAACGCCCTTTACGGATTGTCAGATATTTGGAGGGCGAACCACGCTTATTTCGATATCAGTTGCAATATTCTGGTTGGAATCGGTAAAAGATTGAATTTTGAGATGCTGTTATTGCTCTGTTATGAATTCGGAGTGCTGTTCACTAAACATCTGCTTGATTTATTTCGACTTTGGGAAAATTCAGTTTAATTTGCGTTTACGTTTTTTCCTTGTTTATCTGAATCACCTTACTCTTTGATTAGAATTTATATATTTATATGTATATGAAATAAATTGATGGAATTAGGTATTTGCACTGCACGTACATGTTACTGCTCTTAATTTGCGTGCTGTAATTATGTTTGAACAGTTGAACTTTTTTTTTTCCTTCCAACTTCCATGGATAGACTGCTCTGTATATGTTAATGTTTACTTATCGTGTATGATTTTGATAGCCACTTCTGAAATGAGTTTTGAATGTGCATTGTCAAACAAAATGCCTCAACTGGTTCAAGCACAAAGGACTAATTGAAGTTTGTATACTTATGTAGATTCATTTACGATCAATGTTCTGAATGTGTACCTTTTCAATTGTGTTATGGTCCCATTTTTGTGAAATTTATAGCTTTAAGCCTTTAAGAAGAGCACTACCATTTTCCATTAACTTTTTTTTTCTGCTGATTTTTCTGCTAATGGCAGTGTCTTCTTCAAAATTCAAAAACAAGCTAATGTCTTTTAGCTTAAGTACCATGAAGCTTCGAAGGTGTGATCATCTGAGATTGGGAAATCATCATATTTTAGGATCAATTATTGCATTCAACATATAGAACCAAGTAGTGTCACTTCCAATGACTGTATAATGAAATTTAAAAGATTATGCCACAAATGATTACTCGGTTGCTTGTTTCTTCTTTATGCATTTTGAATAAGAATATCGTGGTTACGGTGCAACTGTTTGGTTTGATATTTGTTGTTTATTGCATTATCTTACAACTTAAGTTTTTTTTTCCATTTTAATTTAATTAAGTAATGCTTTTTTTTCAGGTACATCATGGAAGATAAATTTAGCTAGAAAAGTGAGGAGAGGCTGATATATAAGTATACGGGCATAGGTGAAGTAGATTATAATGCAGAAGTCAAATGTAAAACAACTTTATAGTACTGAAATATCTGGAGTTATGTCATCATCTCTTCCTGTTTTACCTATTTCTTTAGAAGATAGATATCCAATATTGTCAAATTCTCAACAAGCTTCAACGGAGCGAGTTTTCAGAAGCAATTCTATAAATTCCTTTAATACTTCTCATGCCTCAAATAGTGGAGTAGTTGGTCCTTTATATTCATCATCTACGTCTGGGCTCACTTCTAATCTTCAGTTTTCATCACCTAGGCCATTGAATGTTTCTCCATTTATTTCTCAACCGCAAAATAGCAATTTAGGTTCATTCCAAACTCAGTCAGCCAACTATAATACAGAGTCAAATGAGATTAACTGGGGTCAGGGCATTCTTGATTATTCAGATGATATTGATAATAGAAACAATCAAATCTCTAGTAGATCTGTTATGGGTCCTGATGTACTATGCCAGCAAAATGAGTGGTGGACTGATTTAGTGAATGAAGATTGGAAGGATATTCTCGAAACAAGTGCTACAGAACCTCAGGCGATGGTATGACTTACATTTGTTTAGTGGAACAGAATTTAAGATTTGATCACAAATATAGCTTATTTGTGTATTTAGTAGCTGCTATCTTTATAACAAGGCAAGTTTGCAATTCAGCGTATGAATTGCTTTTAACTATATAGTTATGCATAACTCGCCATTTTATAATCTTTCTTTTTTACCAATAGAACACAATCAAAATTTTCCCACTAACTTACGACATTTATTCTAGCGTTGGTAGGTGGAATATGTAATCTTACCTCAAGAAAATAGAGAAAACTGAAGTCTACTTGTTAACAGAATGTGCTGTACAAAAAGCTGTTGCTGCATATTTTGTTGTTGTAAAATCTAATTTTATCTAGTTACATCTATATGACATTCTACAACTTAAATATTTACATTTAGCATCTCTGCAATCTGCATCCCAAAGAGGAGTCAAGAGGGCTCATGAATGTCATCAAACGATGCTTAAAAACTATGCCTCCTATATATTGGAATTTTAAAAGGTTAAACTCCAAACGAGCTTGACAGGCTGACTAATCAGTGACTTGCTGGTTTAACTACATAATGGGTGCAGTGCTTCTGTTCGATCCAGTACAATTCTAGCATAATTTAGGCACAAATGTGGTCTTATTCGTAGAAAGAATGTGCACAAATGAATATTTTTTATAAACATAGACAGGAATTTACTGATTTTGAGTTTGTTCTTAAAGGTTGTAAATTCAGCTGTGCCAGCTTCATCAAACGTATCAACACAGTTACAACAAGTCATCCCTTCTCATTCTGGAGAACCGGGCGCTGTCAATAGTCCATCTACTTCAAATAACGGTGCTGCATCACGACCTCGCATGCGGTGGACCCCTGAACTCCATGAACGCTTTGTGGAAGCTGTGAATCATCTTGGTGGTAGTGAAAGTATGTATACCTCTGCGCTTATTGCTTATTAGAACTCCTGTTTTTGTATTCTATATTCACTCCTATGCATGTTAAATCTCAGAGGCGACGCCTAAAGGTGTGCTTAAGTTGATGAAAGTAGATGGATTGACTATATACCATGTGAAAAGTCACTTACAGGTTTGTTAATGATATATTTTGGATATTCATCTTTTTTGTGATGGTTCTAATTTTTGATTTATTATTGTTGTGCAGAAGTACAGAACAGCTAGGTATAGGCCAGAATTATCTGAAGGTTGATTTTTCTCATTAGCAACTTTCTTTTTTAGTTTGATTTGCTGACTTATTGGTTTCTGATATAGATGAAACAAGTTGTTTTCTTTATCATTTGCAGGGACATCAGAAAAGAGAAGTAACCCAGTCGGTGATATTTCATCCATTGACCTGAAAACGTAAGTCAACCATATTTTAGCTATTGATTTGACATTTTTCAAGTATATAAATCTTATTTCTCTGTGCATTATAAGTTACAAACAGCCATGTTACAACTGTATGTAAACTTAGAGCATCCTTAATGTAAAAGTAACTTGTACAAGTATTTTGTATGCTGCAAGTAGGAAAAAAGCAACTACCTCAACATGCAGTAGGATATTATGAAATTTGAACTACGCAGTGAAAGTCTTGCTAAAGCCTCGCTAAAGCGGGGCTAACGGGCTTAGCATCTTTCGAGCACTACACTTTTACAACTTAAGGTTCTTAAATAGTGGATCTGCTTTAAATAGTGCTATTTACTACTAAGTTTGCTAGATCAGGTCTTTTTAGCACTCGATATAATAGTTTTAATTTTGCATAGTTCTCTTTTAAATCCGAGTAACAAAGCCCATTTCTAGTCCCAAAGTCTAAGCTGCGTGGATTGAGGCATTCTTTAGTATTGTTATATAGTAGTGAACAGTATTTATTTTTCTACTCCAACAAAATAGGACTAATGACGGTTTGATTTTGTCCATAGGATTTTGCCTCTGACATAGGATTTGCAACTCCGGCATAATCTGTTTTATCCCTGATATATTCCAACTATTGTTTTCTTGCACCTTCATCGCTATTTTAACATTGAGCGCTTTAACTGCATTGATTATGACTTGTACGATATTCAAACTAGGTAAGCTTCGTTTCATCAATATTTCAAATACACCACTGTATAAAAACCACACTATACCGCTATATCATAAAATATAGCCTTTTTACTTCAAACATTTCAAGTTTTGAATAATATCGCAGTTTGAAAAAACTCAAAACAAACGACTCTAACAATTCTGTGAATGGTGTGCAATAGATGAAAAACAAGAAGTCTATTTTCGTCGTTGTCAAATAGTTACTTCGTTGAAACAAATATCGATTATTAGAGAATTATAGGAGATGCCGGTCTTTTGAAAAAAGTGCTATGGGTAGGAAAGACTTTCATGATTAGACATTTTGGAAAATGAACTATGATCAATTAATGAGAGATATTTTCTGTGAAAATCCGACAAATGATATTGGAAACTTCTCCGTTGCTTTAGAATCTCATCTGAGTATTTCAAAAAAACATTTAATAAAGTTAGGATTTCAAACGTTACATTTACCATCGAATAAATGATGAACACAAGAATTTCACCTCATCGGAAAATAACGTGCGTTATTCGACTGTTATGTTATGGAACTACAGTGGATGCATAAGATGATTACATTCAAATTGGTGAGTCAACTTTAATTCAAGCTAAAAATTTCTCCAGTACTGTAGTTAATGTTTTCGGTCAAGAATATGTTGAAAGAGATGTTGGAAGATTACTAGCTTTTGAAAAAACAATAAGGTTTTCTAGAATACTCGACAACCTTGACTATATGCATTTTAAGTTATTTGTATGTTCGCCAAGGATAATAATACATACGGCACAAAACATAATTGACTTAGATTTTAGAAGCTGTGCCTCATGAATTTTTATAGGACATTTCTTTTATGGTCTGCTGGGTTTGTCATTGATATTAATGTACTGGAACAATCATGTTTGTTTGCAGATTTAGTGCAACGTAATGTAAATACGACTTTGGTGGGCAAGTAGACAAACTGGTTTACTATTTTTTTACACACGCACATATTCCAAATTTGAGGTTGAAATACTTTTTTACACCTCGTTTTTGCTACACCTGAAAATCCCTCTGATCAAATGTTCCGAATTAAATAATAGAA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AATCAATCTCAACGATTTGTAAACAGATTCAAAGGAAGCTGCAACTACGAATTGAAGAACAAGGGCGCTATCTTCAGCAAATGTTTGAAAAATCATGCAAATCTGGATCTGAGAAAACCGCAACATCTTTAGCTGATAATGATAATGCAGAAGAAGAACTCCAAACAAAAGACGAGCAACACAGTAAAGAGAAGGAAATTGCAACTGAAGGCTCAAGGGAAGTAGGAAGAAAGGAGAAGCTAATCATGGATGAATCCCAATCTTCACCCAAGCGTTTGAAAAGTCAAGACGTGGAAACTATATCTGAATGAGTAGCCTTACATTACTTACTTTTGTATGCTATGCTATTTAGCTTGATATTGATGGAATGTTAAAAGCTTTATTATTCAAAGAAGGTTCAGCATTAGGAGGAGAGTGACCTCTTGCAAATTGCAATTGTGGCATCATAAATAAAATCATATATTGCTGATATTCGACTTTGTTTTGTTTCAAATCATTTTAGCCTGTACAAATGTAAATTTCTTATCAGTTATCACTTGCAAAGCAAGGAATAAGTAGCTGTATTCATATACAAACAGAACAGATGTTTCACATACTGTCCGTGGCATATTGGCCGTAGAGTATGAATTATGTTTTGTGTTGTTCTTTGTACCCATTAAATTGACAAATTTTCATTCTTAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020247678.1	3.3e-81	protein PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 2-like
Swissprot	B8B5N8.1	5.8e-54	Protein PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 2
trEMBL	A0A5P1E5S5	2.4e-81	HTH myb-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G28610.1	42.50	2e-64	243	AtPHR1;PHR1	phosphate starvation response 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G04054	AT4G28610.1	360	162	12	61	396	56	394	42.50	2e-64	243
AfisC3G04054	AT5G29000.2	374	179	13	15	366	10	376	44.39	5e-61	232
AfisC3G04054	AT5G29000.3	257	105	9	127	366	81	333	50.97	5e-57	218

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	226	277	40.3	2.3e-10
PF14379.3	Myb_CC_LHEQLE	Family	309	356	84.5	2.6e-24

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000719	P	photoreactive repair
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0003904	F	deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0007623	P	circadian rhythm
GO:0009536	C	plastid
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009567	P	double fertilization forming a zygote and endosperm
GO:0009650	P	UV protection
GO:0010628	P	positive regulation of gene expression
GO:0016036	P	cellular response to phosphate starvation
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0055063	P	sulfate ion homeostasis
GO:0071486	P	cellular response to high light intensity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network