result

Gene information

Detail information of AfisC3G06458

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G06458	chr3	1154040490	1154046977	+

Sequences

CDS

>AfisC3G06458
ATGGCGTCTAGCTCAACTGAGGCCCAAAACATAAGGGGAGAGCTAACTCACGGCGGTAAATATGTTCAGTATAATCTATACGGTAATTTATTCGAAGTTTCTGCCAAGTACGTGCCTCCTCTTAGACCCATTGGCCGCGGAGCATATGGAGTTGTTTGCGCTGCTGTAAATTCAGAGACAGGAGAAGAGGTTGCTATTAAGAAAATTGGCAATGCATTTAATAATCGAATTGATGCAAAGCGAACTTTAAGAGAAATAAAGCTTCTTCGTCATATGGATCATGAAAACGTGATTATGGTTAAGGATATAATAAGGCCTCCTAGTAAAGAAGATTTTAATGATGTGTACATTGTGTATGAGTTATTGGATACTGATCTTCATCAAATTATACGCTCTAATCAGCCATTGAATGATGAACATTGCCAGTACTTCTTATATCAGTTATTAAGAGGACTGAAGTACGTGCACTCAGCAGGTGTATTGCATCGCGATCTCAAACCAAGCAATTTGCTTTTGAATGCAAATTGCGACCTAAAAATAGGAGATTTTGGACTAGCAAGAACAACTTCTGAAGCTGATTTTATGACAGAGTATGTAGTGACTAGATGGTACCGTGCTCCAGAACTTCTTCTCAACTGTTCGGAATATACAGGTGCTATTGATATCTGGTCAGTTGGTTGCATACTAGGCGAGATTGCAACTCGACAACCTTTGTTTCCAGGAAAAGATTATGTTCATCAGTTAAGACTAATTACCGAGTTAATAGGCTCACCCGATGAATCTAGCCTTGGCTTCCTCAGAAATGATAATGCACGAAGATATGTGAGATTGCTTCCGCAGTATCCAAGACAACAATTTTCTGCTAGATTTCCAACCATGTCAGCTGGAGCTGTTGATTTACTTGAAAAAATGCTTGTATTTGACCCTAGCAAGAGGATAACAGTTGAAGAAGCCCTATGCCATCCTTATATGGCTTCTCTTCATGATATCAATGTAGAGCCAGTTTGCTCTGCTCCTTTTGTCTTTGACTTTGAACAACCATCATTCACTGAAGAAGATATCAAGGAACTTATATACAGAGAATCTTTGAACTTCAATCCAGACCTAATGCAGCACTAA

Protein

Gene

>AfisC3G06458
CCAAATCACGCGATTAAAGACGAAGAAGAAGACCCAACTACCATTTCACGATCTTCTAAATATGATCGTGTGATACCTCGACCAAGACCCATCTTTTGAGAGAGATATCCTTGTTGTTTTTGATAGTAATGGCGTCTAGCTCAACTGAGGCCCAAAACATAAGGGGAGAGCTAACTCACGGCGGTAAATATGTTCAGTATAATCTATACGGTAATTTATTCGAAGTTTCTGCCAAGTACGTGCCTCCTCTTAGACCCATTGGCCGCGGAGCATATGGAGTTGTTTGGTAAAGTTTCAATTCGAATAATTAAGGCACTTTGCATTTTTTGGGGGTTAATTGATGTAGACATGTTATGTGAGCTACATGATTATTCCATGAGGACCGACAATTGATAACGTATGTTAGTTTCAATCCATGTTCTAATATTTCTATCATGCTGATGCAGCGCTGCTGTAAATTCAGAGACAGGAGAAGAGGTTGCTATTAAGAAAATTGGCAATGCATTTAATAATCGAATTGATGCAAAGCGAACTTTAAGAGAAATAAAGCTTCTTCGTCATATGGATCATGAAAACGTATGTTTAAGACAATACTGTTGATTGCCTTTAAAATGGTGTTTATGTAATATTTGTACTGACTTATTAGTTGAATAGGTGATTATGGTTAAGGATATAATAAGGCCTCCTAGTAAAGAAGATTTTAATGATGTGTACATTGTGTATGAGTTATTGGATACTGATCTTCATCAAATTATACGCTCTAATCAGCCATTGAATGATGAACATTGCCAGGTAATCAAGAAGAAATCACCTTAAAAGTAAAGGGATTTCTGCAACATTTTTTTTGGGGATGCTCTTGTCTTGATTCCTAAAAGGCCTAACTTGTTTCGTTTCTACTTGCAGTACTTCTTATATCAGTTATTAAGAGGACTGAAGTACGTGCACTCAGCAGGTGTATTGCATCGCGATCTCAAACCAAGCAATTTGCTTTTGAATGCAAATTGCGACCTAAAAATAGGAGATTTTGGACTAGCAAGAACAACTTCTGAAGCTGATTTTATGACAGAGTATGTAGTGACTAGATGGTACCGTGCTCCAGAACTTCTTCTCAACTGTTCGGAATATACAGGTGCTATTGATATCTGGTCAGTTGGTTGCATACTAGGCGAGATTGCAACTCGACAACCTTTGTTTCCAGGAAAAGATTATGTTCATCAGTTAAGACTAATTACCGAGGTATTATATTACTTTGGCATATCTATGTTTACTGTTCAACCTAGATGTATAAAAGTACACGTTACTTGTTCCATGAGTGTACTTAGAAGGAATTACTTTATGGTGGTTGCTGATGCTTTATGGCAAATGTGGAGCGAAAACATTCCTGGCTATGTTATTCATGGCTATGGACTATTGTACTATCATAATCACAAATACATTTCAAGACTAACACAAAGAAAATAATATGGTGGGTTTTACGTAGGCCTGTCAATGGGCCGGGTTCGGTCCGGGTATTATAAAACCCGGACCCGAGTCCGATTACAATAATTAAAACCCGAGCCCGGCCCGAACCCGCAGGGTATTTCAACCCAATATCCGAGCCCGGCCGATTGGGCTTTTTAGGCCCGTTGGGTAATAATCGTATGCCGAACTCAAAATATTTATGTCAAATCCATATTTTAAAACTGCAACTTTGGTTAAATTTTGTATACAAACAATGTTAACATATAAATTGGGCGGTGATCTAGTCAAGTTCACAACAATAGTATGCAAAATATGTACATGTAAACAAACAAAATGGTAAATAAATAACACACACTCATGTTTTGATATGACGGAAAACTAATAGTCGGATCGAGCCCTAGCCGGGCCGGGTTTTGATAAAACCATACCCGATCCGGGTCGGGCCTGAGTCGGGCTTGGGTAGTAAAACGCAAAATCCGCACCCTCATTAATATGACGGGTTCGGGCCGGGCTCGGGCTGAAACCCGTACCATTGACGGGCCTAGTTTTATGCAATACATGTGGACATTATGACCGTATACCAATCTGGGATATATAAGTAAACCTGAATTTAAAGCTTGTTTTGAAGGTAAAAGTGGATTTTGTTGTAGAACAATAATAATACATAATACAAAAGACAGTTATAAAAGTGAGGTTTTGTTATGTTTATTCTGTATTAAATATTGTTATTGCTCTACAACACATCAGCACAATACTTGGATAAATGACAATGATGTATGTTTGGTGGACAGTGCATAAAACACACTAAAATTTTACATGAAAGAAAATACGTTTCTTGATTAAACATTTGCCTTAGCTAATATTAACTTATCAGATTCTGCATGAGGGATCCACAAGATATGCAAAGTTAAAACGATCAAACCTTTACGTTCCACTAGGTATAGGGAAAAAAAAAACTGGTTTACATAAATGAATATCATGTTTAGATGATGATAGAGACATGCAAAGTTCAAAACTAGCAAACCTTTACATTCAACTAGGTATAGACAAAAAAAAAACTGATTTTACAAATATGAATAACATTTATAGATGGTAATAAGACAATGTTAAGTACCTATGCATCAATGCAACTATCTCGCACACTAAGAAAATTTTGATGACCTTTCAACCGTGTCTTTAAGATTATAACATACAAATATTGTTTTATAGAATCTTATATAGTAAAGAATCTGAAGTTCAATCACATAGATAAGTTATTCATATTAGTTAGTTGCTTAGGTTTCTGGGGTGTACCATAAAGCTTAAAATAGCATTAGAAATTCATTTGGACATCAACTAAAGTACCAAAATACATTTCCATTCAGTGAAGTTTGTTTGTATTATCTGTCATACAAAGAACAAATTATTCAACCATCCCAAATTATTGTTGAGTCGAGTCATCGACCTTTCTACAAAGAATACAAACCGATACATCTTGTCCTATTCATCCGCAACATGAGCCATTCAATTATTTTATGATGCTTATGAGTGCATCAATGAGATGCTCTTATTTTACTCTATTGCTGACTTACGATGTTGTACTCGTGTGGCTGCTTGCTCAAGTTATTAAATTATAGTTATATTATCCATTATACAGAACATTAATTTAAAGAATATTTTCGATGGTGTTGCTAAACTTGCAAGTAGCCATTTTGAAGATTATTGCACGTTTATGGAAACTGATGTTGAGCCTTATGTTGCTTAAGTTAATGCAAAAATTGGTATGGCGAAATCAATCATTAAATGAATTCAGTTAATTGTTTGTTCTATTCTTATGGGGGCTGGCTATTAGGGCACAAAATAAAACATAAAATGAGACACGGTAAATGTTGATCATTGGATCTTAGTGGGGGTCGGAATAGAGGGAGATTCAATGATTGATACTTCTTGTATCACCGTTTGTGTCATCTATTTGTATTCAAATTGATTTTCCCATTCTTATGAGGATGAAATTGTATATATCTGCTTAAAGACGTGTTATTTTGCATACAGCAATATTATTCCATTTTTGACCAAGTTAACACTCTTTTTCGCAATTCGTGCTAGGATATCAACCAAATATTTTACATTTAAACATTCTCGGTTGTGCTATTCGAACTTTTGTTGCACCTTAGGATACATTAAGATGAGTCCACAACAACAGTTAGAACAACACATTGGTTTTGATCTATTTTCTATTATTAGATACCCAAAACCCTTAAGGGACGATGTCTTCACAACAAATTTGCAAACTATTACTTTGATTAGTCACTCTTCCTATTGTTAAGGGAAGAGAATAAAAAATAAATAAAGGCATGGAAAAACACTATATTATTTACTATAAAATTTAAAGATTATCGAAACTTTTCTTGTGATTATTAAAAAATTATATAATCGAAATGTATTGAATTTATCTTTAATGTTTGAACTTTTGAAGAGGACATCTAATGCCAATATAAATGGATTTCATGTACATTGTCTAATTTAGCCATTTTAAAAAGATTTATGAAGTTACATAAATTTTCAGGAGCAGATAATTTATAATGATATTTCCAGTAAGTTAATATAAATAAAAAGGACACACACACATACATACATGTATGTATATATGTATGTACGTTGACCATATTTTATAATCAATCTGAAGCACATTTAATCTATATCAAACATATATTTTTATAAGAATTATTTTACCTTGATATAAGTTATTGAATTTTAAACGTACCGAATGACTCCCATGGCAATTGCTACAGGTTCCCTATGATATGTTTTTTAAAGTGGAAAAAAGTTACCAATAGCAAATTCCTAGAAATTTGATTCGAATGCTAAGCCTTTTTATTTTCATCATAAATAAAATATAAAATAAAAATAGACAGGTAAATTTATTACAAATTGCTATGGTTTTACTTCAGATGAATTTATGCATGTAAAAAAAAAAAGTTCCCTAGCAATTTACCTTGGATTTGCTAAGGCTATTTATTATTGTTAAAGATAAGAAAAGATATAAAAACATCCATGGAAAAATCATAGTAAATTGCATATATTTGCTATAATTTTTAATATAATGGTAAAAAATGCTTGCCGTAGCAAGTTTGTTGGCGGTCAGTCTTTAATTTGCTAGACTATTTGCTATAGAAATTTGATTGGTGGTTGTAAATATGGTTTTATAATAGTGGTTGTCGAAGGTAGTGTTAAAGTTGGTAAGCAGGTGAACAACCTACATCCATCTAATGTTTTAGCATACTCTGAATAGAGCACCATCTTAGAGTATCAATATAAGGATGATGTTCTACTTATGACATGTTAATCAAATGAGGTGAATGCGAAATGACCATCCATTCATGGACATTAACATATTTTAATTTTTCTTATAACATTCTTCTTCTTTCTTTTTTGACAACACCAATACATTTTGTGTTATCTTCATCTCTTGACACTTCTCTTGCAGCTATCCTCGTTGTTTGATTTAACGATCACCTCTGTCAATTTACATCAATAATATCATACGAATAAGATGCATTAGATTTTAACGACCAGGTTAAAGAGGCCAAACGACCAAATTCTTCATTTACTGACTAATATATTTACAATTATGCATTTGCAACTACTGCAGCTACCTAATATTAATTTTGACACATTTCGTCTCAATTATTTGGGAAAAATAGTTAATAGGCTCACCCGATGAATCTAGCCTTGGCTTCCTCAGAAATGATAATGCACGAAGATATGTGAGATTGCTTCCGCAGTATCCAAGACAACAATTTTCTGCTAGATTTCCAACCATGTCAGCTGGAGCTGTTGATTTACTTGAAAAAATGCTTGTATTTGACCCTAGCAAGAGGATAACAGGTATTCCAGTTTCTCAATGTTAAGAAAACTTTTCAGTAACTGTCTGTGAAGCACTACATACAAATTTATTTTTTTATTCTAAAAAAATAATAAAAAAAAACTACAAAAACCCAGCATCAACCAACTATTCATTTTTTTCCTCTTAGCTTGAAAATCAAAAGTTTGATGGGAGACCAATAAAAACGTTTTCCTTAATTTCACATAACATTTTGTTTAGAAACGTTTTATGAAATTCGTTTATGAATTTCGTATGATCTCGTATTATTGTGCAGTTGAAGAAGCCCTATGCCATCCTTATATGGCTTCTCTTCATGATATCAATGTAGAGCCAGTTTGCTCTGCTCCTTTTGTCTTTGACTTTGAACAACCATCATTCACTGAAGAAGATATCAAGGAACTTATATACAGAGAATCTTTGAACTTCAATCCAGACCTAATGCAGCACTAAGTGAAGTTCACTTGTAAGTAATAAATTGGAGTGTCTGAATCTGTTTTTTGGCTTTATTCCTATCGTTGAAGTCTCTTGAATCACTACTCATATTTTGATGCTATCATCTGGCTTTACCAAATATATTGCAACGTATGTGTATATCGTATGGCAAAAACTTAACATGCTACATATGTCAGGGATACCGTTTCTTGTCAATAAAATAGCTTTATTTGACAATTTTTCAGACATAAAATTCTCTAATTTCCTTTTGGAATGCTAATGTACAAGACCTTTACATGATTTATTTTTATTTTTCAGGTAGGTTCCTATTGCCATGAATAAAAGATGGATATACTGTGGTGCATACATACTTCTGTGTAAAATTTGAAAATTTCGTGACAAGTAATTGAGTTTTTTTTAGCCAATGATTTTATAAATGTATTCCTGTTATATTTATTGCCGTTCGTAAATTGAATAATAAGCATGCATGGCTTGATAGCAGCTGGATGTTTTAATTAATTTGAATTATGTGTAATTTGAACCGCTTTGTAAAGAAAACTGGTGAGCTGTTTATAGGAACGATGCAATGGTAATAATAATCGTGCGACTTGTAAATTAAATCGAGGATCAGTGTACGACGATTATGATGATGCGGTTTCGTTTAAAAGGTAGTTGCAAAATATTTGTTTCCATAAACGGTTTGTCCTACATCTTTAATAATAGTTGTAAT

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020080580.1	1.0e-190	mitogen-activated protein kinase 2
Swissprot	Q39024.2	3.3e-186	Mitogen-activated protein kinase 4
trEMBL	A0A199V486	7.3e-191	Mitogen-activated protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G01370.1	84.66	0.0	659	ATMPK4;MAPK4;MPK4	MAP kinase 4

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G06458	AT4G01370.1	365	56	3	367	8	372	84.66	0.0	659
AfisC3G06458	AT1G01560.2	356	61	12	367	14	369	82.87	4e-179	624
AfisC3G06458	AT4G11330.1	358	78	10	367	15	372	78.21	4e-175	610

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	42	324	234.1	1.5e-69

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0000165	P	MAPK cascade
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000746	P	conjugation
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004707	F	MAP kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0005802	C	trans-Golgi network
GO:0007067	P	mitotic nuclear division
GO:0009409	P	response to cold
GO:0009524	C	phragmoplast
GO:0009555	P	pollen development
GO:0009574	C	preprophase band
GO:0009620	P	response to fungus
GO:0009626	P	plant-type hypersensitive response
GO:0009651	P	response to salt stress
GO:0009723	P	response to ethylene
GO:0009734	P	auxin-activated signaling pathway
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0009864	P	induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway
GO:0010051	P	xylem and phloem pattern formation
GO:0010120	P	camalexin biosynthetic process
GO:0010150	P	leaf senescence
GO:0010183	P	pollen tube guidance
GO:0010224	P	response to UV-B
GO:0010229	P	inflorescence development
GO:0010311	P	lateral root formation
GO:0018108	P	peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0042542	P	response to hydrogen peroxide
GO:0048481	P	plant ovule development
GO:0051301	P	cell division
GO:0060918	P	auxin transport
GO:0080026	P	response to indolebutyric acid
GO:0080136	P	priming of cellular response to stress
GO:2000037	P	regulation of stomatal complex patterning
GO:2000038	P	regulation of stomatal complex development

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K20600	MPK4; mitogen-activated protein kinase 4	EC:2.7.11.24	MAPK signaling pathway - plant	ko04016
K20600	MPK4; mitogen-activated protein kinase 4	EC:2.7.11.24	Plant-pathogen interaction	ko04626

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network