result

Gene information

Detail information of AfisC3G06558

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G06558	chr3	1170186908	1170192217	+

Sequences

CDS

>AfisC3G06558
ATGTCTGCCATATGCAGTAAAAGAACCCGGCCAAATAAACCGTCCGTTAATCTAGAAGAAACCGATGACGTGAAATGTGAAACATGCAACTCCGGCCACCGAGCCGCCGAGCTCCTCCTCTGCGACGCCTGCGATTCTGGTTATCACCTCTTTTGCCTTCGGCCCATCTTACCACGTGTACCTAAAGGATACTGGTTCTGTCCGTCTTGCTCTATTCTCAAAAACCCTAACAAAGAAAAATCACCGCGAGAAATCAAAGCTATTGACAAACCCAATCAAATTCAACTCGTGCAGACAAAAATAGATGATTTTTTCAAGATCCGGAGGTATAATGATGATAATTCGTTGATTAAGAAGAAGAAAAAGAGAAATGTCGGGTTGAGAGTGACGCCGAAGAGGAGGAGCAAGTTGCTTGCTTTTATTCCAAGCGAGGAAACCGAGAGAAGAATAGAGCAAATGCGTTCGCTTGCGGATGCTTTGATGAGTAGTGGAGCTCAGTTTAGCAACGATCTTACTTACGTTTCTGGCATGGCTCCTAGATCTGCTAACTGTGCCTATTTAGAACGAGAAGGAATGCAGATAATGGCAAAAGATGATGTTGAAACATTGAATTCGTGTAAGAAGATGATGGAGAGAGGAGAGTGCCCTCCTTTAATGGTGGTTTATGATCCTGTTGAAGGGTACACAGTGCAAGCAGATCGGTTCATTAAAGACTTAACAATAATTACAGAATACGTAGGAGATGTTGATTACTTGAGTAACAGAGAAAATGATGATGGTGATAGCATGATGACTCTATTAACAGCAAATGATCCTTCAAAGAGTCTGGTTATTTGTCCAGACAAGCGCAGCAACATTGCCAGATTCATCAATGGAATCAACAACCATACCCCGGAAGGGAAGAGAAAGCAGAATGTAAAATGCGTGAGGTTCAGCGTGAACGGAGAGGCCAGGGTTTTGTTGATTGCCATTAGAGATATTAAAAAGGGTGAGAGGCTGTATTATGATTACAACGGATATGAACATGAATATCCTACTGAACATTTTGTATGA

Protein

Gene

>AfisC3G06558
ATCATCCGTCGTTTCGCCCCTTCTCCTTCTTCAAAGTTCATTACAAATGTCTGCCATATGCAGTAAAAGAACCCGGCCAAATAAACCGTCCGTTAATCTAGAAGAAACCGATGACGTGAAATGTGAAACATGCAACTCCGGCCACCGAGCCGCCGAGCTCCTCCTCTGCGACGCCTGCGATTCTGGTTATCACCTCTTTTGCCTTCGGCCCATCTTACCACGTGTACCTAAAGGATACTGGTTCTGTCCGTCTTGCTCTATTCTCAAAAACCCTAACAGTAAGATTCTTTTTTATTTTTTATAGATCAGATTTTACTGTAGTTGGATCTTTATTAATCTATCCTTTGTTTTAGAAGAAAAATCACCGCGAGAAATCAAAGCTATTGACAAACCCAATCGTAAGTGTATAAAAATGTGAACTTTTCTTCAAATACGATTTCAGGGTCAATTTTATTCGCATCTAGATACTCATTTATTATTTATTTATTTTGGTGCAGAAATTCAACTCGTGCAGACAAAAATAGATGATTTTTTCAAGATCCGGAGGTATAATGATGATAATTCGTTGATTAAGAAGAAGAAAAAGAGAAATGTCGGGTTGAGAGTGACGCCGAAGAGGAGGAGCAAGTTGCTTGCTTTTATTCCAAGCGAGGAAACCGAGAGAAGAATAGAGCAAATGCGTTCGCTTGCGGATGCTTTGATGAGTAGTGGAGCTCAGTTTAGCAACGATCTTACTTACGTTTCTGGCATGGCTCCTAGATCTGCTAACTGTGCCTATTTAGAACGAGAAGGAATGCAGGTAATTTTACTCAAGACATTTGACCTTTTGTTTTTCTTTAAAAGGTAATCGTGTTTTGATTATTTTCGTTGTTTGCTGTTATGGTAGATAATGGCAAAAGATGATGTTGAAACATTGAATTCGTGTAAGAAGATGATGGAGAGAGGAGAGTGCCCTCCTTTAATGGTGGTTTATGATCCTGTTGAAGGGTGAGTTGTTATATGAAATTTAAAATGATTTTTATTGTGTACATCATGGATCTATATTTCTCCACACTAAGTATAGGTATTACCCGCACCATATTTTACACCAAAAACCACCGACTTTAACAACTATCAAGTTATTTTAATAATACCAAGTTCATTACCCGAACAGTTTATGTATGCTGCTGTTTGTGTATTACTTTCAATTCTTCTTGTCGTTTGAAATTGAGTTTTCGAACCATATATAAATTAGATGATAATTTTGATGCCTTTTTTCCAGTGTGAAAGCTACGGTCTTTCATTTTGGTATATGTGGGAAGTTTAACATATTATTTGGTGTTGGGTATATATGGTGCCATTCTAATATAATCTGTTGCATTTTGATTAATCCTATTCATTGTTTTAAAAACCGCCTTGATATTCGCCTCTAGGAGTGGATGAAATGAGAGATAAAACATCTTGAGCCTTTCTCCAAAAGGGTTTTTTTATCTCTAAAGCTTACTCCTTAGCAAAAGTCATGCAAAATATGCAAAGTGTATGCCTTACACATCTCAAATTGACGAGGCATGAGGAATATACAAAGTGTATTTAATGGAAAACAAAAAAGAACAAAATTTAAGAAAATGAGAGTTATTGTTTTTTACTTCTTAATTTAATATCGATATGATTAAATAAGATTGTTTGTGAAACAATGATCAAAAACTATATAATGAATTCTCATTGCTATTTAAAAAAAAATTCTTACTAGATTTCAGTGAATCACCAAATAAATTTTGTAAACCAATTTGAATTGGTTGAACAAATCAAAATTGGAATTTTGCCAGAATCTTATATAAATTTTGCTGAATCGAAACTGGAATCATATGAATTTTAGTTATTTAGTTTTGATCTTTAAAGAAATAAAACGAGCTGGACCTTAATGATTTGTTCTTTTTTTTAACATAGGTTAGTTTAAAATGTTAAATTTTATTATATTTTTTACGTTTTAATTTTATCCGAAAAGCTTACGTCTTAATGTTTCAATGCCTCCCTCATAGACTTGAAAACGCATCATGTACCCTTTAGTGTTTTAAAACAATTAATCTATCGTAATCCATTAAATTTCTTTTGCCATTCCACTACTTTATACATTTTCATCAAGCTTGTGTGAAGGATAAATCTGGTATTTGATAATTCTATGCTTTGCTTGAATGTGGTCTCCTTTGTTAGCCTTGTCTTGTTGGAGTGTTGCCTCCTTGCTTCTTCAACTTGAGCATTGCTATTGTTTCTTAGCACTTGGCAAACTAGTTTTTCATCAATTCGTAGAGCGAACCACTAGATATTTATCAATTTTTAGTTTGCATCACACCAAGTTTGATCAAGTTAGTGTCATTTTTGATCAAATTTTATTGCATAGCATATTTGCTTTCAGTAAATTCACAAAGATTCTTATCCTCAAAGAGCATCATCTTTTGCATTCTCTTCAAAGAAAGAGTGGAAAATCCAAAGGTATATGTTTATTAATAGACAAGGGTATGACTGCGTTTAAAATTTCATTATTTTTGGTAAGGAATTTAACAAAAATATTAGAGGTTAAATCTAAAGTTTTATCTCTTTCATCTCACTTGATATTTTACCTGAGCTCTCTTTTTTGCATTTGAAGTTGAAATAAAATTCAAACTTAATTTGAATTTTTTTTGACACTCATCTCATGGCATGTCAAGATATTTGCTTGAAACATGGATCCAAATGTCAATTTGATGTTTTATTTGAAATCTGAGGTTTAAAAGTTTGTAGTTAATAAAATTAGGAATGTTTTTCAATAATTTTGAGCTTGAATATTTCACATGGTATTAAATGAACATGCACACAATGCTTTTTAATGGATATTGAATCCAATTTTTCAATAATTTCTTTATTACATGATCGCTTGGAATAATTTAAAGGAAAATTTAGATGTCCACTAAGTAGTTGTTTTTTGGTTTATTTGTTGAATTTTTTTATTTTATTTTGACACAAATATAGACAAAATGCACAATAAACCTCAATCGTTAGATTTTATAGTCGCTAGCTTTTCTGATGTTCATGTTTGACAAATGATTTGGCAGTTATGGATATATTGATCTTTTTGGCGATCTTTCATGTTTTTTGATTTGGCTTGATTTGATTATCGTCATTTGAATCCCCTCTCTCCTTTTGTTTTATTTTAATTACCGTTGATATTTTATGTTAGTGCGTTGCTAAAAGCACCCAACAACGTGCTTTCCAATACCATATTAAACTTTAATCATGTTTAATAAATAAACATGCTATTTAATACCTCTTCTTTTTGTCCACATAGCCATTAATCATTGAATGCTTTACGTGCTAAAAAACCATCCTATCACATTAAAAATCTTGGCTCCCAAAATTTAACAATCCTGAAACCCTAAATTTCATTATAGAAATTGATTATTTTTTCAATATTAGATCACTAATCCATTAGCAAAGAGCACTCTTTTAAGGAAGAAGGTGAATATCAAAATATGACAAATAATATACTACGTAATCAATACTCTATAGAAGTAAAGAAGGATATTTGATTAAAAATAAATTTGTTTGTTTTTTTAATTTGTCAACCGATATTTTTTGGTAGGGTTATATCAATCTTTTTTTGGAGAGAAATGTGTGATCCTAGAAAGTAGAGGAGAGCACACATGGTTATATCAAACTTTTTTATTGTATTTACAAATAATGTTTAGAGTTTGTTACTGGTTTTGTTAGTTGATTGATAGGAGACAAAGATCTTTCATAATTCAAATAATAAAATGAATGTAGGGTACCCTAATGATGCAAATGAGTTAATTATGCTAAGAGTTTTGGTTGAAGAAGAACAATGGGAGTTGGGATTTAAATGATTTGGGTGCCTCTTTTTTATGCTGTTTGATATCAAGCAGTACATAATTTATTTATGAATGGTGCTCTTTAGTAATGGGATTAGAAATCACATTTGTGTACTTTTAGCAACACACTTTATGTTATTGTTTTTGAAAATCTGATGGGTTGACAAGTCCCATGAAAATCAAGGGTTCTAATAAGCATGATCTCTAATAAAATCTATCAAGATGAATTAATTTAGTGATAATGTTAAAGTTGAATAGAGAGTTTTTTTTTGAACCCAGGATGGGAAAATAATCCCAGCCTATAAACAAGTTGAATAGAGAGTAGAGTGAAAAATCTGAAAGAGATGAGTTATTGTGCAAACTCAACTCTTACGAGGTATATTACTCTAACCTACAAGGGCACGAAGTCACTGTAGAGAAAAATGATTTTGCACCATAATTTTAGCACTTAATGTTGGTTTTGTGGTTTGGATTTTCTGGGTACACGTCACACTTTTAAACTTATATCATGCATAGCTTGAGGTTCGGTTCTTGTTGGTTCAAATCAGGTTGGATATAAGTGACTGATTAAATTAAGTTTCTTGTAGGTTCTTTTGATTTAAGGGTCTTTTTGTTGTTGTTGTTGCTATTGTGATTTAGTGTTGTTTGTTTCAAGTCTCATTAAATTTGTTTCAAGCTGGTGTTATGTTTGTTAGAATAAGGTTCTATTAGACATTTAGTTGAATTTTTAATTACCAGAACTGCTACTCTTACAAAAGAAATACATATTCCACATTGAACTTCACGAACGATTTTGAATTGATCTTTTTCTACATGTGTATTTCTGTATTTGCTGGTACTTAAATATATGTATGTTGATCCAAACAGGTACACAGTGCAAGCAGATCGGTTCATTAAAGACTTAACAATAATTACAGAATACGTAGGAGATGTTGATTACTTGAGTAACAGAGAAAATGATGATGGTGATAGCATGATGACTCTATTAACAGCAAATGATCCTTCAAAGAGTCTGGTTATTTGTCCAGACAAGCGCAGCAACATTGCCAGATTCATCAATGGAATCAACAACCATACCCCGTAAGCATTTTTATTCAAAATTTAAACTTCAAATTTGAATTGATTGCTAATGATAATTTTGGTAATCAGGGAAGGGAAGAGAAAGCAGAATGTAAAATGCGTGAGGTTCAGCGTGAACGGAGAGGCCAGGGTTTTGTTGATTGCCATTAGAGATATTAAAAAGGGTGAGAGGCTGTATTATGATTACAACGGATATGAACATGAATATCCTACTGAACATTTTGTATGACTTGATTTCCACTTTAGGCAAACCATTTTTTTAATATACTGAATTTTCAGATTTTGATTTTGTACCGTTTGAAATTTTGTTTGTGTTGTGGAATCAAAATACATGGGAATAAGACATGATTGTGTTTTTGCTGTTGTACTTGTAACAGTATCATTTACG

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_019189085.1	1.4e-125	PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATXR6-like
Swissprot	Q9FNE9.1	3.5e-113	Trithorax-related protein 6
trEMBL	A0A5D2ZSV9	1.7e-125	Histone-lysine N-methyltransferase ATXR6

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G24330.1	64.85	3e-121	431	ATXR6;SDG34	ARABIDOPSIS TRITHORAX-RELATED PROTEIN 6

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G06558	AT5G24330.1	330	96	4	26	350	35	349	64.85	3e-121	431
AfisC3G06558	AT5G09790.2	334	122	3	23	350	64	379	56.29	4e-106	381
AfisC3G06558	AT5G09790.1	328	107	2	23	350	64	352	55.49	1e-101	366

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00628.26	PHD	Domain	26	71	41.6	7.9e-11
PF00856.25	SET	Family	47	338	27.6	2.9e-06

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0000790	C	nuclear chromatin
GO:0000978	F	RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding
GO:0051726	P	regulation of cell cycle
GO:0046872	F	metal ion binding
GO:0005737	C	cytoplasm
GO:0005654	C	nucleoplasm
GO:0005813	C	centrosome
GO:0006275	P	regulation of DNA replication
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009901	P	anther dehiscence
GO:0032453	F	histone demethylase activity (H3-K4 specific)
GO:0034720	P	histone H3-K4 demethylation
GO:0046976	F	histone methyltransferase activity (H3-K27 specific)
GO:0050896	P	response to stimulus
GO:0055008	P	cardiac muscle tissue morphogenesis
GO:0070734	P	histone H3-K27 methylation
GO:0090544	C	BAF-type complex

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network