result

Gene information

Detail information of AfisC3G04860

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G04860	chr3	865044865	865049197	-

Sequences

CDS

>AfisC3G04860
ATGGAAAAAACCATCTTTTGGCTTCATGTTTTTATCTTCTTTCTCGTTTCCTTCTCACACACTAACAGCTCAATCAAAGCATCAACTAACTCGGTCTCTAAAACTCAATTTCTTTCAGGGAACCAAACAATAATCTCCGAAACTGGCAAGTTCGAGCTCGGATTTTTCAGCCCAGGTAACTCTAACAACCACTACATAGGCATATGGTACAAAAACATACCAAACAAGACTATAGTCTGGGTAGCTAACAGAGAAGCACCTGTCGCTGATCCTTCAGTTTCAAAGCTTATAATCTCCAAAAATGGCAGTTTAGTCCTTCTAAACAACTCAACCACTCCAGTCTGGTCCACTAACACAAACTCTGCAGCTATCGCTGCAGTGCTTCTTGATACTGGAAATCTAGTGTTAGTTAACGGGTCGGGTTCAAATTCATATCTTTGGCAAAGCTTCAACTACCCGACTGATACATGGCTTCCCGGAGGTTGGCTTGGGTTCAACAAAATAACAAAAGAGTACCAGAGTTTGACATCATGGAAAAATTCAAACGATCCGAGTCGGGGTTTATTTTCTGAAAGCATGGACCCGGATGGCTCGAACCAGTACGTTATACTCTGGAACGGGTCGTATGTATACTGGTCTAGCGGGTTATGGAATGGGGAAGTCTTTTTAAATGTGCCTGGAAACAAAGGAAAGACAGATTTCAACTTCAGCTTTGTGGACAACGAAGAAAGGAAATATGCAACGTATACTATGTTAGATGATTCTATCACACGGTGTGTAGTAGATTCACATGGGCGGATAAGGCAGTGGTTCTGGTTTAACAAACCTCAGCAGACATGGCAGACTATCTTTACCGAACCACTGGGTACCTGTGATGTGTATTCACTTTGTGGGGATTTTGGTGTATGTGATGATCAAAGTGAACATGCTTGTCAATGTATAGAAGGTTTTAAACCTGCAAACGATGAAGAATGGAAGTTGGATGACTGGAGTTCAGGTTGTGTTAGGGTGTCCAAATTGCAGTGTGGTGGAAAAGATGGATTTTTGGAGATGAATAACATGAGACTACCTGCAAAATCAGATAACTTGACAGTTAAAAGCGGTAAAGAATGTGAATCCAGATGTATGAACGACTGTTCCTGTAACGCATACGCATACAGTGGTGGTGGATGTTTGGTTTGGAAGGGCGAGGTTCGAAATCTTGCAAACGTATATGGTGGTGGAGGTGATACTATTTTTGTTAGGCTTTTGGCCACTGATATTTTAAGTGAATCTAAAGGCAAAAGTAGTAGTTCCACTGCAGTTATTATTGGTGTGGTTCTTGGTTCTGTATCAGCCATATGTATTGCCGTTGGGCTGAGTTTGATATGTCTGAAAAAGAAGCAAAATCAAACATTGAAGCAAGTAGAAGGTTCTTTGATTCAGTTCAAGTATAAACAGTTACAAAAGATGACCAAGAATTTCTCAGAAAAACTAGGAAGCGGAGGCTTTGGCACAGTATTCAAAGGCATGATGCCCGATTCAACTGCCATAGCAGTTAAAAAACTGGAAGGGTTACGCCAAGGTGAAAAGCAATTCAGAAACGAAGTGATCACATTGGGTGCGGTTCAGCATGTGAACCTAGTCCGGCTTTTTGGATTTTGCGTCAAGGAATCAGAAAGAATACTCGTATATGAATTCATGCCAAAGGGATCTTTAGACTTTCATCTTTTTAGTAACAGTTCTAATGTACTGAAGTGGAGCACTAGGTACCAAATAGCTCTCGGGGCTGCAAGAGGTCTAACTTACCTGCACGAGAAGTGCAGAGAGCGCATCGTGCATTGTGACATAAAACCCGATAATATACTTTTGGATGATTCGTTCTGCCCAAAGGTGTCGGATTTTGGCATGGCTAAGCTTATCGGTCGGGACTTTAGTCGAGTCCTTACTACTATGAGAGGGACGATGGGATACCTAGCGCCAGAATGGATATCCGGGCTACCAATAACACCAAAAATAGACGTGTACAGCTACGGGATGATGCTGTTCGAGATAGTATCGGGGAAAAGGAACAGGGTTCGCTCCGAGGATGGAAGCTTGATCTTCTACCCTTCTTGGGCAGCGAGGAAGATTGTCGAAAAAGAAGAAGGGATGAGTTTGGTTGATGAAAGACTGAACGGCGAAGCCAACTTGGAGCAGGTTGAACGAATGTGTAAAGTCGCGATTTGGTGCGTTCAGGACGACGAGAACTACAGGCCGACTATGGCTCAGGTCGTGCAAGCTTTGGAAGGGTTGGTCGAGGTTGGTATGCCGCCTATGCCTACTGCGTTGAAGAACGTTGCTTCTGCTATTAAACTTGAGTTAGTTTAG

Protein

Gene

>AfisC3G04860
GATACAAAAGTAGCTTTGCAGCTATGTTCTCCTTCATAACCAATTTTAATTTCTCCTTATAGCCATGGAAAAAACCATCTTTTGGCTTCATGTTTTTATCTTCTTTCTCGTTTCCTTCTCACACACTAACAGCTCAATCAAAGCATCAACTAACTCGGTCTCTAAAACTCAATTTCTTTCAGGGAACCAAACAATAATCTCCGAAACTGGCAAGTTCGAGCTCGGATTTTTCAGCCCAGGTAACTCTAACAACCACTACATAGGCATATGGTACAAAAACATACCAAACAAGACTATAGTCTGGGTAGCTAACAGAGAAGCACCTGTCGCTGATCCTTCAGTTTCAAAGCTTATAATCTCCAAAAATGGCAGTTTAGTCCTTCTAAACAACTCAACCACTCCAGTCTGGTCCACTAACACAAACTCTGCAGCTATCGCTGCAGTGCTTCTTGATACTGGAAATCTAGTGTTAGTTAACGGGTCGGGTTCAAATTCATATCTTTGGCAAAGCTTCAACTACCCGACTGATACATGGCTTCCCGGAGGTTGGCTTGGGTTCAACAAAATAACAAAAGAGTACCAGAGTTTGACATCATGGAAAAATTCAAACGATCCGAGTCGGGGTTTATTTTCTGAAAGCATGGACCCGGATGGCTCGAACCAGTACGTTATACTCTGGAACGGGTCGTATGTATACTGGTCTAGCGGGTTATGGAATGGGGAAGTCTTTTTAAATGTGCCTGGAAACAAAGGAAAGACAGATTTCAACTTCAGCTTTGTGGACAACGAAGAAAGGAAATATGCAACGTATACTATGTTAGATGATTCTATCACACGGTGTGTAGTAGATTCACATGGGCGGATAAGGCAGTGGTTCTGGTTTAACAAACCTCAGCAGACATGGCAGACTATCTTTACCGAACCACTGGGTACCTGTGATGTGTATTCACTTTGTGGGGATTTTGGTGTATGTGATGATCAAAGTGAACATGCTTGTCAATGTATAGAAGGTTTTAAACCTGCAAACGATGAAGAATGGAAGTTGGATGACTGGAGTTCAGGTTGTGTTAGGGTGTCCAAATTGCAGTGTGGTGGAAAAGATGGATTTTTGGAGATGAATAACATGAGACTACCTGCAAAATCAGATAACTTGACAGTTAAAAGCGGTAAAGAATGTGAATCCAGATGTATGAACGACTGTTCCTGTAACGCATACGCATACAGTGGTGGTGGATGTTTGGTTTGGAAGGGCGAGGTTCGAAATCTTGCAAACGTATATGGTGGTGGAGGTGATACTATTTTTGTTAGGCTTTTGGCCACTGATATTTTAAGTGAATCTAAAGGCAAAAGTAGTAGTTCCACTGCAGTTATTATTGGTGTGGTTCTTGGTTCTGTATCAGCCATATGTATTGCCGTTGGGCTGAGTTTGATATGTCTGAAAAAGAAGCAAAATCAAACATTGAAGCAAGTAGAAGGTTCTTTGATTCAGTTCAAGTATAAACAGTTACAAAAGATGACCAAGAATTTCTCAGAAAAACTAGGAAGCGGAGGCTTTGGCACAGTATTCAAAGGCATGATGCCCGATTCAACTGCCATAGCAGTTAAAAAACTGGAAGGGTTACGCCAAGGTGAAAAGCAATTCAGAAACGAAGTGATCACATTGGGTGCGGTTCAGCATGTGAACCTAGTCCGGCTTTTTGGATTTTGCGTCAAGGAATCAGAAAGAATACTCGTATATGAATTCATGCCAAAGGGATCTTTAGACTTTCATCTTTTTAGTAACAGTTCTAATGTACTGAAGTGGAGCACTAGGTACCAAATAGCTCTCGGGGCTGCAAGAGGTCTAACTTACCTGCACGAGAAGTGCAGAGAGCGCATCGTGCATTGTGACATAAAACCCGATAATATACTTTTGGATGATTCGTTCTGCCCAAAGGTGTCGGATTTTGGCATGGCTAAGCTTATCGGTCGGGACTTTAGTCGAGTCCTTACTACTATGAGAGGTACTATTAGCGAACCATTTATTATTATAAACCAGTTTACCAATATAGTGATAACTTGATATTTCCCATTTAGCAACAACTCAGTCGAAAACTTCTTTTAAAAAAATTAAATAGTATCTTCTAAGTAGTTTTGAATACTGATTTATAAGTAGAATAGTTTGAATGTAATTTAACTTTTAAGTTAAAATAGGTAAAATAATTTCTCGATACTAGTTATAATATATGTTTATAAGTCACAAACAATAAATTATTGTTTTTCATATTTTTACTTATTAGTCAGTTTTGAGTTTTCTATAAGAAGTAGCCAAATATTAGTATTGAAACATGCTCAACAAGCAGTTTAGCTTCAAACATGCCCAACAGGCAGTTTATTAAGAAAAGTTTATTAAACTTCTTATGCGACTATTCTCAGCATGAGTCGTTGCATCTGATGTCGATATATTTTAAACCAAAAGCATATGCTTTTATATTTGGTGACGTGGTATATTTATGATAGTTAAACCCATAACTGCCGGGTCTAAATTTGACACCATGTAAGACCTTCCACATAGTACAGCTTGTAATATTATGTTTTATAACACGAGAATTTGTAATCAGAAGATTTTCACAATAGAACTTGAATTAAATGCTTGTCAAATATATATTTTGAGCTCAGATGCATGTCGAACAAACTATTTGTATTATCGACATGATTGACCTCATGTGATGTTTATTAACAGCCACCTAAGCTCAAACGCCTATTGAATTTTTTTAAAGTATAATCTATGCACAATTGATCATCGCAAGATGCTTATTTAACATTCGTCTAAGCTCATACATTTGTTTATTAAGCATATTTTAAGATTACAACTTGTAATCAAGGTTCAAGATCCCGGTTTCGGTCTTTTGTTATTTTAGAAATTTCGATCTAATTCGTAAATATCGGGAATTTTGGTTCAAGTTTCGGCTTCGGATTTCCTTATTTATTTTTATATAATTATACACACACAATATGTGTGTGTTTAATCAATCGAAACAAGATGTGTAATTTATCTTTAATTGAAAAATAAGATATAAACGAACAATATTGATTGATTATAAATATCTACAACGCAAACAAATATTTATTTATTACTTCGTACTTAACTTTTTTAGTTACACTACTCATCTATTTTGTGATTTGCATATTTCAAAATTAAATTTTCAGATTTCCAATATTTATATATTTGAAACTCGAATCAATTTTTTGTTTCTTCTATAAAATTTGAATTTTATTATTTTTTCACTGAATCGGAATTTCAATTTGGTTTTGTTTCGATCCTTACTGAAACCGGAACAGAACGATCGGAATCTCGATGTTTGGATCGAAATCTCAAACCATGCATGTAATCTTTCATCTTAAAAATTACAAATCCATACTTCAAGTTGAATGTACCGAGCTGTTGGAGATCTTAGAAAACCTTGTATTATTATGAAAGCGGTTGGTAACATAAAGAGACAGATGTATCAGTAATTTTTTTTTTtTGAAAACTTGGTACTTAATAGAGGGTGCAGATACCATGCGTCTTAGATAGCATATACATACCACAAATCATAATATGTCCAAGGTTCGAACTGCACTATATAAGATTCGAACTCGTGACCTCAGAACTTAATCCTCGTCAATGTATCGGTATTTATATTGAAATTTGCTATTTTTCAACAGGGACGATGGGATACCTAGCGCCAGAATGGATATCCGGGCTACCAATAACACCAAAAATAGACGTGTACAGCTACGGGATGATGCTGTTCGAGATAGTATCGGGGAAAAGGAACAGGGTTCGCTCCGAGGATGGAAGCTTGATCTTCTACCCTTCTTGGGCAGCGAGGAAGATTGTCGAAAAAGAAGAAGGGATGAGTTTGGTTGATGAAAGACTGAACGGCGAAGCCAACTTGGAGCAGGTTGAACGAATGTGTAAAGTCGCGATTTGGTGCGTTCAGGACGACGAGAACTACAGGCCGACTATGGCTCAGGTCGTGCAAGCTTTGGAAGGGTTGGTCGAGGTTGGTATGCCGCCTATGCCTACTGCGTTGAAGAACGTTGCTTCTGCTATTAAACTTGAGTTAGTTTAGTTCAAATACTTGAATTTGTTTCCTGATATAGATGGTTACGTTGAATGCTATATGCAATGAAAAAGATATTGTATTGTGTTACATGGTTGTAATTAGAAGTTACGTTGTTGAGTATGGTTCTTCTTTATATGTAGCATGTACTTTTTTTAATACTTTCAAGTTAAATCAGTTTTCACATCTCTCATAAGTGTAGGAAAGAGTTTTATTTATTTGATTAACCACGCATCCTATTTTGC

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256466.1	0.0e+00	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130
Swissprot	O64477.1	2.5e-212	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130
trEMBL	A0A8B9ACZ3	1.1e-270	Receptor-like serine/threonine-protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G19130.1	50.38	0.0	750		S-locus lectin protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G04860	AT2G19130.1	782	357	16	12	771	10	782	50.38	0.0	750
AfisC3G04860	AT4G00340.1	757	391	17	31	757	20	761	42.40	2e-159	560
AfisC3G04860	AT4G11900.1	842	428	30	2	768	5	821	37.29	1e-135	481

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa
Allium fistulosum	AfisC3G04860
Allium sativum	Asa2G04008.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01453.21	B_lectin	Domain	76	180	109.6	6.7e-32
PF00954.17	S_locus_glycop	Domain	212	320	90.0	1.3e-25
PF08276.8	PAN_2	Domain	342	400	60.0	1.6e-16
PF00069.22	Pkinase	Domain	489	753	164.8	2.1e-48

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0016020	C	membrane
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0005634	C	nucleus
GO:0051707	P	response to other organism
GO:0009875	P	pollen-pistil interaction
GO:0031625	F	ubiquitin protein ligase binding
GO:0044699	P	single-organism process
GO:0045087	P	innate immune response
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0050789	P	regulation of biological process
GO:0071215	P	cellular response to abscisic acid stimulus

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network