result

Gene information

Detail information of AfisC3G06574

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G06574	chr3	1173784563	1173792027	+

Sequences

CDS

>AfisC3G06574
ATGGGTTTGAACTGCTACAAAGTCCCAAACCTAAAAGATCCAATTTTAGAGACGCTCAACATATCATATTTGCAAGATAGATACATTCTTGGTGATGAATTGGGTTGGGGTCAATTTGGTGTGATAAAATCGTGTTTTGATATGGTTACAGGAGAATCATTAGCTTGTAAATCCATACCCAAGGACAGATTAGTTTCAAACGATGATCTGCAAACTGTAAAGTTGGAGATAGAAGTCATGAGTAAACTCTCTGGGCATCCAAATGTAGTCGAGCTTAAAGCTGTTTATGAAGAAGAAGGATTTGTGCATTTGGTTATGGAGCTATGTGCTGGTGGAGAGTTATTTCATCGTATTGAGAAATGTGGGAGATTTTGTGAAGGAGATGCTTGTCGGCTGTTTAAGCATTTAATGGAGGTTATTTTGTATTGTCATGAGAAAGGAATTGTGCATAGGGATCTTAAACCGGAGAATATTTTGCTGGCAACAAAATCAAGTTTGTCGGAGATCAAGCTTGCAGATTTTGGTCTAGCAACCTATATTAAGCCTGGGCAGAGCTTGCATGGTACAGTAGGAAGTCCATTTTACATAGCACCAGAAGTATTGGCTGGGGGATATAATGAAGCAGCAGACTTATGGAGTGCTGGAGTTATTCTATACATCCTTCTTTGTGGAATGCCTCCATTCTGGGGTAAAACTAAGTCGCAAATTTTTGAATCTGTTAGATCAGCAGAGCTCAGATTTCCTTCTGACCCATGGGACCATGTATCAGACTCTGCTAAAAATTTGGTTACTGGTATGCTGCAGAGGGATCCAAAACAGAGATTAAATGCCAAACAAGTGTTAGAGCATTCATGGATCAAAATCTTTTCAAACTCATATAACAGTCAATGCACCACAACAAACACAATTTCTCATCAACAAACAACAGCTTCATTATCCTTCTCAAACGTTACCGTACCAGCAACAAGAGATGTTAGTTTTGGGTTCAGCACAGCAGTCAGTAGCCAACAGCAGCCGACTCTTTCATACCCTACTTTCACTTGCCAGTCCTCGTTCTCAAACTCCAACATAGGATTCTCCTTCAGAAACGAGTCAACTGAAGAAGCACATGAGTTGCCGCTGATTCAGAATTTCTCATTCTTCAGCCCTCTTCCTCCAAATGAAACAGAAGTCATTCCATTGGATATAAAAACAAAGGTGGAGATAGATATAGGCAAAGGCATGGGTGAATTCAGGAGGAGGAGACACCACACAATTGGCCTTGGGGAGCAGCTCGATATCATAGTGTCGGAAACTGTGATAAGATGGTCTTCATGCACGTGTGTGCCCAGTGCACATTCTCTTCAATCCTCACTTGTATGCTGA

Protein

Gene

>AfisC3G06574
GTTTTTAAAGACAGCTAATGTTCTCTTTCAGTGCCCGCAAACCCCGTGATAGCATTGAGCTGTGACCTAGGGTTTCTAAATTTTAAATTTTTTGATCTCACTGTCTCCAAATTCACATCTTGGAATTTACTCTATCTTAATACTTTCAGCTTGCTTCCAGTTGTGTTTGCGATTTCTCAATAAACAGCTTGATGCTGTCCCCAATTTTCTACTAGATTTCGATTTTTTTGCCCTCTTCGATCTTCGAACAAACCATCCCTGTTTTCTTCTGTATTTCATGAATTAGGGAAACGATTAGCTTGTGTGTTGACCCATCTTCAATCAGTAAACCCGCCGTGGGTTATTATAGATTTATTGATTTTGAAGGAAAAAGTAACTTCTGAGCTGACAGTATCTCAATTCTCAGTAGACTTACTGCGGGTTTCTTGTAAATTTCATTACTTTGCAATAGAGTTTAGTCTTCGATAAGCACTTCCATTTTTTTTCATTAAACGTTTGATGGGTTTGAACTGCTACAAAGTCCCAAACCTAAAAGATCCAATTTTAGAGACGCTCAACATATCATATTTGCAAGATAGATACATTCTTGGTGATGAATTGGGTTGGGGTCAATTTGGTGTGATAAAATCGTGTTTTGATATGGTTACAGGAGAATCATTAGCTTGTAAATCCATACCCAAGGACAGATTAGTTTCAAACGATGATCTGCAAACTGTAAAGTTGGAGATAGAAGTCATGAGTAAACTCTCTGGGCATCCAAATGTAGTCGAGCTTAAAGCTGTTTATGAAGAAGAAGGATTTGTGCATTTGGTTATGGAGCTATGTGCTGGTGGAGAGTTATTTCATCGTATTGAGAAATGTGGGAGATTTTGTGAAGGAGATGCTTGTCGGCTGTTTAAGCATTTAATGGAGGTTATTTTGTATTGTCATGAGAAAGGAATTGTGCATAGGGATCTTAAACCGGAGAATATTTTGCTGGCAACAAAATCAAGTTTGTCGGAGATCAAGCTTGCAGATTTTGGTCTAGCAACCTATATTAAGCCTGGTAATATTTAGTTAACCTTGGTGTAATATTTAACAATTTTTTGTAGCCAATTTAGTTTTTAAAAACTAATTATCTACTGTGAATTCCATATGCAAACATAGATTTCAAAGGTAATAACCAGTAGTTTGATGCTTGTGAAATTTATGATGTAATCCTGTATTTAGTTTTAATGATTATATATGTCAACAACAAATAGTTTATACCTGAAACTTATTTGAGTGATTTATCCATATGAGTTATGAATTGATTTGAGGAGCATCATTTATCTTTAGATTTGCTTATGGATAAACATCCGGACATTTATCTGTTTTTTTGTGAGCATTTTATAAATTTATAGTAAGTATATCACAATCATCGCTTAGTTACAATTCCTATGTAAACTTATGTTGGCCCATTGAATCATGTTTTTTGTTGTCAAATGATAATTACTACTTCATAATTAATATCTGAATATGTGTCATAATATTGTTTTTACATGCCTCGGTAGCATCTTAAATGCCAAAAGCTAAAATACTAGCATTGTATGCATTAAGAATAGGTTTTTAGATTGAGTTGATCTAAGGCCAACATATGGAGAGCCTATTTCCTATGCAAATACTATTATCGATATAAAATCAGAGCCTAAACAGATACAAGTGTTTAAGCATATACATTGTATGTTTTTTAACTATTATATTAGATGTACTGTCATCTGCATCCAAAATGTTTAGTGCTTCTGCTATGAATTTTAACATGGTTCTACTGTGAAAGAGTTGTCATGTACCGATCAAATGGTACTTTGGTTCTTGTCATTCTTTTGCAGCTTCAATGTACATATACCCTAACAGTCAATCTTCGATGATTTATAATTTGTTTTGCATTTTTTTGGGTTCGATTGACTTTGTGAAGCAGTGAGTTTTGTGTCTGAATATAAATGAGTAGTTTAGTGCAGGATGAGACTCATACACCACAGTTGAGACGACGTACTCAGATTGAACGTTAAGAAACATCCAACGATCCAAATCATATTTCACTTCATGATATTCCTATTAGCAGCTATTTTACTTCTGAAAACTCTTCTGAAAGTCTTGGTTCAGCTCTGAAAAAGTTAAAAAGTGTCTCCCCTCCAGTTTTCCTGGGTATTTGGACTTTGTGATTTTTCAAAACCAGTGTTGCATTAAAATTTTCCTTGAATATTTTATTTTGTGTGAATGAAACTAATTAAATAGTCTTATGGTTTACAGGGCAGAGCTTGCATGGTACAGTAGGAAGTCCATTTTACATAGCACCAGAAGTATTGGCTGGGGGATATAATGAAGCAGCAGACTTATGGAGTGCTGGAGTTATTCTATACATCCTTCTTTGTGGAATGCCTCCATTCTGGGGTAAAACTAAGTCGCAAATTTTTGAATCTGTTAGATCAGCAGAGCTCAGATTTCCTTCTGACCCATGGGACCATGTATCAGACTCTGCTAAAAATTTGGTTACTGGTATGCTGCAGAGGGATCCAAAACAGAGATTAAATGCCAAACAAGTGTTAGGTAAAGGATTATACAAATTGTTTTTTTGTATAACGTCTTAATATATAAAAAATGGCACGTAGAACCACGATAACAAGCTAGCATTGCCAGAAGCCTTAGGGATAAAAGCTCAGACAGTGAATAAATGTTTTAGCTTCTATTGATTTCTTATTAGTTGATGCATTAATAACTTATTCACAGAAATTTGGGCTGTTGAGTGAAGGCTGTTTCTCATTATTGGGGGCAGTTCAATAGGAAAAAAAGAAAAAACCCATGGGGACTTTGGACGACGTTCGTATTAATAATTTTAGTAGAAGGAAAGAAAAAAAAACCAACCCCATAATCTTTACTACTAATAAAGAGAATTCATTGAATAGATTTACTCGGTGTCTTTTTGAAATTCCAAATATACCCTTTTACATCTTATAGAGAAATAATATTCAAATATGGGAACATAGCTTGTTAATTTCTAAGTACAACTGTTAGTCACCATGGAGAACTACAGTGTGCGTTCACAAGATGAAGTATCCGAGTGTACCATATTGTCCGTAATTTAGGTGGGAGTTTATCGGTCGAAGTTTTGTCAGATTCCAAGTTAGTATGAAGAAGTTATTACAGTTTGAACAAAAAAATAGCGGCTTCTGCACTAGGTGGTGTTCAAATATTGGGATGTGATAGCCTGTTATTTTTTAAGTACAACTGTCAGTTCCCATGAAGAACTACAATGTACGTTCACAAAATGAAGTATCCGAGTGTTTCATATTGTCCGTAATTTAGGTGGAAGTTAATCGGTCGAAGTCTTGCCGGATTCCGAGTTATTATGAAGAAAATATTGCAGTCTGAACAAAAAAAATAACAGCTTTTGCACTAGGCGGAGTTCAAATGTGGGGACGTGGTATTCTGTTATTTTCTAAGTACAATTGTCAGTGTCCATGGAGAACTACAGTGTGCGTTTACAAGATGAAGTATCCGAGTGTTCCATATTGTCCGTAATTTAGGTGGGAGTTAATTGGTCGAAGTCTCACAGATTTTGAATTAGTATGAAGAAGTTATTGCAGTTTGAACAAAAAAATAGCGGCTTCTGCACTAGGCGGAGTTTAAATATGGGGATGTGGTAGCCTATTATTTTCTAAGTACAACTCTCAGTCCCCATGGAGAACTACAGTGTGCGTTCAAAAGATGAAGTATCCGAGTGTTTCATATTGTCCGTAATTTAGGTGGAAGTTAATCTGGCGAAGTCTCGTCGGATTCCGAGTTAGTATGAAGACAATATATCAGTCTGAACAAAAAAAATAACGGCTTCTGCACTAGGCGGAGTTCAAATACGGGGATGTGGTAGCCGGTTATTTTCTAAGTATAACTGTCAGTCCCCATGGAGAACTACAGTGTGCGTTCACAGGATGAAGTATCCGAGTGTTCCATATTGTCTGTAATTTAGGTGGGAGTTAATCGGTCGAAGTCTCGTCGGATTCCAAATTAGTATGAAGAAGTTATTGCAGTCCGAACAAAAAAATAGTGGCTTTTGCACTAGGCAGAGTTGAAATATGGAGATGTGGTATCCTGTTATTTTCTAAGTACAACTGTCAGTCCCCATGGTGAACTACAGTGTGCGTTCATAAGATGAAATATCCGAGTGTTCTATATTGTCCGTAATTTAGGTGGGAGTTAATCGGTCGAAGTCTCGTCGGATTCCGAGTTAGTATGAAGAAAATATAGCAATCTGAATTAAAAAAATAACGGTTTCTGCACTAGGCGGAATTCAAATAAGAGGATGTTGTGCCATGTTATTTTCTAAGTAAACTGTCAGTCCCCTTGGAGAATTACAGTGCACGTTCACAAGATGAAGTATCCAAGTGTACCATATTGTCTGTAATTTAGGTAGGAGTTCATCGGTCGAAGTTTTACCTGATTCCGAGTTAGTATGAAGAAGTTATTGTAGTCTGAACAAAAAAATAGCGGTTTCTGCCTAGGCGGCGTTCAAATGTGGGGATGCTACTATCAAATCTACTTCTACGGGTACAAATAAAAATGCATGCACATTGTGGTTAAATGCAGGTCCACCTGGACGTGCATATGTACTCGTAGTATATAAACAAACTCCATGTGTTTTCAACCTCTTTGTAGATTGTTATTCTCACATCTCCCGTTCACACTTCACAAGTTAATTTAAATGTTTAAAATCCAATAACTTTTCATAAAAACGTTGGGTTGATAAATCCTTTTCTTCATTAAATAACAACTTTTATGACTCTTTATTTGTAAACACTACATGTGTGTGTTCAAAAATTAAAATTTTGACATAATTATTAAAAAAAAAATTAAGTTTGCCCTTTGAAAAAATATGCCCCAGTCTATGGGGGTTGGGGACTTCTCTTCAAAGGGTCGAGGGGGAAATGCACCCCGCGTTTGGAGAAATTACTATATGTTATTTAGCGAAATGTCATCAATTAGAGTATTTCCTTGAAAGCACAGCATCGAGTCGATAGTATAGATTTAAGAAAGATCACCGGGATTATGTACCTGAATGATGCAGTTTTCACCGCACCAGAATTAAAACTACCGGGATTATGTACCTGAATGATGCAGTTTTAGTCGATAGTATAGTAAAAACTGCATTTCTTTGATGCAATAAAAACTGCATCTCTTACATGAGGTTAGATTTGCACTAGAATAATGCAGTTGAAAGTTGAAACTATCATTGTGAAATGCGATTATAACTGTTTTTGTTGACAAATACATTTATATTTTTTTTATCATTTCTGTCAATAATATTATTTATTCTACAATTTCACTGAATTAGTCACAGTCAATACTGTTTCTAATGTGAAAGATACGTATTTCAAAATTAAGGTTTACATTTTAATCAGAATTCGATAGCTAAAAGTTAATGGATCAACTGCCTTTTTTAAAGGTAGTTAAAAGTTTGACTGCATTTCGGGAAGAAAGTCAAAATGTTCTTCAAAAAAAAATAAAAAATTCGATAGTTGATTTTCATGTATCAATAATGGCTATCATTATAATGCTTACAAATTTTGCGATATAATTGTGAAAACAATGTTCGAGTTCAAATTTTCTATAAGAAGTTTTTGCATTAAAAAGATTGAAAATACATTGATTCAAAAAGATGGGGTGAAAATACATTGATTCAAAAAGATGGGGTGATATTAATGTCACAGAGACCTAATTTACATAAGTTGGTAAAAGTGGATCTGCTTTACATTTTGATTATTGATCTGGGTCTGGATTGGAATTTTTTGTTATTTATTCATGAATAGAAGTAGATAAAATGGGTTATATATGCATTTAGGGCTGACAATTAGAACCGCAAAACCGAATCGAACCGATCCGAGAAGATCCGAACCCGAACCGAACACGATGAGTCTTGGGTTGGGTCGGGTATGGGTGATAAAAAATACAATAAAGACCCGATCAAACCCGACCCGAACCAACCCAATCCGAAATACCCGACCAAAAAACATTGAAATATATGCATTTTTACACAACCAGACCTGAACCGAAGCTCGGGTCGGGTGGGATCTAGGTTTTTGAAATGTATAGTTTGGACCCGACAAAACCCGAGCCGCCTAGAACCGAGACCTGCCGAGTCGGATCCGGGTCCATCGGGTCGTGTCTAATTGTCACCTCTATATGCATTTTGCAAATGCTCGTCGAAATTATTGTCTTGCCTGTTCATTTACAAACTTCATTTTTGAATGAATCACGCATATAATTAACTTTGTATTTTTCGAGTTATTATTTGTTCTTTCTTTGGGTAATTTCCAAATCAACAATCCTATAATGCAATTGTATTGTTAATGTTTGTGTGATTCTCTAAAATTTGGTGTATATATTGACCGCACTTGTATCCCACAGGAGATAATGAGCTTTGCAGAAAGTTCATTGTTATAAAATAATAACAAAATTCAGGGAGATGTTATAAGCCTTACAAGTTACAGGGAAAAACATGGAAGTTCATGATGTAGTCATTTGTTCTTATCTTTCAAGTTATCATATAGCATTATATTTATTCTTGCATTGGTTTGTTAATAACATTATATTAACTCATTCATGATTCGTCTATTTTGCAGAGCATTCATGGATCAAAATCTTTTCAAACTCATATAACAGTCAATGCACCACAACAAACACAATTTCTCATCAACAAACAACAGCTTCATTATCCTTCTCAAACGTTACCGTACCAGCAACAAGAGATGTTAGTTTTGGGTTCAGCACAGCAGTCAGTAGCCAACAGCAGCCGACTCTTTCATACCCTACTTTCACTTGCCAGTCCTCGTTCTCAAACTCCAACATAGGATTCTCCTTCAGAAACGAGTCAACTGAAGAAGCACATGAGTTGCCGCTGATTCAGAATTTCTCATTCTTCAGCCCTCTTCCTCCAAATGAAACAGAAGTCATTCCATTGGATATAAAAACAAAGGTGGAGATAGATATAGGCAAAGGCATGGGTGAATTCAGGAGGAGGAGACACCACACAATTGGCCTTGGGGAGCAGCTCGATATCATAGTGTCGGAAACTGTGATAAGATGGTCTTCATGCACGTGTGTGCCCAGTGCACATTCTCTTCAATCCTCACTTGTATGCTGATTGAAGTATTAACTTGATTGACTGTATGTAGGATAGCTTTGATTGCTGCTCTTGTTCTGTCTTGGTTCTATGTTGAGTTGAATCAATCATCTATATATATATGACTACTGCTTGGTGGTGTTGCATATAATTTCACGTGTTTATGTTGTTGTTGTAAGCTTTTCCCTGCTACTGCTCAAATCTATTTGTGATGCTTCTGTCCTGCACTCGCAGTTGTTTCTCTGTTTCACAATGTATATTTATGATTGTACCGAAACCACTTGTGATATACATGGTAAATTTGTAAATGTTATTTATGTTTATTCGAGTGAA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020242223.1	2.1e-166	calcium-dependent protein kinase 19
Swissprot	Q6F3A6.1	2.8e-78	Calcium-dependent protein kinase 10
trEMBL	A0A6J0PS31	1.2e-155	calcium-dependent protein kinase 26

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G12580.1	51.19	4e-135	478	PEPKR1	phosphoenolpyruvate carboxylase-related kinase 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G06574	AT1G12580.1	504	192	10	4	454	20	522	51.19	4e-135	478
AfisC3G06574	AT5G12480.1	281	138	1	6	286	42	317	49.11	6e-80	295
AfisC3G06574	AT5G19450.2	282	141	1	6	287	40	316	48.23	2e-79	293

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g330599.t1
Allium fistulosum	AfisC3G06574
Allium sativum	Asa1G04711.1; Asa2G05504.1
Arabidopsis thaliana	AT1G12580.1
Oryza sativa	LOC_Os06g03682.1; LOC_Os06g03682.2

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	30	286	231.8	7.8e-69

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005509	F	calcium ion binding
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004683	F	calmodulin-dependent protein kinase activity
GO:0004713	F	protein tyrosine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005516	F	calmodulin binding
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005634	C	nucleus
GO:0009506	C	plasmodesma
GO:0009536	C	plastid
GO:0009789	P	positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway
GO:0009931	F	calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity
GO:0018105	P	peptidyl-serine phosphorylation
GO:0019903	F	protein phosphatase binding
GO:0046777	P	protein autophosphorylation
GO:0080092	P	regulation of pollen tube growth

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network