result

Gene information

Detail information of AfisC3G04122

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G04122	chr3	736913000	736932860	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC3G04122
TTCCCTTTATTTTTTTCTGTTGTGAAATAAAAAATGACCCCCTTCCTCGAATTTGGAGTGCCAATTCACTATCCGATTAGGTTTGCTCTCCAGTTTTCATCCGTCCGCTCCTGATCCGCATAATTTCGTTTCCTTACTTTCGTCACAGCAGCATCTTCCATGATAAAAGAAATCTCATAAAGCACCCCTTCAGCTGTCTGTCCAGTAATCGCCACAGCCAATATCTCAAACAGGACCATTGTCAACATCTAATCAACGGTCGGTACTCTTGTCCCTTCATTGCTGAACCCTATTCTTTTTTTTTTCTTCCGAGCATGGCCGAAAAGTTGCATCTTGCACGATGCTTTTCAGAAAATGTAAACCTTAGCTGTCATCTTAAATTATTTTTGCATACTTCCTTTATTGATTCTGCTTGGAGAATCCATACCTTTTGAATGTTAGAATTTGTTTTACTCTTTCGATTTTATCGTTAGGCCATGCTGTTTTATTTGGGGATGTTGGTAGTTATATATTTCTTGCTGTAATTTATTGGTTTTCTCAAGGCCTTTATATTTTCTGTATCTGCAAATAGTCTGTCAGGTTATCTGAAATATTTCAAATTGTTACATTTTGAGCTCAACTGATTTTTTCTTCTCCTCCTCCTTTTTATAAGGATCCCAATTTCCGCGCCAGCATTATCTGTCAACATTTTGTGAGCTCAGTTATACGATTTATCTCTCCAGATTTTGTATAAGGTCACCTTAATTATGTTCTTGCACCACGAATTGAACTTCTACTTGTTATGTTTTGGATTAAAATAGTCACTAATTGCTTCATAGGAGCAGAAATATGATGTGGCTGATGTTAATTACTAGTTCATTTGTTTAGTCCAAGTGCTTATCTTTCTGTTCGTGTTTTACTTTATAAAAACGCTAATTTATTCTTCAACATTTGATTTTGTTTTTAAGTGTTGGTTTAAATATGCAGGTTTGCATGATTTGACTGGAGCATATAGAAAACACCTCGCAACATTTGTCAATGGGTGCTCCTAAGCAGAGGTGGTCCAGAGAAGAAGAGGAAGCACTCAAAGCTGGAATACTAAAACATGGAGCTGGAAAATGGACTGCAATTTTGAAAGACCCAGAATTTAGATCTATCTTGGCTTTGCGGTCAAATGTTGATCTTAAGGTACTTGATTAACAAGCCAAATTACTAGAATAAGTTAGGGTATTTAAAACTGAATGTATTTTTTTTCTCACGTATGGTTTGCATCTTTGTACTACTCCAAAGCCTGATAAAGGGTGAAAATGATATACTGTCAAGAAATAGATAGATATATCATGTGATGTTTGTTCAACCTTTGTATTTATGTAGGACAAATATAGGAATATGGGTACTGTAAGAAGTGGGGAAAGAAGTGGGGAAGCATCTCGTGAAAAGGCTGCTGCAGCATTGAAAAGAAGCAAACAAAACCTCATGCAAGATAGCAGTCAATTGGCTCCTAGTGGTAGCAATGAGGATTATCCTAGTGCAATTAAAGATGCCGAGACTCTTATAGTGTCTGTTAACTCTCCTGAATCATCTGGTCAAAAACAAAATTCCAAGTAAGTATCTCAACCTATAATGCAATTATATATGTTATGATGTGTGCTGTTTCTTAAGATATTTTTGTCAGTAGATTTGAATAAATCATCCCCTTTATTAAGTTCTTAGGTCAATACCCTCAATTACTTATTGATGTCAGTGATTATTGTTTTATAAGTTGGCATATGGAACTTATCGAAGTCTAGTTCACATACATAGCCAAAGTTAGTCTCATCCCTTAACTATTCACAATCAAATGCTTAAGGTTTTGGGACTTTAAAAGGTAAAACCTAATTGTCAAGGACCGTTAACTCAAGTGGTAAGTGATATGACGCTAGACCCATCAAACGGGTTGGGTCGGGTAGAATTTAACCCGATCCATTCAAGATATAAACAAATCCGACCCGTTTGACCCATTTAATATACGGGTTGATCCGACCCGATCCATTTAATAAAAGGATTAACCTGATCCGATCCGTTTTAAAAAAAAACTACTGCATAAGCAATAAAAACTACATAATAAAATAAAAAACTGCATCATTATTATCAATACTACTAAGCTGTTACATAACAAACAAAAACTACTGCACCAAACTGCATCGTATATTGATAAATTCTACATAAAAACAGAAAACTGCATCATAAAATATCAAACAAAGGTTTCAATGAAATGACAAACCAAACAGATGTTGCATAAAATATCCACTAGTTATATACAAGCAAGCAACGAGATGTCCGTTAAGGAAGAAGCAACAACCTATAAATGTCAACACTAAGGCCTTGTTGTACGGTGCTATGTATCATAGAAGCGCGATCTTTGTCTTGATGTCACTGGTGCCTGGCTGCAATGTAAAAATATGCAAAGCTATCAAGGCTCTAAATAGCAATAGTATCATGAGGCTCAAATTCAAAACTAATATGACTTAACCAATTCAGGAAAAAAAACAACGTTCCCACTTGATGAAATGTGGGCTTCATTTGCAGGTAAGCTGCCTACCAATAATAACCCCATTTGATTGTTTAGCGTCAGCTTCATTTGTAGATGCGTCAATGAATCAATTGTCATGCCAACTTTCAATTCGGTTTTGACATAAATAGGCAATGCACCCTTTAAAAGTTAAAGCAATAGATGGAGTCTACTTACAATTGAGCAATACATCTGTAAAATGAACATGATAACTTTTTGTTGATGTACTCTTTACATACAAGTTTAGCCCCCCCTTTTATTGATGTAATAGTAGATTAATTAACTTTACCAACCATATTAATGAATGAAGTAGCAATTAAATTGCATTGCTGTATTGTTAAGTGCAAAGTGATATCAATTGACAACTGACAGTCAATAATAAATGCATTTAGATCCAAATATGACAGTAATATCATCACATCGGCATAATCCAATTTTTCCTACTAACAACATTTCCCGATTAAGTCGGTACCATGATGCATGAAAGTTCTATATTAATAAGTATTGATGTCCTACTACCCAAGTTTTAATGGTATAACCTATAGTGGATTGCCATATAATTTCCAGAATTTCACTAAAAATAAAAAAGTAATTATATCAAAACAATATACTATAAAATTGTACCTTCTACTATGACAATCAATAATCACCTAAGGATGTTGTTAGAACTTGAGTAAACTGCTCCACATCAATATGAAATTTGGAAATATCTTCATCTTCTTGTTCTAGTTCCGTTGTAATAGCATTCCCATATAACCAATCATGCGTGCAAAGTAATGCCTCCACAATATCATCTTTAAGGGAGTTGCGATACTCGTCTAAAACCCTTCCATCAATGCTAAATGCGCTTTCGGATGCAACGGTAGTGATAGACACGACTAAAACATCTTTTGCCATGAGAGAGAATAGAGTATTTAAGTTGTTGAGACTGCCAAAATGAAAGAATATCGAGTGGTAACTTGCGATCTAACAGTCCATCTTCTAGATATAACTTAAGTTCTGAATTATGAGAACTTTCTAGTTTGAATATCCAGGACAAGGAAGTAAGAAATTGACAAATAATGTTTTAGTACCTGCACGAAAAATATTTTCATTTGTAAAGTTCATATAATCAAAAAAGAATGGTAATAAATTAAGATGAAAAAGTAAATATTTAATAGACCATCAGGGAACTACCAGACCCGGATTGATTGAAAAGTATAGGTAAACTATCAAGTACATGTACATGTCAAGATGAAGACGCTGATAATATAATTAAATTTTCTATTTGTAGAAAAAAAATGCTTTATACTTTTGAGTGCTGAATGGATCTATTTACTGAAATAGTTATATGTACAAAACATGTCTGACCATTGATGTAATACAACCTATAAAAATAGTTAATTTATTATATAAAAGAAAAGCTATTATTAGTTGTCATAGGTGTAATACAACCTATGAATATAAACTGACCATTGATTGGGAACTGACACATTAAGATGGTGGGTGATGAATATAAAGATAATTATGGGTAGGAAATATCATACTTCTGAAAAGTTTCTAGCATGAAAAAAAAGTAACTACGGAAGATCATCAAATTAAAATTTTGAACAATTTTGAATTGACTTATATGAATGTAATAGTTACAGCTTCTAAGATGATTCAAGGGTGTAAGTGTAACATTATAACAGATACCATGGTACTTGAAATCCAATTCCCATTGACCTGCTTAAATGGATTATGTGAACCAACTGTTTTGTTAAGTTTACATGCTTCATTTAAAAATATATATACACAACAGTTAATCCTTTGAAGATAATGCAACTCACGTCATTAATGCAGCAACAAAAGGTAAATGCAACCATCAAAATTCTACCTAAGCATGGTGCTAATATGCCAAGTAGATAGTTTTTTCAGTCCAGACTAAAGATGAAGAACTTGATCTGGTCTCATCTGAAGCACCTCATCTTTCCCTGCAAAATGAAATATATCATATTTTATAAGATAAGATTAAGTTTTAGCTCAAATTAGAATGCAAATTTGTAACGATAGTTTTTGTTTCTAACGAAATAGAAAAGAGTAACTTGGTCCAGATTTATTAATGAAACAAATTTACTTCAATGAACATTGTTACGTAGCTACTGTTAAATCTCAAGCTCCAAAAGGCATTATAGCATCTTCGCTCAAGTATCCAAGATGATATATTGATATAACAAATCAAAAATTGCAAAAAGTTAATTACCTAGGGTTTGCAGATTTGAAAGACGATGAAGCTCGCATTGAAGAGGAGCCTATCAATGATGATCTCGCTTTTTAAATCTTCGTTTAAGTACATAACTCAAGTATCTAAGATGATCCAAAATTATCAGTGAAAGAAGGTATAGAAATCGCTCTGTTTTCTTCTATCGTGATTTGAGGAGAGATTAGGGTTGAAAGCGTCAAGCGGGTTGGGTCGATCTGAGATTTTTTCCTCGCAAATGTAAACGGGTTG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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020269771.1	3.9e-39	single myb histone 6-like
Swissprot	Q8VWK4.1	4.1e-33	MYB transcription factor
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Best hit in Arabidopsis

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>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g405601.t1
Allium fistulosum	AfisC3G04122
Allium sativum	Asa2G03280.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
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Gene Ontology

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GO:1990841	F	promoter-specific chromatin binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network