result

Gene information

Detail information of AfisC3G04548

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G04548	chr3	815589535	815601133	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC3G04548
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020267885.1	3.8e-80	squamosa promoter-binding-like protein 12
Swissprot	Q5Z818.1	7.4e-57	Squamosa promoter-binding-like protein 12
trEMBL	A0A5P1EU73	2.7e-80	SBP-type domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G43270.1	51.74	7e-38	154	SPL2	squamosa promoter binding protein-like 2

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF03110.11	SBP	Domain	111	184	101.7	1.7e-29

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008361	P	regulation of cell size
GO:0009941	C	chloroplast envelope
GO:0010228	P	vegetative to reproductive phase transition of meristem
GO:0044212	F	transcription regulatory region DNA binding
GO:0042127	P	regulation of cell proliferation
GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0048510	P	regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase
GO:0048653	P	anther development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network