result

Gene information

Detail information of AfisC3G04554

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G04554	chr3	816647280	816660872	-

Sequences

CDS

>AfisC3G04554
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Protein

Gene

>AfisC3G04554
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	AML78250.1	0.0e+00	putative LOV domain-containing protein
Swissprot	Q9ST27.1	0.0e+00	Non-phototropic hypocotyl protein 1B
trEMBL	A0A126X1I4	0.0e+00	Putative LOV domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
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>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g284664.t1
Allium fistulosum	AfisC3G04554
Allium sativum	Asa2G03625.1
Arabidopsis thaliana	AT5G58140.1; AT5G58140.2; AT5G58140.3; AT5G58140.4
Oryza sativa	LOC_Os04g23890.1; LOC_Os04g23890.2; LOC_Os04g23890.3; LOC_Os04g23890.4

Pfam domain

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Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0010119	P	regulation of stomatal movement
GO:0010150	P	leaf senescence
GO:0010155	P	regulation of proton transport
GO:0010181	F	FMN binding
GO:0010362	P	negative regulation of anion channel activity by blue light
GO:0010540	P	basipetal auxin transport
GO:0015970	P	guanosine tetraphosphate biosynthetic process
GO:0015979	P	photosynthesis
GO:0018298	P	protein-chromophore linkage
GO:0019901	F	protein kinase binding
GO:0023014	P	signal transduction by protein phosphorylation
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0048766	P	root hair initiation
GO:0048767	P	root hair elongation
GO:0048825	P	cotyledon development
GO:0080167	P	response to karrikin
GO:1901981	F	phosphatidylinositol phosphate binding
GO:2000114	P	regulation of establishment of cell polarity

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K20715	PHOT; phototropin	EC:2.7.11.1	-	-
K08286	E2.7.11.-; protein-serine/threonine kinase	EC:2.7.11.-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network