result

Gene information

Detail information of AfisC3G07845

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
AfisC3G07845	chr3	1394034577	1394047025	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>AfisC3G07845
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_022928330.1	7.7e-51	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 6-like
Swissprot	O65554.1	9.8e-51	SOS3-interacting protein 3
trEMBL	A0A6J1ICL0	5.5e-51	non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G30960.1	58.29	4e-51	198	ATCIPK6;CIPK6;SIP3;SNRK3.14	SOS3-interacting protein 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
AfisC3G07845	AT4G30960.1	187	44	2	128	280	19	205	58.29	4e-51	198
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AfisC3G07845	AT5G45810.1	211	73	3	104	280	4	209	46.92	1e-47	187

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	133	217	61.5	7.2e-17
PF00069.22	Pkinase	Domain	218	277	47.6	1.2e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005886	C	plasma membrane
GO:0005515	F	protein binding
GO:0050832	P	defense response to fungus
GO:0005739	C	mitochondrion
GO:0005829	C	cytosol
GO:0004674	F	protein serine/threonine kinase activity
GO:0035556	P	intracellular signal transduction
GO:0005524	F	ATP binding
GO:0005986	P	sucrose biosynthetic process
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GO:0009507	C	chloroplast
GO:0009737	P	response to abscisic acid
GO:0010325	P	raffinose family oligosaccharide biosynthetic process
GO:0010540	P	basipetal auxin transport
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GO:0018107	P	peptidyl-threonine phosphorylation
GO:0019593	P	mannitol biosynthetic process
GO:0042538	P	hyperosmotic salinity response

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network