result

Gene information

Detail information of AfisC3G05275

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G05275	chr3	946379207	946384095	+

Sequences

CDS

>AfisC3G05275
ATGTCTTCCTCTTCCATTTGTATTTTTGCTATCTCTCTCTTTCTCCTTGACTGCACAAGAAGTGAGATATCTCTCGGTTCAAAGTTAAAAGCCAGTGAAAGCAATACATGGGTCTCCCAATACAAAACATTTGCCTTCGGTTTCACTAAAACTGGAACCGATGATCGCTTTTTGTTAGCAATATGGTACTATAATCTTCCTTCCAGTCTAACAATAGTATGGTCTCCTAACAGAGATTCTCCAGTCACTAGAAATGCAATAGTAACCCTGGAAAGATCAGGAAACATTGCGTTAACTGATCAAAACAAGCTTATATGGTCATCTAACACAACTGACCTGGACATAGACTCTGCAGTGATGTCCGATACAGGCAGTTTCATTCTATACAATAACACGGGCACTGCTCGTAGAATTGCATGGCAGAGCTTCGATCTTCCAGGCGACACTCTCCTTCCTGGCCAGAACCTATCAGCATCCCTTGAACTCACATCAAATAGATCGCAAAATGGTTACTATGTTCTCAAAATGCTGCAGCAGCATACGTCCCTCAGTCTTGCTCTAACGTTTATCACGTTCGATGCACGTACGAATTACTCGTACTGGTCGAGTCCACAGATATCAAATGCAACGGGAAACGTAGTTGCAGTTCTGGATGATTCTGGAAGCTTCAGCATAACATATGGTGAATCATCCTCAGGTACCGTGTACATACACAAGAATGAGTCTATCTCAAACCAGGACTCCATTCTAAGAAGAATTAGAGTGGAAACAGATGGAAATCTGCGACTGTATGAATGGAATACAAGTACTGCTAAATGGGACATTGCATGGTCTGCAGTTTCAAATCCATGTGAAGTGGCAGGAATCTGTGGAAATGGGATATGTAAACTGGACAGTATCGGTGTAAGCTACAATTGTTCGGACTTACCAGATTTGAATACTGAACACTGCAACAAAAACATGAACATGGATACATGGGCCCAAACAAACTACTATTTCTTAGGTTCGTCTACCATTGCTAATTATAGCAATGTTACAAGTGCTTTGGATTGCCCTAAGTATTGCCAAATGGACTGCGACTGTGTTGCGAGCCTTTATGGTGTTAATGAAGATGCTACCATGTATTGTTGGACTTTGAGAGAGATGGTTTTTGGAGGCTTGCAAGATCCAAGCTCGACTTTTTTCGTAAAAAACAGTGGTGATGGTAAAAATTCGGATTCTAGAGGAAAAAATGAGGGTAGAGATAGAGATGTACTTCTTCCTTTGCTATTGTGTGTTTCTGCGCTTTTAGTTCTGCTTGGAATGTTAGTGTGTTTTGGAATAAGGAGGAGGAGGATTAAAGATGCACAAAGGATTGGTAGAGCTATGAGTTTGCCTGGAGCTCCTTTGTATTTTAGTTATCTGGAGTTGCAGAATGCTACTGATAATTTCTCAGAATTACTTGGAACAGGTGGGTTTGGAAGTGTGTACAAAGGAACGCTCAGAGATGGATCAGAAATAGCAGTAAAACAACTAGAAAGATTTCTACCTCACGGTGAAAAAGAGTTTGTAACAGAGGTTACAACCATTGGCTCAATGCACCACATGAACTTGGTTACTTTTCGTGGTTTCTGCTCTGAAAGAAAACACAGGCTTCTTGTATATGAGTATATGAGCAATGGATCATTAGACAAATGGATATTTCCATCTCTAAGCATTAGGGAAGAAGAAGAGAGAATCCTCGACTGGTCAACTAGGTTTCAAATAGCCATATCTATAGCTCAAGGAATAGCTTATTTTCATGAGCAGTGTAAGAACAGAATCATCCACTGTGACATCAAGCCAGAGAACATTTTGTTAGATGAGGATTTCTGCCCCAAAGTATCGGATTTTGGACTGGCGAAGCTGATGAGTAGAGAGCATTCACATGTAGTTACCATGGTTCGTGGCACGAGAGGGTACTTAGCTCCAGAATGGGTTAGCAATAGACCCATCACTGTGAAAGCTGATGTGTACAGTTATGGCATGCTGCTTCTTGAAATTGTTGGTGGAAGAAGAAATCTCGATATTTCTTTGGATTCTGATGAGTTTTTCTACCCTGGCTGGGCTTACAAGGAAATGAAGAACGGGACACCGATGAATGCTCTGGATAGAAGGATGAAAGGCAAAGTTGATGAGGACGAAGTAGGAAGATGTTTGAGCACGGCGTTTTGGTGCATACAGGAAGAATCATGGGTGAGGCCATCAATGGGAGAAGTGGTGAGAATGCTAGAAGGGTCGGTTGAGATTAACGAGCCACCGATGCCTCAATCTATAGTTGAGTTAGTCGAAGAAGGGCTGCAAAGTGTGTACTTTGCTATGAAGAGAGACTACACTTTGTTTCCTATGAATTCTTCGTCTATGCTTCATAGTCAGAGATCGTCGTTGGCGACTTGTAGCTACTCAACAATGTCACCGAGATAG

Protein

Gene

>AfisC3G05275
CTCATGTCTTCCTCTTCCATTTGTATTTTTGCTATCTCTCTCTTTCTCCTTGACTGCACAAGAAGTGAGATATCTCTCGGTTCAAAGTTAAAAGCCAGTGAAAGCAATACATGGGTCTCCCAATACAAAACATTTGCCTTCGGTTTCACTAAAACTGGAACCGATGATCGCTTTTTGTTAGCAATATGGTACTATAATCTTCCTTCCAGTCTAACAATAGTATGGTCTCCTAACAGAGATTCTCCAGTCACTAGAAATGCAATAGTAACCCTGGAAAGATCAGGAAACATTGCGTTAACTGATCAAAACAAGCTTATATGGTCATCTAACACAACTGACCTGGACATAGACTCTGCAGTGATGTCCGATACAGGCAGTTTCATTCTATACAATAACACGGGCACTGCTCGTAGAATTGCATGGCAGAGCTTCGATCTTCCAGGCGACACTCTCCTTCCTGGCCAGAACCTATCAGCATCCCTTGAACTCACATCAAATAGATCGCAAAATGGTTACTATGTTCTCAAAATGCTGCAGCAGCATACGTCCCTCAGTCTTGCTCTAACGTTTATCACGTTCGATGCACGTACGAATTACTCGTACTGGTCGAGTCCACAGATATCAAATGCAACGGGAAACGTAGTTGCAGTTCTGGATGATTCTGGAAGCTTCAGCATAACATATGGTGAATCATCCTCAGGTCATCATCATCTTCTTTGTTGGGTTTGCCGTATAAATTATCATTTTTCCTAGGTTTTTATTTTAGTCGTGTTTCTAGTGAAATTTAGAAAGCATTTGATTCGAAAATATATGTACTTTAAAATACACAGAGAGGAAAAGAGGTGGAAAACAGTCGATTTGGAAAATGGTATTAACATATAAAATTGAAAATGATTTTTTCTTGTTTTCCACCTTCTGAAAAATATATAAAATAAATATTATGTTCCTTCTCTTTTTCTCTTTTGTTGGAATGGCTAGGATTTTTCAACTCTTCTCTCCCATGTCATTCGAAATACACCTTGAAAACACAAAACACAAAACCTGTTTTCATGTCAAAGATTACCTAAACATTTTAAAATCAGTTTTAGTAGAGCATTTCAGTCACTTTGACCCTTCTTAAATATAAATCAAATTTATTTTAACAAGTTTTAAATTCTTTATAAAAACAGACCACTTTTGGCCAATATGACCAAAAGGTTTAAATTCTGTATAGATTCTTAATAATTTGTTTACATATATATTCTGAAATGTGATCTAAATGAGTGAAAAATACATTTTTTTTTTCTCATGTTAATTTATCTTTGTTCATGTCTTCAGGTACCGTGTACATACACAAGAATGAGTCTATCTCAAACCAGGACTCCATTCTAAGAAGAATTAGAGTGGAAACAGATGGAAATCTGCGACTGTATGAATGGAATACAAGTACTGCTAAATGGGACATTGCATGGTCTGCAGTTTCAAATCCATGTGAAGTGGCAGGAATCTGTGGAAATGGGATATGTAAACTGGACAGTATCGGTGTAAGCTACAATTGTTCGGACTTACCAGATTTGAATACTGAACACTGCAACAAAAACATGAACATGGATACATGGGCCCAAACAAACTACTATTTCTTAGGTTCGTCTACCATTGCTAATTATAGCAATGTTACAAGTGCTTTGGATTGCCCTAAGTATTGCCAAATGGACTGCGACTGTGTTGCGAGCCTTTATGGTGTTAATGAAGATGCTACCATGTATTGTTGGACTTTGAGAGAGATGGTTTTTGGAGGCTTGCAAGATCCAAGCTCGACTTTTTTCGTAAAAAACAGTGGTGATGGTAAAAATTCGGATTCTAGAGGAAAAAATGAGGGTAGAGATAGAGATGTACTTCTTCCTTTGCTATTGTGTGTTTCTGCGCTTTTAGTTCTGCTTGGAATGTTAGTGTGTTTTGGAATAAGGAGGAGGAGGATTAAAGATGCACAAAGGATTGGTAGAGCTATGAGTTTGCCTGGAGCTCCTTTGTATTTTAGTTATCTGGAGTTGCAGAATGCTACTGATAATTTCTCAGAATTACTTGGAACAGGTAATCCAGTCTTTTTCCCTGGCCAGTATGGTATTTTGTTTTTGCAAATGTCAATTTGCCTTTTTTGTTTATGCACATTAGCTTATGTAGAAAATGGTGTTACTCTTCTTCAAGCAGGATTTGCCACAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGCTAAACCTATTAACATCCTACAATTTTCTTTTTCCACCCCACTATGCTATGCTATGAAAAATAGTAACACTCCATAATTTATCCTTTTTTTTTTCTTTTAATATTTCTCTTATTCATTTACTCCTTCATGCTTTCTTATTCAGTAGTTAATGATAATTGAAGTTAATACTTATCTTTAATTTTTACCACCAAATCTTTGCCAAAACGAACATTGTAAGGAAATCACTTGCATAAATAATAAAACGCTTCTATTAGGTTTTAAGTTTAAAATTATCTTGATTTTCTTAAAATTAGTTAATCAATGCTTGGAACTTGTTAAATTAAATTGGAATCGTCTTTCAAATGGAAACTAATAGAAGTAGCTAAAAAAAAAGACTTTGGTAAACTTTAAGAATATTGTTAGTAAACCTTCTTTACAAAAGATAGGATATGGCATGTATGGTCTGTCATTGTAAGTTTCAAATGTTATTTCCTGAATTCTTTTATTTATTTTTAATGAAAGCGAAAAAAAAATCAAAAATAATTATCACTTGCTATTATTATTACTTCACGCTTCAAAGGGTAATTTTAATTACTTTTCTCTAACTAATGGATTGGCATGTTATTGACATCAGTAATGGAAATTTATTGATAAAACTTTTCTTTAGGACATGCATATTATAAGTGCCATACTTATAGTTGTAATAGTTATATAATTTTGTAAAATTTATCATCAGGTGGGTTTGGAAGTGTGTACAAAGGAACGCTCAGAGATGGATCAGAAATAGCAGTAAAACAACTAGAAAGATTTCTACCTCACGGTGAAAAAGAGTTTGTAACAGAGGTTACAACCATTGGCTCAATGCACCACATGAACTTGGTTACTTTTCGTGGTTTCTGCTCTGAAAGAAAACACAGGCTTCTTGTATATGAGTATATGAGCAATGGATCATTAGACAAATGGATATTTCCATCTCTAAGCATTAGGGAAGAAGAAGAGAGAATCCTCGACTGGTCAACTAGGTTTCAAATAGCCATATCTATAGCTCAAGGAATAGCTTATTTTCATGAGCAGTGTAAGAACAGAATCATCCACTGTGACATCAAGCCAGAGAACATTTTGTTAGATGAGGATTTCTGCCCCAAAGTATCGGATTTTGGACTGGCGAAGCTGATGAGTAGAGAGCATTCACATGTAGTTACCATGGTTCGTGGCACGAGAGGGTACTTAGCTCCAGAATGGGTTAGCAATAGACCCATCACTGTGAAAGCTGATGTGTACAGTTATGGCATGCTGCTTCTTGAAATTGTTGGTGGAAGAAGAAATCTCGATATTTCTTTGGATTCTGATGAGTTTTTCTACCCTGGCTGGGCTTACAAGGTAATATTTTCTGTCCTTGAACTTCACTCATTTGTCTGTTTAAAACAGGGTAGAAGCCCATTTGACAACCCACATAATTTTATTTAGTTTTCTGAAAGTAATTTTAGGGCTCGTTTAGATGGACTTAAATAAGTAATTTTTCCTATTTTCGAAAGTCAGAACCAATTCATTTTACAAAAAGTAGTTTTGTTTAAATCGATCCAAACAGAATTTCAGATGATAAGATGACTACAATGACTAGTAATGAAATATATGTCAAACTTTATGATTCAACATCTTTATGTATAATGATGGTGGGTATCAAATAGTGACAGAAAATTACTAGGCTATTTCATCCATTTACTTGGTCAAAACTACTTATAATATATAATTTTAAACAACAAATGGCTACTTCTTTAATTTTGACTATTGCGGATAACAAGCTTAAGTTATAAGGCTTTAGATTTGTGGATTTAGATGTCTATTAATAAGATATGGAGTTTTCAAACATTGATCTCAACTAAATTAGGTATAAATTGCTTGGACTGCTTTAAATGAGTGGTCTAACATGCTACAAGAAAACACCAGTCATGTTAGCAAAGTAGAATTTGCTAAAATGTACTATCTGCTTTTCATTCCTTTTGAAAACGCAAAACATAAAACTCAAAGTTCAAACCAAATGGACGCTTACCTTTATACACATTCTATATAACATATGATCGGAACTTTTACATATTATGTACAGGAAATGAAGAACGGGACACCGATGAATGCTCTGGATAGAAGGATGAAAGGCAAAGTTGATGAGGACGAAGTAGGAAGATGTTTGAGCACGGCGTTTTGGTGCATACAGGAAGAATCATGGGTGAGGCCATCAATGGGAGAAGTGGTGAGAATGCTAGAAGGGTCGGTTGAGATTAACGAGCCACCGATGCCTCAATCTATAGTTGAGTTAGTCGAAGAAGGGCTGCAAAGTGTGTACTTTGCTATGAAGAGAGACTACACTTTGTTTCCTATGAATTCTTCGTCTATGCTTCATAGTCAGAGATCGTCGTTGGCGACTTGTAGCTACTCAACAATGTCACCGAGATAGTTGAGAAGGAACATTAGCTAGCCTCGGCATGTAGTGACTGTAATTGAGTGTTAGGATTTGGATTGTAAAGAAGTACATATCATGAGAAGATTGAAGAGGGGAGAAAACGTTAGGTTTAAACATACATTTTTGTTGTTGTTGTCAGTCTTTGAATACAGCCCCCACATTCAAAATTTGACTAGTGGAGGAAATAAAGTAAAAAGTAATGATAGGATATCATCAGTACTACATGTTCAATT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020268638.1	0.0e+00	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080
Swissprot	Q9FLV4.1	1.5e-263	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080
trEMBL	A0A8B8J9C0	6.9e-287	Receptor-like serine/threonine-protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G24080.1	59.45	4e-165	578		Protein kinase superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G05275	AT5G24080.1	476	169	7	355	813	2	470	59.45	4e-165	578
AfisC3G05275	AT2G19130.1	817	432	27	6	778	13	794	37.45	9e-122	434
AfisC3G05275	AT1G34300.1	803	411	29	21	772	25	778	36.36	1e-116	417

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF01453.21	B_lectin	Domain	71	165	69.5	1.9e-19
PF00954.17	S_locus_glycop	Domain	230	298	29.4	8.2e-07
PF00069.22	Pkinase	Domain	478	681	161.2	2.7e-47

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0004672	F	protein kinase activity
GO:0005488	F	binding
GO:0006468	P	protein phosphorylation

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network